MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 3800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004343	GAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217062
2	NC_004343	CCT	2	6	611	616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217062
3	NC_004343	TTA	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217062
4	NC_004343	GAT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217062
5	NC_004343	ATT	2	6	695	700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217062
6	NC_004343	GAA	2	6	702	707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217062
7	NC_004343	TGC	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217062
8	NC_004343	AAG	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217062
9	NC_004343	ATG	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217062
10	NC_004343	ACG	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24217062
11	NC_004343	GAT	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217062
12	NC_004343	ACT	2	6	1392	1397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217062
13	NC_004343	GAA	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217062
14	NC_004343	AAG	2	6	1537	1542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217062
15	NC_004343	GTT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217062
16	NC_004343	GAC	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24217062
17	NC_004343	TCC	3	9	1793	1801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217062
18	NC_004343	GAA	2	6	1825	1830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217062
19	NC_004343	GAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217062
20	NC_004343	TTC	3	9	1919	1927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217062
21	NC_004343	TGG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24217062
22	NC_004343	CTT	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217062
23	NC_004343	CGG	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24217062
24	NC_004343	CTT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217062
25	NC_004343	CGG	2	6	2434	2439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24217062
26	NC_004343	TTC	2	6	2512	2517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217062
27	NC_004343	AAT	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24217062
28	NC_004343	TCC	2	6	2604	2609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294653594
29	NC_004343	ATT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294653594
30	NC_004343	ATC	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653594
31	NC_004343	GGT	2	6	2980	2985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294653594
32	NC_004343	AGA	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653594
33	NC_004343	CTT	2	6	3179	3184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653594
34	NC_004343	AAG	2	6	3254	3259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653594
35	NC_004343	GAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653594
36	NC_004343	AGA	2	6	3286	3291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653594
37	NC_004343	TGT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004343	GTT	2	6	3473	3478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004343	AGT	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004343	TAG	2	6	3802	3807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004343	GGA	2	6	4024	4029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004343	GGT	2	6	4091	4096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24217066
43	NC_004343	TCT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217066
44	NC_004343	TGT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217066
45	NC_004343	TTC	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217066
46	NC_004343	CCA	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24217066
47	NC_004343	TTC	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217066
48	NC_004343	AAG	2	6	4486	4491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217066
49	NC_004343	AGA	3	9	4553	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217066
50	NC_004343	GCT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217066
51	NC_004343	CGT	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217066
52	NC_004343	TTC	2	6	4789	4794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217066
53	NC_004343	TGT	2	6	4825	4830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217066
54	NC_004343	GGT	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24217066
55	NC_004343	TCT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_004343	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004343	TAC	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_004343	GAA	2	6	5198	5203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004343	TCT	2	6	5329	5334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653593
60	NC_004343	CAA	2	6	5460	5465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294653593
61	NC_004343	TTC	2	6	5543	5548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653593
62	NC_004343	CCT	2	6	5572	5577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294653593
63	NC_004343	GAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653593
64	NC_004343	ATT	2	6	5654	5659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294653593
65	NC_004343	ATC	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653593
66	NC_004343	TTC	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653593
67	NC_004343	GAA	2	6	6058	6063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653593
68	NC_004343	AGA	2	6	6115	6120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004343	GCG	2	6	6125	6130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004343	AAC	2	6	6156	6161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004343	TCT	3	9	6167	6175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004343	AAT	2	6	6218	6223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004343	CTT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_004343	CTC	2	6	6684	6689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217071
75	NC_004343	GGA	2	6	6790	6795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217071
76	NC_004343	CTT	2	6	6895	6900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217071
77	NC_004343	GTA	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217071
78	NC_004343	GAA	2	6	7153	7158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217071
79	NC_004343	GAA	2	6	7252	7257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217071
80	NC_004343	CTC	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294653592
81	NC_004343	TAC	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653592
82	NC_004343	TTC	2	6	7579	7584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653592
83	NC_004343	CTT	2	6	7639	7644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653592
84	NC_004343	TTC	2	6	7709	7714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653592
85	NC_004343	TGC	2	6	7958	7963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294653592
86	NC_004343	GTT	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294653592
87	NC_004343	AGA	3	9	8039	8047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653592
88	NC_004343	GGT	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294653592
89	NC_004343	TTC	2	6	8104	8109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653592
90	NC_004343	TTC	2	6	8276	8281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653592
91	NC_004343	AAT	2	6	8313	8318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294653592
92	NC_004343	ATC	2	6	8629	8634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653592
93	NC_004343	GAA	2	6	8838	8843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653592
94	NC_004343	AGA	2	6	8875	8880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653592
95	NC_004343	TCT	2	6	9025	9030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217073
96	NC_004343	TCT	2	6	9148	9153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217073
97	NC_004343	AGA	2	6	9158	9163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217073
98	NC_004343	ATG	2	6	9340	9345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217073
99	NC_004343	GAA	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217073
100	NC_004343	CTA	2	6	9419	9424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217073
101	NC_004343	TTC	2	6	9492	9497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217073
102	NC_004343	GGA	2	6	9522	9527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217073
103	NC_004343	AGA	2	6	9555	9560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217073
104	NC_004343	CTT	2	6	9761	9766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217073
105	NC_004343	GCC	2	6	9781	9786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24217073
106	NC_004343	AGA	2	6	9787	9792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217073
107	NC_004343	GAA	2	6	9870	9875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217074
108	NC_004343	ATT	2	6	10018	10023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217074
109	NC_004343	AGA	2	6	10070	10075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217074
110	NC_004343	TGA	2	6	10213	10218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217074
111	NC_004343	GCT	2	6	10239	10244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217074
112	NC_004343	TCT	3	9	10338	10346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217074
113	NC_004343	GAT	2	6	10401	10406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217074
114	NC_004343	TTG	2	6	10491	10496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217074
115	NC_004343	TGA	2	6	10565	10570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217074
116	NC_004343	GGA	2	6	10662	10667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217074
117	NC_004343	GTT	2	6	10678	10683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217074
118	NC_004343	GAT	2	6	10830	10835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217074
119	NC_004343	CAA	2	6	10944	10949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24217074
120	NC_004343	ATG	3	9	11080	11088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217074
121	NC_004343	TGG	2	6	11216	11221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24217075
122	NC_004343	GGT	2	6	11372	11377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24217075
123	NC_004343	ATC	2	6	11520	11525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217075
124	NC_004343	GGA	2	6	11713	11718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217075
125	NC_004343	TTC	2	6	12033	12038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217075
126	NC_004343	GGA	2	6	12040	12045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217075
127	NC_004343	AAG	2	6	12125	12130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217076
128	NC_004343	AGA	2	6	12249	12254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217076
129	NC_004343	TCC	2	6	12276	12281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217076
130	NC_004343	GAA	2	6	12346	12351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217076
131	NC_004343	GAA	2	6	12430	12435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217076
132	NC_004343	AGG	2	6	12492	12497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217076
133	NC_004343	GAA	2	6	12499	12504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217076
134	NC_004343	GAA	2	6	12604	12609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217076
135	NC_004343	GAG	2	6	12701	12706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217076
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143	NC_004343	GAT	2	6	13465	13470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294653591
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155	NC_004343	AAG	2	6	15147	15152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_004343	TTA	2	6	15180	15185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217079
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261	NC_004343	GGA	2	6	23195	23200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217087
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263	NC_004343	TCT	2	6	23281	23286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217088
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