MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 67020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006087	CCCAA	2	10	57	66	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_006087	CA	4	8	94	101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006087	AAT	2	6	120	125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006087	TGGCA	2	10	253	262	20 %	20 %	40 %	20 %	50953926
5	NC_006087	CAT	2	6	344	349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953926
6	NC_006087	CG	3	6	388	393	0 %	0 %	50 %	50 %	50953926
7	NC_006087	GAT	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50953926
8	NC_006087	AGC	2	6	403	408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953926
9	NC_006087	CTC	2	6	423	428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50953926
10	NC_006087	ACA	2	6	448	453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953926
11	NC_006087	TCG	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953926
12	NC_006087	CAG	2	6	498	503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953926
13	NC_006087	CAC	2	6	577	582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50953926
14	NC_006087	CGC	2	6	683	688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953926
15	NC_006087	CCT	2	6	770	775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50953926
16	NC_006087	GAG	2	6	840	845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953926
17	NC_006087	TCA	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953926
18	NC_006087	CAA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953926
19	NC_006087	TTC	2	6	978	983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50953926
20	NC_006087	AC	3	6	994	999	50 %	0 %	0 %	50 %	50953926
21	NC_006087	CAA	2	6	1010	1015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953926
22	NC_006087	GAC	2	6	1185	1190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953926
23	NC_006087	CGA	3	9	1337	1345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953926
24	NC_006087	ACCG	2	8	1358	1365	25 %	0 %	25 %	50 %	50953926
25	NC_006087	CAT	2	6	1367	1372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953926
26	NC_006087	CA	3	6	1533	1538	50 %	0 %	0 %	50 %	50953926
27	NC_006087	AAG	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953926
28	NC_006087	GCG	2	6	1583	1588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953926
29	NC_006087	ACC	2	6	1636	1641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50953926
30	NC_006087	AC	3	6	1673	1678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006087	ATCC	2	8	1706	1713	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006087	TTA	2	6	1733	1738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006087	GTC	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006087	GAG	2	6	1811	1816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006087	CGC	2	6	1839	1844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_006087	TTG	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006087	GA	3	6	2002	2007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006087	TCGT	2	8	2049	2056	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_006087	CAG	2	6	2068	2073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006087	GAA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953927
41	NC_006087	GCT	2	6	2298	2303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953927
42	NC_006087	AGA	2	6	2352	2357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953927
43	NC_006087	ATC	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953927
44	NC_006087	GCT	2	6	2397	2402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953927
45	NC_006087	GGA	2	6	2415	2420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953927
46	NC_006087	GCG	2	6	2444	2449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953927
47	NC_006087	CAG	2	6	2465	2470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953927
48	NC_006087	ACA	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953927
49	NC_006087	CGAC	2	8	2585	2592	25 %	0 %	25 %	50 %	50953927
50	NC_006087	CGA	2	6	2742	2747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953927
51	NC_006087	CCG	2	6	2823	2828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953927
52	NC_006087	TGA	2	6	2861	2866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50953927
53	NC_006087	CCG	2	6	2870	2875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953927
54	NC_006087	GGT	2	6	3033	3038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50953927
55	NC_006087	TCA	2	6	3146	3151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953927
56	NC_006087	GA	3	6	3248	3253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006087	CAA	2	6	3301	3306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953928
58	NC_006087	GA	3	6	3310	3315	50 %	0 %	50 %	0 %	50953928
59	NC_006087	GAA	2	6	3325	3330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953928
60	NC_006087	CGG	2	6	3363	3368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953928
61	NC_006087	CGC	2	6	3400	3405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953928
62	NC_006087	CCGG	2	8	3440	3447	0 %	0 %	50 %	50 %	50953928
63	NC_006087	CTG	2	6	3485	3490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953928
64	NC_006087	CGG	2	6	3514	3519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953928
65	NC_006087	CGC	2	6	3550	3555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953928
66	NC_006087	GCT	2	6	3556	3561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953928
67	NC_006087	CGGG	2	8	3600	3607	0 %	0 %	75 %	25 %	50953928
68	NC_006087	CGG	2	6	3643	3648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953928
69	NC_006087	CG	3	6	3708	3713	0 %	0 %	50 %	50 %	50953928
70	NC_006087	CTC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50953928
71	NC_006087	GAG	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953928
72	NC_006087	TTCG	2	8	3976	3983	0 %	50 %	25 %	25 %	50953928
73	NC_006087	AAC	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953928
74	NC_006087	CGC	2	6	4102	4107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953928
75	NC_006087	CGG	2	6	4123	4128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953928
76	NC_006087	CCT	2	6	4155	4160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50953929
77	NC_006087	CT	4	8	4175	4182	0 %	50 %	0 %	50 %	50953929
78	NC_006087	TCG	2	6	4242	4247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953929
79	NC_006087	GTC	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953929
80	NC_006087	GC	3	6	4373	4378	0 %	0 %	50 %	50 %	50953929
81	NC_006087	GTT	2	6	4501	4506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50953929
82	NC_006087	GGA	2	6	4513	4518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953929
83	NC_006087	CCG	2	6	4549	4554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953929
84	NC_006087	CTC	2	6	4571	4576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50953929
85	NC_006087	CTG	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953929
86	NC_006087	GC	4	8	4658	4665	0 %	0 %	50 %	50 %	50953929
87	NC_006087	TCA	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953929
88	NC_006087	ATC	2	6	4818	4823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953929
89	NC_006087	GCT	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953929
90	NC_006087	GCG	2	6	4854	4859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953929
91	NC_006087	CGA	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953929
92	NC_006087	CCG	2	6	5110	5115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953929
93	NC_006087	ACC	2	6	5198	5203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50953929
94	NC_006087	TCA	2	6	5226	5231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953929
95	NC_006087	CGG	2	6	5232	5237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953929
96	NC_006087	GCCG	2	8	5254	5261	0 %	0 %	50 %	50 %	50953929
97	NC_006087	CGT	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953929
98	NC_006087	TCACGC	2	12	5371	5382	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	50953930
99	NC_006087	CG	3	6	5444	5449	0 %	0 %	50 %	50 %	50953930
100	NC_006087	CTCG	2	8	5469	5476	0 %	25 %	25 %	50 %	50953930
101	NC_006087	GC	3	6	5498	5503	0 %	0 %	50 %	50 %	50953930
102	NC_006087	GAG	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953930
103	NC_006087	GAC	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953930
104	NC_006087	CG	3	6	5771	5776	0 %	0 %	50 %	50 %	50953930
105	NC_006087	GTC	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006087	CG	3	6	5810	5815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_006087	TCG	2	6	6065	6070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953931
108	NC_006087	ACA	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953931
109	NC_006087	TGA	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50953931
110	NC_006087	AGA	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953931
111	NC_006087	GGA	2	6	6238	6243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953931
112	NC_006087	CGG	2	6	6249	6254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953931
113	NC_006087	GGC	2	6	6256	6261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953931
114	NC_006087	CGG	2	6	6273	6278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953931
115	NC_006087	GTG	2	6	6301	6306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50953931
116	NC_006087	CCG	2	6	6339	6344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953931
117	NC_006087	GGC	2	6	6359	6364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50953931
118	NC_006087	GAG	2	6	6409	6414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953931
119	NC_006087	TCT	2	6	6440	6445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50953931
120	NC_006087	CAG	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953931
121	NC_006087	CAA	2	6	6525	6530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50953931
122	NC_006087	CGAGG	2	10	6604	6613	20 %	0 %	60 %	20 %	50953931
123	NC_006087	GAA	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953931
124	NC_006087	ATC	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953931
125	NC_006087	GGA	2	6	6711	6716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50953931
126	NC_006087	GAC	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953931
127	NC_006087	CA	3	6	6819	6824	50 %	0 %	0 %	50 %	50953931
128	NC_006087	GAA	2	6	6826	6831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953931
129	NC_006087	CCGCG	2	10	6837	6846	0 %	0 %	40 %	60 %	50953931
130	NC_006087	GAA	2	6	6879	6884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50953931
131	NC_006087	CAAAGA	2	12	6891	6902	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50953931
132	NC_006087	CGA	2	6	6918	6923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50953931
133	NC_006087	AGACCA	2	12	6986	6997	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	50953931
134	NC_006087	ATC	2	6	7093	7098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50953931
135	NC_006087	CG	3	6	7122	7127	0 %	0 %	50 %	50 %	50953931
136	NC_006087	CGC	2	6	7131	7136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50953931
137	NC_006087	CTG	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953931
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139	NC_006087	TCG	2	6	7247	7252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953931
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253	NC_006087	ACC	2	6	11542	11547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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261	NC_006087	GTCG	2	8	11949	11956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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268	NC_006087	GCG	2	6	12226	12231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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270	NC_006087	CAG	2	6	12335	12340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_006087	ATC	2	6	12385	12390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_006087	CAG	2	6	12432	12437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_006087	CGT	2	6	12438	12443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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402	NC_006087	TGG	2	6	18740	18745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
403	NC_006087	CGG	2	6	18746	18751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_006087	GTC	2	6	18915	18920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50953941
405	NC_006087	ATG	2	6	18925	18930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50953941
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