MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 chromosome

Total Repeats: 836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014625	GACA	2	8	6520	6527	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014625	CGGG	2	8	8559	8566	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014625	GGGC	2	8	8664	8671	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014625	GAAC	2	8	13398	13405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014625	GTGA	2	8	13743	13750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014625	TTGC	2	8	14152	14159	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014625	TTCT	2	8	15228	15235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014625	TATG	2	8	15402	15409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014625	GCGA	2	8	15799	15806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014625	GGCC	2	8	15852	15859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014625	CAAG	2	8	16130	16137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014625	CGTC	2	8	16495	16502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014625	GATT	2	8	17038	17045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014625	AGCC	2	8	17796	17803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014625	AACC	2	8	18863	18870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014625	GCTT	2	8	21074	21081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014625	ACCA	2	8	40179	40186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014625	TTAA	2	8	57877	57884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014625	TGCG	2	8	61842	61849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014625	CCTT	2	8	73214	73221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014625	GGCG	2	8	73263	73270	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014625	CTGG	2	8	73396	73403	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014625	CGTG	2	8	80979	80986	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014625	GACG	2	8	88590	88597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014625	GTAA	2	8	90058	90065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014625	AAAG	2	8	92729	92736	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014625	TGCG	2	8	95296	95303	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014625	GCTG	2	8	96020	96027	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014625	TGGC	2	8	96083	96090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014625	TTGC	2	8	96108	96115	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014625	TCCT	2	8	98047	98054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014625	CGGG	2	8	103684	103691	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014625	GCGG	2	8	103741	103748	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014625	CGCC	2	8	112735	112742	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_014625	CTGC	2	8	114089	114096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014625	GATC	2	8	122968	122975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014625	TGGC	2	8	123962	123969	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014625	GCCT	2	8	127798	127805	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014625	CTGA	2	8	136520	136527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014625	CCGG	2	8	138043	138050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014625	TTAA	2	8	151851	151858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014625	CCAC	2	8	152646	152653	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_014625	ATTT	2	8	152706	152713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014625	GCGG	2	8	155539	155546	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014625	CTGG	2	8	158059	158066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014625	CGGG	2	8	158209	158216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014625	GCTG	2	8	167704	167711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014625	GCCC	2	8	168121	168128	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_014625	CGGG	2	8	168204	168211	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014625	GAAC	2	8	169155	169162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014625	AAAG	2	8	169386	169393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014625	ACCG	2	8	169453	169460	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014625	GGTC	2	8	169664	169671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014625	CAGC	2	8	170489	170496	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014625	GCGG	2	8	170599	170606	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014625	CTGG	2	8	172905	172912	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014625	CGGG	2	8	173782	173789	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014625	GCCG	2	8	174024	174031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014625	GAAA	2	8	183154	183161	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014625	GAAG	2	8	183338	183345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014625	CTTC	2	8	185100	185107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014625	CGGG	2	8	192272	192279	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014625	ACCA	2	8	198735	198742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014625	GCCC	2	8	200068	200075	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_014625	AGAC	2	8	207120	207127	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014625	GGCG	2	8	212484	212491	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014625	GCAC	2	8	213055	213062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014625	TCCA	2	8	214287	214294	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014625	GCCG	2	8	214810	214817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014625	GCAG	2	8	216108	216115	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014625	CGGG	2	8	228443	228450	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014625	GATT	2	8	230481	230488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014625	TCGA	2	8	230758	230765	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014625	AGGC	2	8	237738	237745	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014625	GAAC	2	8	238282	238289	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014625	GTGA	2	8	238627	238634	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014625	TTGC	2	8	239036	239043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014625	TTCT	2	8	240113	240120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014625	TATG	2	8	240287	240294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014625	GCGA	2	8	240684	240691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014625	GGCC	2	8	240737	240744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014625	CAAG	2	8	241015	241022	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014625	CGTC	2	8	241380	241387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014625	GATT	2	8	241923	241930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014625	AGCC	2	8	242681	242688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014625	AACC	2	8	243873	243880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014625	CCGG	2	8	251456	251463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014625	CTGA	2	8	253176	253183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014625	GCCC	2	8	274421	274428	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_014625	GGGC	2	8	274617	274624	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014625	CGGG	2	8	279575	279582	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014625	GGAC	2	8	295462	295469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014625	CAGG	2	8	295625	295632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014625	ACAG	2	8	295755	295762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014625	GGGC	2	8	302660	302667	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014625	CCCG	2	8	306768	306775	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_014625	GTCA	2	8	308918	308925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014625	CAGC	2	8	309061	309068	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014625	GTAT	2	8	317141	317148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014625	CTGG	2	8	328522	328529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014625	GCTG	3	12	328539	328550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014625	GCCT	2	8	330295	330302	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014625	GCAA	2	8	333738	333745	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014625	TAAG	2	8	335496	335503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014625	GAAA	2	8	336355	336362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014625	GAAG	2	8	336539	336546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014625	GAAT	2	8	346538	346545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014625	GACC	2	8	346565	346572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014625	TTGC	2	8	346663	346670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014625	GGGC	2	8	346730	346737	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014625	GTGC	2	8	347564	347571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014625	TCGG	2	8	347756	347763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014625	GCCC	2	8	353535	353542	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_014625	TCTG	2	8	359162	359169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014625	CGGG	2	8	360119	360126	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014625	TGGC	2	8	360171	360178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014625	GGGC	2	8	360799	360806	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014625	AGCC	2	8	361046	361053	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014625	TGAT	2	8	361506	361513	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014625	GAGG	2	8	363655	363662	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014625	AAGG	2	8	365565	365572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014625	GGGC	2	8	365686	365693	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014625	ACGA	2	8	374734	374741	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014625	ATGA	2	8	374742	374749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014625	GGAT	2	8	375375	375382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014625	GCTG	2	8	380602	380609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014625	GATT	2	8	380888	380895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014625	GCGG	2	8	381830	381837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014625	GCCT	2	8	382635	382642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014625	TGGC	2	8	382692	382699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014625	GACC	2	8	383052	383059	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014625	GAAC	2	8	398326	398333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014625	GTGA	2	8	398671	398678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014625	TTGC	2	8	399080	399087	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014625	TTCT	2	8	400156	400163	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014625	TATG	2	8	400330	400337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014625	GCGA	2	8	400727	400734	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014625	GGCC	2	8	400780	400787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014625	CAAG	2	8	401058	401065	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014625	CGTC	2	8	401423	401430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014625	GATT	2	8	401967	401974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014625	AGCC	2	8	402725	402732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014625	GACA	2	8	403740	403747	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014625	CGGT	2	8	403864	403871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014625	GGCA	2	8	403914	403921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014625	CCTC	2	8	406980	406987	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_014625	TGAT	2	8	412783	412790	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014625	CACG	2	8	425383	425390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014625	GCCG	2	8	425954	425961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014625	GCGG	2	8	426447	426454	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014625	AGCG	2	8	426679	426686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014625	CCAC	2	8	426688	426695	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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157	NC_014625	CGGG	2	8	444706	444713	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_014625	CGGG	3	12	500193	500204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
167	NC_014625	CTGG	2	8	505190	505197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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197	NC_014625	TCGG	2	8	644647	644654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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295	NC_014625	ACAG	2	8	916487	916494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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297	NC_014625	ACAG	2	8	918497	918504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_014625	GCCC	2	8	1492052	1492059	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
472	NC_014625	GCAC	2	8	1492223	1492230	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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475	NC_014625	ACGG	2	8	1492751	1492758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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480	NC_014625	CTTG	2	8	1508128	1508135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
481	NC_014625	GCGG	2	8	1508747	1508754	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
482	NC_014625	CACC	2	8	1511173	1511180	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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488	NC_014625	CCAC	2	8	1533140	1533147	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
489	NC_014625	TCCT	2	8	1541878	1541885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
490	NC_014625	CGCC	2	8	1552479	1552486	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
491	NC_014625	TATT	2	8	1560680	1560687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_014625	CAGG	2	8	1560979	1560986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_014625	CGCC	2	8	1567935	1567942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
494	NC_014625	GGGC	2	8	1567954	1567961	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
495	NC_014625	TCGA	2	8	1580293	1580300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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497	NC_014625	CCAT	2	8	1585685	1585692	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
498	NC_014625	CAGA	2	8	1585984	1585991	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_014625	CGTT	2	8	1609066	1609073	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_014625	ACCC	2	8	1609087	1609094	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

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