MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 93275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004342	GTT	2	6	21949	21954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212719
502	NC_004342	ATA	2	6	21989	21994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212719
503	NC_004342	ATCG	2	8	22021	22028	25 %	25 %	25 %	25 %	24212719
504	NC_004342	GAT	2	6	22042	22047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212719
505	NC_004342	AGA	2	6	22062	22067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212719
506	NC_004342	A	8	8	22100	22107	100 %	0 %	0 %	0 %	24212719
507	NC_004342	A	6	6	22111	22116	100 %	0 %	0 %	0 %	24212719
508	NC_004342	A	6	6	22149	22154	100 %	0 %	0 %	0 %	24212719
509	NC_004342	A	6	6	22206	22211	100 %	0 %	0 %	0 %	24212719
510	NC_004342	ACA	2	6	22272	22277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212719
511	NC_004342	ATTT	2	8	22305	22312	25 %	75 %	0 %	0 %	24212720
512	NC_004342	TTC	2	6	22417	22422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212720
513	NC_004342	AAG	2	6	22436	22441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212720
514	NC_004342	ATT	2	6	22505	22510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212720
515	NC_004342	TAA	2	6	22573	22578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212720
516	NC_004342	T	6	6	22588	22593	0 %	100 %	0 %	0 %	24212720
517	NC_004342	AGA	2	6	22597	22602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212720
518	NC_004342	ATC	2	6	22616	22621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212720
519	NC_004342	TTA	2	6	22660	22665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212720
520	NC_004342	AAAG	2	8	22678	22685	75 %	0 %	25 %	0 %	24212720
521	NC_004342	GAT	2	6	22867	22872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212720
522	NC_004342	AGA	2	6	22939	22944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212720
523	NC_004342	TAG	2	6	22947	22952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212720
524	NC_004342	AGC	2	6	22954	22959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212720
525	NC_004342	T	8	8	22962	22969	0 %	100 %	0 %	0 %	24212720
526	NC_004342	TCT	2	6	22982	22987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212720
527	NC_004342	GTA	2	6	23009	23014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212720
528	NC_004342	GGA	2	6	23018	23023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212720
529	NC_004342	TTCT	2	8	23061	23068	0 %	75 %	0 %	25 %	24212721
530	NC_004342	A	6	6	23088	23093	100 %	0 %	0 %	0 %	24212721
531	NC_004342	ACA	2	6	23101	23106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212721
532	NC_004342	TA	3	6	23138	23143	50 %	50 %	0 %	0 %	24212721
533	NC_004342	TTG	2	6	23168	23173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212721
534	NC_004342	CT	4	8	23241	23248	0 %	50 %	0 %	50 %	24212721
535	NC_004342	TA	3	6	23282	23287	50 %	50 %	0 %	0 %	24212721
536	NC_004342	ATG	2	6	23301	23306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212721
537	NC_004342	TGA	2	6	23316	23321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212721
538	NC_004342	A	7	7	23321	23327	100 %	0 %	0 %	0 %	24212721
539	NC_004342	CTTTTA	2	12	23340	23351	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	24212721
540	NC_004342	TAA	2	6	23362	23367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212721
541	NC_004342	AGAA	2	8	23397	23404	75 %	0 %	25 %	0 %	24212721
542	NC_004342	GAATTC	2	12	23415	23426	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24212721
543	NC_004342	ATTT	2	8	23435	23442	25 %	75 %	0 %	0 %	24212721
544	NC_004342	ATG	2	6	23499	23504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212721
545	NC_004342	ATC	2	6	23510	23515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212721
546	NC_004342	A	6	6	23532	23537	100 %	0 %	0 %	0 %	24212721
547	NC_004342	GGA	2	6	23570	23575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212721
548	NC_004342	TA	3	6	23708	23713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_004342	TTG	2	6	23720	23725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_004342	AAC	2	6	23809	23814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_004342	TGA	2	6	23817	23822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004342	T	7	7	23875	23881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_004342	TAA	2	6	23897	23902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_004342	TGTT	2	8	23993	24000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004342	A	7	7	24043	24049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004342	TCT	2	6	24104	24109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_004342	ATTTTT	2	12	24164	24175	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	24212722
558	NC_004342	TG	3	6	24178	24183	0 %	50 %	50 %	0 %	24212722
559	NC_004342	T	6	6	24250	24255	0 %	100 %	0 %	0 %	24212722
560	NC_004342	ATTTT	2	10	24274	24283	20 %	80 %	0 %	0 %	24212722
561	NC_004342	CTA	2	6	24508	24513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212722
562	NC_004342	GA	3	6	24536	24541	50 %	0 %	50 %	0 %	24212722
563	NC_004342	TACA	2	8	24550	24557	50 %	25 %	0 %	25 %	24212722
564	NC_004342	ATTG	2	8	24662	24669	25 %	50 %	25 %	0 %	24212722
565	NC_004342	GATGGA	2	12	24798	24809	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	24212722
566	NC_004342	CAA	2	6	24835	24840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212722
567	NC_004342	TATT	2	8	24851	24858	25 %	75 %	0 %	0 %	24212722
568	NC_004342	ATTA	2	8	24891	24898	50 %	50 %	0 %	0 %	24212722
569	NC_004342	TTGGTG	2	12	24907	24918	0 %	50 %	50 %	0 %	24212722
570	NC_004342	CAA	2	6	25062	25067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212722
571	NC_004342	TGC	2	6	25094	25099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212722
572	NC_004342	CGGT	2	8	25168	25175	0 %	25 %	50 %	25 %	24212722
573	NC_004342	CTT	2	6	25192	25197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212722
574	NC_004342	TTAT	2	8	25198	25205	25 %	75 %	0 %	0 %	24212722
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578	NC_004342	GGAT	2	8	25310	25317	25 %	25 %	50 %	0 %	24212722
579	NC_004342	ATTT	2	8	25324	25331	25 %	75 %	0 %	0 %	24212722
580	NC_004342	GCG	2	6	25354	25359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212722
581	NC_004342	ATTTAT	2	12	25372	25383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212722
582	NC_004342	TTGG	2	8	25431	25438	0 %	50 %	50 %	0 %	24212722
583	NC_004342	TCT	2	6	25496	25501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212722
584	NC_004342	TCT	2	6	25604	25609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212722
585	NC_004342	TA	3	6	25743	25748	50 %	50 %	0 %	0 %	24212722
586	NC_004342	TCG	2	6	25789	25794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212722
587	NC_004342	TTATT	2	10	25847	25856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_004342	AATT	2	8	25860	25867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_004342	A	6	6	25902	25907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_004342	ACT	2	6	25949	25954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_004342	ATG	2	6	26040	26045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_004342	GAA	2	6	26074	26079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004342	T	6	6	26115	26120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_004342	TGA	2	6	26157	26162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_004342	GAT	3	9	26201	26209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_004342	TAG	2	6	26225	26230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_004342	T	6	6	26291	26296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_004342	TAAAA	2	10	26312	26321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_004342	TAGT	2	8	26382	26389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_004342	ATT	2	6	26413	26418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_004342	ATA	2	6	26578	26583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004342	ATAA	2	8	26604	26611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_004342	AAT	2	6	26627	26632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_004342	TAC	2	6	26654	26659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_004342	TAT	2	6	26660	26665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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608	NC_004342	TAG	2	6	26767	26772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294827558
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610	NC_004342	GA	3	6	26788	26793	50 %	0 %	50 %	0 %	294827558
611	NC_004342	AAT	2	6	26852	26857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294827558
612	NC_004342	T	6	6	26857	26862	0 %	100 %	0 %	0 %	294827558
613	NC_004342	AGG	2	6	26911	26916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294827558
614	NC_004342	T	7	7	26950	26956	0 %	100 %	0 %	0 %	294827558
615	NC_004342	TTTCAA	2	12	27013	27024	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294827558
616	NC_004342	T	6	6	27047	27052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_004342	TTCA	2	8	27078	27085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NC_004342	TTA	2	6	27098	27103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_004342	T	6	6	27113	27118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_004342	ATA	2	6	27121	27126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_004342	GTT	2	6	27149	27154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_004342	AGAC	2	8	27220	27227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_004342	ATT	2	6	27235	27240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_004342	ACT	2	6	27293	27298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_004342	TAT	2	6	27355	27360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_004342	ACTAA	2	10	27361	27370	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
627	NC_004342	TTAA	2	8	27372	27379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_004342	ATA	2	6	27417	27422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_004342	A	6	6	27469	27474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_004342	ACT	2	6	27523	27528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_004342	TAT	2	6	27642	27647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004342	CA	3	6	27758	27763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_004342	T	6	6	27792	27797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_004342	TAAT	2	8	27814	27821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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636	NC_004342	TTA	2	6	27885	27890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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