MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_R1

Total Repeats: 495

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018107	GCAG	2	8	1975	1982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018107	TTTG	2	8	2605	2612	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018107	TCTG	2	8	3947	3954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018107	TCCC	2	8	3970	3977	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_018107	TAAT	2	8	4071	4078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018107	GCAG	2	8	4170	4177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018107	TACG	2	8	8753	8760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018107	CGGA	2	8	9060	9067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018107	CATA	2	8	9106	9113	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018107	GTCA	2	8	9164	9171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018107	GGCT	2	8	10310	10317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018107	CTGG	2	8	10412	10419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018107	GACT	2	8	10534	10541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018107	CGTC	2	8	10630	10637	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018107	CTGT	2	8	10908	10915	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018107	AAAT	2	8	14455	14462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018107	TAAT	2	8	14463	14470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018107	TCCT	2	8	21270	21277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018107	GTTC	2	8	22112	22119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018107	CGTG	2	8	27568	27575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018107	CAGC	2	8	27681	27688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018107	GGAC	2	8	27798	27805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018107	ACCT	2	8	28073	28080	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018107	CGAT	2	8	28110	28117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018107	GGCT	2	8	29075	29082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018107	AACC	2	8	33276	33283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018107	GATG	2	8	33567	33574	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018107	GGAG	2	8	34006	34013	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018107	TTCA	2	8	34336	34343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018107	GGGT	2	8	34464	34471	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018107	GACC	2	8	36860	36867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018107	CATC	2	8	36887	36894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018107	CAGC	2	8	36995	37002	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018107	CAGA	2	8	37189	37196	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018107	GCGT	2	8	37343	37350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018107	CTGA	2	8	37733	37740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018107	GAAT	2	8	41134	41141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018107	TGGT	2	8	45208	45215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018107	ATAA	2	8	45712	45719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018107	TGAA	2	8	45766	45773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018107	ACCA	2	8	49527	49534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018107	CTAC	2	8	50664	50671	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018107	TCTG	2	8	51002	51009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018107	GATG	2	8	51208	51215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018107	TAAA	2	8	52808	52815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018107	ATTG	2	8	53190	53197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018107	GATA	2	8	53286	53293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018107	CCCA	2	8	53602	53609	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_018107	TGGC	2	8	53661	53668	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018107	CCTT	2	8	55525	55532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018107	CCCG	2	8	56351	56358	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_018107	GTCA	2	8	57093	57100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018107	GCAG	2	8	57666	57673	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018107	TAAA	2	8	58152	58159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018107	CTGA	2	8	58346	58353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018107	AACT	2	8	59701	59708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018107	AATA	2	8	59729	59736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018107	TCCT	2	8	59824	59831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018107	TCCG	2	8	60802	60809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018107	AATA	2	8	60887	60894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018107	AGGC	3	12	61264	61275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018107	AAAC	2	8	61350	61357	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018107	CTTT	2	8	62301	62308	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018107	GCCA	2	8	62429	62436	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018107	TTAA	2	8	62569	62576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018107	AATC	2	8	62700	62707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018107	TCAG	2	8	62802	62809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018107	TAAT	2	8	64232	64239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018107	TATT	2	8	64376	64383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018107	AAGC	2	8	64546	64553	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018107	TTGA	2	8	65804	65811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018107	GAAA	2	8	66016	66023	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018107	TGAT	2	8	66207	66214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018107	TCAG	2	8	66328	66335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018107	CAGC	2	8	66580	66587	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018107	CCTG	2	8	66775	66782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018107	CATA	2	8	67511	67518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018107	ACAG	2	8	67765	67772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018107	CTAC	2	8	68446	68453	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018107	TGGC	2	8	68698	68705	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018107	AGTC	2	8	69203	69210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018107	ATCA	2	8	71827	71834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018107	GAAT	2	8	72688	72695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018107	GCCA	2	8	74395	74402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018107	TTAC	2	8	75599	75606	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018107	TAAT	2	8	75979	75986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018107	AAGG	2	8	76028	76035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018107	TTTA	2	8	77248	77255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018107	TTTG	2	8	77597	77604	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018107	GCTT	2	8	79175	79182	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018107	TGGG	2	8	79203	79210	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018107	CCGT	2	8	80564	80571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018107	CCGC	2	8	81014	81021	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_018107	GAGC	2	8	81038	81045	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018107	CGAA	2	8	81200	81207	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018107	TGCC	2	8	81640	81647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018107	CAGA	2	8	82718	82725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018107	CTGG	2	8	82742	82749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018107	TTAA	2	8	83086	83093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018107	GTAA	2	8	83198	83205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018107	AAAG	2	8	83597	83604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018107	GAAG	2	8	83718	83725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018107	AAGG	2	8	90311	90318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018107	TGAA	2	8	90464	90471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018107	CAGG	2	8	90498	90505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018107	AGAA	2	8	90598	90605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018107	AATA	2	8	90981	90988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018107	TTCG	2	8	91790	91797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018107	CTGA	2	8	91848	91855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018107	CAAC	2	8	92103	92110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018107	GATG	2	8	92474	92481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018107	AGTC	2	8	92613	92620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018107	TGGA	2	8	93342	93349	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018107	ACAG	2	8	104168	104175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018107	CTGA	2	8	104876	104883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018107	TGAA	2	8	104971	104978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018107	TGAT	2	8	105232	105239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018107	TGCC	2	8	105255	105262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018107	TGTC	2	8	105975	105982	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018107	TGTC	2	8	106086	106093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018107	TGCC	2	8	106214	106221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018107	TAAC	2	8	106339	106346	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018107	TATT	2	8	106584	106591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018107	GATT	2	8	106898	106905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018107	TGGC	2	8	107480	107487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018107	CGTT	2	8	108694	108701	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018107	GCTG	2	8	109305	109312	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018107	TATG	2	8	111929	111936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018107	GCCT	2	8	112428	112435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018107	TCGC	2	8	112527	112534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018107	ACAG	2	8	112591	112598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018107	TGCC	2	8	112662	112669	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018107	CTTG	2	8	113001	113008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018107	AGTC	2	8	113061	113068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018107	CAGA	2	8	113199	113206	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018107	ATAA	2	8	114641	114648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018107	TTAA	2	8	115004	115011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018107	CTAT	2	8	115311	115318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018107	TGAT	2	8	117446	117453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018107	GAAG	2	8	117630	117637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018107	CTTT	2	8	119268	119275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018107	TATG	2	8	119534	119541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018107	TTAA	2	8	119763	119770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018107	CTTT	2	8	120138	120145	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018107	CAGT	2	8	120387	120394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018107	TGAT	2	8	120486	120493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018107	CCAG	2	8	120656	120663	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018107	AGCT	2	8	120758	120765	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018107	CATT	2	8	121020	121027	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018107	AAAT	2	8	122842	122849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018107	GCTT	2	8	126301	126308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_018107	AAGG	2	8	130983	130990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018107	TGCC	2	8	132198	132205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_018107	GGCT	2	8	132380	132387	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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163	NC_018107	TCAA	2	8	135787	135794	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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449	NC_018107	ACTC	2	8	307028	307035	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
450	NC_018107	CCAG	2	8	307409	307416	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
451	NC_018107	GCGG	2	8	307718	307725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
452	NC_018107	CATG	2	8	307837	307844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
453	NC_018107	GCTT	2	8	309416	309423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_018107	GCGG	2	8	316792	316799	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
466	NC_018107	CAGC	2	8	317403	317410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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472	NC_018107	CTCC	2	8	323115	323122	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
473	NC_018107	TCTG	2	8	326010	326017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
474	NC_018107	ATTC	2	8	330406	330413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
475	NC_018107	ACGG	2	8	331302	331309	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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480	NC_018107	GCCC	2	8	335273	335280	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
481	NC_018107	GGGA	2	8	335289	335296	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
482	NC_018107	GGGA	2	8	335387	335394	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
483	NC_018107	GGGA	2	8	335485	335492	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
484	NC_018107	TGCG	2	8	336848	336855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_018107	CTGC	2	8	338432	338439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
486	NC_018107	CGAA	2	8	339533	339540	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
487	NC_018107	ATGC	2	8	346214	346221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_018107	ATTA	2	8	349698	349705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_018107	GGAA	2	8	353268	353275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
492	NC_018107	CCGA	2	8	353389	353396	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
493	NC_018107	GATT	2	8	353520	353527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
494	NC_018107	ATTG	2	8	353616	353623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
495	NC_018107	TTGA	2	8	353627	353634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.