MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44

Total Repeats: 931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006530	CTTC	2	8	22966	22973	0 %	50 %	0 %	50 %	56707166
502	NC_006530	CATC	2	8	23056	23063	25 %	25 %	0 %	50 %	56707166
503	NC_006530	AAT	2	6	23078	23083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707166
504	NC_006530	TTTC	2	8	23158	23165	0 %	75 %	0 %	25 %	56707166
505	NC_006530	ATC	2	6	23179	23184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707167
506	NC_006530	CTT	2	6	23187	23192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707167
507	NC_006530	AGT	2	6	23250	23255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707167
508	NC_006530	GTA	2	6	23277	23282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707167
509	NC_006530	TTA	2	6	23344	23349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707167
510	NC_006530	ATG	3	9	23402	23410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_006530	ATT	2	6	23481	23486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_006530	CCTCA	2	10	23502	23511	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
513	NC_006530	CTT	2	6	23542	23547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_006530	AGCA	2	8	23639	23646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
515	NC_006530	TAA	2	6	23651	23656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_006530	CTG	2	6	23659	23664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_006530	AAG	2	6	23744	23749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_006530	ATG	2	6	23805	23810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_006530	AGTCA	2	10	23818	23827	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_006530	CTTA	3	12	23867	23878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_006530	TAA	2	6	23879	23884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_006530	AAT	2	6	23889	23894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_006530	ATT	3	9	23941	23949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707168
524	NC_006530	GCA	2	6	23991	23996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707168
525	NC_006530	TGA	2	6	23997	24002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707168
526	NC_006530	AATTT	2	10	24079	24088	40 %	60 %	0 %	0 %	56707168
527	NC_006530	TAC	2	6	24114	24119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707168
528	NC_006530	TAA	2	6	24126	24131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707168
529	NC_006530	GTG	2	6	24134	24139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707168
530	NC_006530	TGG	2	6	24176	24181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707168
531	NC_006530	TGA	2	6	24183	24188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707168
532	NC_006530	AAC	2	6	24264	24269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707168
533	NC_006530	AAG	2	6	24271	24276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707168
534	NC_006530	AAG	2	6	24371	24376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707168
535	NC_006530	GAA	2	6	24387	24392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707168
536	NC_006530	ATT	2	6	24412	24417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707168
537	NC_006530	GGC	2	6	24418	24423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56707168
538	NC_006530	CTGA	2	8	24550	24557	25 %	25 %	25 %	25 %	56707168
539	NC_006530	AACT	2	8	24587	24594	50 %	25 %	0 %	25 %	56707168
540	NC_006530	TAT	2	6	24628	24633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707168
541	NC_006530	CAA	2	6	24634	24639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707168
542	NC_006530	GTCG	2	8	24685	24692	0 %	25 %	50 %	25 %	56707168
543	NC_006530	AGT	2	6	24706	24711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707168
544	NC_006530	GAT	2	6	24766	24771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707168
545	NC_006530	TGG	2	6	24819	24824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707168
546	NC_006530	GAT	2	6	24850	24855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707168
547	NC_006530	TAT	2	6	24861	24866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707168
548	NC_006530	GATC	2	8	24907	24914	25 %	25 %	25 %	25 %	56707168
549	NC_006530	CAA	2	6	25217	25222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707168
550	NC_006530	AAAG	2	8	25287	25294	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_006530	TTC	3	9	25329	25337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_006530	AGG	2	6	25340	25345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_006530	TAA	2	6	25364	25369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_006530	ACT	2	6	25431	25436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_006530	CAT	2	6	25475	25480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_006530	TGA	2	6	25487	25492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_006530	TAC	2	6	25559	25564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_006530	ATT	2	6	25574	25579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_006530	TTA	2	6	25611	25616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_006530	CTT	2	6	25628	25633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_006530	TCT	2	6	25726	25731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_006530	AGC	2	6	25745	25750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_006530	CTTG	2	8	25796	25803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_006530	TTG	2	6	25808	25813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_006530	TTG	2	6	25866	25871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_006530	GTT	2	6	25922	25927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_006530	TCT	2	6	25996	26001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_006530	AAC	2	6	26075	26080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_006530	TAA	2	6	26093	26098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_006530	TTGA	2	8	26106	26113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_006530	ATC	2	6	26135	26140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_006530	GTA	2	6	26172	26177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_006530	GCGTAT	2	12	26185	26196	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
574	NC_006530	TGA	2	6	26231	26236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_006530	CTT	2	6	26260	26265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_006530	TCT	2	6	26284	26289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_006530	TTG	2	6	26331	26336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_006530	GAC	2	6	26407	26412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_006530	TTA	2	6	26424	26429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_006530	GTTA	2	8	26483	26490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_006530	AGT	2	6	26507	26512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_006530	TCT	2	6	26554	26559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_006530	AAC	2	6	26633	26638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_006530	TAA	2	6	26651	26656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_006530	TTGA	2	8	26664	26671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_006530	ATC	2	6	26693	26698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_006530	GTA	2	6	26730	26735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_006530	GTTGCT	2	12	26757	26768	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
589	NC_006530	ATC	2	6	26855	26860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_006530	AGA	2	6	26865	26870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_006530	AGT	2	6	26900	26905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_006530	CAA	2	6	26914	26919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_006530	A	6	6	26947	26952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_006530	TTTA	2	8	26987	26994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_006530	CTT	2	6	27074	27079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_006530	CAT	2	6	27097	27102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_006530	ATGG	2	8	27127	27134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_006530	AT	3	6	27172	27177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_006530	ATT	2	6	27200	27205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_006530	ATGTT	2	10	27222	27231	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
601	NC_006530	TTTC	2	8	27279	27286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_006530	TAGAAA	2	12	27298	27309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_006530	TTA	2	6	27561	27566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_006530	CTG	2	6	27679	27684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_006530	ACA	2	6	27690	27695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_006530	TCC	2	6	27830	27835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_006530	TGA	2	6	27854	27859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_006530	TAT	2	6	27898	27903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_006530	TAT	2	6	27919	27924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_006530	TA	3	6	28001	28006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_006530	TCC	2	6	28014	28019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_006530	ATT	2	6	28031	28036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_006530	GAA	2	6	28101	28106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_006530	TAT	2	6	28111	28116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_006530	TTC	2	6	28151	28156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_006530	TAA	2	6	28165	28170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_006530	GAT	2	6	28242	28247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_006530	TAA	2	6	28262	28267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_006530	CAT	2	6	28286	28291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_006530	CGA	2	6	28302	28307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_006530	TTA	2	6	28317	28322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_006530	CCT	2	6	28335	28340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_006530	TTTA	2	8	28382	28389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_006530	AAT	2	6	28391	28396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_006530	GCA	2	6	28493	28498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707169
626	NC_006530	AATT	2	8	28504	28511	50 %	50 %	0 %	0 %	56707169
627	NC_006530	TAA	2	6	28627	28632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707169
628	NC_006530	TCC	2	6	28713	28718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56707169
629	NC_006530	AAAG	2	8	28744	28751	75 %	0 %	25 %	0 %	56707169
630	NC_006530	TAT	3	9	28765	28773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707169
631	NC_006530	CTG	2	6	28785	28790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707169
632	NC_006530	T	6	6	28815	28820	0 %	100 %	0 %	0 %	56707169
633	NC_006530	GAT	2	6	28867	28872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707169
634	NC_006530	TCA	2	6	28898	28903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707169
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636	NC_006530	ATTT	2	8	28915	28922	25 %	75 %	0 %	0 %	56707169
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902	NC_006530	CTG	2	6	42348	42353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707185
903	NC_006530	GTA	2	6	42367	42372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707185
904	NC_006530	GGGC	2	8	42495	42502	0 %	0 %	75 %	25 %	56707185
905	NC_006530	CAA	2	6	42510	42515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707185
906	NC_006530	A	7	7	42568	42574	100 %	0 %	0 %	0 %	56707185
907	NC_006530	CTG	2	6	42614	42619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707185
908	NC_006530	AT	3	6	42620	42625	50 %	50 %	0 %	0 %	56707185
909	NC_006530	CACT	2	8	42668	42675	25 %	25 %	0 %	50 %	56707185
910	NC_006530	TTC	2	6	42781	42786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
911	NC_006530	T	7	7	42882	42888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
912	NC_006530	T	6	6	42893	42898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
913	NC_006530	ATCT	2	8	42917	42924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
914	NC_006530	ATA	2	6	42979	42984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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916	NC_006530	TA	4	8	43021	43028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
917	NC_006530	AGA	2	6	43040	43045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
918	NC_006530	GGA	2	6	43064	43069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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922	NC_006530	ATG	2	6	43200	43205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
923	NC_006530	GTC	2	6	43249	43254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
924	NC_006530	AAT	2	6	43257	43262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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