MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 48436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006087	AAT	2	6	120	125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006087	CAT	2	6	344	349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953926
3	NC_006087	GAT	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50953926
4	NC_006087	AGC	2	6	403	408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953926
5	NC_006087	CTC	2	6	423	428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50953926
6	NC_006087	ACA	2	6	448	453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953926
7	NC_006087	TCG	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953926
8	NC_006087	CAG	2	6	498	503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953926
9	NC_006087	CAC	2	6	577	582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50953926
10	NC_006087	CGC	2	6	683	688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953926
11	NC_006087	CCT	2	6	770	775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50953926
12	NC_006087	GAG	2	6	840	845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953926
13	NC_006087	TCA	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953926
14	NC_006087	CAA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953926
15	NC_006087	TTC	2	6	978	983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50953926
16	NC_006087	CAA	2	6	1010	1015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953926
17	NC_006087	GAC	2	6	1185	1190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953926
18	NC_006087	CGA	3	9	1337	1345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953926
19	NC_006087	CAT	2	6	1367	1372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953926
20	NC_006087	AAG	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953926
21	NC_006087	GCG	2	6	1583	1588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953926
22	NC_006087	ACC	2	6	1636	1641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50953926
23	NC_006087	TTA	2	6	1733	1738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006087	GTC	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006087	GAG	2	6	1811	1816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006087	CGC	2	6	1839	1844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_006087	TTG	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006087	CAG	2	6	2068	2073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006087	GAA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953927
30	NC_006087	GCT	2	6	2298	2303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953927
31	NC_006087	AGA	2	6	2352	2357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953927
32	NC_006087	ATC	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953927
33	NC_006087	GCT	2	6	2397	2402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953927
34	NC_006087	GGA	2	6	2415	2420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953927
35	NC_006087	GCG	2	6	2444	2449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953927
36	NC_006087	CAG	2	6	2465	2470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953927
37	NC_006087	ACA	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953927
38	NC_006087	CGA	2	6	2742	2747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953927
39	NC_006087	CCG	2	6	2823	2828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953927
40	NC_006087	TGA	2	6	2861	2866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50953927
41	NC_006087	CCG	2	6	2870	2875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953927
42	NC_006087	GGT	2	6	3033	3038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50953927
43	NC_006087	TCA	2	6	3146	3151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953927
44	NC_006087	CAA	2	6	3301	3306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953928
45	NC_006087	GAA	2	6	3325	3330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953928
46	NC_006087	CGG	2	6	3363	3368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953928
47	NC_006087	CGC	2	6	3400	3405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953928
48	NC_006087	CTG	2	6	3485	3490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953928
49	NC_006087	CGG	2	6	3514	3519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953928
50	NC_006087	CGC	2	6	3550	3555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953928
51	NC_006087	GCT	2	6	3556	3561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953928
52	NC_006087	CGG	2	6	3643	3648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953928
53	NC_006087	CTC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50953928
54	NC_006087	GAG	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953928
55	NC_006087	AAC	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953928
56	NC_006087	CGC	2	6	4102	4107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953928
57	NC_006087	CGG	2	6	4123	4128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953928
58	NC_006087	CCT	2	6	4155	4160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50953929
59	NC_006087	TCG	2	6	4242	4247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953929
60	NC_006087	GTC	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953929
61	NC_006087	GTT	2	6	4501	4506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50953929
62	NC_006087	GGA	2	6	4513	4518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953929
63	NC_006087	CCG	2	6	4549	4554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953929
64	NC_006087	CTC	2	6	4571	4576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50953929
65	NC_006087	CTG	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953929
66	NC_006087	TCA	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953929
67	NC_006087	ATC	2	6	4818	4823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953929
68	NC_006087	GCT	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953929
69	NC_006087	GCG	2	6	4854	4859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953929
70	NC_006087	CGA	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953929
71	NC_006087	CCG	2	6	5110	5115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953929
72	NC_006087	ACC	2	6	5198	5203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50953929
73	NC_006087	TCA	2	6	5226	5231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953929
74	NC_006087	CGG	2	6	5232	5237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953929
75	NC_006087	CGT	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953929
76	NC_006087	GAG	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953930
77	NC_006087	GAC	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953930
78	NC_006087	GTC	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006087	TCG	2	6	6065	6070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953931
80	NC_006087	ACA	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953931
81	NC_006087	TGA	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50953931
82	NC_006087	AGA	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953931
83	NC_006087	GGA	2	6	6238	6243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953931
84	NC_006087	CGG	2	6	6249	6254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953931
85	NC_006087	GGC	2	6	6256	6261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953931
86	NC_006087	CGG	2	6	6273	6278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953931
87	NC_006087	GTG	2	6	6301	6306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50953931
88	NC_006087	CCG	2	6	6339	6344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953931
89	NC_006087	GGC	2	6	6359	6364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953931
90	NC_006087	GAG	2	6	6409	6414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953931
91	NC_006087	TCT	2	6	6440	6445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50953931
92	NC_006087	CAG	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953931
93	NC_006087	CAA	2	6	6525	6530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953931
94	NC_006087	GAA	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953931
95	NC_006087	ATC	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953931
96	NC_006087	GGA	2	6	6711	6716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953931
97	NC_006087	GAC	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953931
98	NC_006087	GAA	2	6	6826	6831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953931
99	NC_006087	GAA	2	6	6879	6884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953931
100	NC_006087	CGA	2	6	6918	6923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953931
101	NC_006087	ATC	2	6	7093	7098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953931
102	NC_006087	CGC	2	6	7131	7136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953931
103	NC_006087	CTG	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953931
104	NC_006087	GCG	2	6	7181	7186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953931
105	NC_006087	TCG	2	6	7247	7252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953931
106	NC_006087	GAA	2	6	7286	7291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953931
107	NC_006087	AAC	2	6	7372	7377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953931
108	NC_006087	GAT	2	6	7389	7394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50953931
109	NC_006087	CTG	2	6	7504	7509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953931
110	NC_006087	GCT	2	6	7515	7520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953931
111	NC_006087	GCC	2	6	7572	7577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953931
112	NC_006087	CGC	2	6	7662	7667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953931
113	NC_006087	ACC	2	6	7747	7752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50953931
114	NC_006087	CGA	2	6	7791	7796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953931
115	NC_006087	CGA	2	6	7809	7814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953931
116	NC_006087	CAC	2	6	7821	7826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50953931
117	NC_006087	AGA	2	6	7868	7873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953931
118	NC_006087	TGA	2	6	7918	7923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006087	CGA	2	6	7954	7959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953932
120	NC_006087	TCA	2	6	8058	8063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953932
121	NC_006087	CGC	2	6	8111	8116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953932
122	NC_006087	CGG	2	6	8137	8142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953932
123	NC_006087	ACG	2	6	8316	8321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953932
124	NC_006087	GCC	2	6	8327	8332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953932
125	NC_006087	CGA	2	6	8389	8394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953932
126	NC_006087	ACG	2	6	8421	8426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953932
127	NC_006087	CTG	2	6	8471	8476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953932
128	NC_006087	CCA	2	6	8511	8516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50953932
129	NC_006087	CGC	2	6	8523	8528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953932
130	NC_006087	GAG	2	6	8591	8596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953932
131	NC_006087	GGA	2	6	8602	8607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953932
132	NC_006087	CGT	2	6	8719	8724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953932
133	NC_006087	GAG	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953932
134	NC_006087	GTC	2	6	8759	8764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953932
135	NC_006087	CGG	2	6	8839	8844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953932
136	NC_006087	CGA	2	6	8860	8865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953932
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