MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae KCTC 2242 chromosome

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017540	TTTTTG	2	12	185	196	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017540	TAAAAT	2	12	2026	2037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017540	GGCGAC	2	12	31451	31462	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017540	GGTCTT	2	12	80729	80740	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017540	CGACGT	2	12	80777	80788	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017540	TTCCAC	2	12	83583	83594	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017540	TCGGCG	2	12	100806	100817	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017540	AGGATG	2	12	139281	139292	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017540	CGGACT	2	12	142900	142911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017540	CGGACT	2	12	143063	143074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017540	ATAGAG	2	12	162096	162107	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017540	TATTGA	2	12	166647	166658	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017540	TGATAG	2	12	205151	205162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017540	CCCTCA	2	12	261685	261696	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017540	GTGGTA	2	12	266070	266081	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017540	GGCTGG	2	12	285433	285444	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017540	GTATTT	2	12	309692	309703	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017540	TCCCTC	2	12	314799	314810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017540	AGGGTG	2	12	314823	314834	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017540	CGCTGT	2	12	323767	323778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017540	TCCTTA	2	12	351685	351696	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017540	TATTCA	2	12	352778	352789	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017540	ATAATT	2	12	364642	364653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017540	ATGCTG	2	12	416734	416745	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017540	CTGCGG	2	12	450912	450923	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017540	GCGCCA	2	12	450998	451009	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017540	AATGAT	2	12	481578	481589	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017540	GCTGAT	2	12	527166	527177	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017540	GCCCTG	2	12	585325	585336	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017540	AGCGCG	2	12	597058	597069	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017540	AAATTA	2	12	606114	606125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017540	TTTTTA	2	12	611463	611474	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017540	AAATAT	2	12	670690	670701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017540	CTCTTC	2	12	702113	702124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017540	CGGCGC	2	12	824021	824032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017540	ATATCG	2	12	837276	837287	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017540	TTCCTG	2	12	904332	904343	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017540	AAGACA	2	12	985411	985422	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017540	GGCGAT	2	12	1089757	1089768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017540	TTATTT	2	12	1102244	1102255	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017540	CGCTCA	2	12	1147535	1147546	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017540	TCCCTC	2	12	1168321	1168332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017540	GAGGGT	2	12	1188925	1188936	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017540	GGCCAA	2	12	1206437	1206448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017540	TCCCTC	2	12	1209573	1209584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017540	GTCGCC	2	12	1209720	1209731	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017540	GGATTT	2	12	1220047	1220058	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017540	ACAAAA	2	12	1235097	1235108	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017540	TGCAAA	2	12	1240227	1240238	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017540	TTATCG	2	12	1248531	1248542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017540	CTCCCT	2	12	1267019	1267030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017540	ATTGTG	2	12	1329121	1329132	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017540	TGCTCA	2	12	1335222	1335233	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017540	GAAAAA	2	12	1339463	1339474	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017540	TGAAAA	2	12	1414104	1414115	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017540	CCTGCC	2	12	1518348	1518359	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017540	TTAATA	2	12	1524410	1524421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017540	GACGTG	2	12	1570517	1570528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017540	ATCTCC	2	12	1595338	1595349	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017540	TATACA	2	12	1698231	1698242	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017540	GGGTCA	2	12	1710573	1710584	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017540	GTAATG	2	12	1713388	1713399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017540	TCTTAT	2	12	1714593	1714604	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017540	CAAAGG	2	12	1716388	1716399	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017540	AGGGAG	2	12	1733832	1733843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017540	ATCGTC	2	12	1830549	1830560	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017540	GTATGG	2	12	1886837	1886848	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017540	ATTTTC	2	12	1900613	1900624	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017540	GATGCC	2	12	1929868	1929879	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017540	TGGTTG	2	12	1932297	1932308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017540	GGGAAA	2	12	1956673	1956684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017540	GGCGCG	2	12	1964508	1964519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017540	AAGGAG	2	12	1998746	1998757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017540	AGGGCG	2	12	2028701	2028712	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017540	CAGCCC	2	12	2100224	2100235	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017540	TGGCGC	2	12	2102761	2102772	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017540	TCACTG	2	12	2145969	2145980	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017540	GCGGTC	2	12	2146066	2146077	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017540	GATCAA	2	12	2221889	2221900	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017540	TTGCGC	2	12	2270595	2270606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017540	ATCTTT	2	12	2270952	2270963	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017540	GAGTAG	2	12	2386185	2386196	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017540	TGCCGC	2	12	2387551	2387562	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017540	ATCTGT	2	12	2400252	2400263	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017540	ATCGAT	2	12	2476290	2476301	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017540	TCACCC	2	12	2489863	2489874	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017540	AATCTC	2	12	2507477	2507488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017540	ACATAA	2	12	2511789	2511800	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017540	GCTAAG	2	12	2512184	2512195	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017540	TTTCCC	2	12	2536387	2536398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017540	GCCAGC	2	12	2584641	2584652	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017540	CCAGCA	2	12	2584804	2584815	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017540	CTGGCG	2	12	2590572	2590583	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017540	TGCCTC	2	12	2608804	2608815	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017540	TATGTT	2	12	2629381	2629392	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017540	AAAAAG	2	12	2662756	2662767	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017540	CAGCGC	2	12	2664166	2664177	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017540	GTGTAA	2	12	2750474	2750485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017540	ACATAA	2	12	2757539	2757550	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017540	GCGGTG	2	12	2775926	2775937	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017540	CCAGCA	2	12	2776089	2776100	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017540	CGTCAT	2	12	2779355	2779366	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017540	CTGCCG	2	12	2781737	2781748	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017540	TGCTCA	2	12	2823081	2823092	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017540	ATCGTT	2	12	2842945	2842956	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017540	GGGTAT	2	12	2925231	2925242	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017540	TTAAGT	2	12	2942509	2942520	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017540	TTATAA	2	12	2942716	2942727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017540	AAAACT	2	12	2970626	2970637	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017540	ATATTT	2	12	2980334	2980345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017540	TAAATA	2	12	2980350	2980361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017540	GAATAA	2	12	3053451	3053462	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017540	AGATAA	2	12	3069957	3069968	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017540	CGCTTG	2	12	3082073	3082084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017540	CGTTTT	2	12	3097071	3097082	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017540	AAAATA	2	12	3112276	3112287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017540	AGCGTC	2	12	3158176	3158187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017540	GATTCG	2	12	3196499	3196510	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017540	ATTCTT	2	12	3217214	3217225	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017540	AATGAG	2	12	3251605	3251616	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017540	GAAAGT	2	12	3347763	3347774	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017540	TCTCGT	2	12	3370356	3370367	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017540	GCAAAA	2	12	3398923	3398934	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017540	CATTAA	2	12	3464300	3464311	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017540	GGGGAG	2	12	3466462	3466473	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017540	AGAAAA	2	12	3487998	3488009	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.