MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 46256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005362	TCA	2	6	149748	149753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_005362	T	7	7	149763	149769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_005362	T	6	6	149787	149792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_005362	AGG	2	6	149797	149802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_005362	ATG	2	6	149805	149810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518215
3506	NC_005362	A	6	6	149820	149825	100 %	0 %	0 %	0 %	42518215
3507	NC_005362	TAG	2	6	149830	149835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518215
3508	NC_005362	TGT	2	6	149858	149863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518215
3509	NC_005362	GCT	2	6	149949	149954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518215
3510	NC_005362	A	6	6	149986	149991	100 %	0 %	0 %	0 %	42518215
3511	NC_005362	ACA	2	6	150043	150048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518215
3512	NC_005362	GTT	2	6	150051	150056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518215
3513	NC_005362	A	6	6	150072	150077	100 %	0 %	0 %	0 %	42518215
3514	NC_005362	ACC	2	6	150095	150100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518215
3515	NC_005362	GCT	2	6	150132	150137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518215
3516	NC_005362	TGG	2	6	150179	150184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518215
3517	NC_005362	TAA	2	6	150194	150199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518215
3518	NC_005362	AAG	2	6	150234	150239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518215
3519	NC_005362	CTT	2	6	150301	150306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518215
3520	NC_005362	CAG	2	6	150307	150312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518215
3521	NC_005362	AGTT	2	8	150373	150380	25 %	50 %	25 %	0 %	42518215
3522	NC_005362	GCA	2	6	150435	150440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518215
3523	NC_005362	A	6	6	150471	150476	100 %	0 %	0 %	0 %	42518215
3524	NC_005362	AAG	2	6	150627	150632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518215
3525	NC_005362	ATT	2	6	150714	150719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518215
3526	NC_005362	TAAA	2	8	150743	150750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_005362	TTAG	2	8	150753	150760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_005362	AAT	2	6	150817	150822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_005362	TAAAT	2	10	150837	150846	60 %	40 %	0 %	0 %	42518216
3530	NC_005362	CTA	2	6	150852	150857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518216
3531	NC_005362	GAT	2	6	150865	150870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518216
3532	NC_005362	A	6	6	150877	150882	100 %	0 %	0 %	0 %	42518216
3533	NC_005362	TAG	4	12	150957	150968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518216
3534	NC_005362	TACTT	2	10	150991	151000	20 %	60 %	0 %	20 %	42518216
3535	NC_005362	TAT	2	6	151039	151044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518216
3536	NC_005362	CTA	2	6	151183	151188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518216
3537	NC_005362	AAC	2	6	151201	151206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518216
3538	NC_005362	ACA	2	6	151312	151317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518216
3539	NC_005362	ATT	2	6	151361	151366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518216
3540	NC_005362	TGA	2	6	151372	151377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518216
3541	NC_005362	GAA	2	6	151442	151447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518216
3542	NC_005362	ATG	2	6	151542	151547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518216
3543	NC_005362	TGG	2	6	151594	151599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518216
3544	NC_005362	GAA	2	6	151616	151621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518216
3545	NC_005362	TCTT	2	8	151717	151724	0 %	75 %	0 %	25 %	42518217
3546	NC_005362	TAA	2	6	151763	151768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518217
3547	NC_005362	AAT	2	6	151967	151972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518217
3548	NC_005362	TTG	2	6	152020	152025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518217
3549	NC_005362	GTT	2	6	152088	152093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518217
3550	NC_005362	ATT	2	6	152096	152101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518217
3551	NC_005362	ATT	2	6	152175	152180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518217
3552	NC_005362	TACT	3	12	152203	152214	25 %	50 %	0 %	25 %	42518217
3553	NC_005362	AT	3	6	152273	152278	50 %	50 %	0 %	0 %	42518217
3554	NC_005362	GGT	2	6	152286	152291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518217
3555	NC_005362	ACA	2	6	152306	152311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518217
3556	NC_005362	TTA	2	6	152359	152364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518217
3557	NC_005362	TTA	2	6	152377	152382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518217
3558	NC_005362	CTA	2	6	152395	152400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518217
3559	NC_005362	TGA	2	6	152416	152421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518217
3560	NC_005362	AAT	2	6	152422	152427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518217
3561	NC_005362	TAC	2	6	152431	152436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518218
3562	NC_005362	A	6	6	152441	152446	100 %	0 %	0 %	0 %	42518218
3563	NC_005362	CCT	2	6	152450	152455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42518218
3564	NC_005362	AAG	3	9	152471	152479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518218
3565	NC_005362	ATT	2	6	152519	152524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518218
3566	NC_005362	TTG	2	6	152589	152594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518218
3567	NC_005362	TA	3	6	152625	152630	50 %	50 %	0 %	0 %	42518218
3568	NC_005362	GTG	2	6	152637	152642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518218
3569	NC_005362	ATT	2	6	152708	152713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518218
3570	NC_005362	TTA	2	6	152835	152840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518218
3571	NC_005362	TGCT	2	8	152901	152908	0 %	50 %	25 %	25 %	42518218
3572	NC_005362	GAA	2	6	152939	152944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518218
3573	NC_005362	TGG	2	6	152971	152976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518218
3574	NC_005362	ATT	2	6	152990	152995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518218
3575	NC_005362	CTA	2	6	153003	153008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518218
3576	NC_005362	TGG	2	6	153100	153105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518218
3577	NC_005362	TAT	2	6	153175	153180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518218
3578	NC_005362	GTT	3	9	153188	153196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518218
3579	NC_005362	CTGG	2	8	153210	153217	0 %	25 %	50 %	25 %	42518218
3580	NC_005362	GAAA	2	8	153222	153229	75 %	0 %	25 %	0 %	42518218
3581	NC_005362	TAAT	2	8	153236	153243	50 %	50 %	0 %	0 %	42518218
3582	NC_005362	T	7	7	153299	153305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_005362	A	8	8	153339	153346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_005362	T	6	6	153351	153356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_005362	AGG	2	6	153380	153385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_005362	CAA	2	6	153460	153465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518219
3587	NC_005362	GAA	2	6	153529	153534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518219
3588	NC_005362	TAC	2	6	153559	153564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518219
3589	NC_005362	TAC	2	6	153593	153598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518219
3590	NC_005362	TAAC	2	8	153638	153645	50 %	25 %	0 %	25 %	42518219
3591	NC_005362	TA	3	6	153752	153757	50 %	50 %	0 %	0 %	42518219
3592	NC_005362	AAT	2	6	153865	153870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518219
3593	NC_005362	T	7	7	153895	153901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_005362	TGA	2	6	153905	153910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_005362	TGAT	2	8	153954	153961	25 %	50 %	25 %	0 %	42518220
3596	NC_005362	GAT	2	6	153985	153990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518220
3597	NC_005362	GAAA	2	8	153993	154000	75 %	0 %	25 %	0 %	42518220
3598	NC_005362	GAA	2	6	154085	154090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518220
3599	NC_005362	TAA	2	6	154222	154227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518220
3600	NC_005362	CGT	2	6	154238	154243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518220
3601	NC_005362	TAG	2	6	154272	154277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518220
3602	NC_005362	A	6	6	154285	154290	100 %	0 %	0 %	0 %	42518220
3603	NC_005362	AC	3	6	154340	154345	50 %	0 %	0 %	50 %	42518220
3604	NC_005362	TGGA	3	12	154460	154471	25 %	25 %	50 %	0 %	42518220
3605	NC_005362	A	7	7	154532	154538	100 %	0 %	0 %	0 %	42518220
3606	NC_005362	TCA	2	6	154551	154556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518220
3607	NC_005362	TGA	2	6	154585	154590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518220
3608	NC_005362	GTAT	2	8	154650	154657	25 %	50 %	25 %	0 %	42518220
3609	NC_005362	GAT	2	6	154715	154720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518220
3610	NC_005362	A	6	6	154781	154786	100 %	0 %	0 %	0 %	42518220
3611	NC_005362	ATT	2	6	154871	154876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518220
3612	NC_005362	TCAA	2	8	154965	154972	50 %	25 %	0 %	25 %	42518220
3613	NC_005362	TCC	2	6	155005	155010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42518220
3614	NC_005362	A	6	6	155050	155055	100 %	0 %	0 %	0 %	42518220
3615	NC_005362	AT	4	8	155125	155132	50 %	50 %	0 %	0 %	42518220
3616	NC_005362	T	6	6	155132	155137	0 %	100 %	0 %	0 %	42518220
3617	NC_005362	TAC	2	6	155173	155178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518220
3618	NC_005362	CAATA	2	10	155180	155189	60 %	20 %	0 %	20 %	42518220
3619	NC_005362	AGC	2	6	155224	155229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518220
3620	NC_005362	AT	3	6	155233	155238	50 %	50 %	0 %	0 %	42518220
3621	NC_005362	TTA	2	6	155264	155269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518220
3622	NC_005362	GCT	2	6	155288	155293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518220
3623	NC_005362	TAA	2	6	155343	155348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_005362	ACT	2	6	155350	155355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_005362	TG	3	6	155382	155387	0 %	50 %	50 %	0 %	42518221
3626	NC_005362	T	6	6	155399	155404	0 %	100 %	0 %	0 %	42518221
3627	NC_005362	ATG	2	6	155444	155449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518221
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3630	NC_005362	ATT	2	6	155588	155593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518221
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3635	NC_005362	GAA	2	6	155725	155730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518221
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3658	NC_005362	AAG	2	6	156911	156916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518221
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3666	NC_005362	ATG	2	6	157254	157259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518221
3667	NC_005362	AAG	2	6	157268	157273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518221
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3698	NC_005362	AAGC	2	8	158641	158648	50 %	0 %	25 %	25 %	42518222
3699	NC_005362	CAA	2	6	158662	158667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518222
3700	NC_005362	CTG	2	6	158703	158708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3702	NC_005362	CAG	2	6	158724	158729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3703	NC_005362	T	7	7	158732	158738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3704	NC_005362	ACT	2	6	158740	158745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3707	NC_005362	ATAGA	2	10	158860	158869	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3708	NC_005362	AGA	2	6	158887	158892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3733	NC_005362	ACTTA	2	10	159938	159947	40 %	40 %	0 %	20 %	42518223
3734	NC_005362	CTA	2	6	159997	160002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518223
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3736	NC_005362	GTTA	2	8	160023	160030	25 %	50 %	25 %	0 %	42518223
3737	NC_005362	CTT	2	6	160085	160090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518223
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3740	NC_005362	ACCT	2	8	160165	160172	25 %	25 %	0 %	50 %	42518223
3741	NC_005362	AGA	2	6	160346	160351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518223
3742	NC_005362	AGA	2	6	160526	160531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518223
3743	NC_005362	ATCACT	2	12	160537	160548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518223
3744	NC_005362	A	6	6	160608	160613	100 %	0 %	0 %	0 %	42518223
3745	NC_005362	TAC	2	6	160647	160652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518223
3746	NC_005362	TTCC	2	8	160658	160665	0 %	50 %	0 %	50 %	42518223
3747	NC_005362	TGC	2	6	160733	160738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518223
3748	NC_005362	ATT	2	6	160753	160758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518223
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3750	NC_005362	GAA	2	6	161022	161027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518223
3751	NC_005362	GAA	2	6	161064	161069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518223
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3871	NC_005362	T	7	7	166144	166150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3872	NC_005362	A	6	6	166179	166184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3873	NC_005362	AATAA	2	10	166197	166206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3874	NC_005362	A	6	6	166205	166210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3876	NC_005362	A	6	6	166230	166235	100 %	0 %	0 %	0 %	42518229
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3994	NC_005362	ATT	2	6	170536	170541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518231
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