MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 93275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004342	T	9	9	156953	156961	0 %	100 %	0 %	0 %	24212845
3502	NC_004342	CAA	2	6	156987	156992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212845
3503	NC_004342	CCG	2	6	157009	157014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24212845
3504	NC_004342	AAGA	2	8	157019	157026	75 %	0 %	25 %	0 %	24212845
3505	NC_004342	ATC	2	6	157045	157050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212845
3506	NC_004342	TG	3	6	157096	157101	0 %	50 %	50 %	0 %	24212845
3507	NC_004342	TC	3	6	157117	157122	0 %	50 %	0 %	50 %	24212845
3508	NC_004342	TTC	2	6	157141	157146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_004342	ATT	2	6	157190	157195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_004342	ATA	2	6	157304	157309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_004342	T	6	6	157340	157345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_004342	GTT	2	6	157430	157435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_004342	TGG	2	6	157447	157452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_004342	CTA	2	6	157522	157527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_004342	TA	4	8	157526	157533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_004342	GTTT	2	8	157583	157590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_004342	T	6	6	157617	157622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_004342	TAA	2	6	157632	157637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_004342	AGT	2	6	157643	157648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_004342	CGT	2	6	157661	157666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_004342	AGT	2	6	157690	157695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_004342	AAAC	2	8	157797	157804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_004342	ATT	2	6	157827	157832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_004342	A	7	7	157834	157840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_004342	AAAAT	2	10	157860	157869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_004342	AAG	2	6	157952	157957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212846
3527	NC_004342	GATTT	2	10	158002	158011	20 %	60 %	20 %	0 %	24212846
3528	NC_004342	GAAA	2	8	158070	158077	75 %	0 %	25 %	0 %	24212846
3529	NC_004342	GAT	2	6	158236	158241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212846
3530	NC_004342	GAT	2	6	158265	158270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212846
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3532	NC_004342	ATT	2	6	158347	158352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212846
3533	NC_004342	A	7	7	158417	158423	100 %	0 %	0 %	0 %	24212846
3534	NC_004342	CAA	2	6	158431	158436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212846
3535	NC_004342	AGC	2	6	158586	158591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212846
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3537	NC_004342	ATC	2	6	158683	158688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212846
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3539	NC_004342	A	6	6	158836	158841	100 %	0 %	0 %	0 %	24212846
3540	NC_004342	T	6	6	158868	158873	0 %	100 %	0 %	0 %	24212846
3541	NC_004342	AGT	2	6	158877	158882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212846
3542	NC_004342	CGA	2	6	158925	158930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212846
3543	NC_004342	A	6	6	158933	158938	100 %	0 %	0 %	0 %	24212846
3544	NC_004342	GA	4	8	158949	158956	50 %	0 %	50 %	0 %	24212846
3545	NC_004342	TTC	2	6	158960	158965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212846
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3547	NC_004342	TTC	2	6	159138	159143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212846
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3549	NC_004342	A	6	6	159256	159261	100 %	0 %	0 %	0 %	24212846
3550	NC_004342	GA	3	6	159311	159316	50 %	0 %	50 %	0 %	24212846
3551	NC_004342	AAGAGA	2	12	159356	159367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212846
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3553	NC_004342	GCG	2	6	159418	159423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212846
3554	NC_004342	AATT	2	8	159443	159450	50 %	50 %	0 %	0 %	24212846
3555	NC_004342	A	6	6	159455	159460	100 %	0 %	0 %	0 %	24212846
3556	NC_004342	T	6	6	159476	159481	0 %	100 %	0 %	0 %	24212846
3557	NC_004342	CGT	2	6	159492	159497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212846
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3560	NC_004342	GAA	2	6	159577	159582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212846
3561	NC_004342	A	7	7	159589	159595	100 %	0 %	0 %	0 %	24212846
3562	NC_004342	GA	3	6	159609	159614	50 %	0 %	50 %	0 %	24212846
3563	NC_004342	TGA	2	6	159629	159634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212846
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3565	NC_004342	TCT	2	6	159796	159801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212846
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3569	NC_004342	A	7	7	159979	159985	100 %	0 %	0 %	0 %	24212846
3570	NC_004342	ATT	2	6	160004	160009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212846
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3572	NC_004342	TAC	2	6	160066	160071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_004342	AGAA	2	8	160120	160127	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_004342	CA	3	6	160149	160154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_004342	TG	3	6	160195	160200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_004342	ACT	2	6	160202	160207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3578	NC_004342	AGT	2	6	160316	160321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3580	NC_004342	CAA	2	6	160349	160354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_004342	TAA	2	6	160358	160363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3583	NC_004342	GTA	2	6	160475	160480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212847
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3591	NC_004342	GA	3	6	160999	161004	50 %	0 %	50 %	0 %	24212848
3592	NC_004342	ATTTT	2	10	161006	161015	20 %	80 %	0 %	0 %	24212848
3593	NC_004342	A	8	8	161086	161093	100 %	0 %	0 %	0 %	24212848
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3599	NC_004342	GAA	2	6	161432	161437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212848
3600	NC_004342	A	6	6	161436	161441	100 %	0 %	0 %	0 %	24212848
3601	NC_004342	T	6	6	161511	161516	0 %	100 %	0 %	0 %	24212848
3602	NC_004342	T	6	6	161518	161523	0 %	100 %	0 %	0 %	24212848
3603	NC_004342	ATTAAA	2	12	161531	161542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212848
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3607	NC_004342	TAGTC	2	10	161981	161990	20 %	40 %	20 %	20 %	24212849
3608	NC_004342	TCT	2	6	162033	162038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212849
3609	NC_004342	ATC	2	6	162050	162055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212849
3610	NC_004342	GAT	2	6	162196	162201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212849
3611	NC_004342	GCC	2	6	162254	162259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24212849
3612	NC_004342	A	7	7	162323	162329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_004342	TTG	2	6	162367	162372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212850
3614	NC_004342	TTC	2	6	162477	162482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212850
3615	NC_004342	AAAG	2	8	162494	162501	75 %	0 %	25 %	0 %	24212850
3616	NC_004342	AGA	2	6	162538	162543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212850
3617	NC_004342	AAG	2	6	162559	162564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212850
3618	NC_004342	TTGCAA	2	12	162591	162602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24212850
3619	NC_004342	CGTT	2	8	162648	162655	0 %	50 %	25 %	25 %	24212850
3620	NC_004342	AAAG	2	8	162671	162678	75 %	0 %	25 %	0 %	24212850
3621	NC_004342	CTT	2	6	162720	162725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212850
3622	NC_004342	GTA	2	6	162770	162775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212850
3623	NC_004342	CTA	2	6	162807	162812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212850
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3625	NC_004342	TGA	2	6	162906	162911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212850
3626	NC_004342	CTT	2	6	163041	163046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212850
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3628	NC_004342	GATTC	2	10	163074	163083	20 %	40 %	20 %	20 %	24212850
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