MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae KCTC 2242 plasmid pKCTC2242

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017541	TAACG	2	10	273	282	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017541	TTTGA	2	10	652	661	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017541	TTTTA	2	10	6434	6443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017541	TAATC	2	10	15644	15653	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017541	TATTT	2	10	16691	16700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017541	TTCTT	2	10	21348	21357	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017541	CCAGA	2	10	31256	31265	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017541	TAGAA	2	10	32552	32561	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017541	GTCAT	2	10	34616	34625	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017541	GATCA	2	10	41206	41215	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017541	GCAGG	2	10	46045	46054	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017541	GCATG	2	10	48984	48993	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017541	AAATT	2	10	49104	49113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017541	AGAAA	2	10	49135	49144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017541	TTCAT	2	10	64098	64107	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017541	TAATT	2	10	64126	64135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017541	TGACC	2	10	64329	64338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017541	TGAAA	2	10	64874	64883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017541	GTGTT	2	10	78621	78630	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017541	GCGTC	2	10	81371	81380	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017541	ACTGG	2	10	81561	81570	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017541	TAACA	2	10	90166	90175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017541	GCCCT	2	10	100621	100630	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_017541	ATTAA	2	10	111734	111743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017541	ATAAA	2	10	113978	113987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017541	ATGTC	2	10	118767	118776	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017541	GATCA	2	10	118847	118856	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017541	CGTTA	2	10	121762	121771	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017541	TTTTC	2	10	122145	122154	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017541	CAGGC	2	10	125987	125996	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017541	CTGTG	2	10	141328	141337	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017541	GATCA	2	10	141540	141549	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017541	GCAAA	2	10	141582	141591	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017541	CGTAT	2	10	146803	146812	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017541	CAGTG	2	10	161223	161232	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017541	GATCA	2	10	171920	171929	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017541	AGGGG	2	10	174610	174619	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017541	CGAGG	2	10	177475	177484	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017541	GGGGA	2	10	180436	180445	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017541	CTTAA	2	10	184953	184962	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.