MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 7462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005824	GTC	2	6	164762	164767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655720
3502	NC_005824	GTA	2	6	164770	164775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655720
3503	NC_005824	TTC	2	6	164897	164902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655720
3504	NC_005824	A	7	7	164952	164958	100 %	0 %	0 %	0 %	45655720
3505	NC_005824	AGT	2	6	165051	165056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655720
3506	NC_005824	ATG	2	6	165088	165093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655720
3507	NC_005824	AATC	2	8	165096	165103	50 %	25 %	0 %	25 %	45655720
3508	NC_005824	TGA	2	6	165116	165121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655720
3509	NC_005824	A	6	6	165138	165143	100 %	0 %	0 %	0 %	45655720
3510	NC_005824	AGC	2	6	165243	165248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655720
3511	NC_005824	ACA	2	6	165261	165266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655720
3512	NC_005824	TCA	2	6	165293	165298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655720
3513	NC_005824	CGGTTA	2	12	165377	165388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45655720
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3515	NC_005824	CAATT	2	10	165572	165581	40 %	40 %	0 %	20 %	45655720
3516	NC_005824	ATT	2	6	165606	165611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655720
3517	NC_005824	GAA	2	6	165613	165618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655720
3518	NC_005824	A	7	7	165643	165649	100 %	0 %	0 %	0 %	45655720
3519	NC_005824	CAT	2	6	165652	165657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655720
3520	NC_005824	AAAATT	2	12	165661	165672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655720
3521	NC_005824	GCC	2	6	165673	165678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45655720
3522	NC_005824	AAG	2	6	165692	165697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655720
3523	NC_005824	ATT	2	6	165812	165817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655720
3524	NC_005824	AGA	2	6	165871	165876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655721
3525	NC_005824	TTTA	2	8	165942	165949	25 %	75 %	0 %	0 %	45655721
3526	NC_005824	G	6	6	166042	166047	0 %	0 %	100 %	0 %	45655721
3527	NC_005824	AGA	2	6	166069	166074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655721
3528	NC_005824	A	6	6	166233	166238	100 %	0 %	0 %	0 %	45655721
3529	NC_005824	A	6	6	166246	166251	100 %	0 %	0 %	0 %	45655721
3530	NC_005824	A	6	6	166253	166258	100 %	0 %	0 %	0 %	45655721
3531	NC_005824	T	6	6	166366	166371	0 %	100 %	0 %	0 %	45655722
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3533	NC_005824	GTG	2	6	166433	166438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655722
3534	NC_005824	TTTA	2	8	166450	166457	25 %	75 %	0 %	0 %	45655722
3535	NC_005824	TTC	2	6	166466	166471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655722
3536	NC_005824	T	6	6	166505	166510	0 %	100 %	0 %	0 %	45655722
3537	NC_005824	A	6	6	166537	166542	100 %	0 %	0 %	0 %	45655722
3538	NC_005824	TAT	2	6	166614	166619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655722
3539	NC_005824	TA	3	6	166628	166633	50 %	50 %	0 %	0 %	45655722
3540	NC_005824	TTTC	2	8	166684	166691	0 %	75 %	0 %	25 %	45655722
3541	NC_005824	A	6	6	166727	166732	100 %	0 %	0 %	0 %	45655722
3542	NC_005824	TCT	2	6	166765	166770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655722
3543	NC_005824	T	6	6	166806	166811	0 %	100 %	0 %	0 %	45655722
3544	NC_005824	TTC	2	6	166844	166849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655722
3545	NC_005824	TTA	2	6	166864	166869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655722
3546	NC_005824	GGA	2	6	166909	166914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655722
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3548	NC_005824	ATCG	2	8	167037	167044	25 %	25 %	25 %	25 %	45655722
3549	NC_005824	ATC	2	6	167098	167103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655722
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3552	NC_005824	ACT	2	6	167349	167354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655722
3553	NC_005824	TTGGA	2	10	167406	167415	20 %	40 %	40 %	0 %	45655722
3554	NC_005824	CCG	2	6	167465	167470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45655722
3555	NC_005824	AGAT	2	8	167541	167548	50 %	25 %	25 %	0 %	45655722
3556	NC_005824	TGGG	2	8	167645	167652	0 %	25 %	75 %	0 %	45655722
3557	NC_005824	T	6	6	167673	167678	0 %	100 %	0 %	0 %	45655722
3558	NC_005824	TCT	2	6	167683	167688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655722
3559	NC_005824	ATCG	2	8	167719	167726	25 %	25 %	25 %	25 %	45655722
3560	NC_005824	ATTC	2	8	167784	167791	25 %	50 %	0 %	25 %	45655722
3561	NC_005824	TCAA	2	8	167822	167829	50 %	25 %	0 %	25 %	45655722
3562	NC_005824	T	6	6	167865	167870	0 %	100 %	0 %	0 %	45655722
3563	NC_005824	ATTTT	2	10	167878	167887	20 %	80 %	0 %	0 %	45655722
3564	NC_005824	CTT	2	6	167894	167899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655722
3565	NC_005824	T	7	7	167898	167904	0 %	100 %	0 %	0 %	45655722
3566	NC_005824	T	6	6	167951	167956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_005824	GAATT	2	10	167970	167979	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_005824	TTA	2	6	168012	168017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_005824	A	7	7	168029	168035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_005824	TTTG	2	8	168118	168125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_005824	A	6	6	168131	168136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_005824	T	7	7	168186	168192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_005824	ATA	2	6	168195	168200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_005824	GTTTC	2	10	168232	168241	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3575	NC_005824	GTT	2	6	168256	168261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_005824	AATC	2	8	168480	168487	50 %	25 %	0 %	25 %	45655723
3577	NC_005824	GAT	3	9	168570	168578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655723
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3580	NC_005824	TAG	2	6	169010	169015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655723
3581	NC_005824	TGC	2	6	169089	169094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655723
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3583	NC_005824	ATGG	2	8	169185	169192	25 %	25 %	50 %	0 %	45655723
3584	NC_005824	TCC	2	6	169209	169214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655723
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3586	NC_005824	TTC	2	6	169343	169348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3589	NC_005824	TGGAT	2	10	169487	169496	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_005824	T	6	6	169496	169501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_005824	ACC	2	6	169572	169577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_005824	CT	3	6	169586	169591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_005824	CCAT	2	8	169668	169675	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_005824	AAGC	2	8	169690	169697	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_005824	T	6	6	169707	169712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_005824	TTAAA	2	10	169746	169755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_005824	CT	3	6	169852	169857	0 %	50 %	0 %	50 %	45655724
3598	NC_005824	AAGGGA	2	12	169914	169925	50 %	0 %	50 %	0 %	45655724
3599	NC_005824	GAA	2	6	170048	170053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655724
3600	NC_005824	TTC	2	6	170121	170126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655724
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3604	NC_005824	AAG	2	6	170259	170264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655724
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3606	NC_005824	TTA	2	6	170332	170337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_005824	T	6	6	170394	170399	0 %	100 %	0 %	0 %	45655725
3608	NC_005824	A	6	6	170400	170405	100 %	0 %	0 %	0 %	45655725
3609	NC_005824	T	8	8	170414	170421	0 %	100 %	0 %	0 %	45655725
3610	NC_005824	GAC	2	6	170552	170557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655725
3611	NC_005824	CGGG	2	8	170568	170575	0 %	0 %	75 %	25 %	45655725
3612	NC_005824	T	6	6	170588	170593	0 %	100 %	0 %	0 %	45655725
3613	NC_005824	GTTCAG	2	12	170649	170660	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45655725
3614	NC_005824	TTC	2	6	170695	170700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655725
3615	NC_005824	GTA	2	6	170814	170819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655725
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3617	NC_005824	AGT	2	6	170984	170989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655725
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3619	NC_005824	AAG	2	6	171232	171237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655725
3620	NC_005824	A	6	6	171275	171280	100 %	0 %	0 %	0 %	45655725
3621	NC_005824	AACA	2	8	171336	171343	75 %	0 %	0 %	25 %	45655725
3622	NC_005824	CGT	2	6	171411	171416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655725
3623	NC_005824	CGATTT	2	12	171422	171433	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45655725
3624	NC_005824	CGAT	2	8	171449	171456	25 %	25 %	25 %	25 %	45655725
3625	NC_005824	TGG	2	6	171476	171481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655725
3626	NC_005824	TAT	2	6	171484	171489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655725
3627	NC_005824	GGA	2	6	171546	171551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655725
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