MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 4472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005823	TATGT	2	10	803	812	20 %	60 %	20 %	0 %	45655915
2	NC_005823	AATTT	2	10	1376	1385	40 %	60 %	0 %	0 %	45655915
3	NC_005823	TATAA	2	10	2368	2377	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005823	GAAAA	2	10	3132	3141	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005823	TTTAA	2	10	4481	4490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005823	GTTTT	2	10	4576	4585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005823	GGTTT	2	10	7286	7295	0 %	60 %	40 %	0 %	45655919
8	NC_005823	GGAAA	2	10	7319	7328	60 %	0 %	40 %	0 %	45655919
9	NC_005823	ACGAA	2	10	7336	7345	60 %	0 %	20 %	20 %	45655919
10	NC_005823	AGTTA	2	10	8482	8491	40 %	40 %	20 %	0 %	45655919
11	NC_005823	GGAGG	2	10	9368	9377	20 %	0 %	80 %	0 %	45655920
12	NC_005823	GAGAT	2	10	9968	9977	40 %	20 %	40 %	0 %	45655920
13	NC_005823	AAGGA	2	10	10549	10558	60 %	0 %	40 %	0 %	45655920
14	NC_005823	GGTTT	2	10	11934	11943	0 %	60 %	40 %	0 %	45655921
15	NC_005823	ATGGA	2	10	12893	12902	40 %	20 %	40 %	0 %	45655923
16	NC_005823	TCAAG	2	10	13291	13300	40 %	20 %	20 %	20 %	45655923
17	NC_005823	TCGGA	2	10	15326	15335	20 %	20 %	40 %	20 %	45655925
18	NC_005823	GTTTT	2	10	17821	17830	0 %	80 %	20 %	0 %	45655927
19	NC_005823	TTAGA	2	10	17908	17917	40 %	40 %	20 %	0 %	45655927
20	NC_005823	TAAAA	2	10	18375	18384	80 %	20 %	0 %	0 %	45655927
21	NC_005823	ATTTA	2	10	19522	19531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005823	ATAAA	2	10	19952	19961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005823	AGATT	2	10	19970	19979	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005823	GATTC	2	10	20673	20682	20 %	40 %	20 %	20 %	45655930
25	NC_005823	GCCTT	2	10	20770	20779	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_005823	ATATT	2	10	21298	21307	40 %	60 %	0 %	0 %	45655931
27	NC_005823	AAAAT	2	10	21471	21480	80 %	20 %	0 %	0 %	45655931
28	NC_005823	ATTTT	2	10	24334	24343	20 %	80 %	0 %	0 %	45655935
29	NC_005823	TAAAA	2	10	26372	26381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005823	ACTAA	2	10	27472	27481	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_005823	GAAGT	2	10	28249	28258	40 %	20 %	40 %	0 %	45655937
32	NC_005823	GAAAA	2	10	29717	29726	80 %	0 %	20 %	0 %	45655938
33	NC_005823	TATTT	2	10	30378	30387	20 %	80 %	0 %	0 %	45655938
34	NC_005823	CGATC	2	10	30986	30995	20 %	20 %	20 %	40 %	45655938
35	NC_005823	GAAAA	2	10	33651	33660	80 %	0 %	20 %	0 %	45655940
36	NC_005823	TATTT	2	10	34220	34229	20 %	80 %	0 %	0 %	45655941
37	NC_005823	GTTTG	2	10	34520	34529	0 %	60 %	40 %	0 %	45655941
38	NC_005823	TACTT	2	10	34633	34642	20 %	60 %	0 %	20 %	45655941
39	NC_005823	TTTCT	2	10	35562	35571	0 %	80 %	0 %	20 %	45655943
40	NC_005823	AGAAT	2	10	35855	35864	60 %	20 %	20 %	0 %	45655943
41	NC_005823	TACAT	2	10	36800	36809	40 %	40 %	0 %	20 %	45655944
42	NC_005823	TGTAA	2	10	37245	37254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005823	ATTTC	2	10	37636	37645	20 %	60 %	0 %	20 %	45655945
44	NC_005823	GTTTG	2	10	38643	38652	0 %	60 %	40 %	0 %	45655945
45	NC_005823	TAAAA	2	10	39694	39703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005823	AAAAT	2	10	40513	40522	80 %	20 %	0 %	0 %	45655946
47	NC_005823	TGGAA	2	10	41618	41627	40 %	20 %	40 %	0 %	45655948
48	NC_005823	TTAAA	2	10	42624	42633	60 %	40 %	0 %	0 %	45655949
49	NC_005823	GGAAA	2	10	43122	43131	60 %	0 %	40 %	0 %	45655949
50	NC_005823	ATCGA	2	10	44112	44121	40 %	20 %	20 %	20 %	45655949
51	NC_005823	GAATT	2	10	44945	44954	40 %	40 %	20 %	0 %	45655951
52	NC_005823	AAAAT	2	10	47319	47328	80 %	20 %	0 %	0 %	45655952
53	NC_005823	TTCAA	2	10	48181	48190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_005823	CAATC	2	10	48628	48637	40 %	20 %	0 %	40 %	45655953
55	NC_005823	TAAAG	2	10	49936	49945	60 %	20 %	20 %	0 %	45655954
56	NC_005823	AGATC	2	10	52429	52438	40 %	20 %	20 %	20 %	45655957
57	NC_005823	AAAAG	2	10	53125	53134	80 %	0 %	20 %	0 %	45655957
58	NC_005823	AACAT	2	10	55847	55856	60 %	20 %	0 %	20 %	45655959
59	NC_005823	TTTGA	2	10	58736	58745	20 %	60 %	20 %	0 %	45655962
60	NC_005823	TCGAT	2	10	59614	59623	20 %	40 %	20 %	20 %	45655963
61	NC_005823	AGGAT	2	10	59667	59676	40 %	20 %	40 %	0 %	45655963
62	NC_005823	TTTGT	2	10	60967	60976	0 %	80 %	20 %	0 %	45655964
63	NC_005823	TTGGT	2	10	61585	61594	0 %	60 %	40 %	0 %	45655964
64	NC_005823	GAAGA	2	10	61872	61881	60 %	0 %	40 %	0 %	45655964
65	NC_005823	TTTAT	2	10	64150	64159	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005823	GAAAA	2	10	65158	65167	80 %	0 %	20 %	0 %	45655966
67	NC_005823	AAAAC	2	10	66813	66822	80 %	0 %	0 %	20 %	45655968
68	NC_005823	AATCT	2	10	67237	67246	40 %	40 %	0 %	20 %	45655968
69	NC_005823	GGGTT	2	10	69565	69574	0 %	40 %	60 %	0 %	45655970
70	NC_005823	ATACC	2	10	71009	71018	40 %	20 %	0 %	40 %	45655971
71	NC_005823	AGATA	2	10	71631	71640	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005823	AAAAT	2	10	72437	72446	80 %	20 %	0 %	0 %	45655972
73	NC_005823	TTGAA	2	10	73889	73898	40 %	40 %	20 %	0 %	45655973
74	NC_005823	AAAGA	2	10	75465	75474	80 %	0 %	20 %	0 %	45655974
75	NC_005823	GGATT	2	10	75891	75900	20 %	40 %	40 %	0 %	45655974
76	NC_005823	GGAAA	2	10	76264	76273	60 %	0 %	40 %	0 %	45655974
77	NC_005823	ATTTG	2	10	78020	78029	20 %	60 %	20 %	0 %	45655974
78	NC_005823	GGTTT	2	10	78571	78580	0 %	60 %	40 %	0 %	45655975
79	NC_005823	TTTTG	2	10	78591	78600	0 %	80 %	20 %	0 %	45655975
80	NC_005823	TCACT	2	10	80283	80292	20 %	40 %	0 %	40 %	45655977
81	NC_005823	AAGAA	2	10	81645	81654	80 %	0 %	20 %	0 %	45655977
82	NC_005823	AGAAT	2	10	82528	82537	60 %	20 %	20 %	0 %	45655977
83	NC_005823	AATTA	2	10	82734	82743	60 %	40 %	0 %	0 %	45655977
84	NC_005823	CTAAA	2	10	83447	83456	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_005823	AATCA	2	10	85283	85292	60 %	20 %	0 %	20 %	45655980
86	NC_005823	AATAC	2	10	85621	85630	60 %	20 %	0 %	20 %	45655980
87	NC_005823	TTCTT	2	10	85769	85778	0 %	80 %	0 %	20 %	45655981
88	NC_005823	ATTAA	2	10	86758	86767	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005823	ATTTT	2	10	87775	87784	20 %	80 %	0 %	0 %	45655983
90	NC_005823	GGATT	2	10	88196	88205	20 %	40 %	40 %	0 %	45655984
91	NC_005823	ATATT	2	10	89138	89147	40 %	60 %	0 %	0 %	45655984
92	NC_005823	AAGGA	2	10	90515	90524	60 %	0 %	40 %	0 %	45655985
93	NC_005823	AGGAA	2	10	91451	91460	60 %	0 %	40 %	0 %	45655986
94	NC_005823	CGGAA	2	10	94439	94448	40 %	0 %	40 %	20 %	45655990
95	NC_005823	TTGAG	2	10	94864	94873	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005823	CCCAC	2	10	95031	95040	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
97	NC_005823	ATTTT	2	10	95556	95565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005823	TCAGA	2	10	96324	96333	40 %	20 %	20 %	20 %	45655991
99	NC_005823	GTTTT	2	10	97045	97054	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005823	ATTTT	2	10	99341	99350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005823	GTAGA	2	10	99999	100008	40 %	20 %	40 %	0 %	45655996
102	NC_005823	CTTTC	2	10	101321	101330	0 %	60 %	0 %	40 %	45655997
103	NC_005823	GATTG	2	10	101687	101696	20 %	40 %	40 %	0 %	45655997
104	NC_005823	TAAAA	2	10	102945	102954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005823	ATATT	2	10	103569	103578	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005823	TTGTA	2	10	104073	104082	20 %	60 %	20 %	0 %	45655999
107	NC_005823	TGTAC	2	10	104392	104401	20 %	40 %	20 %	20 %	45655999
108	NC_005823	CTTTT	2	10	104530	104539	0 %	80 %	0 %	20 %	45655999
109	NC_005823	ATTTT	2	10	108652	108661	20 %	80 %	0 %	0 %	45656003
110	NC_005823	CAAAT	2	10	109159	109168	60 %	20 %	0 %	20 %	45656003
111	NC_005823	TTATT	2	10	109304	109313	20 %	80 %	0 %	0 %	45656003
112	NC_005823	TATAA	2	10	110221	110230	60 %	40 %	0 %	0 %	45656004
113	NC_005823	ATTTT	2	10	111379	111388	20 %	80 %	0 %	0 %	45656005
114	NC_005823	AAAAT	2	10	115136	115145	80 %	20 %	0 %	0 %	45656009
115	NC_005823	TTTGT	2	10	115204	115213	0 %	80 %	20 %	0 %	45656009
116	NC_005823	AAAAT	2	10	115467	115476	80 %	20 %	0 %	0 %	45656009
117	NC_005823	TGGTT	2	10	115672	115681	0 %	60 %	40 %	0 %	45656009
118	NC_005823	AATTT	2	10	116667	116676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005823	ACTTT	2	10	116845	116854	20 %	60 %	0 %	20 %	45656010
120	NC_005823	AAGAA	2	10	117683	117692	80 %	0 %	20 %	0 %	45656010
121	NC_005823	AAATC	2	10	118169	118178	60 %	20 %	0 %	20 %	45656010
122	NC_005823	ATACA	2	10	119519	119528	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_005823	CCTTT	2	10	122783	122792	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_005823	TTTCT	2	10	123327	123336	0 %	80 %	0 %	20 %	45656014
125	NC_005823	AAAAT	2	10	123538	123547	80 %	20 %	0 %	0 %	45656015
126	NC_005823	AATCG	2	10	126672	126681	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_005823	ATTAA	2	10	127095	127104	60 %	40 %	0 %	0 %	45656018
128	NC_005823	TCCAA	2	10	127553	127562	40 %	20 %	0 %	40 %	45656018
129	NC_005823	ATTTT	2	10	127867	127876	20 %	80 %	0 %	0 %	45656019
130	NC_005823	ACAAT	2	10	128065	128074	60 %	20 %	0 %	20 %	45656020
131	NC_005823	CTTTT	2	10	128192	128201	0 %	80 %	0 %	20 %	45656020
132	NC_005823	AAAAT	2	10	132077	132086	80 %	20 %	0 %	0 %	45656025
133	NC_005823	AGATC	2	10	133128	133137	40 %	20 %	20 %	20 %	45656025
134	NC_005823	TTTTA	2	10	133284	133293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005823	GAAAA	2	10	134517	134526	80 %	0 %	20 %	0 %	45656027
136	NC_005823	ATTTT	2	10	134799	134808	20 %	80 %	0 %	0 %	45656027
137	NC_005823	GAAAA	2	10	134882	134891	80 %	0 %	20 %	0 %	45656027
138	NC_005823	AAAGA	2	10	135389	135398	80 %	0 %	20 %	0 %	45656027
139	NC_005823	ATTCG	2	10	136612	136621	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_005823	TAGGT	2	10	137426	137435	20 %	40 %	40 %	0 %	45656028
141	NC_005823	ATTGA	2	10	139449	139458	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_005823	ATTCA	2	10	140375	140384	40 %	40 %	0 %	20 %	45656030
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252	NC_005823	TAATA	2	10	241106	241115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_005823	TAAAA	2	10	247445	247454	80 %	20 %	0 %	0 %	45656122
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270	NC_005823	AAAAT	2	10	261849	261858	80 %	20 %	0 %	0 %	45656132
271	NC_005823	ATTGG	3	15	263433	263447	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
272	NC_005823	TAAAT	2	10	265494	265503	60 %	40 %	0 %	0 %	45656135
273	NC_005823	TGAAA	2	10	265537	265546	60 %	20 %	20 %	0 %	45656135
274	NC_005823	AGTTT	2	10	266184	266193	20 %	60 %	20 %	0 %	45656135
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279	NC_005823	ACAAA	2	10	271410	271419	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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398	NC_005823	CAAAA	2	10	374010	374019	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
399	NC_005823	AATAA	3	15	374952	374966	80 %	20 %	0 %	0 %	45656233
400	NC_005823	TCAAT	2	10	375840	375849	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
401	NC_005823	AGATT	2	10	376054	376063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
402	NC_005823	CATTT	2	10	376808	376817	20 %	60 %	0 %	20 %	45656235
403	NC_005823	TTTGA	2	10	376929	376938	20 %	60 %	20 %	0 %	45656235
404	NC_005823	ATTCT	2	10	376950	376959	20 %	60 %	0 %	20 %	45656235
405	NC_005823	CAAAA	2	10	377041	377050	80 %	0 %	0 %	20 %	45656235
406	NC_005823	CTTAT	2	10	378884	378893	20 %	60 %	0 %	20 %	45656237
407	NC_005823	TTCCG	2	10	378917	378926	0 %	40 %	20 %	40 %	45656237
408	NC_005823	GTTTT	2	10	383349	383358	0 %	80 %	20 %	0 %	45656241
409	NC_005823	ATGAT	2	10	384347	384356	40 %	40 %	20 %	0 %	45656243
410	NC_005823	GATTT	2	10	385334	385343	20 %	60 %	20 %	0 %	45656243
411	NC_005823	GTTCC	2	10	386307	386316	0 %	40 %	20 %	40 %	45656243
412	NC_005823	TTTAA	2	10	386713	386722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_005823	AGGAC	2	10	386992	387001	40 %	0 %	40 %	20 %	45656244
414	NC_005823	TTTTG	2	10	387623	387632	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
415	NC_005823	TCTTA	2	10	388431	388440	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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420	NC_005823	GTTGT	2	10	392578	392587	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
421	NC_005823	AATAG	2	10	392661	392670	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_005823	ATTTT	2	10	395875	395884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_005823	AAAAG	2	10	414579	414588	80 %	0 %	20 %	0 %	45656269
451	NC_005823	AAATT	2	10	416295	416304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_005823	TTTGG	2	10	416541	416550	0 %	60 %	40 %	0 %	45656271
453	NC_005823	TTTAA	2	10	417434	417443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_005823	TATTC	2	10	417790	417799	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
455	NC_005823	GAATT	2	10	417883	417892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
456	NC_005823	AGGGT	2	10	419613	419622	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
457	NC_005823	ATTTT	2	10	420311	420320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_005823	AGGGT	2	10	423397	423406	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
463	NC_005823	TTTAT	2	10	423693	423702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_005823	AAAAT	2	10	431607	431616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_005823	ATTGA	2	10	436068	436077	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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