MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-20

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006529	T	6	6	1284	1289	0 %	100 %	0 %	0 %	56707108
2	NC_006529	T	7	7	1508	1514	0 %	100 %	0 %	0 %	56707108
3	NC_006529	T	6	6	1547	1552	0 %	100 %	0 %	0 %	56707108
4	NC_006529	T	6	6	1566	1571	0 %	100 %	0 %	0 %	56707108
5	NC_006529	A	6	6	2466	2471	100 %	0 %	0 %	0 %	56707109
6	NC_006529	A	6	6	2565	2570	100 %	0 %	0 %	0 %	56707109
7	NC_006529	A	6	6	2882	2887	100 %	0 %	0 %	0 %	56707110
8	NC_006529	T	6	6	3014	3019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006529	T	6	6	3056	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	56707111
10	NC_006529	A	6	6	3425	3430	100 %	0 %	0 %	0 %	56707111
11	NC_006529	T	6	6	4711	4716	0 %	100 %	0 %	0 %	56707113
12	NC_006529	T	6	6	4777	4782	0 %	100 %	0 %	0 %	56707113
13	NC_006529	T	6	6	4831	4836	0 %	100 %	0 %	0 %	56707113
14	NC_006529	T	6	6	5461	5466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006529	T	6	6	5519	5524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006529	T	6	6	5699	5704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006529	A	6	6	6022	6027	100 %	0 %	0 %	0 %	56707114
18	NC_006529	T	8	8	6093	6100	0 %	100 %	0 %	0 %	56707114
19	NC_006529	A	6	6	6369	6374	100 %	0 %	0 %	0 %	56707115
20	NC_006529	T	6	6	6785	6790	0 %	100 %	0 %	0 %	56707115
21	NC_006529	T	7	7	6839	6845	0 %	100 %	0 %	0 %	56707115
22	NC_006529	A	7	7	7696	7702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006529	T	7	7	7774	7780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006529	A	6	6	7790	7795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006529	G	6	6	7908	7913	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006529	A	6	6	8571	8576	100 %	0 %	0 %	0 %	56707117
27	NC_006529	A	6	6	8908	8913	100 %	0 %	0 %	0 %	56707117
28	NC_006529	A	7	7	9449	9455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006529	T	6	6	9486	9491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006529	T	7	7	11068	11074	0 %	100 %	0 %	0 %	56707119
31	NC_006529	T	6	6	11086	11091	0 %	100 %	0 %	0 %	56707119
32	NC_006529	A	7	7	11321	11327	100 %	0 %	0 %	0 %	56707119
33	NC_006529	A	7	7	11361	11367	100 %	0 %	0 %	0 %	56707119
34	NC_006529	A	6	6	11595	11600	100 %	0 %	0 %	0 %	56707120
35	NC_006529	T	6	6	11803	11808	0 %	100 %	0 %	0 %	56707121
36	NC_006529	A	6	6	11875	11880	100 %	0 %	0 %	0 %	56707121
37	NC_006529	T	6	6	13071	13076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006529	T	6	6	13093	13098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006529	T	7	7	13671	13677	0 %	100 %	0 %	0 %	56707125
40	NC_006529	A	7	7	13850	13856	100 %	0 %	0 %	0 %	56707125
41	NC_006529	T	8	8	14102	14109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006529	A	8	8	14335	14342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006529	T	7	7	14413	14419	0 %	100 %	0 %	0 %	56707126
44	NC_006529	T	6	6	14749	14754	0 %	100 %	0 %	0 %	56707126
45	NC_006529	T	6	6	15300	15305	0 %	100 %	0 %	0 %	56707126
46	NC_006529	T	7	7	15329	15335	0 %	100 %	0 %	0 %	56707126
47	NC_006529	A	6	6	17547	17552	100 %	0 %	0 %	0 %	56707130
48	NC_006529	A	6	6	18329	18334	100 %	0 %	0 %	0 %	56707132
49	NC_006529	A	6	6	18843	18848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.