MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 1644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005362	TTGAA	2	10	3120	3129	40 %	40 %	20 %	0 %	42518088
2	NC_005362	TTGCA	2	10	5052	5061	20 %	40 %	20 %	20 %	42518089
3	NC_005362	AAGGT	2	10	5904	5913	40 %	20 %	40 %	0 %	42518089
4	NC_005362	CAGAC	2	10	7102	7111	40 %	0 %	20 %	40 %	42518090
5	NC_005362	TTTGA	2	10	10188	10197	20 %	60 %	20 %	0 %	42518094
6	NC_005362	CTAAT	2	10	10627	10636	40 %	40 %	0 %	20 %	42518094
7	NC_005362	AGTGA	2	10	10755	10764	40 %	20 %	40 %	0 %	42518094
8	NC_005362	TATAA	2	10	11044	11053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005362	AAAAT	2	10	11549	11558	80 %	20 %	0 %	0 %	42518095
10	NC_005362	TTTAT	2	10	11830	11839	20 %	80 %	0 %	0 %	42518095
11	NC_005362	CTATA	2	10	15003	15012	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_005362	TTTTA	2	10	17192	17201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005362	ATTTA	2	10	17502	17511	40 %	60 %	0 %	0 %	42518100
14	NC_005362	TTAGT	2	10	17951	17960	20 %	60 %	20 %	0 %	42518100
15	NC_005362	ACGTA	2	10	19267	19276	40 %	20 %	20 %	20 %	42518100
16	NC_005362	AAAAT	2	10	19410	19419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005362	TAACT	2	10	19425	19434	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_005362	TAAAT	2	10	21912	21921	60 %	40 %	0 %	0 %	42518102
19	NC_005362	TATTT	2	10	23617	23626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005362	GCTAA	2	10	23673	23682	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_005362	CTCTT	2	10	24245	24254	0 %	60 %	0 %	40 %	42518104
22	NC_005362	TGATG	2	10	25198	25207	20 %	40 %	40 %	0 %	42518105
23	NC_005362	TAATT	2	10	25856	25865	40 %	60 %	0 %	0 %	42518106
24	NC_005362	ATTGG	2	10	27221	27230	20 %	40 %	40 %	0 %	42518107
25	NC_005362	TAAAA	2	10	27532	27541	80 %	20 %	0 %	0 %	42518107
26	NC_005362	ATGTT	2	10	27672	27681	20 %	60 %	20 %	0 %	42518107
27	NC_005362	AACTA	2	10	27787	27796	60 %	20 %	0 %	20 %	42518107
28	NC_005362	AATCA	2	10	27959	27968	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_005362	ACGTT	2	10	28065	28074	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_005362	AGCCC	2	10	28932	28941	20 %	0 %	20 %	60 %	42518108
31	NC_005362	ATCTT	2	10	29032	29041	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_005362	TAAAT	2	10	29104	29113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005362	TTGAT	2	10	29557	29566	20 %	60 %	20 %	0 %	42518109
34	NC_005362	AGAAA	2	10	33944	33953	80 %	0 %	20 %	0 %	42518113
35	NC_005362	GGGAT	2	10	37133	37142	20 %	20 %	60 %	0 %	42518114
36	NC_005362	AAAAG	2	10	40097	40106	80 %	0 %	20 %	0 %	42518116
37	NC_005362	AGCTT	2	10	41237	41246	20 %	40 %	20 %	20 %	42518117
38	NC_005362	TTGGT	2	10	41541	41550	0 %	60 %	40 %	0 %	42518117
39	NC_005362	AGGAA	2	10	44481	44490	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005362	AAAGG	2	10	44613	44622	60 %	0 %	40 %	0 %	42518120
41	NC_005362	GAGAA	2	10	49122	49131	60 %	0 %	40 %	0 %	42518124
42	NC_005362	CATTA	2	10	50572	50581	40 %	40 %	0 %	20 %	42518127
43	NC_005362	ATCAA	2	10	51650	51659	60 %	20 %	0 %	20 %	42518128
44	NC_005362	AAATT	2	10	51696	51705	60 %	40 %	0 %	0 %	42518128
45	NC_005362	TGAAT	2	10	52190	52199	40 %	40 %	20 %	0 %	42518128
46	NC_005362	GTGAA	2	10	55124	55133	40 %	20 %	40 %	0 %	42518131
47	NC_005362	GAAAT	2	10	57710	57719	60 %	20 %	20 %	0 %	42518132
48	NC_005362	AGAGA	2	10	58498	58507	60 %	0 %	40 %	0 %	42518132
49	NC_005362	GAAAA	2	10	58552	58561	80 %	0 %	20 %	0 %	42518132
50	NC_005362	TTTTG	2	10	58726	58735	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005362	ATTTA	2	10	58817	58826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005362	CGGTA	2	10	60145	60154	20 %	20 %	40 %	20 %	42518133
53	NC_005362	AAGAT	2	10	61692	61701	60 %	20 %	20 %	0 %	42518133
54	NC_005362	GAATG	2	10	63482	63491	40 %	20 %	40 %	0 %	42518133
55	NC_005362	GAATG	2	10	64307	64316	40 %	20 %	40 %	0 %	42518133
56	NC_005362	CAGCA	2	10	65934	65943	40 %	0 %	20 %	40 %	42518134
57	NC_005362	TACAG	2	10	68485	68494	40 %	20 %	20 %	20 %	42518134
58	NC_005362	TATAA	2	10	70457	70466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005362	ATGGG	2	10	71217	71226	20 %	20 %	60 %	0 %	42518136
60	NC_005362	GAAAT	2	10	72257	72266	60 %	20 %	20 %	0 %	42518137
61	NC_005362	ATGCA	2	10	75244	75253	40 %	20 %	20 %	20 %	42518139
62	NC_005362	AAATT	2	10	75582	75591	60 %	40 %	0 %	0 %	42518139
63	NC_005362	ATAAA	2	10	75642	75651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005362	GTTTT	2	10	76676	76685	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005362	CCTTG	2	10	77602	77611	0 %	40 %	20 %	40 %	42518142
66	NC_005362	ATAGC	2	10	78735	78744	40 %	20 %	20 %	20 %	42518143
67	NC_005362	CATTT	2	10	79041	79050	20 %	60 %	0 %	20 %	42518143
68	NC_005362	GCCCA	2	10	80117	80126	20 %	0 %	20 %	60 %	42518144
69	NC_005362	CTTTT	2	10	81549	81558	0 %	80 %	0 %	20 %	42518145
70	NC_005362	TGTAT	2	10	82900	82909	20 %	60 %	20 %	0 %	42518146
71	NC_005362	TTTTC	2	10	83039	83048	0 %	80 %	0 %	20 %	42518146
72	NC_005362	ATCTT	2	10	83606	83615	20 %	60 %	0 %	20 %	42518147
73	NC_005362	TAAAT	2	10	86083	86092	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005362	CAATT	2	10	86203	86212	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_005362	AGCTG	2	10	86347	86356	20 %	20 %	40 %	20 %	42518150
76	NC_005362	AATCT	2	10	86520	86529	40 %	40 %	0 %	20 %	42518150
77	NC_005362	AAAAG	2	10	87472	87481	80 %	0 %	20 %	0 %	42518150
78	NC_005362	AGTAA	2	10	87719	87728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005362	CTTGA	2	10	87969	87978	20 %	40 %	20 %	20 %	42518151
80	NC_005362	TGACT	2	10	88175	88184	20 %	40 %	20 %	20 %	42518151
81	NC_005362	TTCAA	2	10	88713	88722	40 %	40 %	0 %	20 %	42518152
82	NC_005362	CAGAT	2	10	90783	90792	40 %	20 %	20 %	20 %	42518153
83	NC_005362	GTGAT	2	10	94508	94517	20 %	40 %	40 %	0 %	42518156
84	NC_005362	ATAAA	2	10	95127	95136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005362	AGATA	2	10	95358	95367	60 %	20 %	20 %	0 %	42518157
86	NC_005362	CCATA	2	10	95632	95641	40 %	20 %	0 %	40 %	42518157
87	NC_005362	GATTC	2	10	95887	95896	20 %	40 %	20 %	20 %	42518158
88	NC_005362	AAGAA	2	10	95998	96007	80 %	0 %	20 %	0 %	42518158
89	NC_005362	TTGCA	2	10	97212	97221	20 %	40 %	20 %	20 %	42518159
90	NC_005362	CTCTT	2	10	97380	97389	0 %	60 %	0 %	40 %	42518159
91	NC_005362	AAATT	2	10	97911	97920	60 %	40 %	0 %	0 %	42518160
92	NC_005362	AGAAT	2	10	98405	98414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005362	AGATG	2	10	102610	102619	40 %	20 %	40 %	0 %	42518165
94	NC_005362	TAATA	2	10	102946	102955	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005362	TAATG	2	10	105910	105919	40 %	40 %	20 %	0 %	42518168
96	NC_005362	AGAGT	2	10	106521	106530	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005362	AAAAG	2	10	108636	108645	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005362	ACGGT	2	10	109978	109987	20 %	20 %	40 %	20 %	42518173
99	NC_005362	TTAAG	2	10	109988	109997	40 %	40 %	20 %	0 %	42518173
100	NC_005362	CAATA	2	10	111167	111176	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_005362	TTCTT	2	10	112450	112459	0 %	80 %	0 %	20 %	42518175
102	NC_005362	TTAAG	2	10	112524	112533	40 %	40 %	20 %	0 %	42518175
103	NC_005362	AATAC	2	10	112599	112608	60 %	20 %	0 %	20 %	42518176
104	NC_005362	GTGAT	2	10	115192	115201	20 %	40 %	40 %	0 %	42518180
105	NC_005362	TTTTA	2	10	115323	115332	20 %	80 %	0 %	0 %	42518181
106	NC_005362	AGCGA	2	10	115546	115555	40 %	0 %	40 %	20 %	42518181
107	NC_005362	ATAAA	2	10	116637	116646	80 %	20 %	0 %	0 %	42518181
108	NC_005362	CTTTT	2	10	118311	118320	0 %	80 %	0 %	20 %	42518183
109	NC_005362	TTGAT	2	10	120007	120016	20 %	60 %	20 %	0 %	42518185
110	NC_005362	AGATC	2	10	120487	120496	40 %	20 %	20 %	20 %	42518185
111	NC_005362	ATACT	2	10	121816	121825	40 %	40 %	0 %	20 %	42518187
112	NC_005362	ATGAT	2	10	123528	123537	40 %	40 %	20 %	0 %	42518189
113	NC_005362	AGACA	2	10	123550	123559	60 %	0 %	20 %	20 %	42518189
114	NC_005362	TTATC	2	10	124304	124313	20 %	60 %	0 %	20 %	42518190
115	NC_005362	GAATA	2	10	125658	125667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005362	TTATT	2	10	127488	127497	20 %	80 %	0 %	0 %	42518193
117	NC_005362	TCGAT	2	10	130068	130077	20 %	40 %	20 %	20 %	42518194
118	NC_005362	TAAAT	2	10	131947	131956	60 %	40 %	0 %	0 %	42518196
119	NC_005362	TTAGT	2	10	132747	132756	20 %	60 %	20 %	0 %	42518197
120	NC_005362	AAAGA	2	10	134702	134711	80 %	0 %	20 %	0 %	42518200
121	NC_005362	ATGAC	2	10	135471	135480	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_005362	TTTTC	2	10	135487	135496	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_005362	AGTAA	2	10	136335	136344	60 %	20 %	20 %	0 %	42518201
124	NC_005362	GTTTA	2	10	136449	136458	20 %	60 %	20 %	0 %	42518201
125	NC_005362	TTAAA	2	10	138585	138594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005362	GAAAA	2	10	138768	138777	80 %	0 %	20 %	0 %	42518202
127	NC_005362	CGATT	2	10	138856	138865	20 %	40 %	20 %	20 %	42518202
128	NC_005362	AAAGA	2	10	139571	139580	80 %	0 %	20 %	0 %	42518203
129	NC_005362	AAGTT	2	10	146977	146986	40 %	40 %	20 %	0 %	42518211
130	NC_005362	ATTTT	2	10	148804	148813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005362	TGATA	2	10	149539	149548	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005362	TAAAT	2	10	150837	150846	60 %	40 %	0 %	0 %	42518216
133	NC_005362	TACTT	2	10	150991	151000	20 %	60 %	0 %	20 %	42518216
134	NC_005362	CAATA	2	10	155180	155189	60 %	20 %	0 %	20 %	42518220
135	NC_005362	AAGAA	2	10	155626	155635	80 %	0 %	20 %	0 %	42518221
136	NC_005362	TTGAA	2	10	157838	157847	40 %	40 %	20 %	0 %	42518222
137	NC_005362	ATAGA	2	10	158860	158869	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005362	TCAAG	2	10	159774	159783	40 %	20 %	20 %	20 %	42518223
139	NC_005362	ACTTA	2	10	159938	159947	40 %	40 %	0 %	20 %	42518223
140	NC_005362	AAGAA	2	10	161883	161892	80 %	0 %	20 %	0 %	42518225
141	NC_005362	TAAAG	2	10	162421	162430	60 %	20 %	20 %	0 %	42518225
142	NC_005362	TATAA	2	10	165066	165075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005362	TTACT	2	10	165486	165495	20 %	60 %	0 %	20 %	42518228
144	NC_005362	AATAA	2	10	166197	166206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_005362	CAAAA	2	10	166857	166866	80 %	0 %	0 %	20 %	42518229
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148	NC_005362	ATTAC	2	10	170330	170339	40 %	40 %	0 %	20 %	42518231
149	NC_005362	CTTAA	2	10	173493	173502	40 %	40 %	0 %	20 %	42518233
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251	NC_005362	CTTCA	2	10	284505	284514	20 %	40 %	0 %	40 %	42518340
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254	NC_005362	AGTAA	2	10	285964	285973	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_005362	TAGAT	2	10	308550	308559	40 %	40 %	20 %	0 %	42518362
263	NC_005362	AATTT	2	10	309672	309681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_005362	AATGT	2	10	319037	319046	40 %	40 %	20 %	0 %	42518370
272	NC_005362	CTTTA	2	10	319490	319499	20 %	60 %	0 %	20 %	42518370
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