MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria innocua Clip11262 plasmid pLI100

Total Repeats: 2003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003383	CAA	2	6	19890	19895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450304
502	NC_003383	AATT	2	8	19899	19906	50 %	50 %	0 %	0 %	18450304
503	NC_003383	T	7	7	19964	19970	0 %	100 %	0 %	0 %	18450304
504	NC_003383	T	6	6	19999	20004	0 %	100 %	0 %	0 %	18450304
505	NC_003383	T	6	6	20078	20083	0 %	100 %	0 %	0 %	18450304
506	NC_003383	ATTA	2	8	20158	20165	50 %	50 %	0 %	0 %	18450304
507	NC_003383	ATC	2	6	20167	20172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450304
508	NC_003383	GTTT	2	8	20177	20184	0 %	75 %	25 %	0 %	18450304
509	NC_003383	TTCC	2	8	20197	20204	0 %	50 %	0 %	50 %	18450305
510	NC_003383	CCA	2	6	20211	20216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450305
511	NC_003383	T	6	6	20217	20222	0 %	100 %	0 %	0 %	18450305
512	NC_003383	T	6	6	20224	20229	0 %	100 %	0 %	0 %	18450305
513	NC_003383	TTC	2	6	20238	20243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450305
514	NC_003383	TAT	2	6	20249	20254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450305
515	NC_003383	ATC	2	6	20289	20294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450305
516	NC_003383	TCT	2	6	20335	20340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450305
517	NC_003383	TTC	2	6	20346	20351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450305
518	NC_003383	T	6	6	20358	20363	0 %	100 %	0 %	0 %	18450305
519	NC_003383	GTT	3	9	20381	20389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450305
520	NC_003383	T	8	8	20412	20419	0 %	100 %	0 %	0 %	18450305
521	NC_003383	AAAAT	2	10	20450	20459	80 %	20 %	0 %	0 %	18450305
522	NC_003383	TCA	2	6	20482	20487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450305
523	NC_003383	ATT	2	6	20493	20498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450305
524	NC_003383	GTC	2	6	20505	20510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450305
525	NC_003383	TTG	2	6	20523	20528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450305
526	NC_003383	T	6	6	20532	20537	0 %	100 %	0 %	0 %	18450305
527	NC_003383	A	7	7	20553	20559	100 %	0 %	0 %	0 %	18450305
528	NC_003383	TAA	2	6	20567	20572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450305
529	NC_003383	CGTCAA	2	12	20582	20593	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	18450305
530	NC_003383	T	7	7	20610	20616	0 %	100 %	0 %	0 %	18450305
531	NC_003383	T	7	7	20649	20655	0 %	100 %	0 %	0 %	18450305
532	NC_003383	T	6	6	20657	20662	0 %	100 %	0 %	0 %	18450305
533	NC_003383	GCTT	2	8	20671	20678	0 %	50 %	25 %	25 %	18450305
534	NC_003383	TCA	2	6	20729	20734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450305
535	NC_003383	T	6	6	20777	20782	0 %	100 %	0 %	0 %	18450306
536	NC_003383	TTC	2	6	20813	20818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450306
537	NC_003383	GGT	2	6	20842	20847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18450306
538	NC_003383	AG	3	6	20890	20895	50 %	0 %	50 %	0 %	18450306
539	NC_003383	TCT	2	6	21045	21050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450306
540	NC_003383	T	6	6	21098	21103	0 %	100 %	0 %	0 %	18450306
541	NC_003383	AATC	2	8	21124	21131	50 %	25 %	0 %	25 %	18450306
542	NC_003383	AAG	2	6	21169	21174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450306
543	NC_003383	TTC	2	6	21188	21193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450306
544	NC_003383	T	7	7	21200	21206	0 %	100 %	0 %	0 %	18450306
545	NC_003383	ATTGAA	2	12	21279	21290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18450306
546	NC_003383	TTC	2	6	21314	21319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450306
547	NC_003383	TC	3	6	21318	21323	0 %	50 %	0 %	50 %	18450306
548	NC_003383	GAT	2	6	21386	21391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450306
549	NC_003383	TGT	2	6	21432	21437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450306
550	NC_003383	GATT	2	8	21454	21461	25 %	50 %	25 %	0 %	18450306
551	NC_003383	TCA	2	6	21501	21506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450306
552	NC_003383	TCAAAC	2	12	21549	21560	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	18450306
553	NC_003383	T	8	8	21569	21576	0 %	100 %	0 %	0 %	18450306
554	NC_003383	A	6	6	21588	21593	100 %	0 %	0 %	0 %	18450306
555	NC_003383	CTGC	2	8	21616	21623	0 %	25 %	25 %	50 %	18450306
556	NC_003383	A	6	6	21659	21664	100 %	0 %	0 %	0 %	18450306
557	NC_003383	TTC	2	6	21674	21679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450306
558	NC_003383	GA	3	6	21684	21689	50 %	0 %	50 %	0 %	18450306
559	NC_003383	TTC	2	6	21713	21718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450306
560	NC_003383	ACT	2	6	21816	21821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450306
561	NC_003383	T	6	6	21873	21878	0 %	100 %	0 %	0 %	18450306
562	NC_003383	TC	3	6	21935	21940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_003383	TTC	2	6	21953	21958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_003383	TAT	2	6	21966	21971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_003383	ATA	2	6	21975	21980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_003383	T	6	6	22019	22024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_003383	AT	3	6	22029	22034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_003383	T	8	8	22063	22070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_003383	AAG	2	6	22115	22120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_003383	ATT	2	6	22171	22176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450307
571	NC_003383	AG	3	6	22203	22208	50 %	0 %	50 %	0 %	18450307
572	NC_003383	ATT	2	6	22339	22344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450307
573	NC_003383	AAAG	2	8	22480	22487	75 %	0 %	25 %	0 %	18450307
574	NC_003383	GCC	2	6	22493	22498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18450307
575	NC_003383	AAT	2	6	22566	22571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450307
576	NC_003383	AT	3	6	22592	22597	50 %	50 %	0 %	0 %	18450307
577	NC_003383	TTTCT	2	10	22634	22643	0 %	80 %	0 %	20 %	18450307
578	NC_003383	AATA	2	8	22653	22660	75 %	25 %	0 %	0 %	18450307
579	NC_003383	TG	3	6	22696	22701	0 %	50 %	50 %	0 %	18450307
580	NC_003383	AGT	2	6	22767	22772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450307
581	NC_003383	ATG	2	6	22787	22792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450307
582	NC_003383	TTC	2	6	22851	22856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_003383	AAT	2	6	22869	22874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_003383	TAAA	2	8	22879	22886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_003383	TGAA	2	8	22935	22942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_003383	GT	3	6	22995	23000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_003383	GTT	2	6	23032	23037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450308
588	NC_003383	T	7	7	23065	23071	0 %	100 %	0 %	0 %	18450308
589	NC_003383	TCC	2	6	23084	23089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18450308
590	NC_003383	TTG	2	6	23125	23130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450308
591	NC_003383	ATC	3	9	23146	23154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450308
592	NC_003383	T	6	6	23269	23274	0 %	100 %	0 %	0 %	18450308
593	NC_003383	TCA	2	6	23282	23287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450308
594	NC_003383	TC	3	6	23327	23332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_003383	T	6	6	23385	23390	0 %	100 %	0 %	0 %	18450309
596	NC_003383	TA	3	6	23393	23398	50 %	50 %	0 %	0 %	18450309
597	NC_003383	AAT	2	6	23428	23433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450309
598	NC_003383	CAA	3	9	23473	23481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450309
599	NC_003383	GTT	2	6	23505	23510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450309
600	NC_003383	AGA	2	6	23511	23516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450309
601	NC_003383	AAC	2	6	23550	23555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450309
602	NC_003383	TCAA	2	8	23556	23563	50 %	25 %	0 %	25 %	18450309
603	NC_003383	AACC	2	8	23590	23597	50 %	0 %	0 %	50 %	18450309
604	NC_003383	AGAT	2	8	23609	23616	50 %	25 %	25 %	0 %	18450309
605	NC_003383	A	6	6	23620	23625	100 %	0 %	0 %	0 %	18450309
606	NC_003383	TGG	2	6	23632	23637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18450309
607	NC_003383	GTAA	2	8	23645	23652	50 %	25 %	25 %	0 %	18450309
608	NC_003383	ATT	2	6	23661	23666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_003383	TAA	2	6	23699	23704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450310
610	NC_003383	TGA	2	6	23708	23713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450310
611	NC_003383	GAT	2	6	23724	23729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450310
612	NC_003383	A	7	7	23732	23738	100 %	0 %	0 %	0 %	18450310
613	NC_003383	TGC	2	6	23768	23773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450310
614	NC_003383	CAT	2	6	23776	23781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450310
615	NC_003383	A	7	7	23807	23813	100 %	0 %	0 %	0 %	18450310
616	NC_003383	TTTA	2	8	23843	23850	25 %	75 %	0 %	0 %	18450310
617	NC_003383	GAAA	2	8	23867	23874	75 %	0 %	25 %	0 %	18450310
618	NC_003383	GAAA	2	8	23882	23889	75 %	0 %	25 %	0 %	18450310
619	NC_003383	A	6	6	23887	23892	100 %	0 %	0 %	0 %	18450310
620	NC_003383	AAG	2	6	23992	23997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450310
621	NC_003383	AAC	2	6	24137	24142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450310
622	NC_003383	T	6	6	24157	24162	0 %	100 %	0 %	0 %	18450310
623	NC_003383	ATA	2	6	24163	24168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450310
624	NC_003383	TGAAAA	2	12	24179	24190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18450310
625	NC_003383	ACA	2	6	24194	24199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450310
626	NC_003383	ATA	2	6	24271	24276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450310
627	NC_003383	CTA	2	6	24314	24319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450310
628	NC_003383	TA	3	6	24328	24333	50 %	50 %	0 %	0 %	18450310
629	NC_003383	TTTG	2	8	24335	24342	0 %	75 %	25 %	0 %	18450310
630	NC_003383	TGA	2	6	24380	24385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450310
631	NC_003383	ATT	2	6	24419	24424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450310
632	NC_003383	TAA	2	6	24560	24565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450310
633	NC_003383	AAT	2	6	24609	24614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450310
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635	NC_003383	ATG	2	6	24664	24669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450310
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