MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1

Total Repeats: 46351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004567	GAA	3	9	241	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031103
2	NC_004567	ACA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031103
3	NC_004567	CAA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031103
4	NC_004567	GAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031103
5	NC_004567	GTT	2	6	462	467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031103
6	NC_004567	AGG	2	6	617	622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	380031103
7	NC_004567	GAA	2	6	631	636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031103
8	NC_004567	TTA	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031103
9	NC_004567	CGA	2	6	663	668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031103
10	NC_004567	AAG	2	6	701	706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031103
11	NC_004567	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	380031103
12	NC_004567	GAT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031103
13	NC_004567	AAT	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031103
14	NC_004567	ACC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031103
15	NC_004567	TGG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031103
16	NC_004567	CTA	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004567	TAC	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_004567	TAT	2	6	1493	1498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004567	TCA	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031104
20	NC_004567	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	380031104
21	NC_004567	ACC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031104
22	NC_004567	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031104
23	NC_004567	CAA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031104
24	NC_004567	AGA	2	6	1812	1817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031104
25	NC_004567	AAT	2	6	2125	2130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031104
26	NC_004567	ATG	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031104
27	NC_004567	GAT	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031104
28	NC_004567	AAT	2	6	2194	2199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031104
29	NC_004567	CAG	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031104
30	NC_004567	AAT	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031104
31	NC_004567	AAC	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031104
32	NC_004567	AAG	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031104
33	NC_004567	GAA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031104
34	NC_004567	GAT	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004567	GCT	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_004567	CTA	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_004567	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004567	TTA	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004567	TCA	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004567	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031105
41	NC_004567	GGT	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031105
42	NC_004567	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031105
43	NC_004567	GAT	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031105
44	NC_004567	CGG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031105
45	NC_004567	ACC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031106
46	NC_004567	GCG	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031106
47	NC_004567	ATC	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031106
48	NC_004567	AAC	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031106
49	NC_004567	GCA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031106
50	NC_004567	ATC	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031106
51	NC_004567	GCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031106
52	NC_004567	CAA	3	9	4191	4199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031106
53	NC_004567	GAC	2	6	4220	4225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031106
54	NC_004567	TTA	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031106
55	NC_004567	GAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031106
56	NC_004567	TGA	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031106
57	NC_004567	TTA	3	9	4380	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031106
58	NC_004567	CTG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031106
59	NC_004567	GAG	2	6	4551	4556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	380031106
60	NC_004567	ATG	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
61	NC_004567	ACG	2	6	4682	4687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031107
62	NC_004567	CCA	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031107
63	NC_004567	TTG	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
64	NC_004567	TGA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
65	NC_004567	ATA	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031107
66	NC_004567	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031107
67	NC_004567	GGT	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031107
68	NC_004567	TGG	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031107
69	NC_004567	GTT	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
70	NC_004567	ATC	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031107
71	NC_004567	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031107
72	NC_004567	TGA	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
73	NC_004567	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031107
74	NC_004567	ACC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031107
75	NC_004567	GAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031107
76	NC_004567	TGA	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
77	NC_004567	GAC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031107
78	NC_004567	TGA	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
79	NC_004567	CAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031107
80	NC_004567	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031107
81	NC_004567	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031107
82	NC_004567	TTG	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
83	NC_004567	TGT	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
84	NC_004567	GCA	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031107
85	NC_004567	GCT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031107
86	NC_004567	ACA	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031107
87	NC_004567	GTA	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
88	NC_004567	GTT	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
89	NC_004567	GAA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031107
90	NC_004567	GGT	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031107
91	NC_004567	GTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
92	NC_004567	ACC	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	380031107
93	NC_004567	GAA	2	6	6251	6256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031107
94	NC_004567	GTT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031107
95	NC_004567	GCG	2	6	6373	6378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031107
96	NC_004567	TGA	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031107
97	NC_004567	TCT	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	380031107
98	NC_004567	ACG	2	6	6583	6588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_004567	AGG	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004567	CGG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031108
101	NC_004567	AAG	2	6	6874	6879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
102	NC_004567	TTG	2	6	6890	6895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	380031108
103	NC_004567	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031108
104	NC_004567	ATG	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
105	NC_004567	CAG	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031108
106	NC_004567	ACA	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031108
107	NC_004567	ATT	2	6	7402	7407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031108
108	NC_004567	ATG	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
109	NC_004567	CGG	2	6	7603	7608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031108
110	NC_004567	AAG	2	6	7754	7759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
111	NC_004567	GAA	2	6	7791	7796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
112	NC_004567	TGA	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
113	NC_004567	ATT	2	6	7867	7872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031108
114	NC_004567	GAA	2	6	7899	7904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
115	NC_004567	ATT	2	6	8080	8085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031108
116	NC_004567	GAA	2	6	8089	8094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
117	NC_004567	GAA	4	12	8185	8196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
118	NC_004567	GTG	2	6	8267	8272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031108
119	NC_004567	ATG	3	9	8300	8308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
120	NC_004567	GAC	2	6	8328	8333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031108
121	NC_004567	ATG	2	6	8342	8347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
122	NC_004567	TCA	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031108
123	NC_004567	GAT	3	9	8620	8628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
124	NC_004567	ATC	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031108
125	NC_004567	ACG	2	6	8684	8689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031108
126	NC_004567	CGA	2	6	8706	8711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031108
127	NC_004567	GAT	2	6	8770	8775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
128	NC_004567	TCA	3	9	8822	8830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031108
129	NC_004567	GTG	2	6	8885	8890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	380031108
130	NC_004567	GAA	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
131	NC_004567	GAC	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031108
132	NC_004567	AAG	2	6	8963	8968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	380031108
133	NC_004567	GAT	2	6	9073	9078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
134	NC_004567	TGA	2	6	9123	9128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031108
135	NC_004567	CAA	2	6	9206	9211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031108
136	NC_004567	ATT	2	6	9302	9307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004567	GAA	2	6	9398	9403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004567	CTG	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_004567	TCA	2	6	9423	9428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_004567	ACA	2	6	9483	9488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_004567	CAG	2	6	9548	9553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_004567	CAA	2	6	9745	9750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_004567	AAG	2	6	9823	9828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004567	AGG	2	6	9844	9849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004567	CGA	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031109
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147	NC_004567	CGT	2	6	10004	10009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031109
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152	NC_004567	GCC	2	6	10265	10270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	380031110
153	NC_004567	GCT	2	6	10364	10369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031110
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161	NC_004567	ACA	3	9	10587	10595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031110
162	NC_004567	ATA	2	6	10596	10601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	380031110
163	NC_004567	CTC	2	6	10632	10637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	380031110
164	NC_004567	ATC	2	6	10642	10647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	380031110
165	NC_004567	AAC	2	6	10721	10726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031110
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168	NC_004567	GAT	3	9	10778	10786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	380031110
169	NC_004567	GAG	2	6	10821	10826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_004567	CAA	2	6	10843	10848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	380031111
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172	NC_004567	CGT	4	12	10861	10872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	380031111
173	NC_004567	CGC	2	6	10887	10892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	380031111
174	NC_004567	TTA	2	6	10930	10935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	380031111
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177	NC_004567	GTG	2	6	11144	11149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
178	NC_004567	GGT	2	6	11200	11205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
179	NC_004567	CAG	2	6	11302	11307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	380031112
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239	NC_004567	GGC	2	6	15010	15015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	380031114
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242	NC_004567	ATA	2	6	15300	15305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_004567	ATG	2	6	15353	15358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
244	NC_004567	TAA	2	6	15374	15379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_004567	TGG	2	6	15380	15385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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