MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006366	AG	3	6	488	493	50 %	0 %	50 %	0 %	54292908
2	NC_006366	AG	3	6	2752	2757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006366	AT	3	6	2861	2866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006366	GA	3	6	3798	3803	50 %	0 %	50 %	0 %	54292910
5	NC_006366	AT	3	6	3910	3915	50 %	50 %	0 %	0 %	54292910
6	NC_006366	TC	3	6	5128	5133	0 %	50 %	0 %	50 %	54292911
7	NC_006366	GA	3	6	5198	5203	50 %	0 %	50 %	0 %	54292911
8	NC_006366	CA	3	6	6167	6172	50 %	0 %	0 %	50 %	54292912
9	NC_006366	AT	4	8	6727	6734	50 %	50 %	0 %	0 %	54292912
10	NC_006366	GT	3	6	7354	7359	0 %	50 %	50 %	0 %	54292913
11	NC_006366	GA	4	8	7621	7628	50 %	0 %	50 %	0 %	54292913
12	NC_006366	TA	4	8	8419	8426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006366	TA	3	6	8432	8437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006366	GA	5	10	9539	9548	50 %	0 %	50 %	0 %	54292915
15	NC_006366	GA	3	6	11258	11263	50 %	0 %	50 %	0 %	54292917
16	NC_006366	AG	3	6	11666	11671	50 %	0 %	50 %	0 %	54292917
17	NC_006366	GC	3	6	12709	12714	0 %	0 %	50 %	50 %	54292920
18	NC_006366	GA	3	6	12996	13001	50 %	0 %	50 %	0 %	54292920
19	NC_006366	CG	3	6	13084	13089	0 %	0 %	50 %	50 %	54292920
20	NC_006366	GT	3	6	13914	13919	0 %	50 %	50 %	0 %	54292922
21	NC_006366	GA	3	6	13932	13937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006366	CG	3	6	14988	14993	0 %	0 %	50 %	50 %	54292924
23	NC_006366	TC	3	6	16875	16880	0 %	50 %	0 %	50 %	54292926
24	NC_006366	GC	3	6	17503	17508	0 %	0 %	50 %	50 %	54292926
25	NC_006366	GT	3	6	19013	19018	0 %	50 %	50 %	0 %	54292926
26	NC_006366	CA	3	6	19081	19086	50 %	0 %	0 %	50 %	54292926
27	NC_006366	CA	3	6	20015	20020	50 %	0 %	0 %	50 %	54292928
28	NC_006366	AG	3	6	21526	21531	50 %	0 %	50 %	0 %	54292930
29	NC_006366	CA	3	6	22442	22447	50 %	0 %	0 %	50 %	54292931
30	NC_006366	AG	3	6	22643	22648	50 %	0 %	50 %	0 %	54292931
31	NC_006366	TA	3	6	25002	25007	50 %	50 %	0 %	0 %	54292934
32	NC_006366	AG	3	6	25448	25453	50 %	0 %	50 %	0 %	54292934
33	NC_006366	CA	3	6	25990	25995	50 %	0 %	0 %	50 %	54292934
34	NC_006366	CT	3	6	26722	26727	0 %	50 %	0 %	50 %	54292935
35	NC_006366	TC	3	6	27399	27404	0 %	50 %	0 %	50 %	54292935
36	NC_006366	GA	3	6	28284	28289	50 %	0 %	50 %	0 %	54292935
37	NC_006366	TC	3	6	30967	30972	0 %	50 %	0 %	50 %	54292937
38	NC_006366	CT	3	6	31589	31594	0 %	50 %	0 %	50 %	54292938
39	NC_006366	AC	3	6	33449	33454	50 %	0 %	0 %	50 %	54292938
40	NC_006366	AG	3	6	34671	34676	50 %	0 %	50 %	0 %	54292939
41	NC_006366	GT	3	6	34964	34969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006366	AC	3	6	35934	35939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_006366	AC	3	6	35943	35948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_006366	AG	3	6	36564	36569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006366	AG	3	6	36646	36651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006366	AT	3	6	36689	36694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006366	CT	3	6	37126	37131	0 %	50 %	0 %	50 %	54292943
48	NC_006366	GT	3	6	38362	38367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006366	AC	3	6	38490	38495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_006366	CA	3	6	40027	40032	50 %	0 %	0 %	50 %	54292946
51	NC_006366	TA	3	6	40486	40491	50 %	50 %	0 %	0 %	54292946
52	NC_006366	TA	3	6	41213	41218	50 %	50 %	0 %	0 %	54292947
53	NC_006366	TA	3	6	41481	41486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006366	TA	3	6	41717	41722	50 %	50 %	0 %	0 %	54292948
55	NC_006366	GA	4	8	42567	42574	50 %	0 %	50 %	0 %	54292949
56	NC_006366	AG	3	6	43107	43112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006366	AC	3	6	44082	44087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_006366	AT	3	6	44392	44397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006366	AT	3	6	46851	46856	50 %	50 %	0 %	0 %	54292953
60	NC_006366	AT	3	6	47248	47253	50 %	50 %	0 %	0 %	54292953
61	NC_006366	TA	3	6	49427	49432	50 %	50 %	0 %	0 %	54292956
62	NC_006366	CA	3	6	49438	49443	50 %	0 %	0 %	50 %	54292956
63	NC_006366	CT	3	6	49877	49882	0 %	50 %	0 %	50 %	54292956
64	NC_006366	AT	3	6	50401	50406	50 %	50 %	0 %	0 %	54292956
65	NC_006366	TA	3	6	50540	50545	50 %	50 %	0 %	0 %	54292957
66	NC_006366	TG	3	6	50857	50862	0 %	50 %	50 %	0 %	54292957
67	NC_006366	AT	3	6	54235	54240	50 %	50 %	0 %	0 %	54292958
68	NC_006366	AT	3	6	54549	54554	50 %	50 %	0 %	0 %	54292958
69	NC_006366	TG	3	6	54681	54686	0 %	50 %	50 %	0 %	54292958
70	NC_006366	AT	3	6	55074	55079	50 %	50 %	0 %	0 %	54292959
71	NC_006366	CT	3	6	56130	56135	0 %	50 %	0 %	50 %	54292960
72	NC_006366	TA	3	6	56445	56450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006366	AT	3	6	56567	56572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006366	GT	3	6	56974	56979	0 %	50 %	50 %	0 %	54292961
75	NC_006366	CA	3	6	59376	59381	50 %	0 %	0 %	50 %	54292963
76	NC_006366	AT	3	6	59653	59658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006366	TA	3	6	59681	59686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006366	AT	3	6	59734	59739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006366	TA	3	6	59773	59778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.