MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 13104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005823	TCAT	2	8	23	30	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005823	GTTT	2	8	169	176	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005823	AGAA	2	8	462	469	75 %	0 %	25 %	0 %	45655915
4	NC_005823	ATGA	2	8	829	836	50 %	25 %	25 %	0 %	45655915
5	NC_005823	GAAA	2	8	991	998	75 %	0 %	25 %	0 %	45655915
6	NC_005823	GAAA	2	8	1293	1300	75 %	0 %	25 %	0 %	45655915
7	NC_005823	AGAA	3	12	1414	1425	75 %	0 %	25 %	0 %	45655915
8	NC_005823	TTTA	2	8	1451	1458	25 %	75 %	0 %	0 %	45655915
9	NC_005823	ATTC	2	8	1625	1632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_005823	GGTT	2	8	2116	2123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005823	TTTA	2	8	2442	2449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005823	TAAA	2	8	2591	2598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005823	AATT	2	8	2821	2828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005823	AAAT	2	8	3057	3064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005823	TTAA	2	8	3250	3257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005823	TCAA	2	8	3432	3439	50 %	25 %	0 %	25 %	45655916
17	NC_005823	CTTC	2	8	3849	3856	0 %	50 %	0 %	50 %	45655916
18	NC_005823	ATTG	2	8	4004	4011	25 %	50 %	25 %	0 %	45655916
19	NC_005823	ATTT	2	8	4367	4374	25 %	75 %	0 %	0 %	45655916
20	NC_005823	GAAA	2	8	6284	6291	75 %	0 %	25 %	0 %	45655918
21	NC_005823	TCGT	2	8	6445	6452	0 %	50 %	25 %	25 %	45655918
22	NC_005823	TTCT	2	8	7245	7252	0 %	75 %	0 %	25 %	45655919
23	NC_005823	TTTC	2	8	7368	7375	0 %	75 %	0 %	25 %	45655919
24	NC_005823	AAAC	2	8	7393	7400	75 %	0 %	0 %	25 %	45655919
25	NC_005823	ACAA	2	8	7505	7512	75 %	0 %	0 %	25 %	45655919
26	NC_005823	TTAA	2	8	8306	8313	50 %	50 %	0 %	0 %	45655919
27	NC_005823	GAAC	2	8	8851	8858	50 %	0 %	25 %	25 %	45655920
28	NC_005823	TGAT	2	8	9000	9007	25 %	50 %	25 %	0 %	45655920
29	NC_005823	ACTT	2	8	9189	9196	25 %	50 %	0 %	25 %	45655920
30	NC_005823	TAAA	2	8	9495	9502	75 %	25 %	0 %	0 %	45655920
31	NC_005823	ACTT	2	8	9985	9992	25 %	50 %	0 %	25 %	45655920
32	NC_005823	TTGT	2	8	10092	10099	0 %	75 %	25 %	0 %	45655920
33	NC_005823	CCAT	2	8	12123	12130	25 %	25 %	0 %	50 %	45655922
34	NC_005823	TTCT	2	8	12740	12747	0 %	75 %	0 %	25 %	45655923
35	NC_005823	GATT	2	8	13595	13602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005823	TTCT	2	8	13781	13788	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_005823	TTTC	2	8	13807	13814	0 %	75 %	0 %	25 %	45655924
38	NC_005823	CATT	2	8	14057	14064	25 %	50 %	0 %	25 %	45655924
39	NC_005823	TCTT	2	8	14080	14087	0 %	75 %	0 %	25 %	45655924
40	NC_005823	AGTA	2	8	14094	14101	50 %	25 %	25 %	0 %	45655924
41	NC_005823	AGAT	2	8	14122	14129	50 %	25 %	25 %	0 %	45655924
42	NC_005823	TGTA	2	8	14871	14878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005823	ACTT	2	8	15022	15029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_005823	TCCA	2	8	15668	15675	25 %	25 %	0 %	50 %	45655925
45	NC_005823	ATTT	2	8	15925	15932	25 %	75 %	0 %	0 %	45655926
46	NC_005823	ATGG	2	8	15996	16003	25 %	25 %	50 %	0 %	45655926
47	NC_005823	AGAA	2	8	16022	16029	75 %	0 %	25 %	0 %	45655926
48	NC_005823	ATTT	2	8	16858	16865	25 %	75 %	0 %	0 %	45655926
49	NC_005823	ATTT	2	8	16935	16942	25 %	75 %	0 %	0 %	45655926
50	NC_005823	AATC	3	12	17029	17040	50 %	25 %	0 %	25 %	45655926
51	NC_005823	ACAA	2	8	17105	17112	75 %	0 %	0 %	25 %	45655926
52	NC_005823	AGAA	2	8	17933	17940	75 %	0 %	25 %	0 %	45655927
53	NC_005823	TGAG	2	8	18016	18023	25 %	25 %	50 %	0 %	45655927
54	NC_005823	TAAA	2	8	19907	19914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005823	TTGC	2	8	20500	20507	0 %	50 %	25 %	25 %	45655930
56	NC_005823	AAAG	2	8	21784	21791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005823	ATCG	2	8	22082	22089	25 %	25 %	25 %	25 %	45655932
58	NC_005823	ATTT	2	8	22366	22373	25 %	75 %	0 %	0 %	45655933
59	NC_005823	AAAG	2	8	22739	22746	75 %	0 %	25 %	0 %	45655933
60	NC_005823	TTCT	2	8	23122	23129	0 %	75 %	0 %	25 %	45655934
61	NC_005823	AGAA	2	8	23458	23465	75 %	0 %	25 %	0 %	45655934
62	NC_005823	ATTT	2	8	23496	23503	25 %	75 %	0 %	0 %	45655934
63	NC_005823	TGTT	2	8	24053	24060	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005823	TACA	2	8	24610	24617	50 %	25 %	0 %	25 %	45655935
65	NC_005823	ATTG	2	8	24722	24729	25 %	50 %	25 %	0 %	45655935
66	NC_005823	TATT	2	8	24911	24918	25 %	75 %	0 %	0 %	45655935
67	NC_005823	ATTA	2	8	24951	24958	50 %	50 %	0 %	0 %	45655935
68	NC_005823	CGGT	2	8	25228	25235	0 %	25 %	50 %	25 %	45655935
69	NC_005823	TTAT	2	8	25258	25265	25 %	75 %	0 %	0 %	45655935
70	NC_005823	GGAT	2	8	25370	25377	25 %	25 %	50 %	0 %	45655935
71	NC_005823	ATTT	2	8	25384	25391	25 %	75 %	0 %	0 %	45655935
72	NC_005823	TTGG	2	8	25491	25498	0 %	50 %	50 %	0 %	45655935
73	NC_005823	AATT	2	8	25920	25927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005823	GTTT	2	8	26087	26094	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005823	TAGT	2	8	26442	26449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005823	ATAA	2	8	26664	26671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005823	TTCA	2	8	27138	27145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_005823	AGAC	2	8	27280	27287	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_005823	AATT	2	8	27396	27403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005823	TTAA	2	8	27483	27490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005823	TAAT	2	8	27935	27942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005823	GAAT	2	8	27966	27973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005823	TTTC	2	8	28107	28114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_005823	ATGA	2	8	28141	28148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005823	AAAC	2	8	28198	28205	75 %	0 %	0 %	25 %	45655937
86	NC_005823	GATT	2	8	28415	28422	25 %	50 %	25 %	0 %	45655937
87	NC_005823	ACTT	2	8	28484	28491	25 %	50 %	0 %	25 %	45655937
88	NC_005823	TTCT	2	8	28591	28598	0 %	75 %	0 %	25 %	45655937
89	NC_005823	TTCT	2	8	28627	28634	0 %	75 %	0 %	25 %	45655937
90	NC_005823	AGTC	2	8	28691	28698	25 %	25 %	25 %	25 %	45655937
91	NC_005823	GAAA	2	8	28731	28738	75 %	0 %	25 %	0 %	45655937
92	NC_005823	ACTT	2	8	29047	29054	25 %	50 %	0 %	25 %	45655937
93	NC_005823	CATA	2	8	29288	29295	50 %	25 %	0 %	25 %	45655938
94	NC_005823	AGAT	2	8	29403	29410	50 %	25 %	25 %	0 %	45655938
95	NC_005823	ATTA	2	8	29517	29524	50 %	50 %	0 %	0 %	45655938
96	NC_005823	ATTC	2	8	29611	29618	25 %	50 %	0 %	25 %	45655938
97	NC_005823	ATTT	2	8	29659	29666	25 %	75 %	0 %	0 %	45655938
98	NC_005823	AAAC	2	8	29734	29741	75 %	0 %	0 %	25 %	45655938
99	NC_005823	ATTT	2	8	30013	30020	25 %	75 %	0 %	0 %	45655938
100	NC_005823	GTAT	2	8	30451	30458	25 %	50 %	25 %	0 %	45655938
101	NC_005823	TTTA	2	8	30533	30540	25 %	75 %	0 %	0 %	45655938
102	NC_005823	TAAA	2	8	30611	30618	75 %	25 %	0 %	0 %	45655938
103	NC_005823	AGAA	2	8	30632	30639	75 %	0 %	25 %	0 %	45655938
104	NC_005823	TAGA	2	8	30680	30687	50 %	25 %	25 %	0 %	45655938
105	NC_005823	TCGG	2	8	30706	30713	0 %	25 %	50 %	25 %	45655938
106	NC_005823	AAAG	2	8	31264	31271	75 %	0 %	25 %	0 %	45655938
107	NC_005823	AATC	2	8	31316	31323	50 %	25 %	0 %	25 %	45655938
108	NC_005823	ATTT	2	8	31456	31463	25 %	75 %	0 %	0 %	45655938
109	NC_005823	GTTT	2	8	31545	31552	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005823	ACAG	2	8	32019	32026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_005823	AATT	2	8	32197	32204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005823	TCAA	2	8	33382	33389	50 %	25 %	0 %	25 %	45655940
113	NC_005823	GTTT	2	8	33979	33986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005823	TTCT	2	8	34300	34307	0 %	75 %	0 %	25 %	45655941
115	NC_005823	TCAT	2	8	34422	34429	25 %	50 %	0 %	25 %	45655941
116	NC_005823	GAAA	2	8	35342	35349	75 %	0 %	25 %	0 %	45655943
117	NC_005823	GCTG	2	8	35404	35411	0 %	25 %	50 %	25 %	45655943
118	NC_005823	ATCG	2	8	35791	35798	25 %	25 %	25 %	25 %	45655943
119	NC_005823	GGAA	2	8	35866	35873	50 %	0 %	50 %	0 %	45655943
120	NC_005823	TCTT	2	8	35938	35945	0 %	75 %	0 %	25 %	45655943
121	NC_005823	ATCA	2	8	36254	36261	50 %	25 %	0 %	25 %	45655944
122	NC_005823	TTCT	2	8	36292	36299	0 %	75 %	0 %	25 %	45655944
123	NC_005823	ATCG	2	8	36344	36351	25 %	25 %	25 %	25 %	45655944
124	NC_005823	TGAA	2	8	36401	36408	50 %	25 %	25 %	0 %	45655944
125	NC_005823	ATGT	2	8	37116	37123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005823	AATT	2	8	37365	37372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005823	TCTT	2	8	37497	37504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_005823	AGAA	2	8	37651	37658	75 %	0 %	25 %	0 %	45655945
129	NC_005823	TTTC	2	8	37702	37709	0 %	75 %	0 %	25 %	45655945
130	NC_005823	CATC	2	8	38110	38117	25 %	25 %	0 %	50 %	45655945
131	NC_005823	TGAA	2	8	38968	38975	50 %	25 %	25 %	0 %	45655945
132	NC_005823	TATT	2	8	39116	39123	25 %	75 %	0 %	0 %	45655945
133	NC_005823	CCAA	2	8	39208	39215	50 %	0 %	0 %	50 %	45655945
134	NC_005823	TTTC	2	8	39537	39544	0 %	75 %	0 %	25 %	45655945
135	NC_005823	CTTT	2	8	39625	39632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_005823	GAAA	2	8	39634	39641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005823	TTAA	2	8	39643	39650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005823	AAGT	2	8	39991	39998	50 %	25 %	25 %	0 %	45655946
139	NC_005823	TATC	2	8	40175	40182	25 %	50 %	0 %	25 %	45655946
140	NC_005823	GAAG	2	8	40340	40347	50 %	0 %	50 %	0 %	45655946
141	NC_005823	AATT	2	8	40528	40535	50 %	50 %	0 %	0 %	45655946
142	NC_005823	TTCT	2	8	40736	40743	0 %	75 %	0 %	25 %	45655947
143	NC_005823	AGGA	2	8	40751	40758	50 %	0 %	50 %	0 %	45655947
144	NC_005823	AAAT	2	8	41950	41957	75 %	25 %	0 %	0 %	45655949
145	NC_005823	AAAG	2	8	43172	43179	75 %	0 %	25 %	0 %	45655949
146	NC_005823	GAAT	3	12	43242	43253	50 %	25 %	25 %	0 %	45655949
147	NC_005823	GAAA	2	8	43309	43316	75 %	0 %	25 %	0 %	45655949
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