MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella oxytoca KCTC 1686 chromosome

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016612	TTTTCT	2	12	39509	39520	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016612	AATTAA	2	12	46558	46569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016612	TTTATA	2	12	76401	76412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016612	CTGGCG	2	12	115616	115627	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016612	TAGTTA	2	12	241532	241543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016612	TCTGGC	2	12	260825	260836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016612	CGCCAT	2	12	311308	311319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016612	GTTAAC	2	12	386042	386053	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016612	AAAATT	2	12	407593	407604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016612	CGCTGA	2	12	522226	522237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016612	CTGTAT	2	12	548419	548430	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016612	AATATC	2	12	574120	574131	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016612	AATAAA	2	12	574165	574176	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016612	TAAACA	2	12	593477	593488	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016612	ATTAAT	2	12	632740	632751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016612	TCGCTT	2	12	633404	633415	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016612	AGTTGT	2	12	658347	658358	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016612	TCTTAT	2	12	662532	662543	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016612	TGGGGA	2	12	672219	672230	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016612	CGGCGA	2	12	672724	672735	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016612	TCTCCC	2	12	701414	701425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_016612	GAAAAA	2	12	777941	777952	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016612	AGCGGG	2	12	944603	944614	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016612	CGTTAG	2	12	960825	960836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016612	AAAATG	2	12	1047404	1047415	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016612	CTGGCA	2	12	1103899	1103910	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016612	ACTGAA	2	12	1109214	1109225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016612	ACCGCT	2	12	1148653	1148664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016612	CGGCGT	2	12	1194671	1194682	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016612	TGTGAG	2	12	1197452	1197463	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016612	GGCGCA	2	12	1201529	1201540	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016612	ATAAAT	2	12	1288479	1288490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016612	TATTTT	2	12	1387031	1387042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016612	TCATTT	2	12	1481176	1481187	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016612	CAGCAC	2	12	1581017	1581028	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016612	CCACTG	2	12	1583277	1583288	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016612	CGGTTT	2	12	1683593	1683604	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016612	TTATCC	2	12	1708325	1708336	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016612	CCTGCA	2	12	1708847	1708858	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016612	TTTTGA	2	12	1710030	1710041	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016612	TTTTTA	2	12	1779755	1779766	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016612	GGTCTT	2	12	1787392	1787403	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016612	AAATAT	2	12	1794161	1794172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016612	CGGACT	2	12	1833464	1833475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016612	CGGACT	2	12	1833627	1833638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016612	CCCCAT	2	12	1843994	1844005	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_016612	GAACGA	2	12	1855285	1855296	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016612	TTTTTA	2	12	1875104	1875115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016612	TGTTTC	2	12	1908047	1908058	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016612	AATGAA	2	12	1945347	1945358	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016612	TTGATT	2	12	1957535	1957546	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016612	GCGCTT	2	12	1963605	1963616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016612	GGCCTC	2	12	2005801	2005812	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016612	AGGGGG	2	12	2007467	2007478	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016612	ATACTT	2	12	2024818	2024829	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016612	GGTAAG	2	12	2040123	2040134	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016612	AAAATG	2	12	2048476	2048487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016612	ATGCCC	2	12	2050687	2050698	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016612	AAAATA	2	12	2073764	2073775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016612	AAGCGC	2	12	2114940	2114951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016612	AATGAT	2	12	2184209	2184220	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016612	AAAGGA	2	12	2239478	2239489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016612	TATTAG	2	12	2243659	2243670	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016612	CAATAT	2	12	2262359	2262370	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016612	ACTTGT	2	12	2324856	2324867	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016612	TTTTAC	2	12	2453890	2453901	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016612	TGCAGT	2	12	2475802	2475813	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016612	ACGTTT	2	12	2521925	2521936	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016612	GATCAG	2	12	2604772	2604783	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016612	GTAAGC	2	12	2647438	2647449	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016612	ATTTTT	2	12	2733290	2733301	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016612	GCGAAA	2	12	2934016	2934027	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016612	CTCTTT	2	12	2963388	2963399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016612	ATGATA	2	12	3017733	3017744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016612	TTATCG	2	12	3017749	3017760	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016612	CATAAG	2	12	3063094	3063105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016612	TAAAAA	2	12	3185676	3185687	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016612	AAGAGA	2	12	3222278	3222289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016612	GTTGCT	2	12	3268188	3268199	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016612	CTTCAG	2	12	3337418	3337429	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016612	GTGTGA	2	12	3337818	3337829	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016612	CGATAA	2	12	3369629	3369640	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016612	GATGTG	2	12	3373043	3373054	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016612	TATTTT	2	12	3430712	3430723	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016612	TGAGCC	2	12	3432029	3432040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016612	CCGCAG	2	12	3433017	3433028	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016612	AGCGAA	2	12	3434328	3434339	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016612	CATATA	2	12	3480151	3480162	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016612	TTTATT	2	12	3484386	3484397	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016612	TACCCG	2	12	3555314	3555325	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016612	GATGGT	2	12	3589309	3589320	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016612	GAGATC	2	12	3654239	3654250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016612	AATAAG	2	12	3733244	3733255	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016612	TTTTTA	2	12	3836529	3836540	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016612	GAGAAT	2	12	3871530	3871541	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016612	TCATTA	2	12	3873211	3873222	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016612	CCTTAA	2	12	3873229	3873240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016612	TGGTTG	2	12	3916179	3916190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016612	CATTTC	2	12	3989375	3989386	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016612	AAATGA	2	12	4049363	4049374	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016612	GTGATC	2	12	4104885	4104896	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016612	CGCCCG	2	12	4113414	4113425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_016612	CTACGG	2	12	4119269	4119280	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016612	GGGGGA	2	12	4189875	4189886	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016612	GAAGGG	2	12	4233523	4233534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016612	AACATA	2	12	4248050	4248061	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_016612	GCCAAT	2	12	4263219	4263230	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016612	GGATTT	2	12	4279305	4279316	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016612	CAATGC	2	12	4309469	4309480	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016612	GGGATG	2	12	4324136	4324147	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016612	ATGATT	2	12	4450928	4450939	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016612	GCTGGC	2	12	4451256	4451267	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016612	GCCAGC	2	12	4473652	4473663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016612	AAAGTA	2	12	4482127	4482138	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016612	ATTTTT	2	12	4519499	4519510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016612	ATCATT	2	12	4550314	4550325	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016612	GCGACA	2	12	4564553	4564564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016612	CAAAAA	2	12	4608889	4608900	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016612	TCTTCA	2	12	4614749	4614760	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016612	ATCCTG	2	12	4657183	4657194	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016612	TTGTTT	2	12	4683450	4683461	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016612	TTTTGA	2	12	4716234	4716245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016612	TCGCCG	2	12	4915924	4915935	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016612	AAATCG	2	12	4915969	4915980	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_016612	GATATT	2	12	4920265	4920276	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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127	NC_016612	TAAAAA	2	12	4924476	4924487	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_016612	CTTCCC	2	12	4941784	4941795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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132	NC_016612	AAATTT	2	12	5036846	5036857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.