MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome

Total Repeats: 2953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002942	ATTTT	2	10	246	255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002942	ATTTA	2	10	364	373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002942	TCGTT	2	10	785	794	0 %	60 %	20 %	20 %	52840257
4	NC_002942	GTATT	2	10	1200	1209	20 %	60 %	20 %	0 %	52840257
5	NC_002942	TAAAG	2	10	1769	1778	60 %	20 %	20 %	0 %	52840257
6	NC_002942	AAAAC	2	10	2325	2334	80 %	0 %	0 %	20 %	52840258
7	NC_002942	TAAAG	2	10	6092	6101	60 %	20 %	20 %	0 %	52840260
8	NC_002942	ACTTA	2	10	6985	6994	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_002942	GCCAT	2	10	8233	8242	20 %	20 %	20 %	40 %	52840261
10	NC_002942	TTTGA	2	10	9643	9652	20 %	60 %	20 %	0 %	52840262
11	NC_002942	CTTTC	2	10	11314	11323	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_002942	CGACC	2	10	17569	17578	20 %	0 %	20 %	60 %	52840269
13	NC_002942	TTGGC	2	10	19767	19776	0 %	40 %	40 %	20 %	52840271
14	NC_002942	TGGTA	2	10	24768	24777	20 %	40 %	40 %	0 %	52840275
15	NC_002942	CCTAT	2	10	27054	27063	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_002942	TTATT	2	10	27773	27782	20 %	80 %	0 %	0 %	52840278
17	NC_002942	TCCAG	2	10	28627	28636	20 %	20 %	20 %	40 %	52840278
18	NC_002942	TTTTG	2	10	29800	29809	0 %	80 %	20 %	0 %	52840279
19	NC_002942	TTTTC	2	10	30330	30339	0 %	80 %	0 %	20 %	52840279
20	NC_002942	ATAAA	2	10	30375	30384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002942	ATACA	2	10	31066	31075	60 %	20 %	0 %	20 %	52840281
22	NC_002942	ACCTT	2	10	31853	31862	20 %	40 %	0 %	40 %	52840282
23	NC_002942	GTGAA	2	10	32366	32375	40 %	20 %	40 %	0 %	52840282
24	NC_002942	GTTCT	2	10	32713	32722	0 %	60 %	20 %	20 %	52840282
25	NC_002942	CATGA	2	10	33495	33504	40 %	20 %	20 %	20 %	52840283
26	NC_002942	AAAAT	2	10	33920	33929	80 %	20 %	0 %	0 %	52840283
27	NC_002942	GAACC	2	10	34462	34471	40 %	0 %	20 %	40 %	52840284
28	NC_002942	AAACC	2	10	35776	35785	60 %	0 %	0 %	40 %	52840285
29	NC_002942	GGATG	2	10	38178	38187	20 %	20 %	60 %	0 %	52840286
30	NC_002942	AGGCC	2	10	39068	39077	20 %	0 %	40 %	40 %	52840288
31	NC_002942	AATAA	2	10	40198	40207	80 %	20 %	0 %	0 %	52840288
32	NC_002942	CATTG	2	10	40565	40574	20 %	40 %	20 %	20 %	52840289
33	NC_002942	ATGAA	2	10	41582	41591	60 %	20 %	20 %	0 %	52840290
34	NC_002942	TAAAA	2	10	42649	42658	80 %	20 %	0 %	0 %	52840291
35	NC_002942	GTTAA	2	10	44716	44725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002942	GGTTT	2	10	46776	46785	0 %	60 %	40 %	0 %	52840295
37	NC_002942	AGGTA	2	10	47598	47607	40 %	20 %	40 %	0 %	52840296
38	NC_002942	CAAAA	2	10	47665	47674	80 %	0 %	0 %	20 %	52840296
39	NC_002942	TGATT	2	10	51253	51262	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002942	TTTAT	2	10	53316	53325	20 %	80 %	0 %	0 %	52840300
41	NC_002942	ACCAT	2	10	55719	55728	40 %	20 %	0 %	40 %	52840303
42	NC_002942	GGCTC	2	10	56736	56745	0 %	20 %	40 %	40 %	52840305
43	NC_002942	TTATT	2	10	57013	57022	20 %	80 %	0 %	0 %	52840305
44	NC_002942	CTTTT	2	10	59910	59919	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_002942	ACATT	2	10	60354	60363	40 %	40 %	0 %	20 %	52840308
46	NC_002942	TATGC	2	10	63432	63441	20 %	40 %	20 %	20 %	52840311
47	NC_002942	GCATG	2	10	63458	63467	20 %	20 %	40 %	20 %	52840311
48	NC_002942	TAAAG	2	10	64877	64886	60 %	20 %	20 %	0 %	52840313
49	NC_002942	ATCTT	2	10	71404	71413	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_002942	CTATG	2	10	74298	74307	20 %	40 %	20 %	20 %	52840321
51	NC_002942	ACACA	2	10	74574	74583	60 %	0 %	0 %	40 %	52840322
52	NC_002942	ATTAA	2	10	74594	74603	60 %	40 %	0 %	0 %	52840322
53	NC_002942	CTGGG	2	10	76487	76496	0 %	20 %	60 %	20 %	52840324
54	NC_002942	TTAAA	2	10	76608	76617	60 %	40 %	0 %	0 %	52840324
55	NC_002942	TGGAT	2	10	78005	78014	20 %	40 %	40 %	0 %	52840325
56	NC_002942	AGGAT	2	10	78431	78440	40 %	20 %	40 %	0 %	52840325
57	NC_002942	ATATA	2	10	78853	78862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002942	GCATT	2	10	83219	83228	20 %	40 %	20 %	20 %	52840329
59	NC_002942	TAATT	2	10	83764	83773	40 %	60 %	0 %	0 %	52840329
60	NC_002942	ATTTT	2	10	84598	84607	20 %	80 %	0 %	0 %	52840330
61	NC_002942	TTTTA	2	10	84840	84849	20 %	80 %	0 %	0 %	52840330
62	NC_002942	TGATA	2	10	85707	85716	40 %	40 %	20 %	0 %	52840332
63	NC_002942	GACAG	2	10	85838	85847	40 %	0 %	40 %	20 %	52840332
64	NC_002942	ATGCG	2	10	88901	88910	20 %	20 %	40 %	20 %	52840334
65	NC_002942	ACTTC	2	10	89914	89923	20 %	40 %	0 %	40 %	52840335
66	NC_002942	AGTAA	2	10	92819	92828	60 %	20 %	20 %	0 %	52840338
67	NC_002942	TTGAT	2	10	93111	93120	20 %	60 %	20 %	0 %	52840338
68	NC_002942	CGATG	2	10	95820	95829	20 %	20 %	40 %	20 %	52840341
69	NC_002942	GTTTT	2	10	96724	96733	0 %	80 %	20 %	0 %	52840341
70	NC_002942	GCTTG	2	10	97879	97888	0 %	40 %	40 %	20 %	52840342
71	NC_002942	CATGC	2	10	100415	100424	20 %	20 %	20 %	40 %	52840345
72	NC_002942	TGCTT	2	10	101104	101113	0 %	60 %	20 %	20 %	52840345
73	NC_002942	TTGGA	2	10	101640	101649	20 %	40 %	40 %	0 %	52840345
74	NC_002942	ATTTT	2	10	103300	103309	20 %	80 %	0 %	0 %	52840345
75	NC_002942	TGGAT	2	10	105143	105152	20 %	40 %	40 %	0 %	52840347
76	NC_002942	GTTGA	2	10	105336	105345	20 %	40 %	40 %	0 %	52840347
77	NC_002942	CAAGG	2	10	105930	105939	40 %	0 %	40 %	20 %	52840347
78	NC_002942	AAAAT	2	10	106080	106089	80 %	20 %	0 %	0 %	52840347
79	NC_002942	TTTGG	2	10	106419	106428	0 %	60 %	40 %	0 %	52840347
80	NC_002942	ATAGA	2	10	107012	107021	60 %	20 %	20 %	0 %	52840348
81	NC_002942	GAAAA	2	10	109397	109406	80 %	0 %	20 %	0 %	52840350
82	NC_002942	GCTTT	2	10	110769	110778	0 %	60 %	20 %	20 %	52840351
83	NC_002942	AAGCA	2	10	110963	110972	60 %	0 %	20 %	20 %	52840351
84	NC_002942	TTAAT	2	10	114127	114136	40 %	60 %	0 %	0 %	52840354
85	NC_002942	GAAGA	2	10	115971	115980	60 %	0 %	40 %	0 %	52840355
86	NC_002942	TGTTT	2	10	116282	116291	0 %	80 %	20 %	0 %	52840356
87	NC_002942	ATTAG	2	10	119278	119287	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002942	TTGTA	2	10	119979	119988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002942	TCAAC	2	10	123442	123451	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_002942	GATTT	2	10	123663	123672	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002942	GATAA	2	10	123832	123841	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002942	TTATT	2	10	126478	126487	20 %	80 %	0 %	0 %	52840366
93	NC_002942	TCTTT	2	10	127229	127238	0 %	80 %	0 %	20 %	52840367
94	NC_002942	CCAAT	2	10	129830	129839	40 %	20 %	0 %	40 %	52840367
95	NC_002942	TATTC	2	10	130807	130816	20 %	60 %	0 %	20 %	52840368
96	NC_002942	TAAGA	2	10	130820	130829	60 %	20 %	20 %	0 %	52840368
97	NC_002942	TATTT	2	10	131367	131376	20 %	80 %	0 %	0 %	52840368
98	NC_002942	CTATT	2	10	131720	131729	20 %	60 %	0 %	20 %	52840368
99	NC_002942	TTTTC	2	10	132515	132524	0 %	80 %	0 %	20 %	52840369
100	NC_002942	CTTTT	2	10	133085	133094	0 %	80 %	0 %	20 %	52840369
101	NC_002942	GAAGC	2	10	133418	133427	40 %	0 %	40 %	20 %	52840369
102	NC_002942	TTGTT	2	10	134643	134652	0 %	80 %	20 %	0 %	52840371
103	NC_002942	CAGGG	2	10	135471	135480	20 %	0 %	60 %	20 %	52840372
104	NC_002942	ATATA	2	10	136952	136961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002942	TAGAA	2	10	137158	137167	60 %	20 %	20 %	0 %	52840374
106	NC_002942	TTTTA	2	10	137374	137383	20 %	80 %	0 %	0 %	52840374
107	NC_002942	TTGTT	2	10	137939	137948	0 %	80 %	20 %	0 %	52840375
108	NC_002942	GTTTA	2	10	138298	138307	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002942	GATTA	2	10	138401	138410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002942	TGATT	2	10	138939	138948	20 %	60 %	20 %	0 %	52840376
111	NC_002942	GGTGA	2	10	139402	139411	20 %	20 %	60 %	0 %	52840376
112	NC_002942	CTATG	2	10	139613	139622	20 %	40 %	20 %	20 %	52840376
113	NC_002942	AATTT	2	10	139748	139757	40 %	60 %	0 %	0 %	52840376
114	NC_002942	TATTT	2	10	139809	139818	20 %	80 %	0 %	0 %	52840376
115	NC_002942	CCTTG	2	10	140914	140923	0 %	40 %	20 %	40 %	52840377
116	NC_002942	TAAGT	2	10	143315	143324	40 %	40 %	20 %	0 %	52840380
117	NC_002942	AAATT	2	10	146481	146490	60 %	40 %	0 %	0 %	52840381
118	NC_002942	TTGAT	2	10	146902	146911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002942	AGCAG	2	10	152163	152172	40 %	0 %	40 %	20 %	52840385
120	NC_002942	TTTAT	2	10	152871	152880	20 %	80 %	0 %	0 %	52840385
121	NC_002942	TGAAG	2	10	153735	153744	40 %	20 %	40 %	0 %	52840385
122	NC_002942	ATTGC	2	10	153789	153798	20 %	40 %	20 %	20 %	52840385
123	NC_002942	CAACG	2	10	155341	155350	40 %	0 %	20 %	40 %	52840387
124	NC_002942	CAAAT	2	10	155727	155736	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_002942	GCAAT	2	10	156339	156348	40 %	20 %	20 %	20 %	52840388
126	NC_002942	AAGCC	2	10	156803	156812	40 %	0 %	20 %	40 %	52840389
127	NC_002942	AGATA	2	10	156857	156866	60 %	20 %	20 %	0 %	52840389
128	NC_002942	ACCAA	2	10	156906	156915	60 %	0 %	0 %	40 %	52840389
129	NC_002942	GGTTT	2	10	160153	160162	0 %	60 %	40 %	0 %	52840390
130	NC_002942	ATGCC	2	10	160873	160882	20 %	20 %	20 %	40 %	52840390
131	NC_002942	ATCCG	2	10	162097	162106	20 %	20 %	20 %	40 %	52840390
132	NC_002942	TGATT	2	10	163467	163476	20 %	60 %	20 %	0 %	52840391
133	NC_002942	CAATT	2	10	164397	164406	40 %	40 %	0 %	20 %	52840391
134	NC_002942	GCAGG	2	10	165146	165155	20 %	0 %	60 %	20 %	52840392
135	NC_002942	TCGCA	2	10	166265	166274	20 %	20 %	20 %	40 %	52840393
136	NC_002942	ATGCC	2	10	166746	166755	20 %	20 %	20 %	40 %	52840393
137	NC_002942	TAATT	2	10	170885	170894	40 %	60 %	0 %	0 %	52840396
138	NC_002942	GTTTT	2	10	171349	171358	0 %	80 %	20 %	0 %	52840396
139	NC_002942	TGGTT	2	10	175263	175272	0 %	60 %	40 %	0 %	52840398
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142	NC_002942	TGACC	2	10	179720	179729	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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263	NC_002942	CAATG	2	10	332928	332937	40 %	20 %	20 %	20 %	52840534
264	NC_002942	ACAAA	2	10	333084	333093	80 %	0 %	0 %	20 %	52840534
265	NC_002942	CCGTG	2	10	334086	334095	0 %	20 %	40 %	40 %	52840535
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268	NC_002942	AGAGC	2	10	335692	335701	40 %	0 %	40 %	20 %	52840536
269	NC_002942	AAATT	2	10	336008	336017	60 %	40 %	0 %	0 %	52840537
270	NC_002942	AGGGA	2	10	336155	336164	40 %	0 %	60 %	0 %	52840537
271	NC_002942	CAATA	2	10	337480	337489	60 %	20 %	0 %	20 %	52840538
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