MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 93275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_004342	TTCG	2	8	43371	43378	0 %	50 %	25 %	25 %	24212740
1003	NC_004342	TTA	2	6	43453	43458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212740
1004	NC_004342	ACT	2	6	43500	43505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212740
1005	NC_004342	GAA	2	6	43601	43606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212740
1006	NC_004342	ATT	2	6	43668	43673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212740
1007	NC_004342	A	6	6	43701	43706	100 %	0 %	0 %	0 %	24212740
1008	NC_004342	CTG	2	6	43779	43784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212740
1009	NC_004342	TCT	2	6	43802	43807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212740
1010	NC_004342	ATCGA	2	10	43914	43923	40 %	20 %	20 %	20 %	24212740
1011	NC_004342	GAA	2	6	43928	43933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212740
1012	NC_004342	A	6	6	43955	43960	100 %	0 %	0 %	0 %	24212740
1013	NC_004342	AAAG	2	8	43966	43973	75 %	0 %	25 %	0 %	24212740
1014	NC_004342	AAAT	2	8	43981	43988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_004342	CCAT	2	8	44128	44135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_004342	T	6	6	44188	44193	0 %	100 %	0 %	0 %	294827561
1017	NC_004342	GAAA	2	8	44281	44288	75 %	0 %	25 %	0 %	294827561
1018	NC_004342	TA	4	8	44378	44385	50 %	50 %	0 %	0 %	294827561
1019	NC_004342	GAA	2	6	44433	44438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294827561
1020	NC_004342	CTT	2	6	44442	44447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827561
1021	NC_004342	AGA	2	6	44506	44511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294827561
1022	NC_004342	AG	3	6	44513	44518	50 %	0 %	50 %	0 %	294827561
1023	NC_004342	TAT	2	6	44526	44531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294827561
1024	NC_004342	CTT	2	6	44541	44546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827561
1025	NC_004342	AGAC	2	8	44582	44589	50 %	0 %	25 %	25 %	294827561
1026	NC_004342	T	6	6	44594	44599	0 %	100 %	0 %	0 %	294827561
1027	NC_004342	AT	3	6	44650	44655	50 %	50 %	0 %	0 %	294827561
1028	NC_004342	GGC	2	6	44657	44662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212742
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1030	NC_004342	A	7	7	44695	44701	100 %	0 %	0 %	0 %	24212742
1031	NC_004342	A	7	7	44716	44722	100 %	0 %	0 %	0 %	24212742
1032	NC_004342	GAATT	2	10	44747	44756	40 %	40 %	20 %	0 %	24212742
1033	NC_004342	GGT	2	6	44786	44791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212742
1034	NC_004342	GAA	2	6	44843	44848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212742
1035	NC_004342	TTC	2	6	44955	44960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212742
1036	NC_004342	ACT	2	6	44984	44989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212742
1037	NC_004342	TCC	2	6	45013	45018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24212742
1038	NC_004342	GAA	2	6	45032	45037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212742
1039	NC_004342	TTC	2	6	45094	45099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212742
1040	NC_004342	ATA	3	9	45153	45161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212742
1041	NC_004342	AAT	2	6	45215	45220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212742
1042	NC_004342	ATG	2	6	45357	45362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212742
1043	NC_004342	A	6	6	45408	45413	100 %	0 %	0 %	0 %	24212742
1044	NC_004342	GTA	3	9	45455	45463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212742
1045	NC_004342	GAA	2	6	45531	45536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212742
1046	NC_004342	ATA	2	6	45645	45650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212742
1047	NC_004342	TTGG	2	8	45664	45671	0 %	50 %	50 %	0 %	24212742
1048	NC_004342	CTT	2	6	45702	45707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212742
1049	NC_004342	GAA	2	6	45834	45839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212742
1050	NC_004342	A	7	7	46011	46017	100 %	0 %	0 %	0 %	24212742
1051	NC_004342	GTG	2	6	46037	46042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212742
1052	NC_004342	TAC	2	6	46192	46197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212742
1053	NC_004342	A	7	7	46237	46243	100 %	0 %	0 %	0 %	24212742
1054	NC_004342	GAA	2	6	46302	46307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_004342	AT	3	6	46320	46325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_004342	TAT	2	6	46337	46342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_004342	A	6	6	46378	46383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_004342	T	7	7	46427	46433	0 %	100 %	0 %	0 %	24212743
1059	NC_004342	T	7	7	46437	46443	0 %	100 %	0 %	0 %	24212743
1060	NC_004342	TTCT	2	8	46447	46454	0 %	75 %	0 %	25 %	24212743
1061	NC_004342	AAG	2	6	46479	46484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212743
1062	NC_004342	AGA	2	6	46604	46609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212743
1063	NC_004342	A	6	6	46664	46669	100 %	0 %	0 %	0 %	24212743
1064	NC_004342	A	6	6	46689	46694	100 %	0 %	0 %	0 %	24212743
1065	NC_004342	A	6	6	46788	46793	100 %	0 %	0 %	0 %	24212743
1066	NC_004342	CGG	2	6	46803	46808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212743
1067	NC_004342	TTC	2	6	46819	46824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212743
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1070	NC_004342	A	6	6	46853	46858	100 %	0 %	0 %	0 %	24212743
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1074	NC_004342	TC	3	6	46958	46963	0 %	50 %	0 %	50 %	24212743
1075	NC_004342	A	6	6	46979	46984	100 %	0 %	0 %	0 %	24212743
1076	NC_004342	AAAAT	2	10	47121	47130	80 %	20 %	0 %	0 %	24212743
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1084	NC_004342	GAGGAA	2	12	47582	47593	50 %	0 %	50 %	0 %	24212743
1085	NC_004342	TTA	3	9	47623	47631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212743
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1088	NC_004342	TATT	2	8	47696	47703	25 %	75 %	0 %	0 %	24212743
1089	NC_004342	A	6	6	47736	47741	100 %	0 %	0 %	0 %	24212743
1090	NC_004342	ATAC	2	8	47749	47756	50 %	25 %	0 %	25 %	24212743
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1093	NC_004342	GAA	2	6	47801	47806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212743
1094	NC_004342	TCT	2	6	47834	47839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212743
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1096	NC_004342	ATA	2	6	47889	47894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212743
1097	NC_004342	ATA	2	6	47907	47912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212743
1098	NC_004342	GTT	2	6	47931	47936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_004342	TTCAA	2	10	47983	47992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_004342	AATT	2	8	48008	48015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_004342	CAA	2	6	48019	48024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_004342	T	6	6	48059	48064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_004342	GTT	2	6	48185	48190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212745
1104	NC_004342	ACA	2	6	48194	48199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212745
1105	NC_004342	GAAA	2	8	48324	48331	75 %	0 %	25 %	0 %	24212745
1106	NC_004342	T	7	7	48401	48407	0 %	100 %	0 %	0 %	24212745
1107	NC_004342	TAAA	2	8	48413	48420	75 %	25 %	0 %	0 %	24212745
1108	NC_004342	TTA	2	6	48426	48431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212745
1109	NC_004342	ATT	2	6	48585	48590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212745
1110	NC_004342	TTC	2	6	48605	48610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212745
1111	NC_004342	T	7	7	48611	48617	0 %	100 %	0 %	0 %	24212745
1112	NC_004342	TTC	2	6	48680	48685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212745
1113	NC_004342	CTA	2	6	48694	48699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212745
1114	NC_004342	T	6	6	48767	48772	0 %	100 %	0 %	0 %	24212745
1115	NC_004342	TGGA	2	8	48861	48868	25 %	25 %	50 %	0 %	24212746
1116	NC_004342	TAG	2	6	48982	48987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212746
1117	NC_004342	TCA	2	6	48997	49002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212746
1118	NC_004342	CTT	2	6	49036	49041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212746
1119	NC_004342	T	6	6	49046	49051	0 %	100 %	0 %	0 %	24212746
1120	NC_004342	ATCTTT	2	12	49184	49195	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	24212746
1121	NC_004342	CAT	2	6	49204	49209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212746
1122	NC_004342	TCAAAC	2	12	49216	49227	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	24212746
1123	NC_004342	GAT	2	6	49249	49254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212746
1124	NC_004342	AGCT	2	8	49352	49359	25 %	25 %	25 %	25 %	24212746
1125	NC_004342	CTT	2	6	49372	49377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212746
1126	NC_004342	AAC	2	6	49397	49402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212746
1127	NC_004342	TTG	2	6	49474	49479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212746
1128	NC_004342	A	7	7	49587	49593	100 %	0 %	0 %	0 %	24212746
1129	NC_004342	AGA	2	6	49622	49627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212746
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1131	NC_004342	T	6	6	49731	49736	0 %	100 %	0 %	0 %	24212746
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