MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_R1

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018107	GAGCGG	2	12	1762	1773	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018107	AGCTTA	2	12	32571	32582	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018107	TGAAGC	2	12	45472	45483	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018107	ACAGAA	2	12	56305	56316	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018107	TCAAGT	2	12	56737	56748	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018107	TGAGAA	2	12	59984	59995	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018107	GGAAAC	2	12	66689	66700	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018107	ACCGGA	2	12	73885	73896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018107	GCCAAT	2	12	74306	74317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018107	AATGCA	2	12	78909	78920	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018107	TCCCCG	2	12	82019	82030	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018107	CTTTGC	2	12	112298	112309	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018107	ATTTTA	2	12	117346	117357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018107	TATTAA	2	12	132997	133008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018107	TACTTT	2	12	139113	139124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018107	TATGTA	2	12	157456	157467	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018107	TGTAGA	2	12	166266	166277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018107	TTAGCC	2	12	172086	172097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018107	AAAGCA	2	12	178276	178287	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018107	ACACGT	2	12	180107	180118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018107	GATCAG	2	12	182043	182054	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018107	ACCAGA	2	12	184075	184086	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018107	AGCTCT	2	12	187277	187288	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018107	TAGTAA	2	12	191472	191483	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018107	ACTGGG	2	12	202403	202414	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018107	TTTGAT	2	12	202461	202472	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018107	TCAGCT	2	12	204729	204740	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018107	ACTCTC	2	12	212625	212636	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018107	TGGTAA	2	12	222460	222471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018107	TTTTCT	2	12	233794	233805	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018107	GAGCTG	2	12	234735	234746	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018107	GTTTTC	2	12	248362	248373	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018107	AGCAAC	2	12	250670	250681	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018107	TGGTTT	2	12	251667	251678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018107	CATGCT	2	12	256919	256930	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018107	TTTATC	2	12	258410	258421	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018107	CAGAAA	2	12	260527	260538	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018107	CAAAGA	2	12	261019	261030	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018107	CAATTT	2	12	267589	267600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018107	CAGTAT	2	12	274178	274189	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018107	CAGACT	2	12	276284	276295	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018107	TGTTAA	2	12	282156	282167	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018107	TATGGT	2	12	290663	290674	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018107	CAAAAA	2	12	294176	294187	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018107	TTTCAT	2	12	295861	295872	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018107	TTCATA	2	12	300828	300839	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018107	TCCTGC	2	12	304013	304024	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018107	TGCCGC	2	12	309144	309155	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018107	CTGGCG	2	12	319100	319111	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018107	AATATT	2	12	331432	331443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018107	AAAGTA	2	12	348003	348014	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.