MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1 plasmid pWCFS103

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006377	GAAA	2	8	891	898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006377	CTTT	2	8	1210	1217	0 %	75 %	0 %	25 %	54307187
3	NC_006377	TGTT	2	8	1493	1500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006377	GGTG	2	8	1761	1768	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006377	CTTG	2	8	2258	2265	0 %	50 %	25 %	25 %	54307188
6	NC_006377	GAAA	2	8	2711	2718	75 %	0 %	25 %	0 %	54307188
7	NC_006377	CAAA	2	8	2969	2976	75 %	0 %	0 %	25 %	54307189
8	NC_006377	TACA	2	8	3332	3339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_006377	CAAT	2	8	3394	3401	50 %	25 %	0 %	25 %	54307190
10	NC_006377	CCAC	2	8	3428	3435	25 %	0 %	0 %	75 %	54307190
11	NC_006377	TAAA	2	8	3727	3734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006377	ATTA	2	8	3781	3788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006377	TGCG	2	8	3841	3848	0 %	25 %	50 %	25 %	54307191
14	NC_006377	TTAT	2	8	4383	4390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006377	GAAG	2	8	4582	4589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006377	TCAT	2	8	5517	5524	25 %	50 %	0 %	25 %	54307193
17	NC_006377	AAGG	2	8	5899	5906	50 %	0 %	50 %	0 %	54307194
18	NC_006377	GTCC	2	8	6114	6121	0 %	25 %	25 %	50 %	54307195
19	NC_006377	CGAT	2	8	6330	6337	25 %	25 %	25 %	25 %	54307195
20	NC_006377	GCAA	2	8	6702	6709	50 %	0 %	25 %	25 %	54307196
21	NC_006377	TAAA	2	8	7361	7368	75 %	25 %	0 %	0 %	54307196
22	NC_006377	TCAA	2	8	8075	8082	50 %	25 %	0 %	25 %	54307196
23	NC_006377	TAAA	2	8	8233	8240	75 %	25 %	0 %	0 %	54307196
24	NC_006377	ATGT	2	8	9164	9171	25 %	50 %	25 %	0 %	54307197
25	NC_006377	CCAA	2	8	9730	9737	50 %	0 %	0 %	50 %	54307198
26	NC_006377	AATT	2	8	9740	9747	50 %	50 %	0 %	0 %	54307198
27	NC_006377	AAAT	2	8	9820	9827	75 %	25 %	0 %	0 %	54307198
28	NC_006377	AAAG	2	8	9993	10000	75 %	0 %	25 %	0 %	54307199
29	NC_006377	AAAT	2	8	10109	10116	75 %	25 %	0 %	0 %	54307199
30	NC_006377	AATT	2	8	10271	10278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006377	GAAA	2	8	10734	10741	75 %	0 %	25 %	0 %	54307200
32	NC_006377	AGGT	2	8	11083	11090	25 %	25 %	50 %	0 %	54307200
33	NC_006377	CGGC	2	8	11161	11168	0 %	0 %	50 %	50 %	54307200
34	NC_006377	CAGG	2	8	11367	11374	25 %	0 %	50 %	25 %	54307200
35	NC_006377	AATT	2	8	11684	11691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006377	GTTT	2	8	12561	12568	0 %	75 %	25 %	0 %	54307202
37	NC_006377	TGTT	2	8	12828	12835	0 %	75 %	25 %	0 %	54307202
38	NC_006377	ATGG	2	8	13294	13301	25 %	25 %	50 %	0 %	54307203
39	NC_006377	TGAT	2	8	13384	13391	25 %	50 %	25 %	0 %	54307203
40	NC_006377	TCCG	2	8	13600	13607	0 %	25 %	25 %	50 %	54307203
41	NC_006377	ACCA	2	8	13792	13799	50 %	0 %	0 %	50 %	54307203
42	NC_006377	TTGT	2	8	14152	14159	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006377	TTTA	2	8	14956	14963	25 %	75 %	0 %	0 %	54307206
44	NC_006377	TGGC	2	8	15959	15966	0 %	25 %	50 %	25 %	54307206
45	NC_006377	GTTC	2	8	16882	16889	0 %	50 %	25 %	25 %	54307207
46	NC_006377	AAAC	2	8	18161	18168	75 %	0 %	0 %	25 %	54307208
47	NC_006377	CTGA	2	8	18339	18346	25 %	25 %	25 %	25 %	54307209
48	NC_006377	CTGG	2	8	18724	18731	0 %	25 %	50 %	25 %	54307210
49	NC_006377	TGCT	2	8	20265	20272	0 %	50 %	25 %	25 %	54307211
50	NC_006377	GTTG	2	8	20578	20585	0 %	50 %	50 %	0 %	54307212
51	NC_006377	TTAA	2	8	20904	20911	50 %	50 %	0 %	0 %	54307212
52	NC_006377	TTTG	2	8	21521	21528	0 %	75 %	25 %	0 %	54307213
53	NC_006377	GGGT	2	8	21942	21949	0 %	25 %	75 %	0 %	54307214
54	NC_006377	GTTT	2	8	22309	22316	0 %	75 %	25 %	0 %	54307214
55	NC_006377	TGCT	2	8	23094	23101	0 %	50 %	25 %	25 %	54307215
56	NC_006377	TCGT	2	8	23387	23394	0 %	50 %	25 %	25 %	54307215
57	NC_006377	CTCA	2	8	23996	24003	25 %	25 %	0 %	50 %	54307215
58	NC_006377	TCCT	2	8	24120	24127	0 %	50 %	0 %	50 %	54307216
59	NC_006377	ACAA	2	8	24607	24614	75 %	0 %	0 %	25 %	54307216
60	NC_006377	CTTT	2	8	25456	25463	0 %	75 %	0 %	25 %	54307216
61	NC_006377	ATCA	2	8	25995	26002	50 %	25 %	0 %	25 %	54307216
62	NC_006377	TCTT	2	8	26067	26074	0 %	75 %	0 %	25 %	54307216
63	NC_006377	CATA	2	8	26668	26675	50 %	25 %	0 %	25 %	54307217
64	NC_006377	TAGT	2	8	27358	27365	25 %	50 %	25 %	0 %	54307219
65	NC_006377	CTGC	2	8	27527	27534	0 %	25 %	25 %	50 %	54307220
66	NC_006377	TCAC	2	8	27823	27830	25 %	25 %	0 %	50 %	54307220
67	NC_006377	ACCA	2	8	27878	27885	50 %	0 %	0 %	50 %	54307220
68	NC_006377	TGGC	2	8	27960	27967	0 %	25 %	50 %	25 %	54307220
69	NC_006377	CCCG	2	8	28156	28163	0 %	0 %	25 %	75 %	54307221
70	NC_006377	ATTT	2	8	28502	28509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006377	ATGC	2	8	28530	28537	25 %	25 %	25 %	25 %	54307222
72	NC_006377	TTTG	2	8	28811	28818	0 %	75 %	25 %	0 %	54307222
73	NC_006377	TTTA	2	8	29544	29551	25 %	75 %	0 %	0 %	54307222
74	NC_006377	TAAT	2	8	29636	29643	50 %	50 %	0 %	0 %	54307222
75	NC_006377	GCAT	2	8	29666	29673	25 %	25 %	25 %	25 %	54307222
76	NC_006377	CAAC	2	8	30044	30051	50 %	0 %	0 %	50 %	54307222
77	NC_006377	TTGC	2	8	30093	30100	0 %	50 %	25 %	25 %	54307222
78	NC_006377	TCTT	2	8	30358	30365	0 %	75 %	0 %	25 %	54307222
79	NC_006377	CTTT	2	8	31471	31478	0 %	75 %	0 %	25 %	54307225
80	NC_006377	CTTA	2	8	31581	31588	25 %	50 %	0 %	25 %	54307225
81	NC_006377	AAAC	2	8	32202	32209	75 %	0 %	0 %	25 %	54307226
82	NC_006377	GAGC	2	8	33026	33033	25 %	0 %	50 %	25 %	54307227
83	NC_006377	GATG	2	8	33517	33524	25 %	25 %	50 %	0 %	54307227
84	NC_006377	ATTC	2	8	33826	33833	25 %	50 %	0 %	25 %	54307227
85	NC_006377	GATT	2	8	35029	35036	25 %	50 %	25 %	0 %	54307227
86	NC_006377	TTGA	2	8	35093	35100	25 %	50 %	25 %	0 %	54307227
87	NC_006377	TAAA	2	8	35307	35314	75 %	25 %	0 %	0 %	54307227
88	NC_006377	AAAG	2	8	35699	35706	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.