MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 46256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005362	ATT	2	6	41467	41472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518117
1002	NC_005362	ATT	2	6	41477	41482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518117
1003	NC_005362	CAA	2	6	41499	41504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518117
1004	NC_005362	ATT	2	6	41507	41512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518117
1005	NC_005362	TTGGT	2	10	41541	41550	0 %	60 %	40 %	0 %	42518117
1006	NC_005362	GTA	2	6	41574	41579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518117
1007	NC_005362	ATT	2	6	41593	41598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518117
1008	NC_005362	TTG	2	6	41628	41633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518117
1009	NC_005362	CTT	2	6	41704	41709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518117
1010	NC_005362	TAG	2	6	41718	41723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518117
1011	NC_005362	CAA	2	6	41747	41752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518117
1012	NC_005362	CTTA	2	8	41800	41807	25 %	50 %	0 %	25 %	42518117
1013	NC_005362	AAC	2	6	41851	41856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518117
1014	NC_005362	ATT	2	6	41887	41892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518117
1015	NC_005362	TTA	2	6	41913	41918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518117
1016	NC_005362	TTTG	2	8	41920	41927	0 %	75 %	25 %	0 %	42518117
1017	NC_005362	TGT	2	6	41983	41988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518117
1018	NC_005362	TC	3	6	42049	42054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_005362	A	7	7	42076	42082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_005362	AAT	2	6	42099	42104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_005362	GCT	2	6	42120	42125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_005362	GT	3	6	42166	42171	0 %	50 %	50 %	0 %	42518118
1023	NC_005362	TCTT	2	8	42184	42191	0 %	75 %	0 %	25 %	42518118
1024	NC_005362	GA	3	6	42233	42238	50 %	0 %	50 %	0 %	42518118
1025	NC_005362	GAAT	2	8	42265	42272	50 %	25 %	25 %	0 %	42518118
1026	NC_005362	AAG	2	6	42316	42321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518118
1027	NC_005362	ATA	2	6	42334	42339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518118
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1029	NC_005362	AGT	2	6	42400	42405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518118
1030	NC_005362	AAT	2	6	42502	42507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518118
1031	NC_005362	ATG	2	6	42676	42681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518118
1032	NC_005362	TCA	2	6	42732	42737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518118
1033	NC_005362	ACTG	2	8	42772	42779	25 %	25 %	25 %	25 %	42518118
1034	NC_005362	TGA	2	6	42782	42787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518118
1035	NC_005362	TAA	2	6	42873	42878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518118
1036	NC_005362	AAG	2	6	42893	42898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518118
1037	NC_005362	CGA	2	6	42920	42925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518118
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1039	NC_005362	AG	3	6	42984	42989	50 %	0 %	50 %	0 %	42518118
1040	NC_005362	AGC	2	6	43032	43037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518118
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1042	NC_005362	TTC	2	6	43102	43107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518118
1043	NC_005362	TGT	2	6	43184	43189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_005362	T	6	6	43232	43237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_005362	ATT	2	6	43271	43276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518119
1046	NC_005362	TCC	2	6	43289	43294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42518119
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1050	NC_005362	TAC	2	6	43403	43408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518119
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1053	NC_005362	CAT	2	6	43482	43487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518119
1054	NC_005362	AAT	2	6	43495	43500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518119
1055	NC_005362	TGT	2	6	43555	43560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518119
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1057	NC_005362	TG	3	6	43656	43661	0 %	50 %	50 %	0 %	42518119
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1060	NC_005362	TGT	2	6	43766	43771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518119
1061	NC_005362	TTAA	2	8	43813	43820	50 %	50 %	0 %	0 %	42518119
1062	NC_005362	TTG	2	6	43925	43930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518119
1063	NC_005362	T	6	6	44087	44092	0 %	100 %	0 %	0 %	42518119
1064	NC_005362	CAG	3	9	44108	44116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518119
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1066	NC_005362	AT	3	6	44233	44238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_005362	TGA	2	6	44274	44279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_005362	AT	3	6	44294	44299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_005362	TAAT	2	8	44320	44327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_005362	TTA	2	6	44340	44345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_005362	TAGC	2	8	44449	44456	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_005362	AATC	2	8	44459	44466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_005362	AGGAA	2	10	44481	44490	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_005362	AAAGG	2	10	44613	44622	60 %	0 %	40 %	0 %	42518120
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1088	NC_005362	T	6	6	45027	45032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_005362	GGC	2	6	45038	45043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1093	NC_005362	AAG	2	6	45275	45280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518122
1094	NC_005362	ACTATG	2	12	45302	45313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	42518122
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1099	NC_005362	GTG	2	6	45599	45604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518122
1100	NC_005362	CAT	2	6	45655	45660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518122
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1102	NC_005362	ATT	2	6	45702	45707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518122
1103	NC_005362	TGG	2	6	45769	45774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518122
1104	NC_005362	AATT	2	8	45921	45928	50 %	50 %	0 %	0 %	42518122
1105	NC_005362	AGA	2	6	45956	45961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_005362	TCT	2	6	45971	45976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_005362	T	6	6	45976	45981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_005362	AAG	2	6	46021	46026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518123
1109	NC_005362	GATAAG	2	12	46047	46058	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	42518123
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1111	NC_005362	AGTA	2	8	46091	46098	50 %	25 %	25 %	0 %	42518123
1112	NC_005362	CTT	2	6	46153	46158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518123
1113	NC_005362	ATTT	2	8	46175	46182	25 %	75 %	0 %	0 %	42518123
1114	NC_005362	A	6	6	46230	46235	100 %	0 %	0 %	0 %	42518123
1115	NC_005362	GAA	2	6	46338	46343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518123
1116	NC_005362	AT	3	6	46364	46369	50 %	50 %	0 %	0 %	42518123
1117	NC_005362	AAG	2	6	46492	46497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518123
1118	NC_005362	TAA	2	6	46499	46504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518123
1119	NC_005362	TCAAAT	2	12	46505	46516	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42518123
1120	NC_005362	ACT	2	6	46524	46529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518123
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1123	NC_005362	AGC	2	6	46652	46657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518123
1124	NC_005362	AAT	2	6	46662	46667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518123
1125	NC_005362	A	7	7	46811	46817	100 %	0 %	0 %	0 %	42518123
1126	NC_005362	AG	3	6	46823	46828	50 %	0 %	50 %	0 %	42518123
1127	NC_005362	TTA	2	6	46869	46874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518123
1128	NC_005362	TAA	2	6	46895	46900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518123
1129	NC_005362	TGA	2	6	46988	46993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518123
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1131	NC_005362	AGA	2	6	47195	47200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518123
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1260	NC_005362	TAA	2	6	52727	52732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518128
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