MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 chromosome

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016845	CAGAGA	2	12	149347	149358	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016845	CCTTTA	2	12	193383	193394	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016845	AGGCTG	2	12	227061	227072	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016845	AAATTA	2	12	264462	264473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016845	GGCGAC	2	12	293886	293897	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016845	GGTCTT	2	12	343163	343174	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016845	CGACGT	2	12	343211	343222	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016845	AGGATG	2	12	402923	402934	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016845	CGGACT	2	12	405094	405105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016845	TGATAG	2	12	467188	467199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016845	CCCTCA	2	12	520069	520080	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016845	GTGGTA	2	12	524455	524466	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016845	TCCCTC	2	12	572687	572698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016845	GATGAC	2	12	572719	572730	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016845	TTTTTG	2	12	632298	632309	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016845	AATGAT	2	12	715077	715088	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016845	GCTGAT	2	12	760465	760476	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016845	GCCCTG	2	12	818589	818600	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016845	AAATAT	2	12	906244	906255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016845	CTCTTC	2	12	937667	937678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016845	TTCTGT	2	12	1013471	1013482	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016845	ATATCG	2	12	1075902	1075913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016845	TTCCTG	2	12	1152214	1152225	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016845	AAGACA	2	12	1233308	1233319	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016845	TGCTGA	2	12	1293775	1293786	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016845	GGTTGT	2	12	1295004	1295015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016845	AATCAA	2	12	1312053	1312064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016845	GAGGAT	2	12	1312144	1312155	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016845	GTAAAG	2	12	1312346	1312357	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016845	GACAAG	2	12	1316267	1316278	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016845	AGCTTG	2	12	1328266	1328277	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016845	AATAAA	2	12	1328441	1328452	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016845	CTTTTT	2	12	1328771	1328782	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016845	GGCGAT	2	12	1340769	1340780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016845	TTATTT	2	12	1353263	1353274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016845	TTCCCT	2	12	1427057	1427068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016845	AGGGTG	2	12	1447659	1447670	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016845	GGCCAA	2	12	1459369	1459380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016845	TCCCTC	2	12	1460940	1460951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016845	GGATTT	2	12	1471416	1471427	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016845	ACAAAA	2	12	1486464	1486475	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016845	TGCAAA	2	12	1491594	1491605	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016845	TTATCG	2	12	1499898	1499909	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016845	CTCCCT	2	12	1519678	1519689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016845	ATTGTG	2	12	1581778	1581789	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016845	TGCTCA	2	12	1587879	1587890	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016845	GAAAAA	2	12	1592120	1592131	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016845	TGAAAA	2	12	1666599	1666610	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016845	GCCAGC	2	12	1690967	1690978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016845	CCTGCC	2	12	1763325	1763336	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_016845	TTAATA	2	12	1769372	1769383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016845	GACGTG	2	12	1810657	1810668	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016845	ATCTCC	2	12	1835435	1835446	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016845	CAAAGG	2	12	1949842	1949853	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016845	AGGGAG	2	12	1967334	1967345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016845	ATCGTC	2	12	2063651	2063662	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016845	CTTTTC	2	12	2083597	2083608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016845	GATGCC	2	12	2156224	2156235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016845	GGGAAA	2	12	2183019	2183030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016845	GGCGCG	2	12	2190854	2190865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016845	AAGGAG	2	12	2230049	2230060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016845	CTGCGC	2	12	2324735	2324746	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016845	CAGCCC	2	12	2377209	2377220	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016845	TGGCGC	2	12	2379746	2379757	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016845	TCACTG	2	12	2412999	2413010	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016845	GCGGTC	2	12	2413096	2413107	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016845	GATCAA	2	12	2488806	2488817	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016845	CAGGAT	2	12	2511202	2511213	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016845	TAGTAA	2	12	2534813	2534824	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016845	ATCTTT	2	12	2536755	2536766	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016845	GAGTAG	2	12	2653525	2653536	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016845	AAACAA	2	12	2658234	2658245	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016845	CCGGCG	2	12	2671425	2671436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016845	ATCTGT	2	12	2674444	2674455	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016845	CAAAGC	2	12	2684411	2684422	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016845	AATCTC	2	12	2781284	2781295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016845	ACATAA	2	12	2785595	2785606	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016845	GCTAAG	2	12	2785990	2786001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016845	AACATT	2	12	2805897	2805908	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016845	TTTCCC	2	12	2818068	2818079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016845	CTGGCG	2	12	2879100	2879111	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016845	TGCCTC	2	12	2897326	2897337	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016845	TATGTT	2	12	2917941	2917952	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016845	AAAAAG	2	12	2951320	2951331	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016845	CAGCGC	2	12	2952729	2952740	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016845	CCAGCG	2	12	2972137	2972148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016845	GCCAGC	2	12	3001807	3001818	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016845	TGTAAG	2	12	3029131	3029142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016845	GCTGGC	2	12	3040219	3040230	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016845	CGTCAT	2	12	3060179	3060190	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016845	CTGCCG	2	12	3062561	3062572	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016845	ACGTGC	2	12	3159936	3159947	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016845	GGGTAT	2	12	3201207	3201218	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016845	TTATAA	2	12	3218691	3218702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016845	AAACCA	2	12	3247821	3247832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016845	AGATAA	2	12	3353224	3353235	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016845	CGCTTG	2	12	3365338	3365349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016845	CGTTTT	2	12	3380336	3380347	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016845	CGATCC	2	12	3428239	3428250	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016845	GGCAAA	2	12	3498869	3498880	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016845	AGCGTC	2	12	3504442	3504453	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016845	GATTCG	2	12	3523421	3523432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016845	GCTGCG	2	12	3532574	3532585	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016845	AATTAA	2	12	3563929	3563940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016845	AATGAG	2	12	3577811	3577822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016845	GAAAGT	2	12	3675162	3675173	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016845	TCTCGT	2	12	3696307	3696318	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016845	GCAAAA	2	12	3724872	3724883	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016845	CATTAA	2	12	3782867	3782878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016845	GGGGAG	2	12	3785029	3785040	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016845	AGAAAA	2	12	3806560	3806571	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016845	TCATTG	2	12	3834381	3834392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_016845	AAAAAC	2	12	3853628	3853639	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016845	AGCCAC	2	12	3887931	3887942	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016845	GCGCCG	2	12	3901707	3901718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016845	GCAGGG	2	12	4029062	4029073	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016845	GCTGGC	2	12	4103217	4103228	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016845	GGTTTA	2	12	4105176	4105187	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016845	TCGACA	2	12	4165823	4165834	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016845	GTAAGC	2	12	4238251	4238262	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016845	TTGCTA	2	12	4377532	4377543	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016845	CGCTCG	2	12	4389855	4389866	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016845	TTCACT	2	12	4430878	4430889	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016845	TCGGCA	2	12	4441594	4441605	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016845	ATTAAC	2	12	4441770	4441781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_016845	CTGTAT	2	12	4454817	4454828	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_016845	AACAAA	2	12	4524761	4524772	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_016845	AGTCCG	2	12	4558956	4558967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016845	AGTCCG	2	12	4559119	4559130	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016845	ATTTTA	2	12	4560394	4560405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016845	AGTTGT	2	12	4626900	4626911	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016845	CGATCC	2	12	4650600	4650611	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016845	AATGAT	2	12	4656836	4656847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016845	CCCTCT	2	12	4659233	4659244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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149	NC_016845	TTCCTG	2	12	5161333	5161344	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_016845	ATGGAA	2	12	5170280	5170291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.