MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis strain SB3432

Total Repeats: 261

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021231	TCT	2	6	11	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021231	CAG	2	6	103	108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021231	TAA	2	6	118	123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021231	ATA	2	6	224	229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021231	TGC	2	6	618	623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021231	TAC	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021231	GCT	2	6	2381	2386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021231	GAA	2	6	2437	2442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021231	GTT	2	6	3380	3385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021231	ACA	2	6	3387	3392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021231	TCA	2	6	3538	3543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021231	TAA	2	6	3577	3582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021231	GCA	3	9	3771	3779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021231	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021231	TTC	2	6	4137	4142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021231	TCA	2	6	10652	10657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021231	ACG	2	6	10721	10726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021231	TCG	2	6	10832	10837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021231	GTA	2	6	10844	10849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021231	ACC	2	6	10928	10933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021231	TCA	2	6	11586	11591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021231	GGC	2	6	12522	12527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021231	GTG	2	6	14141	14146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021231	GTT	2	6	14227	14232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021231	GGT	2	6	14373	14378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021231	ACG	2	6	14414	14419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021231	CGG	2	6	14580	14585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021231	ATG	2	6	14636	14641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021231	AGT	2	6	14754	14759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021231	ATG	2	6	14825	14830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021231	AAC	2	6	14832	14837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021231	TCA	2	6	14856	14861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021231	AAT	2	6	15071	15076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021231	CCT	2	6	15801	15806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_021231	CAG	2	6	18821	18826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021231	GGC	2	6	18921	18926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021231	CAA	2	6	19545	19550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021231	GCA	3	9	19555	19563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021231	GGC	2	6	19687	19692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021231	GAA	2	6	19921	19926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021231	ACG	2	6	19974	19979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021231	CCT	3	9	25186	25194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021231	CAG	2	6	25385	25390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021231	GGA	2	6	29342	29347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021231	CAT	2	6	29366	29371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021231	TGG	2	6	29398	29403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021231	GAA	2	6	31139	31144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021231	TGA	2	6	31191	31196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021231	CGG	2	6	31308	31313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021231	TTG	2	6	31327	31332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021231	TCC	2	6	31706	31711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021231	ACC	2	6	31744	31749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_021231	ATA	2	6	31778	31783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021231	TTG	2	6	31788	31793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021231	GGC	2	6	31833	31838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021231	GGA	2	6	31900	31905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021231	GAT	2	6	33957	33962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021231	TCT	2	6	34076	34081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021231	TCC	2	6	34140	34145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_021231	GTA	2	6	34305	34310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021231	GTC	2	6	34327	34332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021231	ATT	2	6	34376	34381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021231	TGA	2	6	35080	35085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021231	CAT	2	6	35094	35099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021231	GAA	2	6	36681	36686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021231	CCG	2	6	37644	37649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021231	CAG	2	6	38610	38615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021231	AAT	2	6	38617	38622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021231	CTG	2	6	38863	38868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021231	ATC	2	6	38900	38905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021231	GGC	2	6	39060	39065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021231	GTG	2	6	40679	40684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021231	ACC	2	6	40761	40766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021231	CTT	2	6	42421	42426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021231	AAC	3	9	42490	42498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021231	CGG	2	6	43592	43597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021231	CCA	2	6	43622	43627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_021231	CGC	2	6	43715	43720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021231	CAC	2	6	43792	43797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021231	ACA	2	6	43822	43827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021231	CAT	2	6	43830	43835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021231	GCG	3	9	43871	43879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021231	GTG	2	6	43887	43892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021231	ATG	2	6	43930	43935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021231	CTG	2	6	44085	44090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021231	TAA	2	6	44108	44113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021231	GGC	2	6	44228	44233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021231	ATC	2	6	44237	44242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021231	GTT	2	6	44341	44346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021231	CCG	2	6	44349	44354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_021231	TCA	2	6	45574	45579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021231	CCA	2	6	45611	45616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021231	AAT	2	6	45667	45672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021231	TTG	2	6	45679	45684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021231	CCT	2	6	45945	45950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_021231	TAC	2	6	45983	45988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021231	ACG	2	6	46705	46710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021231	CAG	2	6	47626	47631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021231	CAA	2	6	47640	47645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021231	CAT	2	6	47659	47664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021231	CAC	2	6	47795	47800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021231	AAT	2	6	47940	47945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021231	GAA	2	6	48677	48682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021231	AAT	2	6	48685	48690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021231	TTG	2	6	48759	48764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021231	CAC	2	6	48779	48784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_021231	CAT	2	6	48841	48846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021231	GCT	2	6	48942	48947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021231	GCA	2	6	49055	49060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021231	TCC	2	6	49085	49090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_021231	TCC	2	6	49103	49108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021231	AAT	2	6	49109	49114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021231	ATT	2	6	49115	49120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021231	TAA	2	6	49144	49149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021231	ATA	2	6	49944	49949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021231	GGT	2	6	50004	50009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021231	GTT	2	6	50642	50647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021231	CAA	2	6	50654	50659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021231	TGA	2	6	50704	50709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021231	CGG	2	6	50758	50763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021231	ACT	2	6	58402	58407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021231	CCG	2	6	59249	59254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_021231	GGC	2	6	59257	59262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021231	ATT	2	6	59326	59331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021231	AAT	2	6	60260	60265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021231	CAA	2	6	65185	65190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021231	CAT	2	6	65234	65239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021231	CAG	2	6	65327	65332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021231	AAT	2	6	65358	65363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021231	GTT	2	6	65413	65418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021231	CTG	3	9	65428	65436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021231	GCA	2	6	67948	67953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021231	AAC	2	6	71957	71962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021231	TGC	2	6	71969	71974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021231	TAA	2	6	75733	75738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021231	AAG	2	6	75744	75749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021231	ATT	2	6	76171	76176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021231	TCT	2	6	76227	76232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021231	CAT	2	6	76345	76350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021231	AAT	2	6	76352	76357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.