MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1

Total Repeats: 9135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004567	GAAT	2	8	582	589	50 %	25 %	25 %	0 %	380031103
2	NC_004567	TAAT	2	8	590	597	50 %	50 %	0 %	0 %	380031103
3	NC_004567	CGAA	2	8	776	783	50 %	0 %	25 %	25 %	380031103
4	NC_004567	GAAA	2	8	1151	1158	75 %	0 %	25 %	0 %	380031103
5	NC_004567	ACTG	2	8	1212	1219	25 %	25 %	25 %	25 %	380031103
6	NC_004567	CGTT	2	8	2563	2570	0 %	50 %	25 %	25 %	380031104
7	NC_004567	AATA	2	8	2693	2700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004567	TAAA	2	8	2709	2716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004567	CGCT	2	8	2934	2941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_004567	AATG	2	8	2949	2956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004567	GTTA	2	8	3326	3333	25 %	50 %	25 %	0 %	380031105
12	NC_004567	AATT	2	8	3619	3626	50 %	50 %	0 %	0 %	380031106
13	NC_004567	AGCG	2	8	3718	3725	25 %	0 %	50 %	25 %	380031106
14	NC_004567	GTCG	2	8	4148	4155	0 %	25 %	50 %	25 %	380031106
15	NC_004567	ATTA	2	8	4502	4509	50 %	50 %	0 %	0 %	380031106
16	NC_004567	TACG	2	8	5428	5435	25 %	25 %	25 %	25 %	380031107
17	NC_004567	ATTA	2	8	6079	6086	50 %	50 %	0 %	0 %	380031107
18	NC_004567	TGAG	2	8	6258	6265	25 %	25 %	50 %	0 %	380031107
19	NC_004567	ACGT	2	8	6791	6798	25 %	25 %	25 %	25 %	380031108
20	NC_004567	TAGC	2	8	8054	8061	25 %	25 %	25 %	25 %	380031108
21	NC_004567	AAAC	2	8	8848	8855	75 %	0 %	0 %	25 %	380031108
22	NC_004567	ATTG	2	8	9687	9694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004567	TTAC	2	8	9885	9892	25 %	50 %	0 %	25 %	380031109
24	NC_004567	TTTA	2	8	11115	11122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004567	TTGA	2	8	11440	11447	25 %	50 %	25 %	0 %	380031112
26	NC_004567	AACC	2	8	12216	12223	50 %	0 %	0 %	50 %	380031112
27	NC_004567	AATC	2	8	12286	12293	50 %	25 %	0 %	25 %	380031112
28	NC_004567	AATG	2	8	12375	12382	50 %	25 %	25 %	0 %	380031112
29	NC_004567	CAAT	2	8	12737	12744	50 %	25 %	0 %	25 %	380031112
30	NC_004567	CAGT	2	8	13189	13196	25 %	25 %	25 %	25 %	380031112
31	NC_004567	TTGA	2	8	13216	13223	25 %	50 %	25 %	0 %	380031112
32	NC_004567	GAGT	2	8	13267	13274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004567	TTAA	2	8	13366	13373	50 %	50 %	0 %	0 %	380031113
34	NC_004567	CAAT	2	8	13406	13413	50 %	25 %	0 %	25 %	380031113
35	NC_004567	CAAA	2	8	13569	13576	75 %	0 %	0 %	25 %	380031113
36	NC_004567	ACGG	2	8	14535	14542	25 %	0 %	50 %	25 %	380031114
37	NC_004567	TTGG	2	8	15269	15276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004567	TAAA	2	8	15338	15345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004567	ATGG	2	8	15673	15680	25 %	25 %	50 %	0 %	380031115
40	NC_004567	TGGC	2	8	15722	15729	0 %	25 %	50 %	25 %	380031115
41	NC_004567	TGGT	2	8	15841	15848	0 %	50 %	50 %	0 %	380031115
42	NC_004567	TTTA	2	8	16037	16044	25 %	75 %	0 %	0 %	380031115
43	NC_004567	GACG	2	8	16577	16584	25 %	0 %	50 %	25 %	380031115
44	NC_004567	GATC	2	8	16714	16721	25 %	25 %	25 %	25 %	380031116
45	NC_004567	AGCT	2	8	17263	17270	25 %	25 %	25 %	25 %	380031116
46	NC_004567	GCTA	2	8	17493	17500	25 %	25 %	25 %	25 %	380031117
47	NC_004567	AAAC	2	8	19704	19711	75 %	0 %	0 %	25 %	380031118
48	NC_004567	ACGA	2	8	20311	20318	50 %	0 %	25 %	25 %	380031118
49	NC_004567	TCAG	2	8	20770	20777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_004567	TAAG	2	8	20995	21002	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004567	AAAC	2	8	21105	21112	75 %	0 %	0 %	25 %	380031119
52	NC_004567	ATGA	2	8	21120	21127	50 %	25 %	25 %	0 %	380031119
53	NC_004567	CGAA	2	8	21419	21426	50 %	0 %	25 %	25 %	380031119
54	NC_004567	GCGG	2	8	23023	23030	0 %	0 %	75 %	25 %	380031120
55	NC_004567	ATTG	2	8	24024	24031	25 %	50 %	25 %	0 %	380031120
56	NC_004567	AGTG	2	8	24143	24150	25 %	25 %	50 %	0 %	380031121
57	NC_004567	GGTT	2	8	24241	24248	0 %	50 %	50 %	0 %	380031121
58	NC_004567	GGAA	2	8	25392	25399	50 %	0 %	50 %	0 %	380031122
59	NC_004567	CCGA	2	8	25441	25448	25 %	0 %	25 %	50 %	380031122
60	NC_004567	AGCT	2	8	26375	26382	25 %	25 %	25 %	25 %	380031122
61	NC_004567	TCTT	2	8	26408	26415	0 %	75 %	0 %	25 %	380031122
62	NC_004567	CGGT	2	8	26492	26499	0 %	25 %	50 %	25 %	380031122
63	NC_004567	CCAG	2	8	26571	26578	25 %	0 %	25 %	50 %	380031122
64	NC_004567	TCAG	2	8	27060	27067	25 %	25 %	25 %	25 %	380031123
65	NC_004567	ATGG	2	8	27206	27213	25 %	25 %	50 %	0 %	380031123
66	NC_004567	CGTG	2	8	27604	27611	0 %	25 %	50 %	25 %	380031123
67	NC_004567	CCTA	2	8	27969	27976	25 %	25 %	0 %	50 %	380031123
68	NC_004567	AACC	2	8	28130	28137	50 %	0 %	0 %	50 %	380031123
69	NC_004567	ATTG	2	8	28147	28154	25 %	50 %	25 %	0 %	380031123
70	NC_004567	CAAG	2	8	28267	28274	50 %	0 %	25 %	25 %	380031123
71	NC_004567	TGAT	2	8	28881	28888	25 %	50 %	25 %	0 %	380031123
72	NC_004567	ACGA	2	8	29133	29140	50 %	0 %	25 %	25 %	380031123
73	NC_004567	AAGG	2	8	29152	29159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004567	GATT	2	8	29283	29290	25 %	50 %	25 %	0 %	380031124
75	NC_004567	TTTA	2	8	29647	29654	25 %	75 %	0 %	0 %	380031124
76	NC_004567	CGTG	2	8	29682	29689	0 %	25 %	50 %	25 %	380031124
77	NC_004567	CATT	3	12	30047	30058	25 %	50 %	0 %	25 %	380031124
78	NC_004567	TGGC	2	8	30192	30199	0 %	25 %	50 %	25 %	380031124
79	NC_004567	ATTA	2	8	31297	31304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004567	TGGA	2	8	31345	31352	25 %	25 %	50 %	0 %	380031125
81	NC_004567	CAGA	2	8	31691	31698	50 %	0 %	25 %	25 %	380031125
82	NC_004567	GTTT	2	8	32204	32211	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004567	AGCC	2	8	32568	32575	25 %	0 %	25 %	50 %	380031126
84	NC_004567	TAGC	2	8	32670	32677	25 %	25 %	25 %	25 %	380031126
85	NC_004567	ATCC	2	8	32743	32750	25 %	25 %	0 %	50 %	380031126
86	NC_004567	CGAT	2	8	33914	33921	25 %	25 %	25 %	25 %	380031127
87	NC_004567	AGTG	2	8	34067	34074	25 %	25 %	50 %	0 %	380031127
88	NC_004567	CGGT	2	8	34209	34216	0 %	25 %	50 %	25 %	380031127
89	NC_004567	TAGT	2	8	34655	34662	25 %	50 %	25 %	0 %	380031127
90	NC_004567	TGAA	2	8	35807	35814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004567	TTGA	2	8	36109	36116	25 %	50 %	25 %	0 %	380031128
92	NC_004567	TGAT	2	8	36611	36618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004567	CAGT	2	8	36651	36658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_004567	AACG	2	8	36859	36866	50 %	0 %	25 %	25 %	380031129
95	NC_004567	CAAC	2	8	37104	37111	50 %	0 %	0 %	50 %	380031130
96	NC_004567	TAAT	2	8	37534	37541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004567	AAAG	2	8	37612	37619	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004567	CAAC	2	8	37665	37672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_004567	GATG	2	8	37940	37947	25 %	25 %	50 %	0 %	380031131
100	NC_004567	AATT	2	8	38526	38533	50 %	50 %	0 %	0 %	380031132
101	NC_004567	TCAG	2	8	38820	38827	25 %	25 %	25 %	25 %	380031132
102	NC_004567	CAGT	2	8	38976	38983	25 %	25 %	25 %	25 %	380031132
103	NC_004567	TGTA	2	8	38996	39003	25 %	50 %	25 %	0 %	380031132
104	NC_004567	GTCT	2	8	39018	39025	0 %	50 %	25 %	25 %	380031132
105	NC_004567	ATTT	2	8	40520	40527	25 %	75 %	0 %	0 %	380031133
106	NC_004567	AATT	2	8	40536	40543	50 %	50 %	0 %	0 %	380031133
107	NC_004567	AGTC	2	8	40597	40604	25 %	25 %	25 %	25 %	380031133
108	NC_004567	CGTA	2	8	40704	40711	25 %	25 %	25 %	25 %	380031133
109	NC_004567	AAGC	2	8	41462	41469	50 %	0 %	25 %	25 %	380031133
110	NC_004567	ACAG	2	8	41934	41941	50 %	0 %	25 %	25 %	380031134
111	NC_004567	ACGT	2	8	42208	42215	25 %	25 %	25 %	25 %	380031134
112	NC_004567	GCTT	2	8	42817	42824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_004567	TCGA	2	8	43042	43049	25 %	25 %	25 %	25 %	380031135
114	NC_004567	TTTA	2	8	43074	43081	25 %	75 %	0 %	0 %	380031135
115	NC_004567	TATT	2	8	43402	43409	25 %	75 %	0 %	0 %	380031135
116	NC_004567	GATG	2	8	43524	43531	25 %	25 %	50 %	0 %	380031135
117	NC_004567	ATTA	2	8	43902	43909	50 %	50 %	0 %	0 %	380031136
118	NC_004567	TGAC	2	8	44329	44336	25 %	25 %	25 %	25 %	380031136
119	NC_004567	CGGC	2	8	44748	44755	0 %	0 %	50 %	50 %	380031136
120	NC_004567	ACCA	2	8	44822	44829	50 %	0 %	0 %	50 %	380031136
121	NC_004567	TAAA	2	8	45535	45542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004567	ATTG	2	8	46368	46375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004567	AAGT	2	8	46643	46650	50 %	25 %	25 %	0 %	380031138
124	NC_004567	TATG	2	8	46863	46870	25 %	50 %	25 %	0 %	380031138
125	NC_004567	GATC	2	8	47127	47134	25 %	25 %	25 %	25 %	380031138
126	NC_004567	TTTG	2	8	47984	47991	0 %	75 %	25 %	0 %	380031139
127	NC_004567	CAAG	2	8	48573	48580	50 %	0 %	25 %	25 %	380031139
128	NC_004567	CATC	2	8	49408	49415	25 %	25 %	0 %	50 %	380031140
129	NC_004567	TGGC	2	8	49428	49435	0 %	25 %	50 %	25 %	380031140
130	NC_004567	TAGC	2	8	49656	49663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_004567	GCAC	2	8	49913	49920	25 %	0 %	25 %	50 %	380031141
132	NC_004567	CAGT	2	8	50226	50233	25 %	25 %	25 %	25 %	380031141
133	NC_004567	AACG	2	8	50537	50544	50 %	0 %	25 %	25 %	380031142
134	NC_004567	TTGT	2	8	50630	50637	0 %	75 %	25 %	0 %	380031142
135	NC_004567	TATT	2	8	50782	50789	25 %	75 %	0 %	0 %	380031142
136	NC_004567	TTTA	2	8	50951	50958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004567	GGAC	2	8	50970	50977	25 %	0 %	50 %	25 %	380031143
138	NC_004567	AGTG	2	8	52038	52045	25 %	25 %	50 %	0 %	380031144
139	NC_004567	ACCC	2	8	53975	53982	25 %	0 %	0 %	75 %	380031145
140	NC_004567	CCAA	2	8	54101	54108	50 %	0 %	0 %	50 %	380031145
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