MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 33424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002662	AAT	2	6	130	135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002662	TAA	2	6	242	247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002662	TGG	2	6	258	263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002662	CAA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002662	CAG	2	6	412	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671983
6	NC_002662	ATT	2	6	521	526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671983
7	NC_002662	CGG	2	6	554	559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15671983
8	NC_002662	GAT	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671983
9	NC_002662	ATG	2	6	605	610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671983
10	NC_002662	AGC	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671983
11	NC_002662	TGG	2	6	828	833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15671983
12	NC_002662	TTC	2	6	918	923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671983
13	NC_002662	AAT	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671983
14	NC_002662	ACT	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15671983
15	NC_002662	GGT	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15671983
16	NC_002662	ATT	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671983
17	NC_002662	TTG	2	6	1508	1513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671983
18	NC_002662	TGG	2	6	1614	1619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15671983
19	NC_002662	CTA	3	9	1833	1841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002662	TAT	2	6	1846	1851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002662	TAA	2	6	1899	1904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671984
22	NC_002662	ATA	2	6	2063	2068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671984
23	NC_002662	TTA	2	6	2107	2112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671984
24	NC_002662	GCT	2	6	2116	2121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671984
25	NC_002662	AGA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671984
26	NC_002662	ATG	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671984
27	NC_002662	AAG	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671984
28	NC_002662	TTA	2	6	2598	2603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671984
29	NC_002662	TGC	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671984
30	NC_002662	TTG	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671984
31	NC_002662	GTA	2	6	2782	2787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671984
32	NC_002662	GAA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671984
33	NC_002662	AAG	2	6	2846	2851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671984
34	NC_002662	GAA	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671984
35	NC_002662	ATT	2	6	3174	3179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
36	NC_002662	GAA	2	6	3193	3198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
37	NC_002662	TTA	2	6	3219	3224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
38	NC_002662	CTT	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671985
39	NC_002662	CAG	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671985
40	NC_002662	TTA	2	6	3339	3344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
41	NC_002662	ACA	2	6	3367	3372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15671985
42	NC_002662	CAG	2	6	3389	3394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671985
43	NC_002662	GAG	2	6	3423	3428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15671985
44	NC_002662	AGA	2	6	3438	3443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
45	NC_002662	CTG	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671985
46	NC_002662	GAA	2	6	3595	3600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
47	NC_002662	ACT	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15671985
48	NC_002662	GTC	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671985
49	NC_002662	GAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
50	NC_002662	TGA	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
51	NC_002662	CTG	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671985
52	NC_002662	TAG	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
53	NC_002662	GCT	2	6	4132	4137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671985
54	NC_002662	AAG	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
55	NC_002662	AAT	2	6	4261	4266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671985
56	NC_002662	GAT	2	6	4276	4281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
57	NC_002662	TCT	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671985
58	NC_002662	TGA	2	6	4326	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
59	NC_002662	TGA	2	6	4692	4697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
60	NC_002662	TTA	2	6	4729	4734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
61	NC_002662	TGT	2	6	4782	4787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671985
62	NC_002662	TTG	2	6	4808	4813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671985
63	NC_002662	TAA	2	6	4824	4829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671985
64	NC_002662	GAA	2	6	4903	4908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
65	NC_002662	AAC	2	6	4926	4931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15671985
66	NC_002662	TGA	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
67	NC_002662	TGT	2	6	4962	4967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671985
68	NC_002662	ATT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
69	NC_002662	TTC	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671985
70	NC_002662	AAG	2	6	5132	5137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
71	NC_002662	TTG	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671985
72	NC_002662	GAA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
73	NC_002662	TGA	2	6	5238	5243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
74	NC_002662	TAT	2	6	5309	5314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
75	NC_002662	AAG	3	9	5540	5548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
76	NC_002662	TGA	2	6	5568	5573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
77	NC_002662	ATG	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
78	NC_002662	ATG	2	6	5630	5635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
79	NC_002662	AGA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
80	NC_002662	TGA	2	6	5715	5720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
81	NC_002662	AGT	2	6	5743	5748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
82	NC_002662	GAA	2	6	5807	5812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
83	NC_002662	TCT	2	6	5833	5838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671985
84	NC_002662	ATT	2	6	5840	5845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671985
85	NC_002662	AAG	2	6	5945	5950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
86	NC_002662	ATG	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671985
87	NC_002662	AAG	2	6	6155	6160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671985
88	NC_002662	GCA	2	6	6602	6607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671986
89	NC_002662	TGA	2	6	6664	6669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671986
90	NC_002662	AAG	2	6	6837	6842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671986
91	NC_002662	GAT	2	6	6878	6883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671986
92	NC_002662	GAA	2	6	6911	6916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671986
93	NC_002662	AGT	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671986
94	NC_002662	CAG	2	6	7074	7079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671986
95	NC_002662	CAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671986
96	NC_002662	AGT	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671986
97	NC_002662	ATA	2	6	7200	7205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671986
98	NC_002662	TTC	2	6	7294	7299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671986
99	NC_002662	ATG	2	6	7611	7616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671986
100	NC_002662	GTG	2	6	7836	7841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15671986
101	NC_002662	AGA	2	6	7915	7920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671986
102	NC_002662	CTT	2	6	7985	7990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671986
103	NC_002662	TGA	2	6	8011	8016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671986
104	NC_002662	AGC	2	6	8065	8070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671986
105	NC_002662	ATA	3	9	8145	8153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671986
106	NC_002662	TGA	2	6	8197	8202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671986
107	NC_002662	TAA	2	6	8404	8409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671986
108	NC_002662	AAG	2	6	8471	8476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671986
109	NC_002662	CTA	2	6	8548	8553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15671986
110	NC_002662	ATT	2	6	8656	8661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671986
111	NC_002662	CAA	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15671986
112	NC_002662	AAT	2	6	8699	8704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671986
113	NC_002662	TGA	2	6	8751	8756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671986
114	NC_002662	AGC	2	6	8989	8994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671986
115	NC_002662	AGA	2	6	9001	9006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671986
116	NC_002662	AGA	2	6	9136	9141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671986
117	NC_002662	AGA	2	6	9235	9240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671986
118	NC_002662	GAA	2	6	9296	9301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671986
119	NC_002662	ATA	2	6	9315	9320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671986
120	NC_002662	TGA	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671986
121	NC_002662	AGC	2	6	9385	9390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671986
122	NC_002662	CTG	2	6	9537	9542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671986
123	NC_002662	TGA	2	6	9625	9630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671986
124	NC_002662	TGA	2	6	9640	9645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671986
125	NC_002662	AAG	2	6	9741	9746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671986
126	NC_002662	TTC	2	6	9877	9882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15671986
127	NC_002662	AGG	2	6	9991	9996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15671986
128	NC_002662	TTG	2	6	10011	10016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671986
129	NC_002662	GAT	2	6	10025	10030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671986
130	NC_002662	GAA	2	6	10105	10110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30023968
131	NC_002662	TGA	3	9	10218	10226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30023968
132	NC_002662	TAA	2	6	10240	10245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30023968
133	NC_002662	TAA	2	6	10318	10323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671987
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262	NC_002662	GTT	2	6	20576	20581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671995
263	NC_002662	AAT	2	6	20593	20598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671995
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265	NC_002662	TAA	2	6	20716	20721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_002662	ACA	2	6	22501	22506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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