MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 54694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002662	TTG	2	6	217068	217073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672197
5002	NC_002662	GAT	2	6	217094	217099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672197
5003	NC_002662	TTC	2	6	217105	217110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672197
5004	NC_002662	AGA	2	6	217120	217125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672197
5005	NC_002662	A	6	6	217169	217174	100 %	0 %	0 %	0 %	15672197
5006	NC_002662	TAA	2	6	217206	217211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672197
5007	NC_002662	TCTA	2	8	217222	217229	25 %	50 %	0 %	25 %	15672197
5008	NC_002662	ATA	2	6	217233	217238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672197
5009	NC_002662	AGA	2	6	217264	217269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672197
5010	NC_002662	AATC	2	8	217383	217390	50 %	25 %	0 %	25 %	15672197
5011	NC_002662	TTA	2	6	217410	217415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672197
5012	NC_002662	TAA	2	6	217425	217430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672197
5013	NC_002662	AATT	2	8	217437	217444	50 %	50 %	0 %	0 %	15672197
5014	NC_002662	TAG	2	6	217450	217455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672197
5015	NC_002662	TTA	2	6	217468	217473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672197
5016	NC_002662	GTT	2	6	217496	217501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672197
5017	NC_002662	GACA	2	8	217509	217516	50 %	0 %	25 %	25 %	15672197
5018	NC_002662	CAAT	2	8	217524	217531	50 %	25 %	0 %	25 %	15672197
5019	NC_002662	TAA	2	6	217539	217544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672197
5020	NC_002662	TA	3	6	217632	217637	50 %	50 %	0 %	0 %	15672197
5021	NC_002662	ATT	2	6	217639	217644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672197
5022	NC_002662	TCTT	2	8	217662	217669	0 %	75 %	0 %	25 %	15672197
5023	NC_002662	ATG	2	6	217679	217684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672197
5024	NC_002662	ACT	2	6	217722	217727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672198
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5026	NC_002662	CTAGT	2	10	217783	217792	20 %	40 %	20 %	20 %	15672198
5027	NC_002662	AACA	2	8	217803	217810	75 %	0 %	0 %	25 %	15672198
5028	NC_002662	GTT	2	6	217824	217829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672198
5029	NC_002662	GAT	2	6	217830	217835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672198
5030	NC_002662	GCA	2	6	217837	217842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672198
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5032	NC_002662	TGG	2	6	217919	217924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672198
5033	NC_002662	ACGA	2	8	218004	218011	50 %	0 %	25 %	25 %	15672198
5034	NC_002662	GAAA	2	8	218048	218055	75 %	0 %	25 %	0 %	15672198
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5037	NC_002662	ATT	2	6	218300	218305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672198
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5039	NC_002662	A	6	6	218378	218383	100 %	0 %	0 %	0 %	15672198
5040	NC_002662	TTCA	2	8	218432	218439	25 %	50 %	0 %	25 %	15672198
5041	NC_002662	CTT	2	6	218460	218465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672198
5042	NC_002662	T	6	6	218481	218486	0 %	100 %	0 %	0 %	15672198
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5044	NC_002662	GAT	2	6	218564	218569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672198
5045	NC_002662	AAAAT	2	10	218583	218592	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_002662	A	7	7	218627	218633	100 %	0 %	0 %	0 %	15672199
5047	NC_002662	ATT	2	6	218645	218650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672199
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5050	NC_002662	TTGG	2	8	218808	218815	0 %	50 %	50 %	0 %	15672199
5051	NC_002662	A	6	6	218845	218850	100 %	0 %	0 %	0 %	15672199
5052	NC_002662	TA	4	8	218866	218873	50 %	50 %	0 %	0 %	15672199
5053	NC_002662	GCA	2	6	218896	218901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672199
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5108	NC_002662	TAAC	2	8	221005	221012	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5109	NC_002662	T	7	7	221063	221069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_002662	AT	3	6	221080	221085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_002662	ATA	2	6	221114	221119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_002662	T	6	6	221148	221153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_002662	AAAAT	2	10	221207	221216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_002662	TA	4	8	221252	221259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_002662	GGA	2	6	221270	221275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5127	NC_002662	GCT	2	6	221810	221815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672202
5128	NC_002662	TGA	2	6	221857	221862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672202
5129	NC_002662	TGC	2	6	221926	221931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672202
5130	NC_002662	TTG	2	6	221955	221960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672202
5131	NC_002662	TCT	2	6	221978	221983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672202
5132	NC_002662	TTTG	2	8	222007	222014	0 %	75 %	25 %	0 %	15672202
5133	NC_002662	TTTG	2	8	222157	222164	0 %	75 %	25 %	0 %	15672202
5134	NC_002662	GTT	2	6	222224	222229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672202
5135	NC_002662	ATG	2	6	222264	222269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672202
5136	NC_002662	TGG	2	6	222313	222318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672202
5137	NC_002662	TGC	2	6	222352	222357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672202
5138	NC_002662	TGG	2	6	222358	222363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672202
5139	NC_002662	GCA	2	6	222473	222478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672202
5140	NC_002662	A	6	6	222482	222487	100 %	0 %	0 %	0 %	15672202
5141	NC_002662	TGG	2	6	222607	222612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672202
5142	NC_002662	ATG	2	6	222720	222725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672202
5143	NC_002662	AAG	2	6	222738	222743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672202
5144	NC_002662	A	7	7	222793	222799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_002662	T	6	6	222824	222829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_002662	GAT	2	6	222869	222874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_002662	TAT	2	6	222889	222894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_002662	A	6	6	222898	222903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_002662	TAA	2	6	222931	222936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5150	NC_002662	TGAAAA	2	12	222947	222958	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_002662	GAA	2	6	223049	223054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672203
5152	NC_002662	A	7	7	223053	223059	100 %	0 %	0 %	0 %	15672203
5153	NC_002662	GAAGC	2	10	223105	223114	40 %	0 %	40 %	20 %	15672203
5154	NC_002662	GTT	2	6	223147	223152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672203
5155	NC_002662	T	6	6	223205	223210	0 %	100 %	0 %	0 %	15672203
5156	NC_002662	TGG	2	6	223313	223318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672203
5157	NC_002662	GA	3	6	223397	223402	50 %	0 %	50 %	0 %	15672203
5158	NC_002662	GAT	2	6	223464	223469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672203
5159	NC_002662	TCG	2	6	223502	223507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672203
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5161	NC_002662	TGA	2	6	223655	223660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672203
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5163	NC_002662	AC	3	6	223678	223683	50 %	0 %	0 %	50 %	15672203
5164	NC_002662	ATT	2	6	223689	223694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672203
5165	NC_002662	ATT	2	6	223714	223719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672203
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5168	NC_002662	TGG	2	6	223808	223813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672203
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5170	NC_002662	TCG	2	6	223976	223981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672203
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5174	NC_002662	GGA	2	6	224176	224181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5175	NC_002662	TAA	2	6	224222	224227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5176	NC_002662	ATT	3	9	224256	224264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5177	NC_002662	GAT	2	6	224268	224273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5178	NC_002662	TGGT	2	8	224284	224291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5179	NC_002662	ATT	4	12	224295	224306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5180	NC_002662	TGG	2	6	224311	224316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5181	NC_002662	GAG	2	6	224342	224347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15672204
5182	NC_002662	T	7	7	224422	224428	0 %	100 %	0 %	0 %	15672204
5183	NC_002662	T	6	6	224446	224451	0 %	100 %	0 %	0 %	15672204
5184	NC_002662	TGA	2	6	224490	224495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672204
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5186	NC_002662	AATA	2	8	224676	224683	75 %	25 %	0 %	0 %	15672204
5187	NC_002662	A	6	6	224739	224744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5188	NC_002662	AGA	2	6	224775	224780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30023980
5189	NC_002662	AAGA	2	8	224786	224793	75 %	0 %	25 %	0 %	30023980
5190	NC_002662	TCA	2	6	224842	224847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30023980
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5192	NC_002662	A	6	6	224909	224914	100 %	0 %	0 %	0 %	30023980
5193	NC_002662	AGA	2	6	225045	225050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30023980
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5195	NC_002662	GAA	2	6	225142	225147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30023980
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5198	NC_002662	A	6	6	225314	225319	100 %	0 %	0 %	0 %	30023980
5199	NC_002662	CAA	2	6	225479	225484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30023980
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5203	NC_002662	AACA	2	8	225659	225666	75 %	0 %	0 %	25 %	30023980
5204	NC_002662	TAA	2	6	225723	225728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30023980
5205	NC_002662	GAGTTA	2	12	225862	225873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30023980
5206	NC_002662	GATT	2	8	225965	225972	25 %	50 %	25 %	0 %	30023980
5207	NC_002662	AAATAG	2	12	226029	226040	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5208	NC_002662	TGC	2	6	226170	226175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30023981
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5211	NC_002662	A	6	6	226377	226382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5212	NC_002662	AGA	2	6	226465	226470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672207
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5217	NC_002662	TAT	2	6	226756	226761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672207
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5219	NC_002662	TGA	2	6	226804	226809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672207
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5221	NC_002662	CTT	2	6	226866	226871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672207
5222	NC_002662	ATG	2	6	226898	226903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672207
5223	NC_002662	AAG	2	6	226995	227000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672207
5224	NC_002662	AG	3	6	227040	227045	50 %	0 %	50 %	0 %	15672208
5225	NC_002662	A	6	6	227076	227081	100 %	0 %	0 %	0 %	15672208
5226	NC_002662	AGC	2	6	227114	227119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672208
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5229	NC_002662	ATA	3	9	227266	227274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672208
5230	NC_002662	TGAAGA	2	12	227324	227335	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15672208
5231	NC_002662	TGTA	2	8	227401	227408	25 %	50 %	25 %	0 %	15672208
5232	NC_002662	CGT	2	6	227532	227537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672208
5233	NC_002662	TTA	2	6	227620	227625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_002662	ATGA	2	8	227639	227646	50 %	25 %	25 %	0 %	15672209
5235	NC_002662	TGAAA	2	10	227657	227666	60 %	20 %	20 %	0 %	15672209
5236	NC_002662	A	7	7	227884	227890	100 %	0 %	0 %	0 %	15672209
5237	NC_002662	AGA	2	6	227930	227935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672209
5238	NC_002662	GA	4	8	227948	227955	50 %	0 %	50 %	0 %	15672209
5239	NC_002662	TTA	2	6	227962	227967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672209
5240	NC_002662	T	6	6	228050	228055	0 %	100 %	0 %	0 %	15672209
5241	NC_002662	AAT	2	6	228070	228075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_002662	AAG	2	6	228153	228158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_002662	AAT	2	6	228171	228176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_002662	GGA	2	6	228223	228228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_002662	A	7	7	228242	228248	100 %	0 %	0 %	0 %	15672210
5246	NC_002662	AGC	2	6	228269	228274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672210
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5248	NC_002662	A	6	6	228282	228287	100 %	0 %	0 %	0 %	15672210
5249	NC_002662	TTG	2	6	228328	228333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672210
5250	NC_002662	ATT	2	6	228337	228342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672210
5251	NC_002662	ATA	2	6	228391	228396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672210
5252	NC_002662	AGC	2	6	228428	228433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672210
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5254	NC_002662	ATG	2	6	228511	228516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672210
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5377	NC_002662	TCT	2	6	233964	233969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5378	NC_002662	A	6	6	234010	234015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5381	NC_002662	TTG	2	6	234043	234048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5382	NC_002662	ATT	2	6	234105	234110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672218
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