MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria innocua Clip11262 plasmid pLI100

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003383	AATTC	2	10	764	773	40 %	40 %	0 %	20 %	18450288
2	NC_003383	TCTTG	2	10	3476	3485	0 %	60 %	20 %	20 %	18450290
3	NC_003383	CGATC	2	10	4761	4770	20 %	20 %	20 %	40 %	18450291
4	NC_003383	TCTTT	2	10	4919	4928	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_003383	ACTTC	2	10	5645	5654	20 %	40 %	0 %	40 %	18450293
6	NC_003383	TTTTG	2	10	6091	6100	0 %	80 %	20 %	0 %	18450294
7	NC_003383	TGATC	2	10	7594	7603	20 %	40 %	20 %	20 %	18450295
8	NC_003383	ATTCC	2	10	9179	9188	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_003383	GAACG	2	10	9542	9551	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_003383	CAAAA	2	10	10829	10838	80 %	0 %	0 %	20 %	18450299
11	NC_003383	CAAAA	2	10	13965	13974	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_003383	TTTCT	2	10	15010	15019	0 %	80 %	0 %	20 %	18450303
13	NC_003383	ATTTT	2	10	15342	15351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003383	TTAAA	2	10	15385	15394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003383	AAATT	2	10	19727	19736	60 %	40 %	0 %	0 %	18450304
16	NC_003383	AAAAT	2	10	20450	20459	80 %	20 %	0 %	0 %	18450305
17	NC_003383	TTTCT	2	10	22634	22643	0 %	80 %	0 %	20 %	18450307
18	NC_003383	AAGAT	2	10	28225	28234	60 %	20 %	20 %	0 %	18450312
19	NC_003383	TTTGC	2	10	28367	28376	0 %	60 %	20 %	20 %	18450312
20	NC_003383	GTTCT	2	10	28539	28548	0 %	60 %	20 %	20 %	18450313
21	NC_003383	TTTAA	2	10	30853	30862	40 %	60 %	0 %	0 %	18450317
22	NC_003383	ATCAA	2	10	32744	32753	60 %	20 %	0 %	20 %	18450319
23	NC_003383	ATTTT	2	10	33368	33377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003383	TTTTC	2	10	34173	34182	0 %	80 %	0 %	20 %	18450320
25	NC_003383	CCATT	2	10	35334	35343	20 %	40 %	0 %	40 %	18450321
26	NC_003383	AGCAA	2	10	37808	37817	60 %	0 %	20 %	20 %	18450323
27	NC_003383	AATTT	2	10	37840	37849	40 %	60 %	0 %	0 %	18450323
28	NC_003383	TTTCT	2	10	42195	42204	0 %	80 %	0 %	20 %	18450328
29	NC_003383	TTTAA	2	10	42322	42331	40 %	60 %	0 %	0 %	18450328
30	NC_003383	ACAAG	2	10	43587	43596	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_003383	AGACA	2	10	44842	44851	60 %	0 %	20 %	20 %	18450330
32	NC_003383	TAAAA	2	10	46669	46678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003383	TGCTA	2	10	47716	47725	20 %	40 %	20 %	20 %	18450332
34	NC_003383	CGAAA	2	10	48627	48636	60 %	0 %	20 %	20 %	18450332
35	NC_003383	AGGCA	2	10	49083	49092	40 %	0 %	40 %	20 %	18450332
36	NC_003383	AATAT	2	10	49881	49890	60 %	40 %	0 %	0 %	18450332
37	NC_003383	CGAAG	2	10	50526	50535	40 %	0 %	40 %	20 %	18450333
38	NC_003383	ATTAC	2	10	50815	50824	40 %	40 %	0 %	20 %	18450333
39	NC_003383	TCTAT	2	10	51251	51260	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_003383	TAGTT	2	10	53245	53254	20 %	60 %	20 %	0 %	18450335
41	NC_003383	GAAAA	2	10	53385	53394	80 %	0 %	20 %	0 %	18450335
42	NC_003383	ATTAA	2	10	55046	55055	60 %	40 %	0 %	0 %	18450335
43	NC_003383	AGAAA	2	10	55998	56007	80 %	0 %	20 %	0 %	18450337
44	NC_003383	TCTAT	2	10	58110	58119	20 %	60 %	0 %	20 %	18450339
45	NC_003383	AAATA	2	10	63602	63611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003383	AGTAA	2	10	63879	63888	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003383	ATCAA	2	10	65584	65593	60 %	20 %	0 %	20 %	18450346
48	NC_003383	TCTAT	2	10	67741	67750	20 %	60 %	0 %	20 %	18450349
49	NC_003383	GGTTT	2	10	69319	69328	0 %	60 %	40 %	0 %	18450350
50	NC_003383	AAAAT	2	10	70525	70534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003383	GTAAA	2	10	70542	70551	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003383	TTAAA	2	10	72515	72524	60 %	40 %	0 %	0 %	18450352
53	NC_003383	AGCCA	2	10	73613	73622	40 %	0 %	20 %	40 %	18450354
54	NC_003383	TATAA	2	10	74452	74461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003383	ATTTT	2	10	76502	76511	20 %	80 %	0 %	0 %	18450357
56	NC_003383	AAATC	2	10	80022	80031	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.