MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 1004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004343	TGAA	2	8	12	19	50 %	25 %	25 %	0 %	24217062
2	NC_004343	TCAA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	24217062
3	NC_004343	TTCA	2	8	199	206	25 %	50 %	0 %	25 %	24217062
4	NC_004343	TGGT	2	8	524	531	0 %	50 %	50 %	0 %	24217062
5	NC_004343	ACGT	2	8	763	770	25 %	25 %	25 %	25 %	24217062
6	NC_004343	AGTT	2	8	778	785	25 %	50 %	25 %	0 %	24217062
7	NC_004343	ACAA	2	8	876	883	75 %	0 %	0 %	25 %	24217062
8	NC_004343	TCAA	2	8	977	984	50 %	25 %	0 %	25 %	24217062
9	NC_004343	GACT	2	8	3063	3070	25 %	25 %	25 %	25 %	294653594
10	NC_004343	TTAG	2	8	3124	3131	25 %	50 %	25 %	0 %	294653594
11	NC_004343	TCAA	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	294653594
12	NC_004343	AATT	2	8	3483	3490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004343	TTCT	2	8	3698	3705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_004343	GAAA	2	8	3875	3882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004343	AGTT	2	8	3947	3954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004343	TTTG	2	8	4056	4063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004343	GTAT	2	8	4239	4246	25 %	50 %	25 %	0 %	24217066
18	NC_004343	TTCC	2	8	4312	4319	0 %	50 %	0 %	50 %	24217066
19	NC_004343	GAAA	2	8	4720	4727	75 %	0 %	25 %	0 %	24217066
20	NC_004343	AGAA	2	8	5496	5503	75 %	0 %	25 %	0 %	294653593
21	NC_004343	TTTC	2	8	5737	5744	0 %	75 %	0 %	25 %	294653593
22	NC_004343	TTTC	2	8	5899	5906	0 %	75 %	0 %	25 %	294653593
23	NC_004343	TGGA	2	8	5918	5925	25 %	25 %	50 %	0 %	294653593
24	NC_004343	AAAT	2	8	6801	6808	75 %	25 %	0 %	0 %	24217071
25	NC_004343	TCAT	2	8	7492	7499	25 %	50 %	0 %	25 %	294653592
26	NC_004343	CTTT	2	8	7920	7927	0 %	75 %	0 %	25 %	294653592
27	NC_004343	CAAA	2	8	8252	8259	75 %	0 %	0 %	25 %	294653592
28	NC_004343	TTAC	2	8	8746	8753	25 %	50 %	0 %	25 %	294653592
29	NC_004343	TATC	2	8	8791	8798	25 %	50 %	0 %	25 %	294653592
30	NC_004343	GATA	2	8	9186	9193	50 %	25 %	25 %	0 %	24217073
31	NC_004343	TTCT	2	8	9533	9540	0 %	75 %	0 %	25 %	24217073
32	NC_004343	GTTC	2	8	9924	9931	0 %	50 %	25 %	25 %	24217074
33	NC_004343	ATTC	2	8	10908	10915	25 %	50 %	0 %	25 %	24217074
34	NC_004343	TTTC	2	8	11660	11667	0 %	75 %	0 %	25 %	24217075
35	NC_004343	TGTT	2	8	11721	11728	0 %	75 %	25 %	0 %	24217075
36	NC_004343	GAAA	2	8	12258	12265	75 %	0 %	25 %	0 %	24217076
37	NC_004343	GGCG	2	8	12303	12310	0 %	0 %	75 %	25 %	24217076
38	NC_004343	GAAA	2	8	12553	12560	75 %	0 %	25 %	0 %	24217076
39	NC_004343	ATTT	2	8	13212	13219	25 %	75 %	0 %	0 %	294653591
40	NC_004343	TTGG	2	8	13662	13669	0 %	50 %	50 %	0 %	294653591
41	NC_004343	CTTT	2	8	13906	13913	0 %	75 %	0 %	25 %	24217078
42	NC_004343	TACT	2	8	14103	14110	25 %	50 %	0 %	25 %	24217078
43	NC_004343	TATT	2	8	15249	15256	25 %	75 %	0 %	0 %	24217079
44	NC_004343	CAAA	2	8	15347	15354	75 %	0 %	0 %	25 %	24217079
45	NC_004343	GATG	2	8	15988	15995	25 %	25 %	50 %	0 %	24217079
46	NC_004343	AATT	2	8	16191	16198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004343	TTTA	2	8	16328	16335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004343	TCCA	2	8	16515	16522	25 %	25 %	0 %	50 %	24217081
49	NC_004343	AGAA	2	8	17079	17086	75 %	0 %	25 %	0 %	24217081
50	NC_004343	AACC	2	8	17223	17230	50 %	0 %	0 %	50 %	24217081
51	NC_004343	GGAA	2	8	17561	17568	50 %	0 %	50 %	0 %	24217081
52	NC_004343	AACC	2	8	17820	17827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_004343	GGTT	2	8	18131	18138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004343	GAAA	2	8	18434	18441	75 %	0 %	25 %	0 %	294653590
55	NC_004343	ACTC	2	8	18473	18480	25 %	25 %	0 %	50 %	294653590
56	NC_004343	GATT	2	8	18704	18711	25 %	50 %	25 %	0 %	294653590
57	NC_004343	TTTA	2	8	18843	18850	25 %	75 %	0 %	0 %	294653590
58	NC_004343	AATT	2	8	19737	19744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004343	AAAT	2	8	20434	20441	75 %	25 %	0 %	0 %	24217085
60	NC_004343	TTGT	2	8	20700	20707	0 %	75 %	25 %	0 %	24217085
61	NC_004343	GTTT	2	8	22088	22095	0 %	75 %	25 %	0 %	24217086
62	NC_004343	TGAA	2	8	22280	22287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004343	CAGA	2	8	22334	22341	50 %	0 %	25 %	25 %	24217087
64	NC_004343	AAAC	2	8	22470	22477	75 %	0 %	0 %	25 %	24217087
65	NC_004343	GTTC	2	8	22815	22822	0 %	50 %	25 %	25 %	24217087
66	NC_004343	AAAG	2	8	22979	22986	75 %	0 %	25 %	0 %	24217087
67	NC_004343	TTAT	2	8	23098	23105	25 %	75 %	0 %	0 %	24217087
68	NC_004343	ATCC	2	8	23321	23328	25 %	25 %	0 %	50 %	24217088
69	NC_004343	GATT	2	8	23390	23397	25 %	50 %	25 %	0 %	24217088
70	NC_004343	AGAA	2	8	23963	23970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004343	TCAA	2	8	24811	24818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_004343	ATTT	2	8	24825	24832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004343	ATAG	2	8	25150	25157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004343	TGTT	2	8	25467	25474	0 %	75 %	25 %	0 %	24217091
75	NC_004343	AAAG	2	8	25828	25835	75 %	0 %	25 %	0 %	24217091
76	NC_004343	TAAG	2	8	26027	26034	50 %	25 %	25 %	0 %	24217091
77	NC_004343	AATT	2	8	26048	26055	50 %	50 %	0 %	0 %	24217091
78	NC_004343	AGAA	2	8	26144	26151	75 %	0 %	25 %	0 %	24217091
79	NC_004343	AAAG	2	8	26295	26302	75 %	0 %	25 %	0 %	24217091
80	NC_004343	ATGT	2	8	26554	26561	25 %	50 %	25 %	0 %	294653589
81	NC_004343	AATT	2	8	26935	26942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004343	TTAT	2	8	27138	27145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004343	TAAA	2	8	27187	27194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004343	GCTA	2	8	27702	27709	25 %	25 %	25 %	25 %	24217095
85	NC_004343	TGTC	2	8	28057	28064	0 %	50 %	25 %	25 %	24217096
86	NC_004343	CTTC	2	8	28137	28144	0 %	50 %	0 %	50 %	24217096
87	NC_004343	AACT	2	8	28233	28240	50 %	25 %	0 %	25 %	24217096
88	NC_004343	GAAA	2	8	28349	28356	75 %	0 %	25 %	0 %	24217096
89	NC_004343	TCAA	2	8	28568	28575	50 %	25 %	0 %	25 %	24217097
90	NC_004343	AGAA	2	8	29232	29239	75 %	0 %	25 %	0 %	24217097
91	NC_004343	TGAT	2	8	29270	29277	25 %	50 %	25 %	0 %	24217097
92	NC_004343	AACG	2	8	29281	29288	50 %	0 %	25 %	25 %	24217097
93	NC_004343	TGGT	2	8	29676	29683	0 %	50 %	50 %	0 %	24217097
94	NC_004343	AACG	2	8	29993	30000	50 %	0 %	25 %	25 %	294653588
95	NC_004343	AAAC	2	8	30114	30121	75 %	0 %	0 %	25 %	294653588
96	NC_004343	AAAC	2	8	30678	30685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_004343	AAAG	2	8	31846	31853	75 %	0 %	25 %	0 %	294653586
98	NC_004343	GAAA	2	8	31900	31907	75 %	0 %	25 %	0 %	294653586
99	NC_004343	ACTT	2	8	33021	33028	25 %	50 %	0 %	25 %	24217104
100	NC_004343	TCAT	2	8	33223	33230	25 %	50 %	0 %	25 %	24217104
101	NC_004343	ATTT	2	8	33455	33462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004343	TCTT	2	8	33996	34003	0 %	75 %	0 %	25 %	24217105
103	NC_004343	GAGT	2	8	34238	34245	25 %	25 %	50 %	0 %	24217105
104	NC_004343	AGTC	2	8	35013	35020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_004343	TTTG	2	8	36017	36024	0 %	75 %	25 %	0 %	294653584
106	NC_004343	AAAG	2	8	36300	36307	75 %	0 %	25 %	0 %	294653584
107	NC_004343	GGTT	2	8	37251	37258	0 %	50 %	50 %	0 %	294653584
108	NC_004343	GAAA	2	8	37956	37963	75 %	0 %	25 %	0 %	294653583
109	NC_004343	ACTC	2	8	37995	38002	25 %	25 %	0 %	50 %	294653583
110	NC_004343	TTTA	2	8	38365	38372	25 %	75 %	0 %	0 %	294653583
111	NC_004343	CGTT	2	8	39461	39468	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_004343	TGTA	2	8	42049	42056	25 %	50 %	25 %	0 %	24217113
113	NC_004343	AAAG	2	8	42075	42082	75 %	0 %	25 %	0 %	24217113
114	NC_004343	AAAT	2	8	42487	42494	75 %	25 %	0 %	0 %	24217113
115	NC_004343	GGAA	2	8	43440	43447	50 %	0 %	50 %	0 %	24217114
116	NC_004343	TTCT	2	8	44069	44076	0 %	75 %	0 %	25 %	294653581
117	NC_004343	TCGA	2	8	44338	44345	25 %	25 %	25 %	25 %	294653581
118	NC_004343	TATG	2	8	44476	44483	25 %	50 %	25 %	0 %	294653581
119	NC_004343	GATA	2	8	44795	44802	50 %	25 %	25 %	0 %	294653580
120	NC_004343	TCAT	2	8	45250	45257	25 %	50 %	0 %	25 %	294653580
121	NC_004343	TCTT	2	8	47160	47167	0 %	75 %	0 %	25 %	24217118
122	NC_004343	ATTT	2	8	47398	47405	25 %	75 %	0 %	0 %	24217118
123	NC_004343	ATCA	2	8	48120	48127	50 %	25 %	0 %	25 %	24217119
124	NC_004343	AAAC	2	8	48483	48490	75 %	0 %	0 %	25 %	24217119
125	NC_004343	ATCA	2	8	48667	48674	50 %	25 %	0 %	25 %	24217119
126	NC_004343	AGAA	2	8	48903	48910	75 %	0 %	25 %	0 %	24217119
127	NC_004343	TGAC	2	8	48949	48956	25 %	25 %	25 %	25 %	24217119
128	NC_004343	AATC	2	8	50164	50171	50 %	25 %	0 %	25 %	24217120
129	NC_004343	TTGT	2	8	50625	50632	0 %	75 %	25 %	0 %	24217121
130	NC_004343	AGGA	2	8	50658	50665	50 %	0 %	50 %	0 %	24217121
131	NC_004343	ATAA	2	8	50831	50838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004343	GGAA	2	8	51234	51241	50 %	0 %	50 %	0 %	24217122
133	NC_004343	AAAG	2	8	51405	51412	75 %	0 %	25 %	0 %	24217122
134	NC_004343	TTCT	2	8	51578	51585	0 %	75 %	0 %	25 %	24217122
135	NC_004343	ACAA	2	8	52102	52109	75 %	0 %	0 %	25 %	24217122
136	NC_004343	ATTT	2	8	52124	52131	25 %	75 %	0 %	0 %	24217122
137	NC_004343	ACCA	2	8	52485	52492	50 %	0 %	0 %	50 %	24217122
138	NC_004343	TCCA	2	8	52844	52851	25 %	25 %	0 %	50 %	24217123
139	NC_004343	TTTC	2	8	52879	52886	0 %	75 %	0 %	25 %	24217123
140	NC_004343	AGAA	2	8	53431	53438	75 %	0 %	25 %	0 %	294653578
141	NC_004343	AGTT	2	8	53930	53937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004343	TCGG	2	8	53944	53951	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_004343	GATC	2	8	54648	54655	25 %	25 %	25 %	25 %	294653577
144	NC_004343	TTCT	2	8	55045	55052	0 %	75 %	0 %	25 %	24217127
145	NC_004343	CTTA	2	8	55109	55116	25 %	50 %	0 %	25 %	24217127
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