MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 6069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005362	AGTA	2	8	358	365	50 %	25 %	25 %	0 %	42518085
2	NC_005362	ATGC	2	8	1273	1280	25 %	25 %	25 %	25 %	42518085
3	NC_005362	TAAA	2	8	1505	1512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005362	GATC	2	8	1751	1758	25 %	25 %	25 %	25 %	42518086
5	NC_005362	AAAG	2	8	1828	1835	75 %	0 %	25 %	0 %	42518086
6	NC_005362	GAAA	2	8	3033	3040	75 %	0 %	25 %	0 %	42518087
7	NC_005362	ATTT	2	8	3085	3092	25 %	75 %	0 %	0 %	42518087
8	NC_005362	ATTT	2	8	3230	3237	25 %	75 %	0 %	0 %	42518088
9	NC_005362	AATT	2	8	3279	3286	50 %	50 %	0 %	0 %	42518088
10	NC_005362	AATG	2	8	3433	3440	50 %	25 %	25 %	0 %	42518088
11	NC_005362	AATT	2	8	3526	3533	50 %	50 %	0 %	0 %	42518088
12	NC_005362	TAAA	2	8	4257	4264	75 %	25 %	0 %	0 %	42518089
13	NC_005362	ACGA	2	8	4425	4432	50 %	0 %	25 %	25 %	42518089
14	NC_005362	GAAA	2	8	4692	4699	75 %	0 %	25 %	0 %	42518089
15	NC_005362	TCGT	2	8	4782	4789	0 %	50 %	25 %	25 %	42518089
16	NC_005362	AAAG	2	8	4913	4920	75 %	0 %	25 %	0 %	42518089
17	NC_005362	TTAT	2	8	5549	5556	25 %	75 %	0 %	0 %	42518089
18	NC_005362	ATCT	2	8	6471	6478	25 %	50 %	0 %	25 %	42518090
19	NC_005362	ATTG	2	8	6645	6652	25 %	50 %	25 %	0 %	42518090
20	NC_005362	ACTT	2	8	6712	6719	25 %	50 %	0 %	25 %	42518090
21	NC_005362	CTTA	2	8	7009	7016	25 %	50 %	0 %	25 %	42518090
22	NC_005362	GCAA	2	8	7193	7200	50 %	0 %	25 %	25 %	42518090
23	NC_005362	GAAT	2	8	7207	7214	50 %	25 %	25 %	0 %	42518090
24	NC_005362	AATT	2	8	7441	7448	50 %	50 %	0 %	0 %	42518090
25	NC_005362	GCAA	2	8	7556	7563	50 %	0 %	25 %	25 %	42518090
26	NC_005362	AAAG	2	8	7919	7926	75 %	0 %	25 %	0 %	42518090
27	NC_005362	TAAT	2	8	8017	8024	50 %	50 %	0 %	0 %	42518090
28	NC_005362	GTTC	2	8	8247	8254	0 %	50 %	25 %	25 %	42518090
29	NC_005362	TTAC	2	8	8905	8912	25 %	50 %	0 %	25 %	42518091
30	NC_005362	AAAG	2	8	8942	8949	75 %	0 %	25 %	0 %	42518091
31	NC_005362	GATC	2	8	8954	8961	25 %	25 %	25 %	25 %	42518091
32	NC_005362	TGCT	2	8	11004	11011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_005362	AAGC	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_005362	AGGA	2	8	11096	11103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005362	ATTA	2	8	11223	11230	50 %	50 %	0 %	0 %	42518095
36	NC_005362	TTTA	2	8	11615	11622	25 %	75 %	0 %	0 %	42518095
37	NC_005362	TATT	2	8	12347	12354	25 %	75 %	0 %	0 %	42518095
38	NC_005362	ATTA	2	8	12468	12475	50 %	50 %	0 %	0 %	42518095
39	NC_005362	GAAA	2	8	12756	12763	75 %	0 %	25 %	0 %	42518095
40	NC_005362	TTAC	2	8	13899	13906	25 %	50 %	0 %	25 %	42518097
41	NC_005362	AATT	2	8	14205	14212	50 %	50 %	0 %	0 %	42518097
42	NC_005362	CTGA	2	8	14396	14403	25 %	25 %	25 %	25 %	42518097
43	NC_005362	TGAG	2	8	14487	14494	25 %	25 %	50 %	0 %	42518097
44	NC_005362	CCTT	2	8	14772	14779	0 %	50 %	0 %	50 %	42518097
45	NC_005362	ATTA	2	8	14994	15001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005362	AAAT	2	8	15077	15084	75 %	25 %	0 %	0 %	42518098
47	NC_005362	TGGT	2	8	15323	15330	0 %	50 %	50 %	0 %	42518098
48	NC_005362	AAAT	2	8	15602	15609	75 %	25 %	0 %	0 %	42518098
49	NC_005362	GAAG	2	8	15642	15649	50 %	0 %	50 %	0 %	42518098
50	NC_005362	AAAG	2	8	16278	16285	75 %	0 %	25 %	0 %	42518099
51	NC_005362	AAAT	2	8	16334	16341	75 %	25 %	0 %	0 %	42518099
52	NC_005362	TTTC	2	8	16568	16575	0 %	75 %	0 %	25 %	42518099
53	NC_005362	TTCA	2	8	16788	16795	25 %	50 %	0 %	25 %	42518099
54	NC_005362	TGAA	2	8	16974	16981	50 %	25 %	25 %	0 %	42518099
55	NC_005362	TAGC	2	8	17468	17475	25 %	25 %	25 %	25 %	42518100
56	NC_005362	TGAT	2	8	17829	17836	25 %	50 %	25 %	0 %	42518100
57	NC_005362	TCAA	2	8	18658	18665	50 %	25 %	0 %	25 %	42518100
58	NC_005362	CCTA	2	8	18777	18784	25 %	25 %	0 %	50 %	42518100
59	NC_005362	CCAA	2	8	19118	19125	50 %	0 %	0 %	50 %	42518100
60	NC_005362	ATTT	2	8	19643	19650	25 %	75 %	0 %	0 %	42518101
61	NC_005362	TAGG	2	8	19702	19709	25 %	25 %	50 %	0 %	42518101
62	NC_005362	ATAA	2	8	19776	19783	75 %	25 %	0 %	0 %	42518101
63	NC_005362	ACCT	2	8	20531	20538	25 %	25 %	0 %	50 %	42518101
64	NC_005362	CATC	2	8	20693	20700	25 %	25 %	0 %	50 %	42518101
65	NC_005362	TAAT	2	8	21242	21249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005362	TAAA	2	8	21524	21531	75 %	25 %	0 %	0 %	42518102
67	NC_005362	CAGC	2	8	22141	22148	25 %	0 %	25 %	50 %	42518102
68	NC_005362	AGGA	2	8	22325	22332	50 %	0 %	50 %	0 %	42518102
69	NC_005362	TTAA	2	8	22405	22412	50 %	50 %	0 %	0 %	42518102
70	NC_005362	AGAT	2	8	22685	22692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005362	CTTG	2	8	22929	22936	0 %	50 %	25 %	25 %	42518103
72	NC_005362	CATT	2	8	22977	22984	25 %	50 %	0 %	25 %	42518103
73	NC_005362	TTTA	2	8	23095	23102	25 %	75 %	0 %	0 %	42518103
74	NC_005362	ATTG	2	8	23277	23284	25 %	50 %	25 %	0 %	42518103
75	NC_005362	TTCA	2	8	23664	23671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_005362	AAAG	2	8	24337	24344	75 %	0 %	25 %	0 %	42518104
77	NC_005362	ATTT	2	8	24841	24848	25 %	75 %	0 %	0 %	42518105
78	NC_005362	TAAA	2	8	24888	24895	75 %	25 %	0 %	0 %	42518105
79	NC_005362	TTTA	2	8	24980	24987	25 %	75 %	0 %	0 %	42518105
80	NC_005362	AATT	2	8	25019	25026	50 %	50 %	0 %	0 %	42518105
81	NC_005362	AATA	2	8	25115	25122	75 %	25 %	0 %	0 %	42518105
82	NC_005362	AAAG	2	8	25467	25474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005362	TAAA	2	8	25771	25778	75 %	25 %	0 %	0 %	42518106
84	NC_005362	AATT	2	8	26059	26066	50 %	50 %	0 %	0 %	42518106
85	NC_005362	TTTA	2	8	26108	26115	25 %	75 %	0 %	0 %	42518106
86	NC_005362	AAGA	2	8	26725	26732	75 %	0 %	25 %	0 %	42518107
87	NC_005362	CTTT	2	8	26825	26832	0 %	75 %	0 %	25 %	42518107
88	NC_005362	TATT	2	8	26874	26881	25 %	75 %	0 %	0 %	42518107
89	NC_005362	TGGA	2	8	26999	27006	25 %	25 %	50 %	0 %	42518107
90	NC_005362	TATT	2	8	27461	27468	25 %	75 %	0 %	0 %	42518107
91	NC_005362	AGAA	2	8	27700	27707	75 %	0 %	25 %	0 %	42518107
92	NC_005362	TAGG	2	8	28130	28137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005362	GTCC	2	8	28454	28461	0 %	25 %	25 %	50 %	42518108
94	NC_005362	AAAC	2	8	28635	28642	75 %	0 %	0 %	25 %	42518108
95	NC_005362	CTTT	2	8	28697	28704	0 %	75 %	0 %	25 %	42518108
96	NC_005362	AATT	2	8	29143	29150	50 %	50 %	0 %	0 %	42518109
97	NC_005362	TGCA	2	8	29203	29210	25 %	25 %	25 %	25 %	42518109
98	NC_005362	ATGA	2	8	29391	29398	50 %	25 %	25 %	0 %	42518109
99	NC_005362	GGAT	2	8	29669	29676	25 %	25 %	50 %	0 %	42518109
100	NC_005362	TATT	2	8	29869	29876	25 %	75 %	0 %	0 %	42518110
101	NC_005362	ACCA	2	8	29887	29894	50 %	0 %	0 %	50 %	42518110
102	NC_005362	TTTC	2	8	29982	29989	0 %	75 %	0 %	25 %	42518110
103	NC_005362	TTTC	2	8	30745	30752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_005362	TAAT	2	8	30987	30994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005362	TGAT	2	8	31373	31380	25 %	50 %	25 %	0 %	42518111
106	NC_005362	CTAT	2	8	31399	31406	25 %	50 %	0 %	25 %	42518111
107	NC_005362	AAAC	2	8	32146	32153	75 %	0 %	0 %	25 %	42518111
108	NC_005362	ATTT	2	8	32441	32448	25 %	75 %	0 %	0 %	42518111
109	NC_005362	AAAC	2	8	32778	32785	75 %	0 %	0 %	25 %	42518111
110	NC_005362	AGAT	2	8	32822	32829	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005362	GGAC	2	8	32968	32975	25 %	0 %	50 %	25 %	42518112
112	NC_005362	TAAT	2	8	33057	33064	50 %	50 %	0 %	0 %	42518112
113	NC_005362	GAAT	2	8	33201	33208	50 %	25 %	25 %	0 %	42518112
114	NC_005362	ATCT	2	8	33353	33360	25 %	50 %	0 %	25 %	42518112
115	NC_005362	TTTC	2	8	33537	33544	0 %	75 %	0 %	25 %	42518112
116	NC_005362	TTTA	2	8	33682	33689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005362	AATC	2	8	34370	34377	50 %	25 %	0 %	25 %	42518113
118	NC_005362	AATT	2	8	34417	34424	50 %	50 %	0 %	0 %	42518113
119	NC_005362	TGAA	2	8	34603	34610	50 %	25 %	25 %	0 %	42518113
120	NC_005362	GCAG	2	8	34649	34656	25 %	0 %	50 %	25 %	42518113
121	NC_005362	ACTC	2	8	35057	35064	25 %	25 %	0 %	50 %	42518113
122	NC_005362	TTTA	2	8	35326	35333	25 %	75 %	0 %	0 %	42518113
123	NC_005362	TTGC	2	8	35990	35997	0 %	50 %	25 %	25 %	42518114
124	NC_005362	AATA	2	8	36215	36222	75 %	25 %	0 %	0 %	42518114
125	NC_005362	TAAT	2	8	36598	36605	50 %	50 %	0 %	0 %	42518114
126	NC_005362	GGCC	2	8	36805	36812	0 %	0 %	50 %	50 %	42518114
127	NC_005362	TAAT	2	8	37222	37229	50 %	50 %	0 %	0 %	42518114
128	NC_005362	TGGC	2	8	37668	37675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_005362	ATTT	2	8	38323	38330	25 %	75 %	0 %	0 %	42518115
130	NC_005362	ATTT	2	8	38903	38910	25 %	75 %	0 %	0 %	42518115
131	NC_005362	TAAT	2	8	39184	39191	50 %	50 %	0 %	0 %	42518115
132	NC_005362	AAAG	2	8	39228	39235	75 %	0 %	25 %	0 %	42518115
133	NC_005362	TAAT	2	8	39571	39578	50 %	50 %	0 %	0 %	42518115
134	NC_005362	AGTC	2	8	39750	39757	25 %	25 %	25 %	25 %	42518116
135	NC_005362	ATAA	2	8	40206	40213	75 %	25 %	0 %	0 %	42518116
136	NC_005362	AGAA	2	8	40220	40227	75 %	0 %	25 %	0 %	42518116
137	NC_005362	CTTA	2	8	41800	41807	25 %	50 %	0 %	25 %	42518117
138	NC_005362	TTTG	2	8	41920	41927	0 %	75 %	25 %	0 %	42518117
139	NC_005362	TCTT	2	8	42184	42191	0 %	75 %	0 %	25 %	42518118
140	NC_005362	GAAT	2	8	42265	42272	50 %	25 %	25 %	0 %	42518118
141	NC_005362	ACTG	2	8	42772	42779	25 %	25 %	25 %	25 %	42518118
142	NC_005362	TAAT	2	8	43409	43416	50 %	50 %	0 %	0 %	42518119
143	NC_005362	TTAA	2	8	43813	43820	50 %	50 %	0 %	0 %	42518119
144	NC_005362	TAAT	2	8	44320	44327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005362	AATC	2	8	44418	44425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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