MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 46256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005362	CAT	2	6	21678	21683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518102
502	NC_005362	TGA	2	6	21791	21796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518102
503	NC_005362	ATT	2	6	21802	21807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518102
504	NC_005362	A	6	6	21902	21907	100 %	0 %	0 %	0 %	42518102
505	NC_005362	TAAAT	2	10	21912	21921	60 %	40 %	0 %	0 %	42518102
506	NC_005362	T	6	6	21937	21942	0 %	100 %	0 %	0 %	42518102
507	NC_005362	AAG	2	6	21953	21958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518102
508	NC_005362	AAG	2	6	21998	22003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518102
509	NC_005362	AAT	2	6	22039	22044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518102
510	NC_005362	TGG	3	9	22072	22080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518102
511	NC_005362	TAT	2	6	22096	22101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518102
512	NC_005362	CAGC	2	8	22141	22148	25 %	0 %	25 %	50 %	42518102
513	NC_005362	AGC	2	6	22218	22223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518102
514	NC_005362	ATT	2	6	22240	22245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518102
515	NC_005362	TTC	2	6	22254	22259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518102
516	NC_005362	AGGA	2	8	22325	22332	50 %	0 %	50 %	0 %	42518102
517	NC_005362	ATG	2	6	22357	22362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518102
518	NC_005362	AAT	2	6	22368	22373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518102
519	NC_005362	TTAA	2	8	22405	22412	50 %	50 %	0 %	0 %	42518102
520	NC_005362	TAAAAT	2	12	22419	22430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518102
521	NC_005362	TGA	3	9	22440	22448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518102
522	NC_005362	AAT	2	6	22462	22467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518102
523	NC_005362	TTA	2	6	22567	22572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518102
524	NC_005362	TTA	2	6	22610	22615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518102
525	NC_005362	CAT	2	6	22621	22626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518102
526	NC_005362	TAG	2	6	22628	22633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518102
527	NC_005362	AGAT	2	8	22685	22692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_005362	TTA	2	6	22699	22704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_005362	T	6	6	22720	22725	0 %	100 %	0 %	0 %	42518103
530	NC_005362	CTT	2	6	22768	22773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518103
531	NC_005362	ATA	2	6	22777	22782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518103
532	NC_005362	TGC	2	6	22792	22797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518103
533	NC_005362	T	6	6	22827	22832	0 %	100 %	0 %	0 %	42518103
534	NC_005362	TAG	2	6	22872	22877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518103
535	NC_005362	GAA	2	6	22887	22892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518103
536	NC_005362	CTTG	2	8	22929	22936	0 %	50 %	25 %	25 %	42518103
537	NC_005362	AAT	2	6	22966	22971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518103
538	NC_005362	CATT	2	8	22977	22984	25 %	50 %	0 %	25 %	42518103
539	NC_005362	ATA	3	9	22993	23001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518103
540	NC_005362	TTTA	2	8	23095	23102	25 %	75 %	0 %	0 %	42518103
541	NC_005362	ATTG	2	8	23277	23284	25 %	50 %	25 %	0 %	42518103
542	NC_005362	GAA	2	6	23309	23314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518103
543	NC_005362	TAT	2	6	23424	23429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518103
544	NC_005362	CTA	2	6	23448	23453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518103
545	NC_005362	T	6	6	23467	23472	0 %	100 %	0 %	0 %	42518103
546	NC_005362	ATC	2	6	23485	23490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518103
547	NC_005362	T	6	6	23512	23517	0 %	100 %	0 %	0 %	42518103
548	NC_005362	AAT	2	6	23569	23574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518103
549	NC_005362	TATTT	2	10	23617	23626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_005362	T	6	6	23633	23638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_005362	TTCA	2	8	23664	23671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
552	NC_005362	GCTAA	2	10	23673	23682	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
553	NC_005362	AGG	2	6	23704	23709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_005362	TAT	2	6	23730	23735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518104
555	NC_005362	TTG	2	6	23918	23923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518104
556	NC_005362	ACT	2	6	24143	24148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518104
557	NC_005362	CTCTT	2	10	24245	24254	0 %	60 %	0 %	40 %	42518104
558	NC_005362	TAA	2	6	24255	24260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518104
559	NC_005362	AAT	2	6	24262	24267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518104
560	NC_005362	AAAG	2	8	24337	24344	75 %	0 %	25 %	0 %	42518104
561	NC_005362	TGA	2	6	24357	24362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518104
562	NC_005362	A	6	6	24365	24370	100 %	0 %	0 %	0 %	42518104
563	NC_005362	TAT	2	6	24501	24506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_005362	TTA	2	6	24507	24512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_005362	TAA	2	6	24527	24532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_005362	CAA	2	6	24575	24580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518105
567	NC_005362	TA	3	6	24584	24589	50 %	50 %	0 %	0 %	42518105
568	NC_005362	TAG	2	6	24634	24639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518105
569	NC_005362	ATA	2	6	24665	24670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518105
570	NC_005362	A	6	6	24723	24728	100 %	0 %	0 %	0 %	42518105
571	NC_005362	T	6	6	24756	24761	0 %	100 %	0 %	0 %	42518105
572	NC_005362	A	6	6	24780	24785	100 %	0 %	0 %	0 %	42518105
573	NC_005362	GTT	2	6	24831	24836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518105
574	NC_005362	ATTT	2	8	24841	24848	25 %	75 %	0 %	0 %	42518105
575	NC_005362	TAG	2	6	24860	24865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518105
576	NC_005362	TCA	2	6	24876	24881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518105
577	NC_005362	TAAA	2	8	24888	24895	75 %	25 %	0 %	0 %	42518105
578	NC_005362	AAT	2	6	24909	24914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518105
579	NC_005362	TGA	2	6	24961	24966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518105
580	NC_005362	TTTA	2	8	24980	24987	25 %	75 %	0 %	0 %	42518105
581	NC_005362	AATT	2	8	25019	25026	50 %	50 %	0 %	0 %	42518105
582	NC_005362	TA	4	8	25028	25035	50 %	50 %	0 %	0 %	42518105
583	NC_005362	TA	4	8	25062	25069	50 %	50 %	0 %	0 %	42518105
584	NC_005362	T	7	7	25070	25076	0 %	100 %	0 %	0 %	42518105
585	NC_005362	TTA	2	6	25101	25106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518105
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587	NC_005362	AATA	2	8	25115	25122	75 %	25 %	0 %	0 %	42518105
588	NC_005362	TAT	2	6	25130	25135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518105
589	NC_005362	TTCATC	2	12	25136	25147	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	42518105
590	NC_005362	ATT	2	6	25154	25159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518105
591	NC_005362	AT	3	6	25192	25197	50 %	50 %	0 %	0 %	42518105
592	NC_005362	TGATG	2	10	25198	25207	20 %	40 %	40 %	0 %	42518105
593	NC_005362	TAT	2	6	25249	25254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518105
594	NC_005362	ATT	2	6	25362	25367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518105
595	NC_005362	AT	3	6	25390	25395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_005362	AT	4	8	25426	25433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_005362	T	6	6	25439	25444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_005362	ATG	2	6	25449	25454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_005362	AAAG	2	8	25467	25474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_005362	A	6	6	25480	25485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_005362	TAA	2	6	25509	25514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_005362	AAG	2	6	25522	25527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_005362	TTTTTA	2	12	25596	25607	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_005362	ATG	2	6	25616	25621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_005362	GGT	2	6	25627	25632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_005362	GTA	2	6	25675	25680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518106
607	NC_005362	ATC	2	6	25681	25686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518106
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609	NC_005362	TAAA	2	8	25771	25778	75 %	25 %	0 %	0 %	42518106
610	NC_005362	A	7	7	25776	25782	100 %	0 %	0 %	0 %	42518106
611	NC_005362	ATG	2	6	25786	25791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518106
612	NC_005362	A	7	7	25810	25816	100 %	0 %	0 %	0 %	42518106
613	NC_005362	TAA	2	6	25823	25828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518106
614	NC_005362	TAATT	2	10	25856	25865	40 %	60 %	0 %	0 %	42518106
615	NC_005362	GAT	2	6	25896	25901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518106
616	NC_005362	TAC	2	6	25976	25981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518106
617	NC_005362	AATT	2	8	26059	26066	50 %	50 %	0 %	0 %	42518106
618	NC_005362	A	6	6	26083	26088	100 %	0 %	0 %	0 %	42518106
619	NC_005362	TTTA	2	8	26108	26115	25 %	75 %	0 %	0 %	42518106
620	NC_005362	GA	3	6	26169	26174	50 %	0 %	50 %	0 %	42518106
621	NC_005362	AAT	2	6	26175	26180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518106
622	NC_005362	AAG	2	6	26218	26223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518106
623	NC_005362	ATA	2	6	26230	26235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518106
624	NC_005362	TA	3	6	26388	26393	50 %	50 %	0 %	0 %	42518106
625	NC_005362	TGA	2	6	26441	26446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518106
626	NC_005362	AGA	2	6	26480	26485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518106
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628	NC_005362	AAT	2	6	26526	26531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518106
629	NC_005362	TGC	2	6	26537	26542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518106
630	NC_005362	ATT	2	6	26562	26567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518106
631	NC_005362	AAGA	2	8	26725	26732	75 %	0 %	25 %	0 %	42518107
632	NC_005362	ATA	2	6	26735	26740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518107
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634	NC_005362	CAT	2	6	26803	26808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518107
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