MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 chromosome

Total Repeats: 13459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016845	C	6	6	5123271	5123276	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13002	NC_016845	CAA	2	6	5123296	5123301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_016845	GCG	2	6	5123305	5123310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_016845	CCT	2	6	5123320	5123325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13005	NC_016845	CCTG	2	8	5123340	5123347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13006	NC_016845	CAA	2	6	5123976	5123981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_016845	CAA	2	6	5123990	5123995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_016845	GCC	2	6	5124052	5124057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13009	NC_016845	TAA	2	6	5125593	5125598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_016845	A	6	6	5125685	5125690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_016845	GCG	2	6	5125763	5125768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_016845	C	6	6	5125773	5125778	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13013	NC_016845	CAAA	2	8	5125804	5125811	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13014	NC_016845	CAA	2	6	5125812	5125817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_016845	CA	3	6	5125846	5125851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13016	NC_016845	TGT	2	6	5125883	5125888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_016845	T	7	7	5125888	5125894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_016845	ATC	3	9	5125911	5125919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_016845	A	6	6	5125923	5125928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_016845	GCTG	2	8	5125976	5125983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13021	NC_016845	ATCA	2	8	5126018	5126025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13022	NC_016845	GCC	2	6	5126042	5126047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13023	NC_016845	AAC	2	6	5126053	5126058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_016845	GC	3	6	5126079	5126084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13025	NC_016845	AGA	2	6	5126095	5126100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_016845	TCC	2	6	5130082	5130087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_016845	AAT	2	6	5130095	5130100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_016845	GAAAT	2	10	5130171	5130180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_016845	TAA	2	6	5130205	5130210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_016845	ATT	2	6	5130218	5130223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_016845	CAA	2	6	5130284	5130289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_016845	TTA	2	6	5130329	5130334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_016845	CCAA	2	8	5130791	5130798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13034	NC_016845	CATT	2	8	5130881	5130888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13035	NC_016845	TCA	2	6	5130890	5130895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_016845	TGG	2	6	5130934	5130939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_016845	CTC	2	6	5130966	5130971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13038	NC_016845	GGC	2	6	5130976	5130981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_016845	CGC	2	6	5134627	5134632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13040	NC_016845	C	6	6	5134677	5134682	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13041	NC_016845	AGC	2	6	5135233	5135238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_016845	GC	3	6	5137686	5137691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13043	NC_016845	TGT	2	6	5137960	5137965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_016845	CGC	2	6	5137982	5137987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13045	NC_016845	CGG	2	6	5138028	5138033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_016845	CAC	2	6	5138037	5138042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13047	NC_016845	G	6	6	5138485	5138490	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_016845	A	7	7	5138513	5138519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_016845	ATGTA	2	10	5138571	5138580	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_016845	GCGG	2	8	5138587	5138594	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13051	NC_016845	A	7	7	5138600	5138606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_016845	CGGCC	2	10	5138628	5138637	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13053	NC_016845	CTTT	2	8	5138643	5138650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13054	NC_016845	GTA	2	6	5138682	5138687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_016845	CAG	2	6	5143250	5143255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_016845	GC	3	6	5143256	5143261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13057	NC_016845	AC	3	6	5143329	5143334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_016845	T	6	6	5143437	5143442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_016845	GAT	2	6	5145762	5145767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_016845	TGAA	2	8	5145775	5145782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_016845	GCA	2	6	5145789	5145794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_016845	TGATA	2	10	5145852	5145861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_016845	TGG	2	6	5146866	5146871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_016845	TCA	2	6	5151712	5151717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_016845	TTG	2	6	5151726	5151731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_016845	TC	3	6	5154167	5154172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13067	NC_016845	TCTG	2	8	5154175	5154182	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13068	NC_016845	GAA	2	6	5154214	5154219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_016845	GTTA	2	8	5157528	5157535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_016845	GCA	2	6	5161195	5161200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_016845	CGC	2	6	5161204	5161209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13072	NC_016845	CCA	2	6	5161288	5161293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13073	NC_016845	TTCCTG	2	12	5161333	5161344	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_016845	TCC	2	6	5162163	5162168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13075	NC_016845	A	6	6	5162249	5162254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_016845	CCG	2	6	5162257	5162262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13077	NC_016845	AGG	2	6	5162281	5162286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_016845	ATTT	2	8	5162462	5162469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_016845	GTA	2	6	5162861	5162866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_016845	CCT	2	6	5163604	5163609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13081	NC_016845	CCG	2	6	5163654	5163659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13082	NC_016845	ACG	2	6	5163707	5163712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_016845	TCT	3	9	5166144	5166152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_016845	TCA	2	6	5166855	5166860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_016845	GC	3	6	5166871	5166876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13086	NC_016845	TGA	2	6	5166892	5166897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_016845	A	8	8	5166910	5166917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_016845	TA	3	6	5169481	5169486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_016845	AAGT	2	8	5169500	5169507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_016845	T	9	9	5169564	5169572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_016845	T	6	6	5169574	5169579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_016845	CAC	2	6	5170243	5170248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13093	NC_016845	AGGA	2	8	5170266	5170273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_016845	ATGGAA	2	12	5170280	5170291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_016845	CAT	2	6	5170316	5170321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_016845	CGCT	2	8	5171591	5171598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13097	NC_016845	ATC	2	6	5171612	5171617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_016845	CAAAA	2	10	5173411	5173420	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13099	NC_016845	TAAT	2	8	5173431	5173438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_016845	ACA	2	6	5173439	5173444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_016845	TAA	2	6	5173478	5173483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_016845	A	8	8	5173502	5173509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_016845	CATA	2	8	5173510	5173517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13104	NC_016845	TGG	2	6	5173548	5173553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_016845	CCGC	2	8	5173771	5173778	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13106	NC_016845	CATT	2	8	5173795	5173802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13107	NC_016845	GA	3	6	5174859	5174864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_016845	CCCT	2	8	5176701	5176708	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13109	NC_016845	TAC	2	6	5178151	5178156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_016845	G	6	6	5178248	5178253	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_016845	CTC	2	6	5180567	5180572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13112	NC_016845	CTG	2	6	5180591	5180596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_016845	GGCA	2	8	5180695	5180702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13114	NC_016845	GAAA	2	8	5180707	5180714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_016845	CGC	2	6	5180747	5180752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13116	NC_016845	ATA	2	6	5180763	5180768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_016845	TTC	2	6	5181468	5181473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_016845	CA	3	6	5181771	5181776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13119	NC_016845	TC	3	6	5187759	5187764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13120	NC_016845	TTC	2	6	5187795	5187800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_016845	ATC	3	9	5189087	5189095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_016845	CGT	2	6	5189116	5189121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_016845	CAG	2	6	5189160	5189165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_016845	A	7	7	5189168	5189174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_016845	ACG	2	6	5189178	5189183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_016845	AAAGC	2	10	5189793	5189802	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13127	NC_016845	TGC	2	6	5189841	5189846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13128	NC_016845	GGC	2	6	5189854	5189859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_016845	TGAC	2	8	5190700	5190707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13131	NC_016845	T	7	7	5192079	5192085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13392	NC_016845	TGT	2	6	5301004	5301009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13393	NC_016845	TTC	2	6	5302626	5302631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13394	NC_016845	TAC	2	6	5302674	5302679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13395	NC_016845	GCC	2	6	5302707	5302712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13396	NC_016845	ATT	2	6	5302727	5302732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13397	NC_016845	T	6	6	5302784	5302789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13400	NC_016845	TCAC	2	8	5304194	5304201	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13409	NC_016845	GCT	2	6	5307226	5307231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13412	NC_016845	TGCG	2	8	5308450	5308457	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13413	NC_016845	C	7	7	5310664	5310670	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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13417	NC_016845	TAAA	2	8	5314337	5314344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13422	NC_016845	GAA	2	6	5314449	5314454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13423	NC_016845	ATT	2	6	5314526	5314531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13424	NC_016845	A	6	6	5314546	5314551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13425	NC_016845	CTG	2	6	5314588	5314593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13428	NC_016845	A	6	6	5316379	5316384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13429	NC_016845	GGGC	2	8	5318314	5318321	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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13431	NC_016845	ATA	2	6	5319535	5319540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13432	NC_016845	AAT	2	6	5319589	5319594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13433	NC_016845	GCCA	2	8	5319648	5319655	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13437	NC_016845	AG	3	6	5321653	5321658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13438	NC_016845	CTGC	2	8	5321678	5321685	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13444	NC_016845	CTCC	2	8	5328676	5328683	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.