MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006366	TCAT	2	8	119	126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006366	ATTG	2	8	616	623	25 %	50 %	25 %	0 %	54292908
3	NC_006366	TAAA	2	8	1011	1018	75 %	25 %	0 %	0 %	54292908
4	NC_006366	ACGA	2	8	1290	1297	50 %	0 %	25 %	25 %	54292908
5	NC_006366	AACA	2	8	1601	1608	75 %	0 %	0 %	25 %	54292909
6	NC_006366	ATCA	2	8	1612	1619	50 %	25 %	0 %	25 %	54292909
7	NC_006366	CAAT	3	12	1742	1753	50 %	25 %	0 %	25 %	54292909
8	NC_006366	ACAA	2	8	1788	1795	75 %	0 %	0 %	25 %	54292909
9	NC_006366	TTTA	2	8	3070	3077	25 %	75 %	0 %	0 %	54292910
10	NC_006366	TTTC	2	8	3480	3487	0 %	75 %	0 %	25 %	54292910
11	NC_006366	ATTT	2	8	3535	3542	25 %	75 %	0 %	0 %	54292910
12	NC_006366	TTGG	2	8	3710	3717	0 %	50 %	50 %	0 %	54292910
13	NC_006366	AAGA	2	8	4016	4023	75 %	0 %	25 %	0 %	54292910
14	NC_006366	ATTT	2	8	4052	4059	25 %	75 %	0 %	0 %	54292910
15	NC_006366	TTTC	2	8	5184	5191	0 %	75 %	0 %	25 %	54292911
16	NC_006366	ATTT	2	8	5385	5392	25 %	75 %	0 %	0 %	54292911
17	NC_006366	AGTT	2	8	5460	5467	25 %	50 %	25 %	0 %	54292911
18	NC_006366	TTAA	2	8	5539	5546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006366	TTTA	2	8	5743	5750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006366	TTAA	2	8	5883	5890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006366	TTAA	2	8	6462	6469	50 %	50 %	0 %	0 %	54292912
22	NC_006366	ATTG	2	8	7509	7516	25 %	50 %	25 %	0 %	54292913
23	NC_006366	AAGA	2	8	7651	7658	75 %	0 %	25 %	0 %	54292913
24	NC_006366	TTTG	2	8	7740	7747	0 %	75 %	25 %	0 %	54292913
25	NC_006366	CAAT	2	8	7840	7847	50 %	25 %	0 %	25 %	54292913
26	NC_006366	ATGA	2	8	7918	7925	50 %	25 %	25 %	0 %	54292913
27	NC_006366	TTGT	2	8	8036	8043	0 %	75 %	25 %	0 %	54292913
28	NC_006366	AAAC	2	8	8130	8137	75 %	0 %	0 %	25 %	54292913
29	NC_006366	AAAT	2	8	8255	8262	75 %	25 %	0 %	0 %	54292913
30	NC_006366	ATAA	2	8	8409	8416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006366	AATC	2	8	8518	8525	50 %	25 %	0 %	25 %	54292914
32	NC_006366	TTTA	2	8	8908	8915	25 %	75 %	0 %	0 %	54292915
33	NC_006366	AATG	2	8	9407	9414	50 %	25 %	25 %	0 %	54292915
34	NC_006366	TGCA	2	8	9418	9425	25 %	25 %	25 %	25 %	54292915
35	NC_006366	GTCT	2	8	9723	9730	0 %	50 %	25 %	25 %	54292915
36	NC_006366	TAAA	2	8	10478	10485	75 %	25 %	0 %	0 %	54292916
37	NC_006366	CACT	2	8	10505	10512	25 %	25 %	0 %	50 %	54292916
38	NC_006366	TAAT	2	8	10562	10569	50 %	50 %	0 %	0 %	54292916
39	NC_006366	AATA	2	8	11200	11207	75 %	25 %	0 %	0 %	54292917
40	NC_006366	TTAA	2	8	11309	11316	50 %	50 %	0 %	0 %	54292917
41	NC_006366	TTTA	2	8	11364	11371	25 %	75 %	0 %	0 %	54292917
42	NC_006366	CAAA	2	8	12587	12594	75 %	0 %	0 %	25 %	54292920
43	NC_006366	TGGG	2	8	12817	12824	0 %	25 %	75 %	0 %	54292920
44	NC_006366	TCAA	2	8	12881	12888	50 %	25 %	0 %	25 %	54292920
45	NC_006366	GTGG	2	8	12903	12910	0 %	25 %	75 %	0 %	54292920
46	NC_006366	TTTA	2	8	14050	14057	25 %	75 %	0 %	0 %	54292923
47	NC_006366	GCCA	2	8	14210	14217	25 %	0 %	25 %	50 %	54292923
48	NC_006366	ACTG	2	8	14356	14363	25 %	25 %	25 %	25 %	54292923
49	NC_006366	AGCG	2	8	15985	15992	25 %	0 %	50 %	25 %	54292925
50	NC_006366	AGGT	2	8	16343	16350	25 %	25 %	50 %	0 %	54292925
51	NC_006366	CAAA	2	8	16808	16815	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_006366	TGAA	2	8	17040	17047	50 %	25 %	25 %	0 %	54292926
53	NC_006366	AAAT	2	8	17152	17159	75 %	25 %	0 %	0 %	54292926
54	NC_006366	ATTT	2	8	17733	17740	25 %	75 %	0 %	0 %	54292926
55	NC_006366	CTTG	2	8	17746	17753	0 %	50 %	25 %	25 %	54292926
56	NC_006366	TTCA	2	8	17788	17795	25 %	50 %	0 %	25 %	54292926
57	NC_006366	CCAT	2	8	17894	17901	25 %	25 %	0 %	50 %	54292926
58	NC_006366	TACC	2	8	17967	17974	25 %	25 %	0 %	50 %	54292926
59	NC_006366	CCTT	2	8	18109	18116	0 %	50 %	0 %	50 %	54292926
60	NC_006366	TTTA	2	8	18270	18277	25 %	75 %	0 %	0 %	54292926
61	NC_006366	TCTT	2	8	18353	18360	0 %	75 %	0 %	25 %	54292926
62	NC_006366	AGCA	2	8	18363	18370	50 %	0 %	25 %	25 %	54292926
63	NC_006366	TGGT	2	8	18450	18457	0 %	50 %	50 %	0 %	54292926
64	NC_006366	AAGT	2	8	19359	19366	50 %	25 %	25 %	0 %	54292926
65	NC_006366	CAAA	2	8	19425	19432	75 %	0 %	0 %	25 %	54292926
66	NC_006366	ATTC	2	8	19572	19579	25 %	50 %	0 %	25 %	54292927
67	NC_006366	ATTT	2	8	20286	20293	25 %	75 %	0 %	0 %	54292928
68	NC_006366	CAGG	2	8	20298	20305	25 %	0 %	50 %	25 %	54292928
69	NC_006366	TCAT	2	8	20374	20381	25 %	50 %	0 %	25 %	54292928
70	NC_006366	CCAG	2	8	20608	20615	25 %	0 %	25 %	50 %	54292929
71	NC_006366	TGGT	2	8	20759	20766	0 %	50 %	50 %	0 %	54292929
72	NC_006366	CTGA	2	8	21121	21128	25 %	25 %	25 %	25 %	54292929
73	NC_006366	ATTG	2	8	21427	21434	25 %	50 %	25 %	0 %	54292930
74	NC_006366	TGAG	2	8	21582	21589	25 %	25 %	50 %	0 %	54292930
75	NC_006366	AAGC	2	8	21613	21620	50 %	0 %	25 %	25 %	54292930
76	NC_006366	GTGC	2	8	22092	22099	0 %	25 %	50 %	25 %	54292931
77	NC_006366	CTGT	2	8	22530	22537	0 %	50 %	25 %	25 %	54292931
78	NC_006366	ACCA	2	8	23457	23464	50 %	0 %	0 %	50 %	54292931
79	NC_006366	AAAG	2	8	23587	23594	75 %	0 %	25 %	0 %	54292932
80	NC_006366	CTAA	2	8	24318	24325	50 %	25 %	0 %	25 %	54292933
81	NC_006366	GATT	2	8	24412	24419	25 %	50 %	25 %	0 %	54292933
82	NC_006366	ATTA	2	8	24600	24607	50 %	50 %	0 %	0 %	54292933
83	NC_006366	TAAA	2	8	25392	25399	75 %	25 %	0 %	0 %	54292934
84	NC_006366	AGGT	2	8	26016	26023	25 %	25 %	50 %	0 %	54292934
85	NC_006366	TTAC	2	8	26479	26486	25 %	50 %	0 %	25 %	54292935
86	NC_006366	AATG	2	8	26592	26599	50 %	25 %	25 %	0 %	54292935
87	NC_006366	TTTG	2	8	26841	26848	0 %	75 %	25 %	0 %	54292935
88	NC_006366	CAGC	2	8	27503	27510	25 %	0 %	25 %	50 %	54292935
89	NC_006366	CAGC	2	8	28298	28305	25 %	0 %	25 %	50 %	54292935
90	NC_006366	TCAT	2	8	28371	28378	25 %	50 %	0 %	25 %	54292935
91	NC_006366	CAAT	2	8	28681	28688	50 %	25 %	0 %	25 %	54292935
92	NC_006366	AATG	2	8	28812	28819	50 %	25 %	25 %	0 %	54292935
93	NC_006366	AAGC	2	8	28952	28959	50 %	0 %	25 %	25 %	54292936
94	NC_006366	TTTG	2	8	29329	29336	0 %	75 %	25 %	0 %	54292936
95	NC_006366	TGGT	2	8	29754	29761	0 %	50 %	50 %	0 %	54292937
96	NC_006366	GATC	2	8	30495	30502	25 %	25 %	25 %	25 %	54292937
97	NC_006366	GTTT	2	8	32118	32125	0 %	75 %	25 %	0 %	54292938
98	NC_006366	AGAT	2	8	32392	32399	50 %	25 %	25 %	0 %	54292938
99	NC_006366	AGAA	2	8	32515	32522	75 %	0 %	25 %	0 %	54292938
100	NC_006366	TTAT	2	8	32553	32560	25 %	75 %	0 %	0 %	54292938
101	NC_006366	CAAT	2	8	32579	32586	50 %	25 %	0 %	25 %	54292938
102	NC_006366	TATT	2	8	33075	33082	25 %	75 %	0 %	0 %	54292938
103	NC_006366	CTTT	2	8	33401	33408	0 %	75 %	0 %	25 %	54292938
104	NC_006366	TGAT	2	8	33711	33718	25 %	50 %	25 %	0 %	54292938
105	NC_006366	GAAC	2	8	33788	33795	50 %	0 %	25 %	25 %	54292938
106	NC_006366	TGGT	2	8	33831	33838	0 %	50 %	50 %	0 %	54292938
107	NC_006366	ACTA	2	8	34013	34020	50 %	25 %	0 %	25 %	54292938
108	NC_006366	CGAA	2	8	34188	34195	50 %	0 %	25 %	25 %	54292938
109	NC_006366	AATT	2	8	34230	34237	50 %	50 %	0 %	0 %	54292938
110	NC_006366	ATCA	2	8	34518	34525	50 %	25 %	0 %	25 %	54292939
111	NC_006366	TAAA	2	8	34923	34930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006366	TGAT	2	8	35067	35074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006366	AATT	2	8	35286	35293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006366	GTTA	2	8	35614	35621	25 %	50 %	25 %	0 %	54292940
115	NC_006366	TTAA	2	8	36272	36279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006366	AACT	2	8	36988	36995	50 %	25 %	0 %	25 %	54292943
117	NC_006366	TTGG	2	8	37450	37457	0 %	50 %	50 %	0 %	54292943
118	NC_006366	CAAA	2	8	37608	37615	75 %	0 %	0 %	25 %	54292943
119	NC_006366	AAAC	2	8	38118	38125	75 %	0 %	0 %	25 %	54292944
120	NC_006366	CATC	2	8	38149	38156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_006366	CAAG	2	8	38795	38802	50 %	0 %	25 %	25 %	54292945
122	NC_006366	AATC	2	8	39015	39022	50 %	25 %	0 %	25 %	54292945
123	NC_006366	CATT	2	8	39119	39126	25 %	50 %	0 %	25 %	54292945
124	NC_006366	TAAT	2	8	39658	39665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006366	AATT	2	8	39719	39726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006366	TTTA	2	8	39842	39849	25 %	75 %	0 %	0 %	54292946
127	NC_006366	AATT	2	8	40384	40391	50 %	50 %	0 %	0 %	54292946
128	NC_006366	AATG	2	8	40499	40506	50 %	25 %	25 %	0 %	54292946
129	NC_006366	CTAA	2	8	41298	41305	50 %	25 %	0 %	25 %	54292947
130	NC_006366	AAAT	2	8	41788	41795	75 %	25 %	0 %	0 %	54292948
131	NC_006366	AATT	2	8	41874	41881	50 %	50 %	0 %	0 %	54292948
132	NC_006366	CAGC	2	8	41936	41943	25 %	0 %	25 %	50 %	54292948
133	NC_006366	CAAT	2	8	42138	42145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_006366	ATTA	2	8	42559	42566	50 %	50 %	0 %	0 %	54292949
135	NC_006366	CAAT	2	8	42751	42758	50 %	25 %	0 %	25 %	54292949
136	NC_006366	TAAA	2	8	42887	42894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006366	ATTT	2	8	43063	43070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006366	TTAT	2	8	43133	43140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006366	AGAA	2	8	44029	44036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006366	TTTA	2	8	44875	44882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006366	TACC	2	8	44931	44938	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_006366	ATAC	2	8	45532	45539	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_006366	ATTA	2	8	45962	45969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006366	TTAA	2	8	46929	46936	50 %	50 %	0 %	0 %	54292953
145	NC_006366	CATT	2	8	47203	47210	25 %	50 %	0 %	25 %	54292953
146	NC_006366	TATC	2	8	47513	47520	25 %	50 %	0 %	25 %	54292954
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185	NC_006366	ATTC	2	8	59455	59462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.