MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella oxytoca E718 chromosome

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018106	AACGTT	2	12	60918	60929	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018106	CCACTG	2	12	156787	156798	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018106	CCTGCA	2	12	282457	282468	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018106	TTTTGA	2	12	283640	283651	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018106	GGTCTT	2	12	360958	360969	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018106	AAATAT	2	12	367726	367737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018106	CGGACT	2	12	411275	411286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018106	CCCCAT	2	12	421640	421651	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018106	GAACGA	2	12	432930	432941	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018106	TTTTTA	2	12	452649	452660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018106	TGTTTC	2	12	485587	485598	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018106	AATGAA	2	12	522889	522900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018106	ACGCTG	2	12	532293	532304	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018106	TTGATT	2	12	535077	535088	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018106	CGGTAG	2	12	540261	540272	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018106	GCGCTT	2	12	541158	541169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018106	GGCCTC	2	12	582888	582899	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018106	AGGGGG	2	12	584554	584565	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018106	CGTAAA	2	12	599189	599200	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018106	TTCAGT	2	12	603990	604001	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018106	ATTGGC	2	12	634865	634876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018106	ATGCCC	2	12	655816	655827	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018106	GTTTTT	2	12	691198	691209	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018106	ATTCCC	2	12	766737	766748	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018106	CCCGGA	2	12	767479	767490	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018106	TGTTAA	2	12	786345	786356	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018106	AATGAT	2	12	790916	790927	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018106	AAAGGA	2	12	846181	846192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018106	TATTAG	2	12	848275	848286	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018106	CAATAT	2	12	866976	866987	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018106	CCAGCA	2	12	907552	907563	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018106	ACTTGT	2	12	929469	929480	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018106	CGCCCG	2	12	1026537	1026548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018106	AGGGCA	2	12	1027210	1027221	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018106	TTTTAC	2	12	1058517	1058528	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018106	TGCAGT	2	12	1080429	1080440	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018106	ACGTTT	2	12	1126641	1126652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018106	GCGTTA	2	12	1162880	1162891	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018106	CCGACC	2	12	1194821	1194832	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_018106	ATAAAA	2	12	1198412	1198423	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018106	AGTCAG	2	12	1199619	1199630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018106	GTAAGC	2	12	1252979	1252990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018106	CCATCG	2	12	1339705	1339716	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018106	TGCTGA	2	12	1466702	1466713	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018106	TGATTT	2	12	1495656	1495667	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018106	CCACAC	2	12	1499579	1499590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018106	CTCTTT	2	12	1636847	1636858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018106	ATGATA	2	12	1691179	1691190	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018106	TTATCG	2	12	1691195	1691206	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018106	CATAAG	2	12	1736293	1736304	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018106	TGGCGG	2	12	1827872	1827883	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018106	TAAAAA	2	12	1858551	1858562	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018106	AAGAGA	2	12	1895153	1895164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018106	GCCAGC	2	12	1909532	1909543	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018106	GTTGCT	2	12	1941065	1941076	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018106	AACTGA	2	12	1998699	1998710	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018106	TAAGAA	2	12	2003405	2003416	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018106	TCTTGC	2	12	2048713	2048724	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018106	CGTGCT	2	12	2053503	2053514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018106	AACGTT	2	12	2072187	2072198	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018106	TGAGCC	2	12	2127818	2127829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018106	CCGCAG	2	12	2128809	2128820	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018106	AGCGAA	2	12	2130120	2130131	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018106	TTTATT	2	12	2180806	2180817	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018106	CGGATG	2	12	2219980	2219991	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018106	GTGCAG	2	12	2225365	2225376	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018106	ATCGGC	2	12	2225581	2225592	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018106	AGGCTC	2	12	2225708	2225719	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018106	GCTGGA	2	12	2226174	2226185	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018106	ATAAAA	2	12	2232066	2232077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018106	TTACCT	2	12	2242257	2242268	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018106	TCAAAA	2	12	2243009	2243020	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018106	ACTGGC	2	12	2243170	2243181	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018106	TACCCG	2	12	2251076	2251087	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018106	TGCCGT	2	12	2268151	2268162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018106	GATGGT	2	12	2284332	2284343	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018106	GAGATC	2	12	2349274	2349285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018106	CTTTGG	2	12	2364735	2364746	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018106	AATAAG	2	12	2428777	2428788	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018106	CGTTAT	2	12	2474294	2474305	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018106	GGCAGA	2	12	2550785	2550796	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018106	GAGAAT	2	12	2570220	2570231	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018106	GAGAAA	2	12	2604168	2604179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018106	TTGCTG	2	12	2651069	2651080	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018106	GGCCAG	2	12	2651884	2651895	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018106	CATTTC	2	12	2689080	2689091	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018106	ATCGGG	2	12	2742983	2742994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018106	CTCTTT	2	12	2820479	2820490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018106	CGGGTT	2	12	2820709	2820720	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018106	CGGGAT	2	12	2823580	2823591	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018106	GTGATC	2	12	2829644	2829655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018106	CGCCCG	2	12	2838176	2838187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018106	CTACGG	2	12	2844006	2844017	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018106	GTTGAA	2	12	2887699	2887710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018106	GGGGGA	2	12	2897619	2897630	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018106	AACATA	2	12	2957028	2957039	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018106	GCCAAT	2	12	2972196	2972207	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018106	GGATTT	2	12	2988284	2988295	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018106	CTTTAT	2	12	3014060	3014071	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018106	CAATGC	2	12	3018888	3018899	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018106	GGGATG	2	12	3033802	3033813	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018106	CTTTAA	2	12	3143430	3143441	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018106	CTGCGC	2	12	3151592	3151603	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018106	TAATTT	2	12	3245704	3245715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018106	ATCATT	2	12	3251037	3251048	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018106	GCGACA	2	12	3264903	3264914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018106	TCTTCA	2	12	3324331	3324342	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018106	ACGATT	2	12	3332294	3332305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018106	ATCCTG	2	12	3366776	3366787	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018106	CGATAA	2	12	3395302	3395313	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018106	AACAGG	2	12	3421315	3421326	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018106	TTTTGA	2	12	3426505	3426516	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018106	TCCCAC	2	12	3538647	3538658	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_018106	AAACAT	2	12	3542325	3542336	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018106	TCGCCG	2	12	3627280	3627291	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018106	AAATCG	2	12	3627325	3627336	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018106	GATATT	2	12	3631621	3631632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018106	CAAAAA	2	12	3633154	3633165	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018106	GGTTAT	2	12	3647666	3647677	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018106	CTTCCC	2	12	3653138	3653149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_018106	ATTGCG	2	12	3662517	3662528	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018106	GGGTAT	2	12	3694283	3694294	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018106	AAGGAT	2	12	3732388	3732399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.