MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Legionella pneumophila str. Lens

Total Repeats: 2928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006369	TCGTT	2	10	335	344	0 %	60 %	20 %	20 %	54292965
2	NC_006369	GTATT	2	10	750	759	20 %	60 %	20 %	0 %	54292965
3	NC_006369	TAAAG	2	10	1319	1328	60 %	20 %	20 %	0 %	54292965
4	NC_006369	AAAAC	2	10	1875	1884	80 %	0 %	0 %	20 %	54292966
5	NC_006369	TAAAG	2	10	5641	5650	60 %	20 %	20 %	0 %	54292968
6	NC_006369	GCCAT	2	10	7761	7770	20 %	20 %	20 %	40 %	54292969
7	NC_006369	TTTGA	2	10	9171	9180	20 %	60 %	20 %	0 %	54292970
8	NC_006369	CTTTC	2	10	10842	10851	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_006369	CGACC	2	10	17095	17104	20 %	0 %	20 %	60 %	54292977
10	NC_006369	GAATG	2	10	18914	18923	40 %	20 %	40 %	0 %	54292978
11	NC_006369	TTGGC	2	10	19287	19296	0 %	40 %	40 %	20 %	54292979
12	NC_006369	TATTT	2	10	20314	20323	20 %	80 %	0 %	0 %	54292980
13	NC_006369	TGGTA	2	10	25299	25308	20 %	40 %	40 %	0 %	54292984
14	NC_006369	CTATC	2	10	27583	27592	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_006369	TTATT	2	10	28301	28310	20 %	80 %	0 %	0 %	54292987
16	NC_006369	TTTTG	2	10	30328	30337	0 %	80 %	20 %	0 %	54292988
17	NC_006369	TTTTC	2	10	30858	30867	0 %	80 %	0 %	20 %	54292988
18	NC_006369	ATAAA	2	10	30903	30912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006369	ATACA	2	10	31594	31603	60 %	20 %	0 %	20 %	54292990
20	NC_006369	ACCTT	2	10	32369	32378	20 %	40 %	0 %	40 %	54292991
21	NC_006369	GTGAA	2	10	32882	32891	40 %	20 %	40 %	0 %	54292991
22	NC_006369	CATGA	2	10	34011	34020	40 %	20 %	20 %	20 %	54292992
23	NC_006369	AAAAT	2	10	34436	34445	80 %	20 %	0 %	0 %	54292992
24	NC_006369	GAACC	2	10	34978	34987	40 %	0 %	20 %	40 %	54292993
25	NC_006369	AAACC	2	10	36292	36301	60 %	0 %	0 %	40 %	54292994
26	NC_006369	GGATG	2	10	38693	38702	20 %	20 %	60 %	0 %	54292995
27	NC_006369	ATTTT	2	10	38936	38945	20 %	80 %	0 %	0 %	54292995
28	NC_006369	AGGCC	2	10	39583	39592	20 %	0 %	40 %	40 %	54292996
29	NC_006369	AATAA	2	10	40713	40722	80 %	20 %	0 %	0 %	54292996
30	NC_006369	GTTTT	2	10	41990	41999	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006369	ATGAA	2	10	42097	42106	60 %	20 %	20 %	0 %	54292998
32	NC_006369	TAAAA	2	10	43164	43173	80 %	20 %	0 %	0 %	54292999
33	NC_006369	GTTAA	2	10	45232	45241	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006369	GCTTT	2	10	46925	46934	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_006369	AGGTA	2	10	48114	48123	40 %	20 %	40 %	0 %	54293004
36	NC_006369	TGATT	2	10	49123	49132	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006369	TTGTT	2	10	50205	50214	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006369	ACCAT	2	10	52464	52473	40 %	20 %	0 %	40 %	54293010
39	NC_006369	GGCTC	2	10	53481	53490	0 %	20 %	40 %	40 %	54293012
40	NC_006369	TTATT	2	10	53758	53767	20 %	80 %	0 %	0 %	54293012
41	NC_006369	CTTTT	2	10	56673	56682	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_006369	ACATT	2	10	57114	57123	40 %	40 %	0 %	20 %	54293016
43	NC_006369	CCCCA	2	10	57448	57457	20 %	0 %	0 %	80 %	54293016
44	NC_006369	TTTAT	2	10	57890	57899	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006369	TATGC	2	10	60377	60386	20 %	40 %	20 %	20 %	54293019
46	NC_006369	AAGAA	2	10	61571	61580	80 %	0 %	20 %	0 %	54293021
47	NC_006369	GAGTT	2	10	62681	62690	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006369	GCTTT	2	10	62990	62999	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006369	ATTTG	2	10	63126	63135	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006369	TAAAG	2	10	64946	64955	60 %	20 %	20 %	0 %	54293023
51	NC_006369	GATAG	2	10	67932	67941	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006369	AGATG	2	10	69239	69248	40 %	20 %	40 %	0 %	54293026
53	NC_006369	TCTAC	2	10	69898	69907	20 %	40 %	0 %	40 %	54293026
54	NC_006369	TATGA	2	10	70695	70704	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006369	CTTCA	2	10	70754	70763	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_006369	GATTT	2	10	72351	72360	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006369	TATAA	2	10	74860	74869	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006369	CTTTT	2	10	74959	74968	0 %	80 %	0 %	20 %	54293030
59	NC_006369	TTCAA	2	10	75259	75268	40 %	40 %	0 %	20 %	54293030
60	NC_006369	TTTCA	2	10	77993	78002	20 %	60 %	0 %	20 %	54293033
61	NC_006369	ATGGC	2	10	78488	78497	20 %	20 %	40 %	20 %	54293033
62	NC_006369	AAAAT	2	10	82606	82615	80 %	20 %	0 %	0 %	54293035
63	NC_006369	TGGAT	2	10	83884	83893	20 %	40 %	40 %	0 %	54293036
64	NC_006369	CATTG	2	10	83917	83926	20 %	40 %	20 %	20 %	54293036
65	NC_006369	AGGAT	2	10	84310	84319	40 %	20 %	40 %	0 %	54293036
66	NC_006369	ATATA	2	10	84732	84741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006369	ATAAC	2	10	86406	86415	60 %	20 %	0 %	20 %	54293037
68	NC_006369	GCATT	2	10	89109	89118	20 %	40 %	20 %	20 %	54293039
69	NC_006369	CAAAT	2	10	89201	89210	60 %	20 %	0 %	20 %	54293039
70	NC_006369	TAATT	2	10	89654	89663	40 %	60 %	0 %	0 %	54293039
71	NC_006369	CGTTC	2	10	90036	90045	0 %	40 %	20 %	40 %	54293039
72	NC_006369	ATTTT	2	10	90488	90497	20 %	80 %	0 %	0 %	54293040
73	NC_006369	TTTTA	2	10	90730	90739	20 %	80 %	0 %	0 %	54293040
74	NC_006369	TGATA	2	10	91597	91606	40 %	40 %	20 %	0 %	54293042
75	NC_006369	GACAG	2	10	91728	91737	40 %	0 %	40 %	20 %	54293042
76	NC_006369	ATGCG	2	10	94791	94800	20 %	20 %	40 %	20 %	54293044
77	NC_006369	TTGAT	2	10	96321	96330	20 %	60 %	20 %	0 %	54293045
78	NC_006369	CGATG	2	10	99030	99039	20 %	20 %	40 %	20 %	54293048
79	NC_006369	GTTTT	2	10	99934	99943	0 %	80 %	20 %	0 %	54293048
80	NC_006369	GTTTG	2	10	100903	100912	0 %	60 %	40 %	0 %	54293049
81	NC_006369	ATATG	2	10	100920	100929	40 %	40 %	20 %	0 %	54293049
82	NC_006369	ATCAA	2	10	101791	101800	60 %	20 %	0 %	20 %	54293050
83	NC_006369	TGCTT	2	10	104310	104319	0 %	60 %	20 %	20 %	54293052
84	NC_006369	TTGGA	2	10	104846	104855	20 %	40 %	40 %	0 %	54293052
85	NC_006369	ATTTT	2	10	106506	106515	20 %	80 %	0 %	0 %	54293052
86	NC_006369	TGGAT	2	10	108345	108354	20 %	40 %	40 %	0 %	54293054
87	NC_006369	CAAGG	2	10	109132	109141	40 %	0 %	40 %	20 %	54293054
88	NC_006369	AAAAT	2	10	109282	109291	80 %	20 %	0 %	0 %	54293054
89	NC_006369	TTTGG	2	10	109621	109630	0 %	60 %	40 %	0 %	54293054
90	NC_006369	GAAAA	2	10	112599	112608	80 %	0 %	20 %	0 %	54293057
91	NC_006369	GCTTT	2	10	114165	114174	0 %	60 %	20 %	20 %	54293059
92	NC_006369	AAGCA	2	10	114359	114368	60 %	0 %	20 %	20 %	54293059
93	NC_006369	TTAAT	2	10	117523	117532	40 %	60 %	0 %	0 %	54293062
94	NC_006369	GAAGA	2	10	119367	119376	60 %	0 %	40 %	0 %	54293063
95	NC_006369	TGTTT	2	10	119678	119687	0 %	80 %	20 %	0 %	54293064
96	NC_006369	ATTAG	2	10	122674	122683	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006369	TCAAC	2	10	126837	126846	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_006369	GATTT	2	10	127058	127067	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006369	GATAA	2	10	127227	127236	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006369	CTTTT	2	10	130602	130611	0 %	80 %	0 %	20 %	54293074
101	NC_006369	AGCCA	2	10	132789	132798	40 %	0 %	20 %	40 %	54293074
102	NC_006369	CCAAT	2	10	133200	133209	40 %	20 %	0 %	40 %	54293074
103	NC_006369	TATTC	2	10	134048	134057	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_006369	TAAGA	2	10	134061	134070	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006369	TTTTC	2	10	134719	134728	0 %	80 %	0 %	20 %	54293075
106	NC_006369	CTTTT	2	10	135289	135298	0 %	80 %	0 %	20 %	54293075
107	NC_006369	GAAGC	2	10	135622	135631	40 %	0 %	40 %	20 %	54293075
108	NC_006369	TTGTT	2	10	136847	136856	0 %	80 %	20 %	0 %	54293077
109	NC_006369	CAGGG	2	10	137675	137684	20 %	0 %	60 %	20 %	54293078
110	NC_006369	ATATA	2	10	139156	139165	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006369	TAGAA	2	10	139362	139371	60 %	20 %	20 %	0 %	54293080
112	NC_006369	TTTTA	2	10	139578	139587	20 %	80 %	0 %	0 %	54293080
113	NC_006369	TTGTT	2	10	140143	140152	0 %	80 %	20 %	0 %	54293081
114	NC_006369	GTTTA	2	10	140502	140511	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006369	GATTA	2	10	140605	140614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006369	TGATT	2	10	141143	141152	20 %	60 %	20 %	0 %	54293082
117	NC_006369	CTATG	2	10	141817	141826	20 %	40 %	20 %	20 %	54293082
118	NC_006369	AATTT	2	10	141952	141961	40 %	60 %	0 %	0 %	54293082
119	NC_006369	TATTT	2	10	142013	142022	20 %	80 %	0 %	0 %	54293082
120	NC_006369	TAAGT	2	10	145519	145528	40 %	40 %	20 %	0 %	54293086
121	NC_006369	CCCAA	2	10	145806	145815	40 %	0 %	0 %	60 %	54293087
122	NC_006369	AAATT	2	10	148685	148694	60 %	40 %	0 %	0 %	54293087
123	NC_006369	TTGAT	2	10	149106	149115	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006369	AAGGC	2	10	154326	154335	40 %	0 %	40 %	20 %	54293092
125	NC_006369	AGCAG	2	10	154366	154375	40 %	0 %	40 %	20 %	54293092
126	NC_006369	TTTAT	2	10	155074	155083	20 %	80 %	0 %	0 %	54293092
127	NC_006369	TGAAG	2	10	155938	155947	40 %	20 %	40 %	0 %	54293092
128	NC_006369	ATTGC	2	10	155992	156001	20 %	40 %	20 %	20 %	54293092
129	NC_006369	TTTTA	2	10	156977	156986	20 %	80 %	0 %	0 %	54293093
130	NC_006369	CAAAT	2	10	157934	157943	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_006369	GCAAT	2	10	158546	158555	40 %	20 %	20 %	20 %	54293095
132	NC_006369	AGATA	2	10	159064	159073	60 %	20 %	20 %	0 %	54293096
133	NC_006369	ACCAA	2	10	159113	159122	60 %	0 %	0 %	40 %	54293096
134	NC_006369	AAAGC	2	10	162143	162152	60 %	0 %	20 %	20 %	54293097
135	NC_006369	ATGCC	2	10	163079	163088	20 %	20 %	20 %	40 %	54293097
136	NC_006369	TTGGC	2	10	163397	163406	0 %	40 %	40 %	20 %	54293097
137	NC_006369	ATCCG	2	10	164303	164312	20 %	20 %	20 %	40 %	54293097
138	NC_006369	ATTGA	2	10	165718	165727	40 %	40 %	20 %	0 %	54293098
139	NC_006369	CAATT	2	10	166603	166612	40 %	40 %	0 %	20 %	54293098
140	NC_006369	GCAGG	2	10	167352	167361	20 %	0 %	60 %	20 %	54293099
141	NC_006369	TCGCA	2	10	168471	168480	20 %	20 %	20 %	40 %	54293100
142	NC_006369	ATGCC	2	10	168952	168961	20 %	20 %	20 %	40 %	54293100
143	NC_006369	AGCCG	2	10	170127	170136	20 %	0 %	40 %	40 %	54293101
144	NC_006369	ATTTG	2	10	170593	170602	20 %	60 %	20 %	0 %	54293101
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148	NC_006369	ATGAA	2	10	176170	176179	60 %	20 %	20 %	0 %	54293104
149	NC_006369	AGAGA	2	10	177204	177213	60 %	0 %	40 %	0 %	54293104
150	NC_006369	AATTA	2	10	179256	179265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006369	CTTTA	2	10	180153	180162	20 %	60 %	0 %	20 %	54293106
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159	NC_006369	GGTTA	2	10	196752	196761	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_006369	ATGAG	2	10	213136	213145	40 %	20 %	40 %	0 %	54293145
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183	NC_006369	GCTTT	2	10	235723	235732	0 %	60 %	20 %	20 %	54293162
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193	NC_006369	TCTTT	2	10	250727	250736	0 %	80 %	0 %	20 %	54293177
194	NC_006369	AAGGA	2	10	250894	250903	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
195	NC_006369	CAATC	2	10	251387	251396	40 %	20 %	0 %	40 %	54293178
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198	NC_006369	TAAAA	2	10	253073	253082	80 %	20 %	0 %	0 %	54293180
199	NC_006369	AACAA	2	10	253497	253506	80 %	0 %	0 %	20 %	54293180
200	NC_006369	TGAAA	2	10	253863	253872	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
201	NC_006369	GAAAG	2	10	255106	255115	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
202	NC_006369	TTTTA	2	10	255211	255220	20 %	80 %	0 %	0 %	54293182
203	NC_006369	AAAAT	2	10	255549	255558	80 %	20 %	0 %	0 %	54293182
204	NC_006369	AACCA	2	10	256073	256082	60 %	0 %	0 %	40 %	54293183
205	NC_006369	TTAAT	2	10	256644	256653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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213	NC_006369	AAGGG	2	10	264339	264348	40 %	0 %	60 %	0 %	54293192
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219	NC_006369	TAAAA	2	10	276360	276369	80 %	20 %	0 %	0 %	54293201
220	NC_006369	TTAAT	2	10	277214	277223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
221	NC_006369	TTAAT	2	10	279780	279789	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_006369	TCTGC	2	10	279858	279867	0 %	40 %	20 %	40 %	54293203
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229	NC_006369	TATTT	2	10	284651	284660	20 %	80 %	0 %	0 %	54293207
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241	NC_006369	TTCTT	2	10	299380	299389	0 %	80 %	0 %	20 %	54293218
242	NC_006369	ATTTT	2	10	307062	307071	20 %	80 %	0 %	0 %	54293227
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244	NC_006369	AAAAT	2	10	310557	310566	80 %	20 %	0 %	0 %	54293230
245	NC_006369	GGTTT	2	10	312035	312044	0 %	60 %	40 %	0 %	54293231
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247	NC_006369	GAAAT	2	10	313329	313338	60 %	20 %	20 %	0 %	54293232
248	NC_006369	CAAGT	2	10	313527	313536	40 %	20 %	20 %	20 %	54293232
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250	NC_006369	AAGAT	2	10	315796	315805	60 %	20 %	20 %	0 %	54293234
251	NC_006369	CTGTT	2	10	315832	315841	0 %	60 %	20 %	20 %	54293234
252	NC_006369	TAAAA	2	10	317780	317789	80 %	20 %	0 %	0 %	54293235
253	NC_006369	CATTG	2	10	321640	321649	20 %	40 %	20 %	20 %	54293237
254	NC_006369	CATAG	2	10	323532	323541	40 %	20 %	20 %	20 %	54293240
255	NC_006369	CAGGT	2	10	324384	324393	20 %	20 %	40 %	20 %	54293240
256	NC_006369	ATTTA	2	10	324780	324789	40 %	60 %	0 %	0 %	54293240
257	NC_006369	AATAT	2	10	329203	329212	60 %	40 %	0 %	0 %	54293242
258	NC_006369	AGCCA	2	10	329943	329952	40 %	0 %	20 %	40 %	54293242
259	NC_006369	GCGTT	2	10	330400	330409	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
260	NC_006369	CCTTA	2	10	331097	331106	20 %	40 %	0 %	40 %	54293243
261	NC_006369	TGATT	2	10	331482	331491	20 %	60 %	20 %	0 %	54293244
262	NC_006369	TGGAA	2	10	332277	332286	40 %	20 %	40 %	0 %	54293244
263	NC_006369	ACTAA	2	10	332720	332729	60 %	20 %	0 %	20 %	54293244
264	NC_006369	AATCC	2	10	333490	333499	40 %	20 %	0 %	40 %	54293245
265	NC_006369	ATTCC	2	10	334425	334434	20 %	40 %	0 %	40 %	54293246
266	NC_006369	AAAAT	2	10	335102	335111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_006369	ACTTT	2	10	337338	337347	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
268	NC_006369	AAATC	2	10	338489	338498	60 %	20 %	0 %	20 %	54293250
269	NC_006369	CCATT	2	10	339722	339731	20 %	40 %	0 %	40 %	54293250
270	NC_006369	TTTCT	2	10	341046	341055	0 %	80 %	0 %	20 %	54293251
271	NC_006369	CCCGT	2	10	342789	342798	0 %	20 %	20 %	60 %	54293251
272	NC_006369	ATTTA	2	10	344057	344066	40 %	60 %	0 %	0 %	54293252
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274	NC_006369	ATTAA	2	10	345919	345928	60 %	40 %	0 %	0 %	54293255
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497	NC_006369	AGATT	2	10	601961	601970	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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