MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 54694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002662	AGA	2	6	128181	128186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672107
3002	NC_002662	CTT	2	6	128191	128196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672107
3003	NC_002662	ATCTT	2	10	128250	128259	20 %	60 %	0 %	20 %	15672107
3004	NC_002662	GCTC	2	8	128299	128306	0 %	25 %	25 %	50 %	15672107
3005	NC_002662	TAT	2	6	128430	128435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672107
3006	NC_002662	GAC	2	6	128589	128594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672107
3007	NC_002662	GAC	2	6	128616	128621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672107
3008	NC_002662	ACT	2	6	128625	128630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672107
3009	NC_002662	TC	3	6	128697	128702	0 %	50 %	0 %	50 %	15672107
3010	NC_002662	ATG	2	6	128719	128724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672107
3011	NC_002662	GAG	2	6	128743	128748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15672107
3012	NC_002662	GTCT	2	8	128786	128793	0 %	50 %	25 %	25 %	15672107
3013	NC_002662	TTC	2	6	128811	128816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672107
3014	NC_002662	TAT	2	6	128817	128822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672107
3015	NC_002662	AGA	3	9	128828	128836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672107
3016	NC_002662	TGA	2	6	128909	128914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672107
3017	NC_002662	AAG	2	6	128948	128953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672107
3018	NC_002662	AAG	2	6	128957	128962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672107
3019	NC_002662	TAA	2	6	128987	128992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672107
3020	NC_002662	CTT	2	6	128993	128998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672107
3021	NC_002662	TGT	2	6	129017	129022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672107
3022	NC_002662	CAA	2	6	129107	129112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672107
3023	NC_002662	A	7	7	129171	129177	100 %	0 %	0 %	0 %	15672107
3024	NC_002662	AAG	2	6	129279	129284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672107
3025	NC_002662	GGT	2	6	129295	129300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672107
3026	NC_002662	A	6	6	129319	129324	100 %	0 %	0 %	0 %	15672107
3027	NC_002662	AGA	2	6	129330	129335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672107
3028	NC_002662	A	6	6	129340	129345	100 %	0 %	0 %	0 %	15672107
3029	NC_002662	T	6	6	129366	129371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_002662	T	6	6	129380	129385	0 %	100 %	0 %	0 %	15672108
3031	NC_002662	AGT	2	6	129411	129416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672108
3032	NC_002662	TTA	2	6	129417	129422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672108
3033	NC_002662	ATTG	2	8	129521	129528	25 %	50 %	25 %	0 %	15672108
3034	NC_002662	GATT	2	8	129533	129540	25 %	50 %	25 %	0 %	15672108
3035	NC_002662	GAG	2	6	129570	129575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15672108
3036	NC_002662	AGT	2	6	129635	129640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672108
3037	NC_002662	GAAAA	2	10	129701	129710	80 %	0 %	20 %	0 %	15672108
3038	NC_002662	GAC	2	6	129753	129758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672108
3039	NC_002662	AGC	2	6	129769	129774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672108
3040	NC_002662	GCA	2	6	129797	129802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672108
3041	NC_002662	GATT	2	8	129884	129891	25 %	50 %	25 %	0 %	15672108
3042	NC_002662	A	6	6	129916	129921	100 %	0 %	0 %	0 %	15672108
3043	NC_002662	AAT	2	6	129931	129936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672108
3044	NC_002662	TGGG	2	8	129940	129947	0 %	25 %	75 %	0 %	15672108
3045	NC_002662	AAC	2	6	129949	129954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672108
3046	NC_002662	TCT	2	6	129987	129992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672108
3047	NC_002662	A	6	6	130018	130023	100 %	0 %	0 %	0 %	15672108
3048	NC_002662	ATA	2	6	130049	130054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672108
3049	NC_002662	CGA	2	6	130076	130081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672108
3050	NC_002662	TGT	2	6	130147	130152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672108
3051	NC_002662	AGC	2	6	130273	130278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672108
3052	NC_002662	TGAAAT	2	12	130297	130308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15672108
3053	NC_002662	CCAAA	2	10	130529	130538	60 %	0 %	0 %	40 %	15672108
3054	NC_002662	ATGA	2	8	130571	130578	50 %	25 %	25 %	0 %	15672108
3055	NC_002662	CTT	2	6	130584	130589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_002662	ATA	3	9	130603	130611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_002662	TAT	2	6	130621	130626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_002662	CTA	2	6	130807	130812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672109
3059	NC_002662	TC	3	6	130835	130840	0 %	50 %	0 %	50 %	15672109
3060	NC_002662	GAA	2	6	130917	130922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672109
3061	NC_002662	AACT	2	8	130969	130976	50 %	25 %	0 %	25 %	15672109
3062	NC_002662	TGG	2	6	130984	130989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672109
3063	NC_002662	GCA	2	6	131004	131009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672109
3064	NC_002662	CAAA	2	8	131088	131095	75 %	0 %	0 %	25 %	15672109
3065	NC_002662	TCG	2	6	131141	131146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672109
3066	NC_002662	AGA	3	9	131171	131179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672109
3067	NC_002662	AGA	2	6	131276	131281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672109
3068	NC_002662	TTAC	2	8	131287	131294	25 %	50 %	0 %	25 %	15672109
3069	NC_002662	ATC	2	6	131302	131307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672109
3070	NC_002662	GTC	2	6	131314	131319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672109
3071	NC_002662	TA	3	6	131405	131410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_002662	GA	3	6	131483	131488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_002662	TGGCT	2	10	131490	131499	0 %	40 %	40 %	20 %	15672110
3074	NC_002662	A	8	8	131502	131509	100 %	0 %	0 %	0 %	15672110
3075	NC_002662	T	6	6	131546	131551	0 %	100 %	0 %	0 %	15672110
3076	NC_002662	A	6	6	131575	131580	100 %	0 %	0 %	0 %	15672110
3077	NC_002662	GCCAT	2	10	131690	131699	20 %	20 %	20 %	40 %	15672110
3078	NC_002662	ATT	2	6	131740	131745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672110
3079	NC_002662	TGGA	2	8	131828	131835	25 %	25 %	50 %	0 %	15672110
3080	NC_002662	GGC	2	6	131879	131884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15672111
3081	NC_002662	TTG	2	6	131889	131894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672111
3082	NC_002662	AAC	2	6	131909	131914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672111
3083	NC_002662	AGT	2	6	131925	131930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672111
3084	NC_002662	CAAC	2	8	131932	131939	50 %	0 %	0 %	50 %	15672111
3085	NC_002662	TGG	2	6	131993	131998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672111
3086	NC_002662	TAT	2	6	132014	132019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672111
3087	NC_002662	GCA	2	6	132042	132047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672111
3088	NC_002662	TGA	2	6	132058	132063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672111
3089	NC_002662	CAAAT	2	10	132069	132078	60 %	20 %	0 %	20 %	15672111
3090	NC_002662	A	8	8	132113	132120	100 %	0 %	0 %	0 %	15672111
3091	NC_002662	TCG	2	6	132155	132160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672111
3092	NC_002662	TGA	2	6	132163	132168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672111
3093	NC_002662	GTT	2	6	132220	132225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672111
3094	NC_002662	GTT	2	6	132234	132239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672111
3095	NC_002662	TGA	3	9	132391	132399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672111
3096	NC_002662	AGAA	2	8	132410	132417	75 %	0 %	25 %	0 %	15672111
3097	NC_002662	TGC	2	6	132482	132487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672111
3098	NC_002662	TGT	2	6	132541	132546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672111
3099	NC_002662	ATT	2	6	132564	132569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672111
3100	NC_002662	GCG	2	6	132570	132575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15672111
3101	NC_002662	GAA	2	6	132632	132637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672111
3102	NC_002662	A	7	7	132644	132650	100 %	0 %	0 %	0 %	15672111
3103	NC_002662	A	6	6	132652	132657	100 %	0 %	0 %	0 %	15672111
3104	NC_002662	TTTTA	2	10	132671	132680	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_002662	AGT	2	6	132730	132735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_002662	TAT	2	6	132738	132743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672112
3107	NC_002662	TTCATA	2	12	132821	132832	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15672112
3108	NC_002662	A	7	7	132845	132851	100 %	0 %	0 %	0 %	15672112
3109	NC_002662	GAAA	2	8	132869	132876	75 %	0 %	25 %	0 %	15672112
3110	NC_002662	GAA	2	6	132907	132912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672112
3111	NC_002662	GTG	2	6	132944	132949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672112
3112	NC_002662	GAT	2	6	132952	132957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672112
3113	NC_002662	GA	4	8	133045	133052	50 %	0 %	50 %	0 %	15672112
3114	NC_002662	GAA	2	6	133072	133077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672112
3115	NC_002662	ATT	2	6	133090	133095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672112
3116	NC_002662	GTT	2	6	133114	133119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672112
3117	NC_002662	CAG	2	6	133136	133141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672112
3118	NC_002662	CT	3	6	133144	133149	0 %	50 %	0 %	50 %	15672112
3119	NC_002662	CTG	2	6	133160	133165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672112
3120	NC_002662	AGA	2	6	133170	133175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672112
3121	NC_002662	GAA	2	6	133185	133190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672112
3122	NC_002662	A	6	6	133211	133216	100 %	0 %	0 %	0 %	15672112
3123	NC_002662	AAC	2	6	133242	133247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672112
3124	NC_002662	CA	3	6	133251	133256	50 %	0 %	0 %	50 %	15672112
3125	NC_002662	ATG	2	6	133331	133336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672112
3126	NC_002662	GAAT	2	8	133421	133428	50 %	25 %	25 %	0 %	15672112
3127	NC_002662	TAT	2	6	133572	133577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672112
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3131	NC_002662	CA	3	6	133807	133812	50 %	0 %	0 %	50 %	15672113
3132	NC_002662	A	6	6	133812	133817	100 %	0 %	0 %	0 %	15672113
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3146	NC_002662	ATT	2	6	134169	134174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3149	NC_002662	ATT	2	6	134406	134411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3249	NC_002662	CAATG	2	10	138374	138383	40 %	20 %	20 %	20 %	15672119
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3253	NC_002662	ATT	2	6	138650	138655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672120
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3255	NC_002662	ATT	2	6	138795	138800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672120
3256	NC_002662	GAAA	2	8	138811	138818	75 %	0 %	25 %	0 %	15672120
3257	NC_002662	AAC	2	6	138838	138843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672120
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3275	NC_002662	A	7	7	139988	139994	100 %	0 %	0 %	0 %	15672121
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