MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 91992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005823	ATCG	2	8	22082	22089	25 %	25 %	25 %	25 %	45655932
502	NC_005823	GAT	2	6	22103	22108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655932
503	NC_005823	AGA	2	6	22123	22128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655932
504	NC_005823	A	8	8	22161	22168	100 %	0 %	0 %	0 %	45655932
505	NC_005823	A	6	6	22172	22177	100 %	0 %	0 %	0 %	45655932
506	NC_005823	A	6	6	22210	22215	100 %	0 %	0 %	0 %	45655932
507	NC_005823	A	7	7	22267	22273	100 %	0 %	0 %	0 %	45655932
508	NC_005823	ACA	2	6	22333	22338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655932
509	NC_005823	ATTT	2	8	22366	22373	25 %	75 %	0 %	0 %	45655933
510	NC_005823	TTC	2	6	22478	22483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655933
511	NC_005823	AAG	2	6	22497	22502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655933
512	NC_005823	ATT	2	6	22566	22571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655933
513	NC_005823	TAA	2	6	22634	22639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655933
514	NC_005823	T	6	6	22649	22654	0 %	100 %	0 %	0 %	45655933
515	NC_005823	AGA	2	6	22658	22663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655933
516	NC_005823	ATC	2	6	22677	22682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655933
517	NC_005823	TTA	2	6	22721	22726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655933
518	NC_005823	AAAG	2	8	22739	22746	75 %	0 %	25 %	0 %	45655933
519	NC_005823	GAT	2	6	22928	22933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655933
520	NC_005823	AGA	2	6	23000	23005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655933
521	NC_005823	TAG	2	6	23008	23013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655933
522	NC_005823	T	8	8	23023	23030	0 %	100 %	0 %	0 %	45655933
523	NC_005823	TCT	2	6	23043	23048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655933
524	NC_005823	GTA	2	6	23070	23075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655933
525	NC_005823	GGA	2	6	23079	23084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655933
526	NC_005823	TTCT	2	8	23122	23129	0 %	75 %	0 %	25 %	45655934
527	NC_005823	A	6	6	23149	23154	100 %	0 %	0 %	0 %	45655934
528	NC_005823	ACA	2	6	23162	23167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655934
529	NC_005823	TA	3	6	23199	23204	50 %	50 %	0 %	0 %	45655934
530	NC_005823	TTG	2	6	23229	23234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655934
531	NC_005823	CT	4	8	23302	23309	0 %	50 %	0 %	50 %	45655934
532	NC_005823	TA	3	6	23343	23348	50 %	50 %	0 %	0 %	45655934
533	NC_005823	ATG	2	6	23362	23367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655934
534	NC_005823	TGA	2	6	23377	23382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655934
535	NC_005823	A	7	7	23382	23388	100 %	0 %	0 %	0 %	45655934
536	NC_005823	CTTTTA	2	12	23401	23412	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45655934
537	NC_005823	TAA	2	6	23423	23428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655934
538	NC_005823	AGAA	2	8	23458	23465	75 %	0 %	25 %	0 %	45655934
539	NC_005823	GAATTC	2	12	23476	23487	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45655934
540	NC_005823	ATTT	2	8	23496	23503	25 %	75 %	0 %	0 %	45655934
541	NC_005823	ATG	2	6	23560	23565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655934
542	NC_005823	ATC	2	6	23571	23576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655934
543	NC_005823	A	6	6	23593	23598	100 %	0 %	0 %	0 %	45655934
544	NC_005823	GGA	2	6	23631	23636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655934
545	NC_005823	TA	3	6	23769	23774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_005823	TTG	2	6	23781	23786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_005823	AAC	2	6	23870	23875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_005823	TGA	2	6	23878	23883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_005823	T	7	7	23936	23942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_005823	TAA	2	6	23958	23963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_005823	TGTT	2	8	24053	24060	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_005823	A	7	7	24103	24109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_005823	TCT	2	6	24164	24169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_005823	ATTTTT	2	12	24224	24235	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45655935
555	NC_005823	TG	3	6	24238	24243	0 %	50 %	50 %	0 %	45655935
556	NC_005823	T	6	6	24310	24315	0 %	100 %	0 %	0 %	45655935
557	NC_005823	ATTTT	2	10	24334	24343	20 %	80 %	0 %	0 %	45655935
558	NC_005823	CTA	2	6	24568	24573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655935
559	NC_005823	GA	3	6	24596	24601	50 %	0 %	50 %	0 %	45655935
560	NC_005823	TACA	2	8	24610	24617	50 %	25 %	0 %	25 %	45655935
561	NC_005823	ATTG	2	8	24722	24729	25 %	50 %	25 %	0 %	45655935
562	NC_005823	GATGGA	2	12	24858	24869	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	45655935
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564	NC_005823	TATT	2	8	24911	24918	25 %	75 %	0 %	0 %	45655935
565	NC_005823	ATTA	2	8	24951	24958	50 %	50 %	0 %	0 %	45655935
566	NC_005823	TTGGTG	2	12	24967	24978	0 %	50 %	50 %	0 %	45655935
567	NC_005823	CAA	2	6	25122	25127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655935
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570	NC_005823	CTT	2	6	25252	25257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655935
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573	NC_005823	TGC	2	6	25289	25294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655935
574	NC_005823	GGAT	2	8	25370	25377	25 %	25 %	50 %	0 %	45655935
575	NC_005823	ATTT	2	8	25384	25391	25 %	75 %	0 %	0 %	45655935
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577	NC_005823	ATTTAT	2	12	25432	25443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655935
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579	NC_005823	TCT	2	6	25556	25561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655935
580	NC_005823	TCT	2	6	25664	25669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655935
581	NC_005823	TA	3	6	25803	25808	50 %	50 %	0 %	0 %	45655935
582	NC_005823	TCG	2	6	25849	25854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655935
583	NC_005823	AATT	2	8	25920	25927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_005823	A	6	6	25961	25966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_005823	TTC	2	6	25992	25997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_005823	GTA	2	6	26051	26056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_005823	GTTT	2	8	26087	26094	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_005823	ATG	2	6	26100	26105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_005823	GAA	2	6	26134	26139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_005823	T	6	6	26175	26180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_005823	TGA	2	6	26217	26222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_005823	GAT	3	9	26261	26269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_005823	TAG	2	6	26285	26290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_005823	T	6	6	26351	26356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_005823	TAAAA	2	10	26372	26381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_005823	TAGT	2	8	26442	26449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
597	NC_005823	ATT	2	6	26473	26478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_005823	ATA	2	6	26638	26643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_005823	ATAA	2	8	26664	26671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_005823	AAT	2	6	26687	26692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_005823	TAC	2	6	26714	26719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_005823	TAT	2	6	26720	26725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_005823	CTT	2	6	26754	26759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655936
604	NC_005823	TAG	2	6	26827	26832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655936
605	NC_005823	TTC	2	6	26842	26847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655936
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607	NC_005823	AAT	2	6	26912	26917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655936
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611	NC_005823	TTTCAA	2	12	27073	27084	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45655936
612	NC_005823	T	6	6	27107	27112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_005823	TTCA	2	8	27138	27145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_005823	TTA	2	6	27158	27163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_005823	T	6	6	27173	27178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_005823	ATA	2	6	27181	27186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_005823	GTT	2	6	27209	27214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_005823	AGAC	2	8	27280	27287	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
619	NC_005823	ATT	2	6	27295	27300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_005823	ACT	2	6	27353	27358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_005823	AATT	2	8	27396	27403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_005823	TAT	2	6	27466	27471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_005823	ACTAA	2	10	27472	27481	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
624	NC_005823	TTAA	2	8	27483	27490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_005823	ATA	2	6	27528	27533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_005823	A	6	6	27580	27585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_005823	TAT	2	6	27646	27651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_005823	TAT	2	6	27763	27768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_005823	CA	3	6	27879	27884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_005823	TTG	2	6	27917	27922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_005823	TAAT	2	8	27935	27942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_005823	GAAT	2	8	27966	27973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_005823	TTA	2	6	28006	28011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_005823	AGA	2	6	28097	28102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_005823	TTTC	2	8	28107	28114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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