MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae 1084 chromosome

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018522	TAAGCG	2	12	40990	41001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018522	CGCCAG	2	12	68592	68603	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018522	TCCTGC	2	12	89199	89210	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018522	GCCAGC	2	12	89218	89229	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018522	CAGGAA	2	12	141605	141616	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018522	TTTATC	2	12	182795	182806	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018522	TTTTTA	2	12	200854	200865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018522	GGGCGC	2	12	245605	245616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018522	AGCCAC	2	12	265752	265763	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018522	ATCGTT	2	12	287918	287929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018522	CGCAGG	2	12	295144	295155	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018522	CTTTAG	2	12	314845	314856	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018522	GAATGA	2	12	336312	336323	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018522	GATGGC	2	12	372808	372819	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018522	GCGGGA	2	12	388191	388202	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018522	GCGGCT	2	12	388356	388367	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018522	AAAAAC	2	12	410767	410778	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018522	GAAGAG	2	12	414545	414556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018522	GAAAGG	2	12	444173	444184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018522	AAAAAT	2	12	447535	447546	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018522	CTTTTG	2	12	459127	459138	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018522	CAAAAA	2	12	464415	464426	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018522	GGCAGC	2	12	498539	498550	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018522	GCACAG	2	12	516576	516587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018522	ATTTAA	2	12	553375	553386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018522	CCCGTT	2	12	608655	608666	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018522	AGAGGG	2	12	634235	634246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018522	ATCATT	2	12	636631	636642	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018522	AGCGTC	2	12	641467	641478	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018522	GGATCG	2	12	642868	642879	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018522	TACAAC	2	12	668467	668478	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018522	TAAAAT	2	12	734971	734982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018522	CGGACT	2	12	736245	736256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018522	CGGACT	2	12	736408	736419	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018522	AGATAC	2	12	772230	772241	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018522	GTTAAT	2	12	785279	785290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018522	AAAGTG	2	12	796168	796179	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018522	AAGCGC	2	12	798224	798235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018522	CGAGCG	2	12	837762	837773	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018522	GTTTAC	2	12	838835	838846	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018522	TAGCAA	2	12	850085	850096	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018522	CTTTTT	2	12	858005	858016	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018522	GCTTAC	2	12	990677	990688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018522	ATGTCG	2	12	1061423	1061434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018522	GCCAGC	2	12	1122006	1122017	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018522	TAAACC	2	12	1122278	1122289	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018522	GGCTGC	2	12	1151917	1151928	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018522	GCGACT	2	12	1155098	1155109	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018522	ATTAGA	2	12	1172112	1172123	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018522	CCCTGC	2	12	1215876	1215887	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018522	ACAAAA	2	12	1229944	1229955	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018522	CTCCCT	2	12	1368967	1368978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_018522	GTTTTT	2	12	1391454	1391465	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018522	CAATGA	2	12	1410702	1410713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018522	CCCGTG	2	12	1420415	1420426	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018522	TTTTCT	2	12	1438523	1438534	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018522	CTCCCC	2	12	1460059	1460070	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
58	NC_018522	TTAATG	2	12	1462220	1462231	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018522	TTTTGC	2	12	1520234	1520245	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018522	ACGAGA	2	12	1548798	1548809	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018522	ACTTTC	2	12	1568405	1568416	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018522	ATCGCT	2	12	1592524	1592535	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018522	CAGCTT	2	12	1592608	1592619	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018522	GCAAAC	2	12	1654227	1654238	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018522	GATTCT	2	12	1678957	1678968	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018522	CTATGA	2	12	1704674	1704685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018522	GTAAAT	2	12	1706761	1706772	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018522	GCAGCC	2	12	1718485	1718496	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018522	CGAATC	2	12	1727636	1727647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018522	TTTATT	2	12	1738513	1738524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018522	CGTAAA	2	12	1745204	1745215	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018522	CTGACA	2	12	1849366	1849377	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018522	AGGTTG	2	12	1851605	1851616	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018522	ACTACC	2	12	1887143	1887154	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018522	CCGCAG	2	12	1892266	1892277	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018522	TGCCAA	2	12	1899735	1899746	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018522	ATGTAT	2	12	1900388	1900399	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018522	GACGCT	2	12	1907719	1907730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018522	GGATCG	2	12	1922125	1922136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018522	GTTGAC	2	12	1937394	1937405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018522	AAATCT	2	12	1938229	1938240	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018522	TGGTTC	2	12	1941524	1941535	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018522	AAAACG	2	12	1999852	1999863	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018522	CGCAAG	2	12	2014847	2014858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018522	TCTTAT	2	12	2043451	2043462	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018522	TTATAA	2	12	2157278	2157289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018522	ACTTAA	2	12	2157485	2157496	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018522	GCAGGG	2	12	2187012	2187023	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018522	AGAGCC	2	12	2205896	2205907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018522	GCCAGA	2	12	2240608	2240619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018522	AACGAT	2	12	2250374	2250385	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018522	TAATCA	2	12	2309288	2309299	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018522	CGCCAG	2	12	2310006	2310017	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018522	CGGCAG	2	12	2311728	2311739	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018522	ATGACG	2	12	2314110	2314121	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018522	GACCGA	2	12	2370894	2370905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018522	ATTAAA	2	12	2391067	2391078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018522	TGCATA	2	12	2397865	2397876	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018522	GGGCAA	2	12	2408502	2408513	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018522	GCGCTG	2	12	2424993	2425004	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018522	CTTTTT	2	12	2426403	2426414	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018522	AACATA	2	12	2459685	2459696	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018522	GAGGCA	2	12	2480258	2480269	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018522	CGCCAG	2	12	2498493	2498504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018522	CCTTAG	2	12	2567078	2567089	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018522	TTATGT	2	12	2567474	2567485	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018522	GAGATT	2	12	2571786	2571797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018522	GCTTTG	2	12	2667209	2667220	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018522	ATTACT	2	12	2800356	2800367	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018522	ATCCTG	2	12	2823989	2824000	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018522	AAAATA	2	12	2890239	2890250	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018522	TAAAAA	2	12	2899845	2899856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018522	GACCGC	2	12	2913903	2913914	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018522	CAGTGA	2	12	2914000	2914011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018522	GGGCTG	2	12	2949778	2949789	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018522	GTTTTT	2	12	2977587	2977598	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018522	TTCCAG	2	12	3029782	3029793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018522	CGCCGT	2	12	3056902	3056913	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018522	CTTTCC	2	12	3121441	3121452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018522	GCTGGC	2	12	3141884	3141895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018522	GGCATC	2	12	3148247	3148258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018522	TAAAAA	2	12	3232697	3232708	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018522	ATCAAA	2	12	3246745	3246756	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018522	AGCCTC	2	12	3249112	3249123	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018522	GAAGCG	2	12	3254244	3254255	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018522	TTGTGT	2	12	3256341	3256352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018522	TCCTTT	2	12	3257913	3257924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018522	GCTGGT	2	12	3258382	3258393	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_018522	TCGGAT	2	12	3258993	3259004	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_018522	CTGAGG	2	12	3260506	3260517	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_018522	GAAAAG	2	12	3267048	3267059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018522	CCAGAC	2	12	3393908	3393919	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018522	AGGTGA	2	12	3425649	3425660	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018522	CCTTTG	2	12	3427590	3427601	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018522	GGAGAT	2	12	3541961	3541972	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018522	CACGTC	2	12	3566787	3566798	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018522	CAGCGC	2	12	3656421	3656432	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018522	ATTTTC	2	12	3687480	3687491	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_018522	AATTAA	2	12	3693868	3693879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018522	TGAGCA	2	12	3766139	3766150	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_018522	AGGGAG	2	12	3834337	3834348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018522	AGGGAG	2	12	3842597	3842608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018522	CGATAA	2	12	3852548	3852559	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_018522	TATCAT	2	12	3852564	3852575	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_018522	ATTTGC	2	12	3860851	3860862	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_018522	TTGGCC	2	12	3894436	3894447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018522	CATCGC	2	12	4010135	4010146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018522	CGGCAA	2	12	4042660	4042671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018522	ACGATC	2	12	4057400	4057411	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_018522	CAGGAA	2	12	4171749	4171760	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_018522	GAGCGC	2	12	4198643	4198654	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_018522	GCCTAC	2	12	4240443	4240454	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018522	TCGATA	2	12	4248968	4248979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_018522	AACAGA	2	12	4306197	4306208	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_018522	ATATTT	2	12	4413424	4413435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018522	ACACAA	2	12	4431894	4431905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_018522	ATAAAA	2	12	4472399	4472410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018522	CGCGCT	2	12	4486803	4486814	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
159	NC_018522	TCTCCC	2	12	4497746	4497757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_018522	CAGGGC	2	12	4498534	4498545	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_018522	ATCAGC	2	12	4544621	4544632	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_018522	ATCATT	2	12	4590011	4590022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_018522	ACAAAA	2	12	4667599	4667610	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_018522	TGAATA	2	12	4705268	4705279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018522	ATAAGG	2	12	4706370	4706381	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018522	CGCGGG	2	12	4708282	4708293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_018522	CAGCAA	2	12	4708940	4708951	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_018522	ATTTTT	2	12	4770332	4770343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_018522	ATTTTA	2	12	5087860	5087871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_018522	CAGCCT	2	12	5125364	5125375	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
182	NC_018522	TAAAGG	2	12	5158993	5159004	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.