MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 67020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006087	GAA	2	6	159066	159071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_006087	GGC	2	6	159113	159118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_006087	CGA	2	6	159124	159129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_006087	AGCG	2	8	159149	159156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_006087	ACC	2	6	159168	159173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_006087	CAT	2	6	159200	159205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_006087	TTC	2	6	159214	159219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_006087	GCA	2	6	159283	159288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_006087	GC	3	6	159295	159300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_006087	CAGAC	2	10	159344	159353	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4011	NC_006087	CCA	3	9	159531	159539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_006087	GAT	2	6	159573	159578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_006087	ACG	2	6	159694	159699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_006087	ACC	2	6	159719	159724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_006087	ATG	2	6	159751	159756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_006087	CTG	2	6	159807	159812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_006087	CCAA	2	8	159847	159854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_006087	TCG	2	6	159920	159925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_006087	GCA	3	9	159976	159984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_006087	CTT	2	6	160053	160058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_006087	GCA	2	6	160108	160113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_006087	TTC	2	6	160115	160120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_006087	CAC	2	6	160138	160143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_006087	CTT	2	6	160178	160183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_006087	GCA	2	6	160194	160199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_006087	ATC	2	6	160356	160361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_006087	CTT	2	6	160447	160452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_006087	TC	3	6	160495	160500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_006087	A	7	7	160567	160573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_006087	CAACC	2	10	160584	160593	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4031	NC_006087	ACGA	2	8	160596	160603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_006087	ACC	2	6	160619	160624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_006087	GT	3	6	160653	160658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_006087	AAACC	2	10	160701	160710	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4035	NC_006087	GCG	2	6	160916	160921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_006087	CGA	2	6	160951	160956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_006087	AGC	2	6	160987	160992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_006087	ACC	2	6	161143	161148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_006087	CGC	2	6	161159	161164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_006087	GGAG	2	8	161331	161338	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_006087	ACC	2	6	161347	161352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_006087	CGGAC	2	10	161400	161409	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4043	NC_006087	AGG	2	6	161431	161436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_006087	CCGA	2	8	161464	161471	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_006087	AGGTGG	2	12	161497	161508	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_006087	CGA	2	6	161543	161548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_006087	TC	3	6	161549	161554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_006087	CTG	2	6	161565	161570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_006087	TGC	2	6	161615	161620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_006087	GCC	2	6	161631	161636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_006087	CGC	2	6	161663	161668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_006087	CGC	2	6	161675	161680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_006087	CAC	2	6	161697	161702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_006087	CGA	2	6	161711	161716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_006087	GGT	2	6	161759	161764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_006087	GTTC	2	8	161796	161803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4057	NC_006087	CGT	2	6	161861	161866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_006087	ATCG	2	8	161921	161928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_006087	GGC	2	6	161931	161936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_006087	CGGT	2	8	161942	161949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4061	NC_006087	TCCC	2	8	161952	161959	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4062	NC_006087	CGC	2	6	161980	161985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_006087	CG	3	6	161993	161998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_006087	CGA	2	6	162054	162059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_006087	GC	3	6	162083	162088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_006087	AGC	2	6	162097	162102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_006087	CCT	2	6	162123	162128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_006087	TGAAC	2	10	162144	162153	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4069	NC_006087	CTC	2	6	162190	162195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_006087	C	6	6	162217	162222	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4071	NC_006087	AGA	2	6	162237	162242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954047
4072	NC_006087	GC	3	6	162255	162260	0 %	0 %	50 %	50 %	50954047
4073	NC_006087	CG	3	6	162283	162288	0 %	0 %	50 %	50 %	50954047
4074	NC_006087	CGTT	2	8	162386	162393	0 %	50 %	25 %	25 %	50954047
4075	NC_006087	CCTCGT	2	12	162399	162410	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	50954047
4076	NC_006087	CGG	3	9	162411	162419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954047
4077	NC_006087	GAG	2	6	162428	162433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954047
4078	NC_006087	CG	3	6	162442	162447	0 %	0 %	50 %	50 %	50954047
4079	NC_006087	GGA	2	6	162568	162573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954047
4080	NC_006087	GTCCTC	3	18	162580	162597	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	50954047
4081	NC_006087	CCG	2	6	162600	162605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954047
4082	NC_006087	CGCC	2	8	162674	162681	0 %	0 %	25 %	75 %	50954047
4083	NC_006087	GCCG	2	8	162685	162692	0 %	0 %	50 %	50 %	50954047
4084	NC_006087	CGG	2	6	162705	162710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954047
4085	NC_006087	GCT	2	6	162747	162752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954047
4086	NC_006087	CGG	2	6	162786	162791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954047
4087	NC_006087	TCG	2	6	162806	162811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954047
4088	NC_006087	GCGGG	2	10	162870	162879	0 %	0 %	80 %	20 %	50954047
4089	NC_006087	GGC	2	6	162880	162885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954047
4090	NC_006087	GCG	2	6	162887	162892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954047
4091	NC_006087	GA	3	6	162928	162933	50 %	0 %	50 %	0 %	50954047
4092	NC_006087	GGGA	2	8	162937	162944	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_006087	GAT	2	6	162959	162964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_006087	ACG	2	6	162980	162985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_006087	GGC	2	6	163001	163006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_006087	GC	3	6	163081	163086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4097	NC_006087	CG	3	6	163111	163116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_006087	GTC	2	6	163150	163155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_006087	CGGC	2	8	163193	163200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_006087	CAT	3	9	163201	163209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_006087	AGG	2	6	163233	163238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_006087	CAT	2	6	163258	163263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_006087	GCC	2	6	163474	163479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954048
4104	NC_006087	CGC	2	6	163551	163556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954048
4105	NC_006087	CGAG	2	8	163559	163566	25 %	0 %	50 %	25 %	50954048
4106	NC_006087	CCG	2	6	163567	163572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954048
4107	NC_006087	CGG	2	6	163694	163699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954048
4108	NC_006087	GC	3	6	163741	163746	0 %	0 %	50 %	50 %	50954048
4109	NC_006087	GAC	2	6	163755	163760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954048
4110	NC_006087	C	6	6	163787	163792	0 %	0 %	0 %	100 %	50954048
4111	NC_006087	TCTCGA	2	12	163811	163822	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50954048
4112	NC_006087	CG	4	8	163839	163846	0 %	0 %	50 %	50 %	50954048
4113	NC_006087	TTG	2	6	163915	163920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50954048
4114	NC_006087	AG	3	6	163929	163934	50 %	0 %	50 %	0 %	50954048
4115	NC_006087	GGT	2	6	163952	163957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954048
4116	NC_006087	GGA	2	6	164004	164009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_006087	CCTG	2	8	164020	164027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_006087	CGC	2	6	164032	164037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_006087	GAG	2	6	164042	164047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_006087	GCG	2	6	164053	164058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954049
4121	NC_006087	GCC	2	6	164108	164113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954049
4122	NC_006087	GTG	2	6	164117	164122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954049
4123	NC_006087	CGACC	2	10	164176	164185	20 %	0 %	20 %	60 %	50954049
4124	NC_006087	GGC	2	6	164215	164220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954049
4125	NC_006087	TCC	2	6	164222	164227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954049
4126	NC_006087	CG	3	6	164228	164233	0 %	0 %	50 %	50 %	50954049
4127	NC_006087	TCG	2	6	164259	164264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954049
4128	NC_006087	ACG	2	6	164318	164323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954049
4129	NC_006087	GTG	2	6	164324	164329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954049
4130	NC_006087	GCG	2	6	164357	164362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954049
4131	NC_006087	CCG	2	6	164389	164394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954049
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4141	NC_006087	GGC	2	6	164614	164619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4256	NC_006087	CGC	3	9	168187	168195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954054
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4372	NC_006087	CTGC	2	8	172687	172694	0 %	25 %	25 %	50 %	50954060
4373	NC_006087	GGT	2	6	172695	172700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954060
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4378	NC_006087	GTG	2	6	172958	172963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4379	NC_006087	GAT	2	6	172967	172972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954061
4380	NC_006087	TCG	2	6	172980	172985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954061
4381	NC_006087	CGA	2	6	173014	173019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954061
4382	NC_006087	TGA	2	6	173050	173055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954061
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4408	NC_006087	TGA	2	6	173919	173924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954062
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4424	NC_006087	GGC	2	6	174756	174761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4425	NC_006087	CTG	2	6	174762	174767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4426	NC_006087	TG	3	6	174766	174771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4427	NC_006087	CGA	2	6	174915	174920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954063
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4429	NC_006087	GCGCA	2	10	174968	174977	20 %	0 %	40 %	40 %	50954063
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4451	NC_006087	CGGC	2	8	176038	176045	0 %	0 %	50 %	50 %	50954063
4452	NC_006087	TGG	2	6	176069	176074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954063
4453	NC_006087	CGT	2	6	176076	176081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954063
4454	NC_006087	GA	3	6	176102	176107	50 %	0 %	50 %	0 %	50954063
4455	NC_006087	G	6	6	176130	176135	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4456	NC_006087	CG	3	6	176187	176192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4457	NC_006087	TGGTG	2	10	176256	176265	0 %	40 %	60 %	0 %	50954064
4458	NC_006087	AGC	2	6	176285	176290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954064
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4461	NC_006087	GCG	2	6	176383	176388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954064
4462	NC_006087	CGC	2	6	176436	176441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954064
4463	NC_006087	CCTC	2	8	176462	176469	0 %	25 %	0 %	75 %	50954064
4464	NC_006087	CGT	2	6	176487	176492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954064
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4466	NC_006087	CGGC	2	8	176526	176533	0 %	0 %	50 %	50 %	50954064
4467	NC_006087	GGC	3	9	176531	176539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954064
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4469	NC_006087	CAG	2	6	176566	176571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954064
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4472	NC_006087	GTCGT	2	10	176699	176708	0 %	40 %	40 %	20 %	50954064
4473	NC_006087	GCG	2	6	176797	176802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954064
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4483	NC_006087	TCC	2	6	177274	177279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954064
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4486	NC_006087	CAGG	2	8	177443	177450	25 %	0 %	50 %	25 %	50954065
4487	NC_006087	CCG	2	6	177457	177462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954065
4488	NC_006087	CGA	2	6	177464	177469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954065
4489	NC_006087	GAG	2	6	177486	177491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954065
4490	NC_006087	CAC	2	6	177536	177541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954065
4491	NC_006087	GCT	2	6	177590	177595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954065
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4493	NC_006087	CACC	2	8	177659	177666	25 %	0 %	0 %	75 %	50954065
4494	NC_006087	GATG	2	8	177692	177699	25 %	25 %	50 %	0 %	50954065
4495	NC_006087	G	6	6	177715	177720	0 %	0 %	100 %	0 %	50954065
4496	NC_006087	CTG	2	6	177774	177779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954065
4497	NC_006087	CG	4	8	177782	177789	0 %	0 %	50 %	50 %	50954065
4498	NC_006087	CTCG	2	8	177806	177813	0 %	25 %	25 %	50 %	50954065
4499	NC_006087	GGA	2	6	177932	177937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954065
4500	NC_006087	TCGCGG	2	12	177955	177966	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	50954065

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