MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 67020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006087	TCT	2	6	199448	199453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954077
5002	NC_006087	CGG	2	6	199493	199498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954077
5003	NC_006087	GGTC	2	8	199605	199612	0 %	25 %	50 %	25 %	50954077
5004	NC_006087	AC	3	6	199627	199632	50 %	0 %	0 %	50 %	50954077
5005	NC_006087	CGG	3	9	199740	199748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954077
5006	NC_006087	GTC	2	6	199789	199794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954077
5007	NC_006087	GAC	2	6	199807	199812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954077
5008	NC_006087	GCC	2	6	199861	199866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954077
5009	NC_006087	GCG	2	6	199879	199884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954077
5010	NC_006087	CCG	2	6	199938	199943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954077
5011	NC_006087	TGC	2	6	199953	199958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954077
5012	NC_006087	CGA	2	6	199965	199970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954077
5013	NC_006087	CCT	2	6	199977	199982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954077
5014	NC_006087	CGGC	2	8	199997	200004	0 %	0 %	50 %	50 %	50954077
5015	NC_006087	CG	3	6	200022	200027	0 %	0 %	50 %	50 %	50954077
5016	NC_006087	GAT	2	6	200062	200067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954077
5017	NC_006087	GCGG	2	8	200093	200100	0 %	0 %	75 %	25 %	50954078
5018	NC_006087	CGAG	2	8	200139	200146	25 %	0 %	50 %	25 %	50954078
5019	NC_006087	GTA	2	6	200148	200153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954078
5020	NC_006087	GAC	2	6	200178	200183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5021	NC_006087	CAG	2	6	200208	200213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5022	NC_006087	CCG	2	6	200235	200240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954078
5023	NC_006087	GCGG	2	8	200301	200308	0 %	0 %	75 %	25 %	50954078
5024	NC_006087	CCGG	2	8	200344	200351	0 %	0 %	50 %	50 %	50954078
5025	NC_006087	CG	3	6	200425	200430	0 %	0 %	50 %	50 %	50954078
5026	NC_006087	GAT	2	6	200475	200480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954078
5027	NC_006087	TGA	2	6	200561	200566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954078
5028	NC_006087	TCG	2	6	200584	200589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5029	NC_006087	CGA	2	6	200591	200596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5030	NC_006087	TCCG	2	8	200761	200768	0 %	25 %	25 %	50 %	50954078
5031	NC_006087	CGG	2	6	200806	200811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954078
5032	NC_006087	GTG	2	6	200866	200871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954078
5033	NC_006087	AGT	2	6	200897	200902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954078
5034	NC_006087	GTCC	2	8	200909	200916	0 %	25 %	25 %	50 %	50954078
5035	NC_006087	GC	3	6	200929	200934	0 %	0 %	50 %	50 %	50954078
5036	NC_006087	CTG	2	6	200976	200981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5037	NC_006087	TGC	2	6	200998	201003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5038	NC_006087	ACC	2	6	201010	201015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954078
5039	NC_006087	GCC	2	6	201069	201074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954078
5040	NC_006087	ACC	2	6	201088	201093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954078
5041	NC_006087	CGC	2	6	201101	201106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954078
5042	NC_006087	AGGGCG	2	12	201124	201135	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	50954078
5043	NC_006087	CGG	2	6	201145	201150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954078
5044	NC_006087	AGGA	2	8	201151	201158	50 %	0 %	50 %	0 %	50954078
5045	NC_006087	CCG	2	6	201208	201213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954078
5046	NC_006087	CG	3	6	201244	201249	0 %	0 %	50 %	50 %	50954078
5047	NC_006087	ACG	2	6	201254	201259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5048	NC_006087	CGA	2	6	201363	201368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5049	NC_006087	CCGA	2	8	201403	201410	25 %	0 %	25 %	50 %	50954078
5050	NC_006087	CAG	2	6	201420	201425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5051	NC_006087	CGG	2	6	201458	201463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954078
5052	NC_006087	GCC	2	6	201475	201480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954078
5053	NC_006087	GAC	2	6	201504	201509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5054	NC_006087	CCG	2	6	201515	201520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954078
5055	NC_006087	GCG	2	6	201575	201580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954078
5056	NC_006087	GC	3	6	201637	201642	0 %	0 %	50 %	50 %	50954078
5057	NC_006087	CAG	2	6	201687	201692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5058	NC_006087	AGC	2	6	201709	201714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5059	NC_006087	CGA	2	6	201767	201772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5060	NC_006087	CGA	2	6	201788	201793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5061	NC_006087	AGG	2	6	201808	201813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954078
5062	NC_006087	CGA	3	9	201821	201829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954078
5063	NC_006087	GAG	3	9	201939	201947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954078
5064	NC_006087	CCGGG	2	10	201997	202006	0 %	0 %	60 %	40 %	50954078
5065	NC_006087	CAT	2	6	202053	202058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954078
5066	NC_006087	GGC	2	6	202068	202073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_006087	GA	3	6	202084	202089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_006087	C	6	6	202164	202169	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5069	NC_006087	GAG	3	9	202178	202186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_006087	CACTC	2	10	202223	202232	20 %	20 %	0 %	60 %	50954079
5071	NC_006087	CGG	2	6	202262	202267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954079
5072	NC_006087	GAG	2	6	202338	202343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954079
5073	NC_006087	GTC	2	6	202377	202382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954079
5074	NC_006087	ACG	2	6	202390	202395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954079
5075	NC_006087	CGG	2	6	202433	202438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954079
5076	NC_006087	GC	3	6	202506	202511	0 %	0 %	50 %	50 %	50954079
5077	NC_006087	CG	3	6	202569	202574	0 %	0 %	50 %	50 %	50954079
5078	NC_006087	CGG	2	6	202592	202597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954079
5079	NC_006087	GGT	2	6	202647	202652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954079
5080	NC_006087	GGC	2	6	202707	202712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954079
5081	NC_006087	CGA	2	6	202733	202738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954079
5082	NC_006087	AGA	2	6	202757	202762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954079
5083	NC_006087	CAT	2	6	202779	202784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954079
5084	NC_006087	TTG	2	6	202867	202872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50954080
5085	NC_006087	GAA	2	6	202925	202930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954080
5086	NC_006087	GGC	2	6	202967	202972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954080
5087	NC_006087	GCG	2	6	202975	202980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954080
5088	NC_006087	GGA	3	9	203008	203016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954080
5089	NC_006087	GAA	2	6	203051	203056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954080
5090	NC_006087	CAG	2	6	203108	203113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954080
5091	NC_006087	GCT	2	6	203132	203137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954080
5092	NC_006087	CGC	2	6	203162	203167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954080
5093	NC_006087	CGG	3	9	203173	203181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954080
5094	NC_006087	GGC	2	6	203186	203191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954080
5095	NC_006087	C	6	6	203196	203201	0 %	0 %	0 %	100 %	50954080
5096	NC_006087	GGT	2	6	203225	203230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954080
5097	NC_006087	ACC	2	6	203332	203337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_006087	GCA	2	6	203365	203370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_006087	GTT	2	6	203431	203436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_006087	AGG	3	9	203484	203492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_006087	CTC	2	6	203507	203512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_006087	TCC	2	6	203516	203521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_006087	GAT	2	6	203582	203587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_006087	CGAT	2	8	203624	203631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_006087	GTC	2	6	203644	203649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_006087	GC	3	6	203660	203665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_006087	CAAA	2	8	203682	203689	75 %	0 %	0 %	25 %	50954081
5108	NC_006087	CCG	2	6	203759	203764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954081
5109	NC_006087	ACG	2	6	203798	203803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954081
5110	NC_006087	CAA	2	6	203856	203861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50954081
5111	NC_006087	TCG	2	6	203897	203902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954081
5112	NC_006087	CGC	2	6	203910	203915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954081
5113	NC_006087	CGG	2	6	204045	204050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954081
5114	NC_006087	CGC	2	6	204081	204086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954081
5115	NC_006087	GC	3	6	204164	204169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_006087	GACG	2	8	204186	204193	25 %	0 %	50 %	25 %	50954082
5117	NC_006087	TCG	2	6	204224	204229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5118	NC_006087	GGC	2	6	204264	204269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954082
5119	NC_006087	CGA	2	6	204317	204322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5120	NC_006087	CGG	2	6	204525	204530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954082
5121	NC_006087	CTG	2	6	204562	204567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5122	NC_006087	G	6	6	204591	204596	0 %	0 %	100 %	0 %	50954082
5123	NC_006087	GCA	2	6	204609	204614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5124	NC_006087	AACA	2	8	204649	204656	75 %	0 %	0 %	25 %	50954082
5125	NC_006087	CCCGA	2	10	204658	204667	20 %	0 %	20 %	60 %	50954082
5126	NC_006087	AGA	2	6	204686	204691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954082
5127	NC_006087	AGC	2	6	204692	204697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5128	NC_006087	GCT	2	6	204713	204718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5129	NC_006087	ACG	2	6	204722	204727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5130	NC_006087	GAC	2	6	204802	204807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5131	NC_006087	TCC	2	6	204809	204814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954082
5132	NC_006087	CGG	2	6	204840	204845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954082
5133	NC_006087	TAC	2	6	204877	204882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954082
5134	NC_006087	GCA	2	6	204912	204917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5135	NC_006087	GGC	2	6	204918	204923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954082
5136	NC_006087	CCGG	2	8	204969	204976	0 %	0 %	50 %	50 %	50954082
5137	NC_006087	GAG	2	6	204982	204987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954082
5138	NC_006087	CGGCG	2	10	204990	204999	0 %	0 %	60 %	40 %	50954082
5139	NC_006087	ACACG	2	10	205080	205089	40 %	0 %	20 %	40 %	50954082
5140	NC_006087	CAG	2	6	205150	205155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5141	NC_006087	TTC	2	6	205168	205173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954082
5142	NC_006087	ATC	2	6	205192	205197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954082
5143	NC_006087	AGAC	2	8	205220	205227	50 %	0 %	25 %	25 %	50954082
5144	NC_006087	CGG	2	6	205254	205259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954082
5145	NC_006087	AGCGC	2	10	205297	205306	20 %	0 %	40 %	40 %	50954082
5146	NC_006087	GTC	2	6	205359	205364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5147	NC_006087	ACA	2	6	205427	205432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50954082
5148	NC_006087	CGG	3	9	205442	205450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954082
5149	NC_006087	GGA	2	6	205489	205494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954082
5150	NC_006087	CCT	2	6	205536	205541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954082
5151	NC_006087	GCA	2	6	205590	205595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5152	NC_006087	CAA	2	6	205623	205628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50954082
5153	NC_006087	CGG	2	6	205644	205649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954082
5154	NC_006087	ACG	2	6	205670	205675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5155	NC_006087	TGA	2	6	205703	205708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954082
5156	NC_006087	AGC	2	6	205778	205783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
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5158	NC_006087	GAAC	2	8	205859	205866	50 %	0 %	25 %	25 %	50954082
5159	NC_006087	AAC	2	6	205912	205917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50954082
5160	NC_006087	GAC	2	6	205963	205968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
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5163	NC_006087	TGC	2	6	206057	206062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954082
5164	NC_006087	GCG	2	6	206063	206068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954082
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5167	NC_006087	CACCTC	2	12	206157	206168	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	50954082
5168	NC_006087	TGGG	2	8	206188	206195	0 %	25 %	75 %	0 %	50954082
5169	NC_006087	CGG	3	9	206244	206252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954082
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5171	NC_006087	GGT	2	6	206308	206313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954082
5172	NC_006087	GCC	2	6	206328	206333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954082
5173	NC_006087	CCACGC	2	12	206366	206377	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	50954082
5174	NC_006087	GCCG	2	8	206379	206386	0 %	0 %	50 %	50 %	50954082
5175	NC_006087	GCG	2	6	206438	206443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954082
5176	NC_006087	GCACCG	2	12	206450	206461	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	50954082
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5179	NC_006087	ATT	2	6	206559	206564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5180	NC_006087	CCGAA	2	10	206591	206600	40 %	0 %	20 %	40 %	50954083
5181	NC_006087	TCGC	2	8	206613	206620	0 %	25 %	25 %	50 %	50954083
5182	NC_006087	ATTC	2	8	206700	206707	25 %	50 %	0 %	25 %	50954083
5183	NC_006087	GAT	2	6	206734	206739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954083
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5187	NC_006087	CCTC	2	8	206853	206860	0 %	25 %	0 %	75 %	50954083
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5195	NC_006087	CGC	2	6	207196	207201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5196	NC_006087	GCA	2	6	207202	207207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5197	NC_006087	GGC	2	6	207209	207214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5198	NC_006087	TGC	2	6	207230	207235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5199	NC_006087	GTGCC	2	10	207254	207263	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5200	NC_006087	CCG	2	6	207285	207290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5201	NC_006087	GAGG	2	8	207315	207322	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5202	NC_006087	TGC	2	6	207332	207337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5203	NC_006087	TCG	2	6	207338	207343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5205	NC_006087	C	6	6	207425	207430	0 %	0 %	0 %	100 %	50954084
5206	NC_006087	GACC	2	8	207444	207451	25 %	0 %	25 %	50 %	50954084
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5209	NC_006087	GC	3	6	207525	207530	0 %	0 %	50 %	50 %	50954084
5210	NC_006087	TGC	2	6	207582	207587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954084
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5213	NC_006087	CG	3	6	207648	207653	0 %	0 %	50 %	50 %	50954084
5214	NC_006087	TGG	2	6	207662	207667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954084
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5218	NC_006087	TGC	2	6	207798	207803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954084
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5221	NC_006087	CGA	2	6	207907	207912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954084
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5225	NC_006087	GGC	2	6	208065	208070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954084
5226	NC_006087	GCT	2	6	208216	208221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954084
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5229	NC_006087	AGG	2	6	208269	208274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954084
5230	NC_006087	ACG	2	6	208284	208289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954084
5231	NC_006087	GCT	3	9	208321	208329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954084
5232	NC_006087	ACG	2	6	208338	208343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954084
5233	NC_006087	CGC	2	6	208372	208377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954084
5234	NC_006087	TGC	3	9	208404	208412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954084
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5239	NC_006087	GCA	2	6	208614	208619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954084
5240	NC_006087	CGC	2	6	208671	208676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954084
5241	NC_006087	TACGAC	2	12	208685	208696	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50954084
5242	NC_006087	TGC	2	6	208716	208721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954084
5243	NC_006087	AAG	2	6	208724	208729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954084
5244	NC_006087	CCG	2	6	208828	208833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954084
5245	NC_006087	CGT	2	6	208908	208913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954084
5246	NC_006087	GTG	2	6	208949	208954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954084
5247	NC_006087	GCG	4	12	208974	208985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954084
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5271	NC_006087	GCG	2	6	209835	209840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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