MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome

Total Repeats: 72597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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72502	NC_002942	GCA	2	6	3393613	3393618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52843193
72503	NC_002942	AAT	2	6	3393675	3393680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72504	NC_002942	T	6	6	3393712	3393717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72505	NC_002942	CAC	2	6	3393850	3393855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72506	NC_002942	TAA	3	9	3393864	3393872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72507	NC_002942	AGA	2	6	3393889	3393894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72508	NC_002942	ATG	2	6	3393911	3393916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72509	NC_002942	CAT	2	6	3393926	3393931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72510	NC_002942	A	6	6	3393957	3393962	100 %	0 %	0 %	0 %	52843194
72511	NC_002942	TAA	2	6	3393970	3393975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52843194
72512	NC_002942	TGA	2	6	3394016	3394021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52843194
72513	NC_002942	TCT	2	6	3394034	3394039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52843194
72514	NC_002942	CAA	2	6	3394042	3394047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52843194
72515	NC_002942	GTC	2	6	3394125	3394130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52843194
72516	NC_002942	GTTG	2	8	3394154	3394161	0 %	50 %	50 %	0 %	52843194
72517	NC_002942	T	6	6	3394187	3394192	0 %	100 %	0 %	0 %	52843194
72518	NC_002942	TCA	2	6	3394241	3394246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52843194
72519	NC_002942	TAG	2	6	3394263	3394268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52843194
72520	NC_002942	TTG	2	6	3394345	3394350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52843194
72521	NC_002942	CTA	2	6	3394368	3394373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52843194
72522	NC_002942	AAG	2	6	3394375	3394380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52843194
72523	NC_002942	CA	3	6	3394381	3394386	50 %	0 %	0 %	50 %	52843194
72524	NC_002942	CCA	2	6	3394434	3394439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52843194
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72534	NC_002942	GTA	2	6	3394698	3394703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52843194
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72538	NC_002942	GTAA	2	8	3394779	3394786	50 %	25 %	25 %	0 %	52843194
72539	NC_002942	TTC	2	6	3394792	3394797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52843194
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72544	NC_002942	ATT	2	6	3395107	3395112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52843194
72545	NC_002942	TA	3	6	3395118	3395123	50 %	50 %	0 %	0 %	52843194
72546	NC_002942	CAA	2	6	3395253	3395258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52843194
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72554	NC_002942	CTG	2	6	3395538	3395543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52843195
72555	NC_002942	GCC	2	6	3395656	3395661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52843195
72556	NC_002942	ATC	2	6	3395722	3395727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52843195
72557	NC_002942	CAA	2	6	3395868	3395873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52843195
72558	NC_002942	ATA	2	6	3395901	3395906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52843195
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72564	NC_002942	CATCCA	2	12	3396177	3396188	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	52843195
72565	NC_002942	AACT	2	8	3396213	3396220	50 %	25 %	0 %	25 %	52843195
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72569	NC_002942	AAAATC	2	12	3396514	3396525	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	52843195
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72571	NC_002942	AG	3	6	3396603	3396608	50 %	0 %	50 %	0 %	52843195
72572	NC_002942	T	6	6	3396677	3396682	0 %	100 %	0 %	0 %	52843195
72573	NC_002942	GCT	2	6	3396736	3396741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52843195
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72578	NC_002942	AT	3	6	3396917	3396922	50 %	50 %	0 %	0 %	52843195
72579	NC_002942	CGT	2	6	3396932	3396937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52843195
72580	NC_002942	ATGG	2	8	3397002	3397009	25 %	25 %	50 %	0 %	52843196
72581	NC_002942	AAC	2	6	3397089	3397094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52843196
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72583	NC_002942	ACA	2	6	3397108	3397113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52843196
72584	NC_002942	TAA	2	6	3397131	3397136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52843196
72585	NC_002942	ATTTA	2	10	3397206	3397215	40 %	60 %	0 %	0 %	52843197
72586	NC_002942	CAG	2	6	3397277	3397282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52843197
72587	NC_002942	T	8	8	3397355	3397362	0 %	100 %	0 %	0 %	52843197
72588	NC_002942	T	7	7	3397436	3397442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72589	NC_002942	AAATCA	2	12	3397459	3397470	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72590	NC_002942	T	9	9	3397471	3397479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72591	NC_002942	T	6	6	3397494	3397499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72592	NC_002942	ACG	2	6	3397542	3397547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52843198
72593	NC_002942	GATA	2	8	3397682	3397689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72594	NC_002942	T	7	7	3397692	3397698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72595	NC_002942	ATT	2	6	3397721	3397726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72596	NC_002942	T	6	6	3397725	3397730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72597	NC_002942	T	6	6	3397737	3397742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.