MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 7651

< Previous12345678910111213141516Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_004343	GAA	2	6	44733	44738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653580
1003	NC_004343	GATA	2	8	44795	44802	50 %	25 %	25 %	0 %	294653580
1004	NC_004343	AAG	2	6	44830	44835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653580
1005	NC_004343	TGGAT	2	10	44957	44966	20 %	40 %	40 %	0 %	294653580
1006	NC_004343	TTTCC	2	10	45109	45118	0 %	60 %	0 %	40 %	294653580
1007	NC_004343	CGGAA	2	10	45143	45152	40 %	0 %	40 %	20 %	294653580
1008	NC_004343	G	6	6	45156	45161	0 %	0 %	100 %	0 %	294653580
1009	NC_004343	TCAT	2	8	45250	45257	25 %	50 %	0 %	25 %	294653580
1010	NC_004343	T	6	6	45275	45280	0 %	100 %	0 %	0 %	294653580
1011	NC_004343	A	6	6	45281	45286	100 %	0 %	0 %	0 %	294653580
1012	NC_004343	ACG	2	6	45301	45306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294653580
1013	NC_004343	T	6	6	45364	45369	0 %	100 %	0 %	0 %	294653580
1014	NC_004343	A	7	7	45395	45401	100 %	0 %	0 %	0 %	294653580
1015	NC_004343	CG	3	6	45411	45416	0 %	0 %	50 %	50 %	294653580
1016	NC_004343	CTA	2	6	45453	45458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653580
1017	NC_004343	ATTGG	2	10	45461	45470	20 %	40 %	40 %	0 %	294653580
1018	NC_004343	GTTTAA	2	12	45564	45575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294653579
1019	NC_004343	GAA	2	6	45623	45628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653579
1020	NC_004343	A	7	7	45670	45676	100 %	0 %	0 %	0 %	294653579
1021	NC_004343	A	6	6	45869	45874	100 %	0 %	0 %	0 %	294653579
1022	NC_004343	AGA	2	6	45880	45885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653579
1023	NC_004343	AT	3	6	45886	45891	50 %	50 %	0 %	0 %	294653579
1024	NC_004343	AAG	2	6	45921	45926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653579
1025	NC_004343	A	6	6	45931	45936	100 %	0 %	0 %	0 %	294653579
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1028	NC_004343	A	6	6	46001	46006	100 %	0 %	0 %	0 %	294653579
1029	NC_004343	A	6	6	46046	46051	100 %	0 %	0 %	0 %	294653579
1030	NC_004343	AGA	2	6	46102	46107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653579
1031	NC_004343	GAA	2	6	46179	46184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653579
1032	NC_004343	AG	3	6	46193	46198	50 %	0 %	50 %	0 %	294653579
1033	NC_004343	T	7	7	46229	46235	0 %	100 %	0 %	0 %	24217118
1034	NC_004343	GAA	2	6	46261	46266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217118
1035	NC_004343	GAA	2	6	46306	46311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217118
1036	NC_004343	TAC	2	6	46416	46421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217118
1037	NC_004343	GT	3	6	46487	46492	0 %	50 %	50 %	0 %	24217118
1038	NC_004343	TCC	3	9	46539	46547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217118
1039	NC_004343	T	7	7	46602	46608	0 %	100 %	0 %	0 %	24217118
1040	NC_004343	T	7	7	46614	46620	0 %	100 %	0 %	0 %	24217118
1041	NC_004343	GAA	3	9	46627	46635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217118
1042	NC_004343	A	6	6	46681	46686	100 %	0 %	0 %	0 %	24217118
1043	NC_004343	TAT	2	6	46729	46734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217118
1044	NC_004343	TA	3	6	46877	46882	50 %	50 %	0 %	0 %	24217118
1045	NC_004343	AAG	2	6	47111	47116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217118
1046	NC_004343	GA	3	6	47117	47122	50 %	0 %	50 %	0 %	24217118
1047	NC_004343	TCTT	2	8	47160	47167	0 %	75 %	0 %	25 %	24217118
1048	NC_004343	A	6	6	47202	47207	100 %	0 %	0 %	0 %	24217118
1049	NC_004343	ATTTT	2	10	47357	47366	20 %	80 %	0 %	0 %	24217118
1050	NC_004343	T	7	7	47363	47369	0 %	100 %	0 %	0 %	24217118
1051	NC_004343	ATTT	2	8	47398	47405	25 %	75 %	0 %	0 %	24217118
1052	NC_004343	GAA	2	6	47470	47475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217118
1053	NC_004343	T	7	7	47494	47500	0 %	100 %	0 %	0 %	24217118
1054	NC_004343	ACTTG	2	10	47634	47643	20 %	40 %	20 %	20 %	24217118
1055	NC_004343	ATTTT	2	10	47813	47822	20 %	80 %	0 %	0 %	24217118
1056	NC_004343	GGA	2	6	47835	47840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217118
1057	NC_004343	GAA	2	6	47853	47858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217119
1058	NC_004343	GAA	2	6	47866	47871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217119
1059	NC_004343	AT	3	6	47890	47895	50 %	50 %	0 %	0 %	24217119
1060	NC_004343	A	6	6	47907	47912	100 %	0 %	0 %	0 %	24217119
1061	NC_004343	TTA	2	6	47938	47943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217119
1062	NC_004343	A	8	8	47984	47991	100 %	0 %	0 %	0 %	24217119
1063	NC_004343	GAA	2	6	48003	48008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217119
1064	NC_004343	AGG	2	6	48014	48019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217119
1065	NC_004343	A	6	6	48055	48060	100 %	0 %	0 %	0 %	24217119
1066	NC_004343	AGA	2	6	48074	48079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217119
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1070	NC_004343	A	7	7	48158	48164	100 %	0 %	0 %	0 %	24217119
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1075	NC_004343	TCCGT	2	10	48608	48617	0 %	40 %	20 %	40 %	24217119
1076	NC_004343	ATATT	2	10	48627	48636	40 %	60 %	0 %	0 %	24217119
1077	NC_004343	ATCA	2	8	48667	48674	50 %	25 %	0 %	25 %	24217119
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1080	NC_004343	A	8	8	48848	48855	100 %	0 %	0 %	0 %	24217119
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1083	NC_004343	TGAC	2	8	48949	48956	25 %	25 %	25 %	25 %	24217119
1084	NC_004343	GGC	2	6	48971	48976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24217119
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1086	NC_004343	CTT	2	6	49087	49092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217119
1087	NC_004343	TAG	2	6	49138	49143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217119
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1092	NC_004343	TTC	2	6	49490	49495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217119
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1094	NC_004343	GAA	2	6	49502	49507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217119
1095	NC_004343	CTT	2	6	49581	49586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217119
1096	NC_004343	TGA	2	6	49601	49606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217119
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1099	NC_004343	TTA	3	9	49755	49763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217120
1100	NC_004343	T	8	8	49766	49773	0 %	100 %	0 %	0 %	24217120
1101	NC_004343	CT	3	6	49790	49795	0 %	50 %	0 %	50 %	24217120
1102	NC_004343	CTG	2	6	49812	49817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217120
1103	NC_004343	A	6	6	49850	49855	100 %	0 %	0 %	0 %	24217120
1104	NC_004343	TAC	2	6	49880	49885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217120
1105	NC_004343	ATT	2	6	49890	49895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217120
1106	NC_004343	GC	3	6	49917	49922	0 %	0 %	50 %	50 %	24217120
1107	NC_004343	AT	3	6	50113	50118	50 %	50 %	0 %	0 %	24217120
1108	NC_004343	T	6	6	50143	50148	0 %	100 %	0 %	0 %	24217120
1109	NC_004343	AATC	2	8	50164	50171	50 %	25 %	0 %	25 %	24217120
1110	NC_004343	T	6	6	50231	50236	0 %	100 %	0 %	0 %	24217120
1111	NC_004343	TAA	2	6	50266	50271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24217121
1112	NC_004343	A	6	6	50329	50334	100 %	0 %	0 %	0 %	24217121
1113	NC_004343	CTT	2	6	50533	50538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217121
1114	NC_004343	TTGT	2	8	50625	50632	0 %	75 %	25 %	0 %	24217121
1115	NC_004343	TG	3	6	50637	50642	0 %	50 %	50 %	0 %	24217121
1116	NC_004343	AGGA	2	8	50658	50665	50 %	0 %	50 %	0 %	24217121
1117	NC_004343	AACCAA	2	12	50678	50689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24217121
1118	NC_004343	ATT	2	6	50767	50772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004343	A	6	6	50795	50800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_004343	ATAA	2	8	50831	50838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_004343	ATG	2	6	50864	50869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_004343	AATTT	2	10	50873	50882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_004343	AG	3	6	50935	50940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_004343	CAATA	2	10	51142	51151	60 %	20 %	0 %	20 %	24217122
1125	NC_004343	T	7	7	51222	51228	0 %	100 %	0 %	0 %	24217122
1126	NC_004343	GGAA	2	8	51234	51241	50 %	0 %	50 %	0 %	24217122
1127	NC_004343	AGA	2	6	51242	51247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217122
1128	NC_004343	TCT	2	6	51255	51260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217122
1129	NC_004343	AGG	2	6	51378	51383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217122
1130	NC_004343	AAAG	2	8	51405	51412	75 %	0 %	25 %	0 %	24217122
1131	NC_004343	GAA	2	6	51446	51451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217122
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1133	NC_004343	GGA	2	6	51553	51558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217122
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1155	NC_004343	GGA	2	6	52507	52512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217122
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