MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 1992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002662	AACTG	2	10	615	624	40 %	20 %	20 %	20 %	15671983
2	NC_002662	ATAAA	2	10	7401	7410	80 %	20 %	0 %	0 %	15671986
3	NC_002662	AAGAT	2	10	10187	10196	60 %	20 %	20 %	0 %	30023968
4	NC_002662	AGTAA	2	10	10330	10339	60 %	20 %	20 %	0 %	15671987
5	NC_002662	TAATA	2	10	10514	10523	60 %	40 %	0 %	0 %	15671987
6	NC_002662	AAATG	2	10	12242	12251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002662	CTTTA	2	10	12636	12645	20 %	60 %	0 %	20 %	15671989
8	NC_002662	AATTT	2	10	13446	13455	40 %	60 %	0 %	0 %	15671991
9	NC_002662	ATAGG	2	10	13972	13981	40 %	20 %	40 %	0 %	15671991
10	NC_002662	ACTCT	2	10	14256	14265	20 %	40 %	0 %	40 %	15671991
11	NC_002662	TAAAT	2	10	15327	15336	60 %	40 %	0 %	0 %	15671992
12	NC_002662	ATTTT	2	10	17844	17853	20 %	80 %	0 %	0 %	15671995
13	NC_002662	AAATG	2	10	18082	18091	60 %	20 %	20 %	0 %	15671995
14	NC_002662	TACTT	2	10	19744	19753	20 %	60 %	0 %	20 %	15671995
15	NC_002662	TTTAG	2	10	21817	21826	20 %	60 %	20 %	0 %	15671998
16	NC_002662	CTATT	2	10	22435	22444	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_002662	ATGGA	2	10	22518	22527	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002662	GGGTT	2	10	23113	23122	0 %	40 %	60 %	0 %	15672000
19	NC_002662	ATTTT	2	10	24750	24759	20 %	80 %	0 %	0 %	15672001
20	NC_002662	TTTGG	2	10	25604	25613	0 %	60 %	40 %	0 %	15672002
21	NC_002662	TGGTA	2	10	27545	27554	20 %	40 %	40 %	0 %	15672003
22	NC_002662	CTTAA	2	10	28604	28613	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_002662	AAGTC	2	10	28745	28754	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_002662	TTTTA	2	10	30092	30101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002662	AAATA	2	10	30858	30867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002662	TAATC	2	10	35398	35407	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_002662	TCATT	2	10	37065	37074	20 %	60 %	0 %	20 %	15672010
28	NC_002662	CGTTT	2	10	37324	37333	0 %	60 %	20 %	20 %	15672010
29	NC_002662	ATTTT	2	10	37427	37436	20 %	80 %	0 %	0 %	15672010
30	NC_002662	CTTTC	2	10	38267	38276	0 %	60 %	0 %	40 %	15672011
31	NC_002662	CAATC	2	10	40124	40133	40 %	20 %	0 %	40 %	15672013
32	NC_002662	TGCCT	2	10	41122	41131	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_002662	CATGC	2	10	41668	41677	20 %	20 %	20 %	40 %	15672017
34	NC_002662	TTAAA	2	10	42164	42173	60 %	40 %	0 %	0 %	15672018
35	NC_002662	TACCC	2	10	42188	42197	20 %	20 %	0 %	60 %	15672018
36	NC_002662	TAACT	2	10	43589	43598	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_002662	ATGAA	2	10	45222	45231	60 %	20 %	20 %	0 %	15672024
38	NC_002662	TTTGA	2	10	45697	45706	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002662	TTTTG	2	10	46180	46189	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002662	AAAAT	2	10	46951	46960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002662	TGCCT	2	10	48500	48509	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_002662	AATAA	2	10	49680	49689	80 %	20 %	0 %	0 %	15672029
43	NC_002662	ACTTT	2	10	50601	50610	20 %	60 %	0 %	20 %	15672030
44	NC_002662	GATTG	2	10	50862	50871	20 %	40 %	40 %	0 %	15672031
45	NC_002662	AAAAG	2	10	51313	51322	80 %	0 %	20 %	0 %	15672032
46	NC_002662	ATTCA	2	10	51938	51947	40 %	40 %	0 %	20 %	15672032
47	NC_002662	AAATT	2	10	52291	52300	60 %	40 %	0 %	0 %	15672032
48	NC_002662	CAATT	2	10	53810	53819	40 %	40 %	0 %	20 %	15672034
49	NC_002662	TTGTA	2	10	53962	53971	20 %	60 %	20 %	0 %	15672035
50	NC_002662	GCTTC	2	10	54763	54772	0 %	40 %	20 %	40 %	15672036
51	NC_002662	GAAAT	2	10	55467	55476	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002662	ATCAA	2	10	56005	56014	60 %	20 %	0 %	20 %	15672038
53	NC_002662	AGTAA	2	10	56500	56509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002662	GGATT	2	10	57317	57326	20 %	40 %	40 %	0 %	15672039
55	NC_002662	ATTAT	2	10	57485	57494	40 %	60 %	0 %	0 %	15672039
56	NC_002662	CTTAT	2	10	57678	57687	20 %	60 %	0 %	20 %	15672039
57	NC_002662	AAATA	2	10	57832	57841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002662	TATTG	2	10	59994	60003	20 %	60 %	20 %	0 %	15672041
59	NC_002662	TTTAA	2	10	60127	60136	40 %	60 %	0 %	0 %	15672041
60	NC_002662	TTAAT	2	10	61113	61122	40 %	60 %	0 %	0 %	15672042
61	NC_002662	CAAAA	2	10	62306	62315	80 %	0 %	0 %	20 %	15672043
62	NC_002662	TAGTA	2	10	62584	62593	40 %	40 %	20 %	0 %	15672043
63	NC_002662	GCTTG	2	10	63200	63209	0 %	40 %	40 %	20 %	15672044
64	NC_002662	TCCAT	2	10	63551	63560	20 %	40 %	0 %	40 %	15672044
65	NC_002662	GGCTT	2	10	66329	66338	0 %	40 %	40 %	20 %	15672046
66	NC_002662	AATTA	2	10	66833	66842	60 %	40 %	0 %	0 %	15672047
67	NC_002662	GACTT	2	10	67292	67301	20 %	40 %	20 %	20 %	15672048
68	NC_002662	GTTTT	2	10	67446	67455	0 %	80 %	20 %	0 %	15672048
69	NC_002662	TTTCA	2	10	67489	67498	20 %	60 %	0 %	20 %	15672048
70	NC_002662	ATTCA	2	10	68745	68754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_002662	AAATT	2	10	69086	69095	60 %	40 %	0 %	0 %	15672049
72	NC_002662	CTTAA	2	10	69359	69368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_002662	GGTTC	2	10	70508	70517	0 %	40 %	40 %	20 %	15672050
74	NC_002662	CTTTA	2	10	70543	70552	20 %	60 %	0 %	20 %	15672050
75	NC_002662	ATTTT	2	10	70716	70725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002662	CAAAT	2	10	72181	72190	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_002662	AGTTT	2	10	75026	75035	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002662	AATAA	2	10	75180	75189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002662	AATCA	2	10	76179	76188	60 %	20 %	0 %	20 %	15672055
80	NC_002662	CCATT	2	10	78267	78276	20 %	40 %	0 %	40 %	15672056
81	NC_002662	TGAAA	2	10	78486	78495	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002662	GAAGT	2	10	78989	78998	40 %	20 %	40 %	0 %	15672057
83	NC_002662	ATGAT	2	10	80003	80012	40 %	40 %	20 %	0 %	15672058
84	NC_002662	TGGTT	2	10	80999	81008	0 %	60 %	40 %	0 %	15672059
85	NC_002662	TTTAA	2	10	84013	84022	40 %	60 %	0 %	0 %	15672061
86	NC_002662	GAAAA	2	10	84538	84547	80 %	0 %	20 %	0 %	15672061
87	NC_002662	CCAAT	2	10	84940	84949	40 %	20 %	0 %	40 %	15672062
88	NC_002662	TACAG	2	10	85922	85931	40 %	20 %	20 %	20 %	15672062
89	NC_002662	GTTGT	2	10	86520	86529	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002662	TCGTA	2	10	89090	89099	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_002662	TAAAA	2	10	89371	89380	80 %	20 %	0 %	0 %	15672067
92	NC_002662	TATTT	2	10	89383	89392	20 %	80 %	0 %	0 %	15672067
93	NC_002662	ACTAT	2	10	89812	89821	40 %	40 %	0 %	20 %	15672067
94	NC_002662	TTGCA	2	10	90152	90161	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_002662	TAGAG	2	10	92028	92037	40 %	20 %	40 %	0 %	15672070
96	NC_002662	TAATA	2	10	92557	92566	60 %	40 %	0 %	0 %	15672071
97	NC_002662	CTATA	2	10	92937	92946	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_002662	TAGAG	2	10	94007	94016	40 %	20 %	40 %	0 %	15672072
99	NC_002662	ATTCT	2	10	94779	94788	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_002662	CTATA	2	10	95436	95445	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_002662	GTAAA	2	10	96325	96334	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002662	ATTTA	2	10	98585	98594	40 %	60 %	0 %	0 %	15672078
103	NC_002662	TTTTA	2	10	101411	101420	20 %	80 %	0 %	0 %	15672081
104	NC_002662	AAAGA	2	10	105223	105232	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002662	TCAAG	2	10	106208	106217	40 %	20 %	20 %	20 %	15672087
106	NC_002662	GTTTG	2	10	106846	106855	0 %	60 %	40 %	0 %	15672087
107	NC_002662	ATAGA	2	10	107080	107089	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002662	ATCTT	2	10	110408	110417	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_002662	TAGCT	2	10	110908	110917	20 %	40 %	20 %	20 %	15672090
110	NC_002662	AGTTG	2	10	110962	110971	20 %	40 %	40 %	0 %	15672090
111	NC_002662	TAAAA	2	10	111083	111092	80 %	20 %	0 %	0 %	15672091
112	NC_002662	CAGGT	2	10	112918	112927	20 %	20 %	40 %	20 %	15672093
113	NC_002662	TCTGG	2	10	113458	113467	0 %	40 %	40 %	20 %	15672093
114	NC_002662	TATGA	2	10	114315	114324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002662	GTTTG	2	10	114511	114520	0 %	60 %	40 %	0 %	15672094
116	NC_002662	TTTAC	2	10	117619	117628	20 %	60 %	0 %	20 %	15672097
117	NC_002662	ACAAT	2	10	118410	118419	60 %	20 %	0 %	20 %	15672097
118	NC_002662	GATTT	2	10	118481	118490	20 %	60 %	20 %	0 %	15672097
119	NC_002662	TTACA	2	10	119458	119467	40 %	40 %	0 %	20 %	15672098
120	NC_002662	CTAAT	2	10	122672	122681	40 %	40 %	0 %	20 %	15672101
121	NC_002662	AATAG	2	10	123720	123729	60 %	20 %	20 %	0 %	15672103
122	NC_002662	TGACC	2	10	124330	124339	20 %	20 %	20 %	40 %	15672103
123	NC_002662	TATTC	2	10	124934	124943	20 %	60 %	0 %	20 %	15672104
124	NC_002662	TTTTA	2	10	125667	125676	20 %	80 %	0 %	0 %	15672105
125	NC_002662	TGGAT	2	10	126792	126801	20 %	40 %	40 %	0 %	30023975
126	NC_002662	ATCTT	2	10	128250	128259	20 %	60 %	0 %	20 %	15672107
127	NC_002662	GAAAA	2	10	129701	129710	80 %	0 %	20 %	0 %	15672108
128	NC_002662	CCAAA	2	10	130529	130538	60 %	0 %	0 %	40 %	15672108
129	NC_002662	TGGCT	2	10	131490	131499	0 %	40 %	40 %	20 %	15672110
130	NC_002662	GCCAT	2	10	131690	131699	20 %	20 %	20 %	40 %	15672110
131	NC_002662	CAAAT	2	10	132069	132078	60 %	20 %	0 %	20 %	15672111
132	NC_002662	TTTTA	2	10	132671	132680	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002662	ATTTT	2	10	135993	136002	20 %	80 %	0 %	0 %	15672116
134	NC_002662	GCTTG	2	10	137039	137048	0 %	40 %	40 %	20 %	15672117
135	NC_002662	GAAGC	2	10	137688	137697	40 %	0 %	40 %	20 %	15672118
136	NC_002662	CAATG	2	10	138374	138383	40 %	20 %	20 %	20 %	15672119
137	NC_002662	TACAA	2	10	138489	138498	60 %	20 %	0 %	20 %	15672119
138	NC_002662	CAATT	2	10	139955	139964	40 %	40 %	0 %	20 %	15672121
139	NC_002662	TTGTA	2	10	140107	140116	20 %	60 %	20 %	0 %	15672122
140	NC_002662	GCTTC	2	10	140908	140917	0 %	40 %	20 %	40 %	15672123
141	NC_002662	TAAAA	2	10	142668	142677	80 %	20 %	0 %	0 %	15672126
142	NC_002662	CGTCG	2	10	146589	146598	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_002662	TTCAA	2	10	147617	147626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_002662	TCAAA	2	10	309800	309809	60 %	20 %	0 %	20 %	15672292
274	NC_002662	TGGTA	2	10	310067	310076	20 %	40 %	40 %	0 %	15672292
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