MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria innocua Clip11262 plasmid pLI100

Total Repeats: 2003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003383	AGA	2	6	39455	39460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450326
1002	NC_003383	CAT	2	6	39502	39507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450326
1003	NC_003383	ACA	2	6	39579	39584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450326
1004	NC_003383	ACT	2	6	39588	39593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450326
1005	NC_003383	GGT	2	6	39642	39647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18450326
1006	NC_003383	TCT	2	6	39691	39696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450326
1007	NC_003383	A	6	6	39750	39755	100 %	0 %	0 %	0 %	18450326
1008	NC_003383	GTT	2	6	39762	39767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450326
1009	NC_003383	AGC	2	6	39791	39796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450326
1010	NC_003383	AGT	2	6	39830	39835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450326
1011	NC_003383	TTG	2	6	39841	39846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450326
1012	NC_003383	TCT	2	6	39887	39892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450326
1013	NC_003383	GAA	2	6	39906	39911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450326
1014	NC_003383	AAC	2	6	39966	39971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450326
1015	NC_003383	CTG	2	6	39979	39984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450326
1016	NC_003383	TTA	2	6	40021	40026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450326
1017	NC_003383	AC	3	6	40048	40053	50 %	0 %	0 %	50 %	18450326
1018	NC_003383	TTG	2	6	40093	40098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450326
1019	NC_003383	TCG	2	6	40214	40219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450326
1020	NC_003383	TCA	2	6	40228	40233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450326
1021	NC_003383	GTG	2	6	40249	40254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18450326
1022	NC_003383	CTA	2	6	40321	40326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450326
1023	NC_003383	AGA	2	6	40385	40390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450326
1024	NC_003383	GAA	2	6	40419	40424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450326
1025	NC_003383	TTC	2	6	40501	40506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450326
1026	NC_003383	TCT	2	6	40576	40581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450326
1027	NC_003383	CTT	2	6	40610	40615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450326
1028	NC_003383	AAG	2	6	40630	40635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450326
1029	NC_003383	AT	3	6	40706	40711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_003383	TCT	2	6	40777	40782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_003383	GC	3	6	40882	40887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_003383	AACC	2	8	40929	40936	50 %	0 %	0 %	50 %	18450327
1033	NC_003383	CTG	2	6	40972	40977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450327
1034	NC_003383	CTT	2	6	40978	40983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450327
1035	NC_003383	TTC	2	6	41006	41011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450327
1036	NC_003383	AGA	2	6	41018	41023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450327
1037	NC_003383	AAT	2	6	41054	41059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450327
1038	NC_003383	ATGA	2	8	41104	41111	50 %	25 %	25 %	0 %	18450327
1039	NC_003383	CCA	2	6	41124	41129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450327
1040	NC_003383	CCAA	2	8	41192	41199	50 %	0 %	0 %	50 %	18450327
1041	NC_003383	ATT	2	6	41219	41224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450327
1042	NC_003383	AT	3	6	41409	41414	50 %	50 %	0 %	0 %	18450327
1043	NC_003383	CCG	2	6	41520	41525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18450327
1044	NC_003383	ATG	2	6	41565	41570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450327
1045	NC_003383	TGT	2	6	41582	41587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450327
1046	NC_003383	CTT	2	6	41608	41613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450327
1047	NC_003383	TTG	2	6	41635	41640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450327
1048	NC_003383	CCA	2	6	41688	41693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450327
1049	NC_003383	ATA	2	6	41743	41748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450327
1050	NC_003383	CTA	2	6	41764	41769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450327
1051	NC_003383	A	6	6	41805	41810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_003383	A	6	6	41884	41889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_003383	A	6	6	42013	42018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003383	CA	3	6	42049	42054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_003383	TGG	2	6	42098	42103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18450328
1056	NC_003383	GAT	2	6	42121	42126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450328
1057	NC_003383	T	6	6	42157	42162	0 %	100 %	0 %	0 %	18450328
1058	NC_003383	A	6	6	42166	42171	100 %	0 %	0 %	0 %	18450328
1059	NC_003383	AT	3	6	42173	42178	50 %	50 %	0 %	0 %	18450328
1060	NC_003383	GAT	2	6	42186	42191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450328
1061	NC_003383	TTTCT	2	10	42195	42204	0 %	80 %	0 %	20 %	18450328
1062	NC_003383	ACAA	2	8	42214	42221	75 %	0 %	0 %	25 %	18450328
1063	NC_003383	ATT	2	6	42241	42246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450328
1064	NC_003383	ATG	2	6	42266	42271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450328
1065	NC_003383	AG	3	6	42292	42297	50 %	0 %	50 %	0 %	18450328
1066	NC_003383	AAT	2	6	42312	42317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450328
1067	NC_003383	TTTAA	2	10	42322	42331	40 %	60 %	0 %	0 %	18450328
1068	NC_003383	CTTT	2	8	42358	42365	0 %	75 %	0 %	25 %	18450328
1069	NC_003383	GTT	2	6	42393	42398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450328
1070	NC_003383	A	6	6	42404	42409	100 %	0 %	0 %	0 %	18450328
1071	NC_003383	TTC	2	6	42436	42441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450328
1072	NC_003383	ATA	2	6	42449	42454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450328
1073	NC_003383	TA	3	6	42504	42509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_003383	AAT	2	6	42520	42525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_003383	AAT	2	6	42533	42538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_003383	AAT	2	6	42546	42551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_003383	ATT	2	6	42578	42583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_003383	T	6	6	42705	42710	0 %	100 %	0 %	0 %	18450329
1079	NC_003383	AAGC	2	8	42740	42747	50 %	0 %	25 %	25 %	18450329
1080	NC_003383	ATT	2	6	42753	42758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450329
1081	NC_003383	GGC	2	6	42809	42814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18450329
1082	NC_003383	ATGG	2	8	42845	42852	25 %	25 %	50 %	0 %	18450329
1083	NC_003383	AGC	2	6	42861	42866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450329
1084	NC_003383	CTAT	2	8	42957	42964	25 %	50 %	0 %	25 %	18450329
1085	NC_003383	CCA	2	6	42999	43004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450329
1086	NC_003383	GTC	2	6	43011	43016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450329
1087	NC_003383	TGAT	2	8	43017	43024	25 %	50 %	25 %	0 %	18450329
1088	NC_003383	AGA	2	6	43042	43047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450329
1089	NC_003383	AAG	2	6	43115	43120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450329
1090	NC_003383	GA	3	6	43155	43160	50 %	0 %	50 %	0 %	18450329
1091	NC_003383	A	7	7	43213	43219	100 %	0 %	0 %	0 %	18450329
1092	NC_003383	ACAG	2	8	43270	43277	50 %	0 %	25 %	25 %	18450329
1093	NC_003383	AGC	2	6	43414	43419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450329
1094	NC_003383	A	6	6	43465	43470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_003383	ATTT	2	8	43475	43482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_003383	GTAA	2	8	43534	43541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_003383	TAT	2	6	43569	43574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_003383	ACTT	2	8	43578	43585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_003383	ACAAG	2	10	43587	43596	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_003383	GAC	2	6	43606	43611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_003383	ATT	2	6	43709	43714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_003383	GCA	2	6	43719	43724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_003383	T	6	6	43784	43789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_003383	AGG	2	6	43812	43817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_003383	ATG	2	6	43868	43873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_003383	AAG	2	6	43875	43880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_003383	TAA	2	6	43902	43907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450330
1108	NC_003383	TTTG	2	8	43942	43949	0 %	75 %	25 %	0 %	18450330
1109	NC_003383	TGC	2	6	44008	44013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450330
1110	NC_003383	AGC	2	6	44146	44151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450330
1111	NC_003383	TAC	2	6	44154	44159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450330
1112	NC_003383	AGA	2	6	44185	44190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450330
1113	NC_003383	AAC	2	6	44198	44203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450330
1114	NC_003383	GAAA	2	8	44263	44270	75 %	0 %	25 %	0 %	18450330
1115	NC_003383	GTC	2	6	44321	44326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450330
1116	NC_003383	ATCG	2	8	44374	44381	25 %	25 %	25 %	25 %	18450330
1117	NC_003383	T	6	6	44472	44477	0 %	100 %	0 %	0 %	18450330
1118	NC_003383	TCT	2	6	44511	44516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450330
1119	NC_003383	GAA	2	6	44537	44542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450330
1120	NC_003383	AG	3	6	44587	44592	50 %	0 %	50 %	0 %	18450330
1121	NC_003383	GAA	2	6	44669	44674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450330
1122	NC_003383	A	6	6	44773	44778	100 %	0 %	0 %	0 %	18450330
1123	NC_003383	G	7	7	44795	44801	0 %	0 %	100 %	0 %	18450330
1124	NC_003383	AGACA	2	10	44842	44851	60 %	0 %	20 %	20 %	18450330
1125	NC_003383	GAT	2	6	44900	44905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450330
1126	NC_003383	AAG	2	6	44913	44918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450330
1127	NC_003383	CAG	2	6	44933	44938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450330
1128	NC_003383	GCA	2	6	45146	45151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450330
1129	NC_003383	AGA	2	6	45154	45159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450330
1130	NC_003383	AGAA	2	8	45231	45238	75 %	0 %	25 %	0 %	18450330
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1132	NC_003383	GAA	2	6	45272	45277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450330
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