MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 7462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005824	ACA	2	6	22393	22398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655604
502	NC_005824	TCT	2	6	22424	22429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655604
503	NC_005824	A	6	6	22432	22437	100 %	0 %	0 %	0 %	45655604
504	NC_005824	A	7	7	22458	22464	100 %	0 %	0 %	0 %	45655604
505	NC_005824	AGAA	2	8	22494	22501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_005824	AAC	2	6	22507	22512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_005824	T	6	6	22527	22532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_005824	TAT	2	6	22570	22575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655605
509	NC_005824	TCA	2	6	22651	22656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655605
510	NC_005824	GAT	2	6	22700	22705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655605
511	NC_005824	TTTTGT	2	12	22780	22791	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	45655605
512	NC_005824	A	6	6	22828	22833	100 %	0 %	0 %	0 %	45655605
513	NC_005824	TCT	2	6	22837	22842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655605
514	NC_005824	TACTT	2	10	22855	22864	20 %	60 %	0 %	20 %	45655605
515	NC_005824	AGGGG	2	10	22904	22913	20 %	0 %	80 %	0 %	45655605
516	NC_005824	AGT	2	6	22940	22945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655605
517	NC_005824	A	6	6	23135	23140	100 %	0 %	0 %	0 %	45655605
518	NC_005824	A	6	6	23170	23175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_005824	TCAA	2	8	23342	23349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_005824	ATTT	2	8	23356	23363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_005824	TGC	2	6	23407	23412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_005824	ATG	2	6	23435	23440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_005824	TAC	2	6	23450	23455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_005824	GAATA	2	10	23466	23475	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
525	NC_005824	T	6	6	23551	23556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_005824	TAA	2	6	23589	23594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_005824	AGT	2	6	23619	23624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_005824	ATAG	2	8	23682	23689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
529	NC_005824	TAT	2	6	23695	23700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_005824	T	6	6	23778	23783	0 %	100 %	0 %	0 %	45655606
531	NC_005824	GAA	2	6	23784	23789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655606
532	NC_005824	A	6	6	23846	23851	100 %	0 %	0 %	0 %	45655606
533	NC_005824	CGA	2	6	23853	23858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655606
534	NC_005824	A	6	6	23941	23946	100 %	0 %	0 %	0 %	45655606
535	NC_005824	TGTT	2	8	23999	24006	0 %	75 %	25 %	0 %	45655606
536	NC_005824	TCT	2	6	24020	24025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655606
537	NC_005824	AAAAAT	2	12	24032	24043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45655606
538	NC_005824	GAA	2	6	24080	24085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655606
539	NC_005824	AAT	2	6	24131	24136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655606
540	NC_005824	A	6	6	24144	24149	100 %	0 %	0 %	0 %	45655606
541	NC_005824	GTAGG	2	10	24166	24175	20 %	20 %	60 %	0 %	45655606
542	NC_005824	AGT	2	6	24194	24199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655606
543	NC_005824	A	6	6	24200	24205	100 %	0 %	0 %	0 %	45655606
544	NC_005824	GAAAAA	2	12	24250	24261	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45655606
545	NC_005824	A	8	8	24257	24264	100 %	0 %	0 %	0 %	45655606
546	NC_005824	GTC	2	6	24304	24309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655606
547	NC_005824	A	6	6	24319	24324	100 %	0 %	0 %	0 %	45655606
548	NC_005824	A	6	6	24335	24340	100 %	0 %	0 %	0 %	45655606
549	NC_005824	AAAG	2	8	24360	24367	75 %	0 %	25 %	0 %	45655606
550	NC_005824	A	6	6	24413	24418	100 %	0 %	0 %	0 %	45655606
551	NC_005824	ATA	2	6	24457	24462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655606
552	NC_005824	TA	3	6	24532	24537	50 %	50 %	0 %	0 %	45655606
553	NC_005824	TAAG	2	8	24559	24566	50 %	25 %	25 %	0 %	45655606
554	NC_005824	A	6	6	24572	24577	100 %	0 %	0 %	0 %	45655606
555	NC_005824	AATT	2	8	24580	24587	50 %	50 %	0 %	0 %	45655606
556	NC_005824	AAT	2	6	24597	24602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655606
557	NC_005824	A	7	7	24623	24629	100 %	0 %	0 %	0 %	45655606
558	NC_005824	GAA	2	6	24635	24640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655606
559	NC_005824	ATA	2	6	24641	24646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655606
560	NC_005824	ATA	2	6	24727	24732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655606
561	NC_005824	TAT	2	6	24801	24806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655606
562	NC_005824	T	6	6	24817	24822	0 %	100 %	0 %	0 %	45655606
563	NC_005824	AAAG	2	8	24827	24834	75 %	0 %	25 %	0 %	45655606
564	NC_005824	T	7	7	24941	24947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_005824	CTG	2	6	25042	25047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655608
566	NC_005824	AAG	2	6	25063	25068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655608
567	NC_005824	ATGT	2	8	25086	25093	25 %	50 %	25 %	0 %	45655608
568	NC_005824	TC	3	6	25097	25102	0 %	50 %	0 %	50 %	45655608
569	NC_005824	T	8	8	25117	25124	0 %	100 %	0 %	0 %	45655608
570	NC_005824	A	6	6	25161	25166	100 %	0 %	0 %	0 %	45655608
571	NC_005824	T	7	7	25172	25178	0 %	100 %	0 %	0 %	45655608
572	NC_005824	ACA	2	6	25265	25270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655608
573	NC_005824	CA	3	6	25342	25347	50 %	0 %	0 %	50 %	45655608
574	NC_005824	AGA	2	6	25373	25378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655608
575	NC_005824	CTAAC	2	10	25387	25396	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
576	NC_005824	TTG	2	6	25458	25463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_005824	AATT	2	8	25467	25474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_005824	CAA	2	6	25545	25550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_005824	T	6	6	25582	25587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_005824	TTAT	2	8	25670	25677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_005824	TAAA	2	8	25719	25726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_005824	TAAGT	2	10	25769	25778	40 %	40 %	20 %	0 %	45655609
583	NC_005824	TCT	2	6	25781	25786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655609
584	NC_005824	ATC	2	6	25799	25804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655609
585	NC_005824	A	7	7	25901	25907	100 %	0 %	0 %	0 %	45655609
586	NC_005824	AGA	2	6	25912	25917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655609
587	NC_005824	TCT	2	6	25925	25930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655609
588	NC_005824	CTT	2	6	25956	25961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655609
589	NC_005824	GGT	2	6	26021	26026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655609
590	NC_005824	CTA	2	6	26058	26063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655609
591	NC_005824	CTT	2	6	26064	26069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655609
592	NC_005824	TGG	2	6	26074	26079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655609
593	NC_005824	AAG	2	6	26080	26085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655609
594	NC_005824	TTC	2	6	26151	26156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655609
595	NC_005824	GCTA	2	8	26234	26241	25 %	25 %	25 %	25 %	45655609
596	NC_005824	TTC	3	9	26242	26250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655609
597	NC_005824	GAG	2	6	26286	26291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655609
598	NC_005824	AAT	2	6	26354	26359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655609
599	NC_005824	A	6	6	26406	26411	100 %	0 %	0 %	0 %	45655609
600	NC_005824	TGTC	2	8	26589	26596	0 %	50 %	25 %	25 %	45655610
601	NC_005824	T	6	6	26634	26639	0 %	100 %	0 %	0 %	45655610
602	NC_005824	CTTC	2	8	26669	26676	0 %	50 %	0 %	50 %	45655610
603	NC_005824	TAG	2	6	26678	26683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655610
604	NC_005824	ATATC	2	10	26703	26712	40 %	40 %	0 %	20 %	45655610
605	NC_005824	CG	3	6	26745	26750	0 %	0 %	50 %	50 %	45655610
606	NC_005824	AACT	2	8	26765	26772	50 %	25 %	0 %	25 %	45655610
607	NC_005824	AGA	2	6	26791	26796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655610
608	NC_005824	TC	3	6	26860	26865	0 %	50 %	0 %	50 %	45655610
609	NC_005824	GAAA	2	8	26881	26888	75 %	0 %	25 %	0 %	45655610
610	NC_005824	A	7	7	26886	26892	100 %	0 %	0 %	0 %	45655610
611	NC_005824	T	6	6	26908	26913	0 %	100 %	0 %	0 %	45655610
612	NC_005824	A	7	7	26925	26931	100 %	0 %	0 %	0 %	45655610
613	NC_005824	GAA	2	6	26977	26982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655610
614	NC_005824	AGA	2	6	27009	27014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655610
615	NC_005824	GA	3	6	27074	27079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_005824	AGT	2	6	27113	27118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655611
617	NC_005824	A	6	6	27156	27161	100 %	0 %	0 %	0 %	45655611
618	NC_005824	CAC	2	6	27210	27215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45655611
619	NC_005824	CAAAA	2	10	27350	27359	80 %	0 %	0 %	20 %	45655611
620	NC_005824	TAT	2	6	27366	27371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655611
621	NC_005824	GGT	3	9	27585	27593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655611
622	NC_005824	ATT	2	6	27642	27647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655611
623	NC_005824	TGA	2	6	27718	27723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655611
624	NC_005824	CTT	2	6	27733	27738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655611
625	NC_005824	A	7	7	27752	27758	100 %	0 %	0 %	0 %	45655611
626	NC_005824	AGAA	2	8	27764	27771	75 %	0 %	25 %	0 %	45655611
627	NC_005824	TGAT	2	8	27802	27809	25 %	50 %	25 %	0 %	45655611
628	NC_005824	AACG	2	8	27813	27820	50 %	0 %	25 %	25 %	45655611
629	NC_005824	GCG	2	6	27870	27875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655611
630	NC_005824	GAG	2	6	27925	27930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655611
631	NC_005824	TC	3	6	28077	28082	0 %	50 %	0 %	50 %	45655611
632	NC_005824	A	6	6	28097	28102	100 %	0 %	0 %	0 %	45655611
633	NC_005824	A	6	6	28104	28109	100 %	0 %	0 %	0 %	45655611
634	NC_005824	TA	3	6	28125	28130	50 %	50 %	0 %	0 %	45655611
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636	NC_005824	TGGCT	2	10	28216	28225	0 %	40 %	40 %	20 %	45655611
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