MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 chromosome

Total Repeats: 1172

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002973	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_002973	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906229
3	NC_002973	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	46906230
4	NC_002973	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46906230
5	NC_002973	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906230
6	NC_002973	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46906231
7	NC_002973	AAAAGC	2	12	11269	11280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	46906232
8	NC_002973	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	46906236
9	NC_002973	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906236
10	NC_002973	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002973	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_002973	ATTTTC	2	12	21960	21971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	46906241
13	NC_002973	CTTCAT	2	12	22976	22987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	46906243
14	NC_002973	TTTTGG	2	12	23340	23351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906243
15	NC_002973	ATTGAA	2	12	26989	27000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	46906246
16	NC_002973	CCAAAA	2	12	37140	37151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906258
17	NC_002973	AATTAT	2	12	37754	37765	50 %	50 %	0 %	0 %	46906259
18	NC_002973	TCACCA	2	12	38902	38913	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	46906261
19	NC_002973	CGATTA	2	12	44332	44343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906265
20	NC_002973	TTATGT	2	12	48821	48832	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46906268
21	NC_002973	AAAGAT	2	12	52473	52484	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906271
22	NC_002973	TGAAAT	2	12	53310	53321	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	46906272
23	NC_002973	TGGCGG	2	12	56443	56454	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46906276
24	NC_002973	TCAAAA	2	12	56563	56574	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	46906276
25	NC_002973	AAAAAT	2	12	59010	59021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	46906281
26	NC_002973	GCAGAA	2	12	62935	62946	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	46906283
27	NC_002973	AGGTAA	2	12	63026	63037	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46906284
28	NC_002973	TGATTG	2	12	64414	64425	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	46906285
29	NC_002973	TGATTT	2	12	69745	69756	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46906290
30	NC_002973	TTTTGC	2	12	70350	70361	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	46906291
31	NC_002973	AAATAA	2	12	84072	84083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	46906305
32	NC_002973	TAAATT	2	12	87224	87235	50 %	50 %	0 %	0 %	46906309
33	NC_002973	ATTTAT	2	12	87398	87409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002973	CTTTTT	2	12	96571	96582	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	46906322
35	NC_002973	ATCACT	2	12	99631	99642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906325
36	NC_002973	GATATT	2	12	99690	99701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	46906325
37	NC_002973	CAGATT	2	12	103207	103218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906325
38	NC_002973	AACTAT	2	12	105983	105994	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	46906326
39	NC_002973	AACCAG	2	12	111221	111232	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	46906331
40	NC_002973	TATTAG	2	12	115514	115525	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	46906336
41	NC_002973	TAGCAG	2	12	115577	115588	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46906336
42	NC_002973	TTATTT	2	12	119039	119050	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	46906340
43	NC_002973	ATTACA	2	12	123233	123244	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	46906345
44	NC_002973	TAAAAT	2	12	126957	126968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906348
45	NC_002973	CAAAAT	2	12	127098	127109	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	46906348
46	NC_002973	CAAGCG	2	12	128099	128110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906348
47	NC_002973	GTTTTA	2	12	133865	133876	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46906356
48	NC_002973	TGATTT	2	12	135881	135892	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46906360
49	NC_002973	AAGTAA	2	12	139852	139863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906363
50	NC_002973	CCGTTA	2	12	143359	143370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906370
51	NC_002973	CAGGTT	2	12	150684	150695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_002973	CAACTG	2	12	153105	153116	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	46906379
53	NC_002973	TCTGAA	2	12	156086	156097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906383
54	NC_002973	GTTGCA	2	12	161833	161844	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	46906391
55	NC_002973	GATTGC	2	12	161895	161906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	46906391
56	NC_002973	AGGCGG	2	12	167543	167554	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46906395
57	NC_002973	CGTAAC	2	12	170364	170375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	46906396
58	NC_002973	AGTACC	2	12	170409	170420	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	46906396
59	NC_002973	GTTTTC	2	12	171386	171397	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	46906397
60	NC_002973	GTTGAT	2	12	173002	173013	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	46906399
61	NC_002973	GTAAAA	2	12	173365	173376	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906399
62	NC_002973	TTTTAC	2	12	175409	175420	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	46906403
63	NC_002973	TTTTTA	2	12	176446	176457	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	46906405
64	NC_002973	GCATTA	2	12	176676	176687	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906405
65	NC_002973	AAAGTA	2	12	177658	177669	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906406
66	NC_002973	ACACTT	2	12	178575	178586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_002973	TTGCAC	2	12	180552	180563	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906408
68	NC_002973	AGAAGT	2	12	182700	182711	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46906409
69	NC_002973	CAATCC	2	12	184616	184627	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	46906411
70	NC_002973	AAAGAT	2	12	186627	186638	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906413
71	NC_002973	TGAAGT	2	12	190872	190883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906414
72	NC_002973	CATTGA	2	12	199005	199016	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906421
73	NC_002973	TGCAGC	2	12	199660	199671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46906422
74	NC_002973	TAAAAA	2	12	201898	201909	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	46906424
75	NC_002973	AATAAA	2	12	204904	204915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002973	AAAGCA	2	12	215110	215121	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	46906436
77	NC_002973	TTCTTT	2	12	219809	219820	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	46906442
78	NC_002973	GAAAAA	2	12	221898	221909	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	46906444
79	NC_002973	GAAAAA	2	12	223122	223133	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	46906446
80	NC_002973	GCAAGT	2	12	228949	228960	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46906449
81	NC_002973	GAAAAC	2	12	231819	231830	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_002973	TGTCGG	2	12	232869	232880	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	46906452
83	NC_002973	AAAAAC	2	12	234354	234365	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	46906453
84	NC_002973	GCAGAA	2	12	235898	235909	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	46906454
85	NC_002973	TAAAAT	2	12	239211	239222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906459
86	NC_002973	CCAGAA	2	12	240424	240435	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	85700164
87	NC_002973	ATTCAA	2	12	242713	242724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_002973	AAGGAA	2	12	244284	244295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002973	TAGGCG	2	12	245937	245948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_002973	ATTCAA	2	12	248732	248743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_002973	AAGGAA	2	12	250303	250314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002973	TAGGCG	2	12	251956	251967	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_002973	AGTCAA	2	12	253770	253781	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_002973	TTTACC	2	12	254199	254210	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	46906462
95	NC_002973	AGTAAA	2	12	261456	261467	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906468
96	NC_002973	GTACGT	2	12	262262	262273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	46906470
97	NC_002973	AAGTCG	2	12	267530	267541	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46906475
98	NC_002973	TTATAT	2	12	268554	268565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002973	ACAGTA	2	12	268883	268894	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46906478
100	NC_002973	AAAACA	2	12	269258	269269	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	46906479
101	NC_002973	GCATGG	2	12	269439	269450	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46906479
102	NC_002973	CTGTAG	2	12	272383	272394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	46906484
103	NC_002973	GACAAT	2	12	273895	273906	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46906486
104	NC_002973	GTGAGC	2	12	274350	274361	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46906486
105	NC_002973	ATTGAT	2	12	274544	274555	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	46906486
106	NC_002973	TAAAAA	2	12	275614	275625	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	46906487
107	NC_002973	TGAATC	2	12	276399	276410	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906488
108	NC_002973	GCTACT	2	12	278091	278102	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906489
109	NC_002973	TTCTGA	2	12	281165	281176	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	46906491
110	NC_002973	AAGAAA	2	12	284381	284392	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	46906495
111	NC_002973	TTCGTG	2	12	290137	290148	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	46906496
112	NC_002973	TAACAA	2	12	293442	293453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	46906499
113	NC_002973	TTTAAC	2	12	294515	294526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	46906500
114	NC_002973	GTTGAG	2	12	296369	296380	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	46906501
115	NC_002973	ATTTTT	2	12	296642	296653	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	46906501
116	NC_002973	TTTATA	2	12	297186	297197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002973	CCAAAT	2	12	299175	299186	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	46906502
118	NC_002973	AGAACT	2	12	301789	301800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46906504
119	NC_002973	AACTTT	2	12	304269	304280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_002973	TACAAG	2	12	306033	306044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46906508
121	NC_002973	CGAAAT	2	12	306087	306098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46906508
122	NC_002973	TAAAAA	2	12	309638	309649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002973	CATTAT	2	12	309817	309828	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	46906511
124	NC_002973	TCTTTT	2	12	310278	310289	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	46906511
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126	NC_002973	ATGAAA	2	12	313043	313054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906514
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128	NC_002973	GCTTTT	2	12	314386	314397	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	46906516
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225	NC_002973	GACGGC	2	12	577892	577903	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46906779
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231	NC_002973	TACAGT	2	12	594010	594021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906794
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234	NC_002973	TTTGGC	2	12	602007	602018	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	46906801
235	NC_002973	TTTGGT	2	12	602712	602723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906802
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238	NC_002973	AAATAA	2	12	617750	617761	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_002973	AGAATG	2	12	623588	623599	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46906825
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241	NC_002973	GCACTT	2	12	625899	625910	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906827
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459	NC_002973	GCAAAC	2	12	1187387	1187398	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	46907400
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