MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 91992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_005823	TTC	2	6	43515	43520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655949
1003	NC_005823	TTCG	2	8	43569	43576	0 %	50 %	25 %	25 %	45655949
1004	NC_005823	TTA	2	6	43651	43656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655949
1005	NC_005823	ACT	2	6	43698	43703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655949
1006	NC_005823	GAA	2	6	43799	43804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655949
1007	NC_005823	ATT	2	6	43866	43871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655949
1008	NC_005823	A	6	6	43899	43904	100 %	0 %	0 %	0 %	45655949
1009	NC_005823	CTG	2	6	43977	43982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655949
1010	NC_005823	TCT	2	6	44000	44005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655949
1011	NC_005823	ATCGA	2	10	44112	44121	40 %	20 %	20 %	20 %	45655949
1012	NC_005823	GAA	2	6	44126	44131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655949
1013	NC_005823	A	6	6	44153	44158	100 %	0 %	0 %	0 %	45655949
1014	NC_005823	AAAG	2	8	44164	44171	75 %	0 %	25 %	0 %	45655949
1015	NC_005823	AAAT	2	8	44179	44186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_005823	CCAT	2	8	44326	44333	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_005823	T	6	6	44386	44391	0 %	100 %	0 %	0 %	45655950
1018	NC_005823	GAAA	2	8	44479	44486	75 %	0 %	25 %	0 %	45655950
1019	NC_005823	TA	4	8	44576	44583	50 %	50 %	0 %	0 %	45655950
1020	NC_005823	ATT	2	6	44615	44620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655950
1021	NC_005823	GAA	2	6	44631	44636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655950
1022	NC_005823	CTT	2	6	44640	44645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655950
1023	NC_005823	AGA	2	6	44704	44709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655950
1024	NC_005823	AG	3	6	44711	44716	50 %	0 %	50 %	0 %	45655950
1025	NC_005823	TAT	2	6	44724	44729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655950
1026	NC_005823	CTT	2	6	44739	44744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655950
1027	NC_005823	AGAC	2	8	44780	44787	50 %	0 %	25 %	25 %	45655950
1028	NC_005823	CTT	2	6	44791	44796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655950
1029	NC_005823	AT	3	6	44848	44853	50 %	50 %	0 %	0 %	45655950
1030	NC_005823	GGC	2	6	44855	44860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655951
1031	NC_005823	CAG	2	6	44865	44870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655951
1032	NC_005823	A	7	7	44893	44899	100 %	0 %	0 %	0 %	45655951
1033	NC_005823	A	7	7	44914	44920	100 %	0 %	0 %	0 %	45655951
1034	NC_005823	GAATT	2	10	44945	44954	40 %	40 %	20 %	0 %	45655951
1035	NC_005823	GGT	2	6	44984	44989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655951
1036	NC_005823	GAA	2	6	45041	45046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655951
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1039	NC_005823	TCC	2	6	45211	45216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655951
1040	NC_005823	GAA	2	6	45230	45235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655951
1041	NC_005823	TTC	2	6	45292	45297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655951
1042	NC_005823	ATA	3	9	45351	45359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655951
1043	NC_005823	AAT	2	6	45413	45418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655951
1044	NC_005823	ATG	2	6	45555	45560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655951
1045	NC_005823	A	6	6	45606	45611	100 %	0 %	0 %	0 %	45655951
1046	NC_005823	AGT	4	12	45652	45663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655951
1047	NC_005823	GAA	2	6	45729	45734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655951
1048	NC_005823	ATA	2	6	45843	45848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655951
1049	NC_005823	TTGG	2	8	45862	45869	0 %	50 %	50 %	0 %	45655951
1050	NC_005823	CTT	2	6	45900	45905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655951
1051	NC_005823	GAA	2	6	46032	46037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655951
1052	NC_005823	A	7	7	46209	46215	100 %	0 %	0 %	0 %	45655951
1053	NC_005823	GTG	2	6	46235	46240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655951
1054	NC_005823	TAC	2	6	46390	46395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655951
1055	NC_005823	A	7	7	46435	46441	100 %	0 %	0 %	0 %	45655951
1056	NC_005823	GAA	2	6	46500	46505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_005823	AT	3	6	46518	46523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_005823	TAT	2	6	46535	46540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_005823	A	6	6	46576	46581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_005823	T	7	7	46625	46631	0 %	100 %	0 %	0 %	45655952
1061	NC_005823	T	7	7	46635	46641	0 %	100 %	0 %	0 %	45655952
1062	NC_005823	TTCT	2	8	46645	46652	0 %	75 %	0 %	25 %	45655952
1063	NC_005823	AAG	2	6	46677	46682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655952
1064	NC_005823	AGA	2	6	46802	46807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655952
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1066	NC_005823	A	6	6	46887	46892	100 %	0 %	0 %	0 %	45655952
1067	NC_005823	A	6	6	46986	46991	100 %	0 %	0 %	0 %	45655952
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1071	NC_005823	GTA	2	6	47033	47038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655952
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1078	NC_005823	A	6	6	47177	47182	100 %	0 %	0 %	0 %	45655952
1079	NC_005823	AAAAT	2	10	47319	47328	80 %	20 %	0 %	0 %	45655952
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1082	NC_005823	ATA	2	6	47445	47450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655952
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1084	NC_005823	GGAAAA	2	12	47647	47658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655952
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1087	NC_005823	GAGGAA	2	12	47780	47791	50 %	0 %	50 %	0 %	45655952
1088	NC_005823	TTA	3	9	47821	47829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655952
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1091	NC_005823	TATT	2	8	47894	47901	25 %	75 %	0 %	0 %	45655952
1092	NC_005823	A	6	6	47934	47939	100 %	0 %	0 %	0 %	45655952
1093	NC_005823	ATAC	2	8	47947	47954	50 %	25 %	0 %	25 %	45655952
1094	NC_005823	AGC	2	6	47959	47964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655952
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1096	NC_005823	GAA	2	6	47999	48004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655952
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1098	NC_005823	T	6	6	48046	48051	0 %	100 %	0 %	0 %	45655952
1099	NC_005823	ATA	2	6	48087	48092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655952
1100	NC_005823	GTT	2	6	48129	48134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_005823	TTCAA	2	10	48181	48190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1102	NC_005823	AATT	2	8	48206	48213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_005823	CAA	2	6	48217	48222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_005823	T	6	6	48257	48262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_005823	GTT	2	6	48383	48388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655953
1106	NC_005823	ACA	2	6	48392	48397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655953
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1108	NC_005823	TAAA	2	8	48611	48618	75 %	25 %	0 %	0 %	45655953
1109	NC_005823	CAATC	2	10	48628	48637	40 %	20 %	0 %	40 %	45655953
1110	NC_005823	ATT	2	6	48783	48788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655953
1111	NC_005823	TTC	2	6	48803	48808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655953
1112	NC_005823	T	7	7	48809	48815	0 %	100 %	0 %	0 %	45655953
1113	NC_005823	TTC	2	6	48878	48883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655953
1114	NC_005823	CTA	2	6	48892	48897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655953
1115	NC_005823	T	6	6	48965	48970	0 %	100 %	0 %	0 %	45655953
1116	NC_005823	TGGA	2	8	49059	49066	25 %	25 %	50 %	0 %	45655954
1117	NC_005823	TAG	2	6	49180	49185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655954
1118	NC_005823	TCA	2	6	49195	49200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655954
1119	NC_005823	CTT	2	6	49234	49239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655954
1120	NC_005823	T	6	6	49244	49249	0 %	100 %	0 %	0 %	45655954
1121	NC_005823	ATCTTT	2	12	49382	49393	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45655954
1122	NC_005823	CAT	2	6	49402	49407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655954
1123	NC_005823	TCAAAC	2	12	49414	49425	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45655954
1124	NC_005823	GAT	2	6	49447	49452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655954
1125	NC_005823	AGCT	2	8	49550	49557	25 %	25 %	25 %	25 %	45655954
1126	NC_005823	CTT	2	6	49570	49575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655954
1127	NC_005823	AAC	2	6	49595	49600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655954
1128	NC_005823	TTG	2	6	49672	49677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655954
1129	NC_005823	A	7	7	49785	49791	100 %	0 %	0 %	0 %	45655954
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1131	NC_005823	T	8	8	49828	49835	0 %	100 %	0 %	0 %	45655954
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1262	NC_005823	A	7	7	55837	55843	100 %	0 %	0 %	0 %	45655959
1263	NC_005823	AACAT	2	10	55847	55856	60 %	20 %	0 %	20 %	45655959
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